MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36005	NC_002505	TTG	2	6	2190042	2190047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642035
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36235	NC_002505	G	6	6	2205281	2205286	0 %	0 %	100 %	0 %	15642049
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36238	NC_002505	TAA	2	6	2205567	2205572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642050
36239	NC_002505	GC	3	6	2205595	2205600	0 %	0 %	50 %	50 %	15642050
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36349	NC_002505	GT	3	6	2210927	2210932	0 %	50 %	50 %	0 %	15642053
36350	NC_002505	GCA	2	6	2210947	2210952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642053
36351	NC_002505	A	6	6	2211100	2211105	100 %	0 %	0 %	0 %	15642054
36352	NC_002505	TTGG	2	8	2211149	2211156	0 %	50 %	50 %	0 %	15642054
36353	NC_002505	CTCA	2	8	2211161	2211168	25 %	25 %	0 %	50 %	15642055
36354	NC_002505	GCA	2	6	2211228	2211233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642055
36355	NC_002505	A	6	6	2211233	2211238	100 %	0 %	0 %	0 %	15642055
36356	NC_002505	CGAT	2	8	2211289	2211296	25 %	25 %	25 %	25 %	15642055
36357	NC_002505	CCA	2	6	2211341	2211346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642055
36358	NC_002505	CGA	2	6	2211385	2211390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642055
36359	NC_002505	CGC	2	6	2211404	2211409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642055
36360	NC_002505	T	6	6	2211421	2211426	0 %	100 %	0 %	0 %	15642055
36361	NC_002505	TCA	2	6	2211429	2211434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642055
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36364	NC_002505	GCG	2	6	2211648	2211653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642055
36365	NC_002505	GAT	2	6	2211710	2211715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642055
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36369	NC_002505	ATT	2	6	2211903	2211908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642055
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36383	NC_002505	TGC	2	6	2212724	2212729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642057
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36464	NC_002505	CGA	2	6	2217524	2217529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642062
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36466	NC_002505	ATC	2	6	2217544	2217549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642062
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36471	NC_002505	TTC	2	6	2217844	2217849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642063
36472	NC_002505	ACG	2	6	2217933	2217938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642063
36473	NC_002505	GAA	2	6	2218019	2218024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642063
36474	NC_002505	ATCG	2	8	2218086	2218093	25 %	25 %	25 %	25 %	15642063
36475	NC_002505	TAC	2	6	2218122	2218127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642063
36476	NC_002505	CAC	2	6	2218139	2218144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642063
36477	NC_002505	TCT	2	6	2218163	2218168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642063
36478	NC_002505	ATT	2	6	2218246	2218251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642063
36479	NC_002505	CAA	2	6	2218463	2218468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642063
36480	NC_002505	CAC	2	6	2218493	2218498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642063
36481	NC_002505	TTTA	2	8	2218518	2218525	25 %	75 %	0 %	0 %	15642063
36482	NC_002505	T	6	6	2218572	2218577	0 %	100 %	0 %	0 %	15642063
36483	NC_002505	TCA	2	6	2218598	2218603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642063
36484	NC_002505	CACC	2	8	2218718	2218725	25 %	0 %	0 %	75 %	15642063
36485	NC_002505	ATG	2	6	2218732	2218737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642063
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36487	NC_002505	CAG	2	6	2218799	2218804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642063
36488	NC_002505	TCA	2	6	2218822	2218827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642063
36489	NC_002505	GCA	2	6	2218840	2218845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642063
36490	NC_002505	CAG	2	6	2218880	2218885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642063
36491	NC_002505	GCT	2	6	2218918	2218923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642063
36492	NC_002505	TAG	2	6	2218928	2218933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642063
36493	NC_002505	GC	3	6	2218937	2218942	0 %	0 %	50 %	50 %	15642063
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36495	NC_002505	AGT	2	6	2219056	2219061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642063
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36500	NC_002505	GCCTT	2	10	2219335	2219344	0 %	40 %	20 %	40 %	15642063

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