MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36501	NC_002505	TCA	2	6	2219356	2219361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642063
36502	NC_002505	ATCA	2	8	2219409	2219416	50 %	25 %	0 %	25 %	15642063
36503	NC_002505	CAC	2	6	2219417	2219422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642063
36504	NC_002505	CAA	2	6	2219471	2219476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642063
36505	NC_002505	CTT	2	6	2219489	2219494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642063
36506	NC_002505	TTC	3	9	2219514	2219522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642063
36507	NC_002505	TCT	2	6	2219560	2219565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642063
36508	NC_002505	GGCT	2	8	2219568	2219575	0 %	25 %	50 %	25 %	15642063
36509	NC_002505	TCT	2	6	2219848	2219853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642063
36510	NC_002505	GCT	2	6	2219876	2219881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642063
36511	NC_002505	TGAGA	2	10	2220007	2220016	40 %	20 %	40 %	0 %	15642064
36512	NC_002505	TGCGC	2	10	2220103	2220112	0 %	20 %	40 %	40 %	15642064
36513	NC_002505	TGA	2	6	2220176	2220181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642064
36514	NC_002505	CAC	2	6	2220233	2220238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642064
36515	NC_002505	CTG	2	6	2220247	2220252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642064
36516	NC_002505	TCA	2	6	2220277	2220282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642064
36517	NC_002505	TCA	2	6	2220329	2220334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642064
36518	NC_002505	CCATT	2	10	2220337	2220346	20 %	40 %	0 %	40 %	15642064
36519	NC_002505	CAG	2	6	2220357	2220362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642064
36520	NC_002505	TCA	2	6	2220511	2220516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642064
36521	NC_002505	CGT	2	6	2220623	2220628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642064
36522	NC_002505	ATC	2	6	2220682	2220687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642064
36523	NC_002505	AGC	2	6	2220784	2220789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642065
36524	NC_002505	GAT	2	6	2220838	2220843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642065
36525	NC_002505	CTG	2	6	2220861	2220866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642065
36526	NC_002505	CAGG	2	8	2220879	2220886	25 %	0 %	50 %	25 %	15642065
36527	NC_002505	TTC	2	6	2220895	2220900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642065
36528	NC_002505	TTG	2	6	2221077	2221082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642065
36529	NC_002505	TCA	2	6	2221088	2221093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642065
36530	NC_002505	AACTT	2	10	2221176	2221185	40 %	40 %	0 %	20 %	15642066
36531	NC_002505	TCA	2	6	2221280	2221285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642066
36532	NC_002505	TTC	2	6	2221360	2221365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642066
36533	NC_002505	CGT	2	6	2221419	2221424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642066
36534	NC_002505	CAA	2	6	2221449	2221454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642066
36535	NC_002505	CAC	2	6	2221623	2221628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642066
36536	NC_002505	TCG	2	6	2221637	2221642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642066
36537	NC_002505	CAT	2	6	2221701	2221706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642066
36538	NC_002505	T	7	7	2221709	2221715	0 %	100 %	0 %	0 %	15642066
36539	NC_002505	ACCA	2	8	2221729	2221736	50 %	0 %	0 %	50 %	15642066
36540	NC_002505	GAC	2	6	2221779	2221784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642066
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36542	NC_002505	GCT	2	6	2221839	2221844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642066
36543	NC_002505	TAAG	2	8	2221921	2221928	50 %	25 %	25 %	0 %	15642067
36544	NC_002505	TTTG	2	8	2221988	2221995	0 %	75 %	25 %	0 %	15642067
36545	NC_002505	CCA	2	6	2222041	2222046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642067
36546	NC_002505	T	6	6	2222050	2222055	0 %	100 %	0 %	0 %	15642067
36547	NC_002505	GTC	2	6	2222081	2222086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642067
36548	NC_002505	AAT	2	6	2222157	2222162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642067
36549	NC_002505	CAA	2	6	2222197	2222202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642067
36550	NC_002505	TCA	2	6	2222277	2222282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642067
36551	NC_002505	CA	3	6	2222281	2222286	50 %	0 %	0 %	50 %	15642067
36552	NC_002505	TGCGC	2	10	2222304	2222313	0 %	20 %	40 %	40 %	15642067
36553	NC_002505	CAC	2	6	2222324	2222329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642067
36554	NC_002505	CATCT	2	10	2222372	2222381	20 %	40 %	0 %	40 %	15642067
36555	NC_002505	GA	3	6	2222425	2222430	50 %	0 %	50 %	0 %	15642067
36556	NC_002505	ATG	2	6	2222466	2222471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642067
36557	NC_002505	T	6	6	2222612	2222617	0 %	100 %	0 %	0 %	15642067
36558	NC_002505	ACC	2	6	2222672	2222677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642067
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36560	NC_002505	AT	3	6	2222750	2222755	50 %	50 %	0 %	0 %	15642067
36561	NC_002505	TTTG	2	8	2222759	2222766	0 %	75 %	25 %	0 %	15642067
36562	NC_002505	CCG	2	6	2222777	2222782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642067
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36564	NC_002505	TCG	2	6	2222983	2222988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642068
36565	NC_002505	TGCGC	2	10	2223056	2223065	0 %	20 %	40 %	40 %	15642068
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36567	NC_002505	CT	3	6	2223106	2223111	0 %	50 %	0 %	50 %	15642068
36568	NC_002505	CGA	2	6	2223187	2223192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642068
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36581	NC_002505	T	6	6	2224173	2224178	0 %	100 %	0 %	0 %	15642068
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36585	NC_002505	A	6	6	2224289	2224294	100 %	0 %	0 %	0 %	15642068
36586	NC_002505	GTGGC	2	10	2224475	2224484	0 %	20 %	60 %	20 %	15642069
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36589	NC_002505	TGAG	2	8	2224647	2224654	25 %	25 %	50 %	0 %	15642069
36590	NC_002505	GGATCG	2	12	2224740	2224751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15642069
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36609	NC_002505	TCAA	2	8	2225870	2225877	50 %	25 %	0 %	25 %	15642069
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36614	NC_002505	ACCG	2	8	2226022	2226029	25 %	0 %	25 %	50 %	15642069
36615	NC_002505	CAC	2	6	2226046	2226051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642069
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36618	NC_002505	CGC	2	6	2226181	2226186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642069
36619	NC_002505	CAC	2	6	2226226	2226231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642069
36620	NC_002505	GAA	2	6	2226256	2226261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642069
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36718	NC_002505	CAT	2	6	2232510	2232515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642074
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36720	NC_002505	CAAG	2	8	2232645	2232652	50 %	0 %	25 %	25 %	15642074
36721	NC_002505	AG	3	6	2232681	2232686	50 %	0 %	50 %	0 %	15642074
36722	NC_002505	AGC	3	9	2232962	2232970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642075
36723	NC_002505	CATC	2	8	2233074	2233081	25 %	25 %	0 %	50 %	15642075
36724	NC_002505	GC	3	6	2233087	2233092	0 %	0 %	50 %	50 %	15642075
36725	NC_002505	ATGGC	2	10	2233105	2233114	20 %	20 %	40 %	20 %	15642075
36726	NC_002505	AGCAAG	2	12	2233157	2233168	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15642075
36727	NC_002505	TCA	2	6	2233236	2233241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642075
36728	NC_002505	CAC	2	6	2233546	2233551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642076
36729	NC_002505	T	6	6	2233594	2233599	0 %	100 %	0 %	0 %	15642076
36730	NC_002505	GCATC	2	10	2233614	2233623	20 %	20 %	20 %	40 %	15642076
36731	NC_002505	CG	3	6	2233652	2233657	0 %	0 %	50 %	50 %	15642076
36732	NC_002505	T	6	6	2233679	2233684	0 %	100 %	0 %	0 %	15642076
36733	NC_002505	CGC	2	6	2233693	2233698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642076
36734	NC_002505	ATC	2	6	2233735	2233740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642076
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36736	NC_002505	GTAG	2	8	2233773	2233780	25 %	25 %	50 %	0 %	15642077
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