MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_002505	AAG	2	6	2161208	2161213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642010
35503	NC_002505	GATT	2	8	2161296	2161303	25 %	50 %	25 %	0 %	15642010
35504	NC_002505	ACG	2	6	2161331	2161336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642010
35505	NC_002505	TGC	2	6	2161343	2161348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642010
35506	NC_002505	TGA	2	6	2161350	2161355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
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35509	NC_002505	CAA	2	6	2161434	2161439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642010
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35511	NC_002505	GGC	2	6	2161459	2161464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642010
35512	NC_002505	CG	3	6	2161581	2161586	0 %	0 %	50 %	50 %	15642010
35513	NC_002505	TGA	2	6	2161659	2161664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
35514	NC_002505	TGA	2	6	2161671	2161676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
35515	NC_002505	TCA	2	6	2161697	2161702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642010
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35517	NC_002505	A	6	6	2161783	2161788	100 %	0 %	0 %	0 %	15642010
35518	NC_002505	GTG	2	6	2161798	2161803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642010
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35522	NC_002505	GAT	2	6	2161992	2161997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642010
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35544	NC_002505	AT	3	6	2163292	2163297	50 %	50 %	0 %	0 %	15642011
35545	NC_002505	CTG	2	6	2163416	2163421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642011
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35552	NC_002505	CTG	3	9	2163910	2163918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642013
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35555	NC_002505	TCAA	2	8	2164096	2164103	50 %	25 %	0 %	25 %	15642013
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35617	NC_002505	CGT	2	6	2167827	2167832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642015
35618	NC_002505	ACCG	2	8	2167855	2167862	25 %	0 %	25 %	50 %	15642015
35619	NC_002505	ACC	2	6	2167894	2167899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642015
35620	NC_002505	GCA	2	6	2167998	2168003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642015
35621	NC_002505	TTA	2	6	2168072	2168077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642015
35622	NC_002505	TGT	2	6	2168526	2168531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642016
35623	NC_002505	T	6	6	2168531	2168536	0 %	100 %	0 %	0 %	15642016
35624	NC_002505	GGTT	2	8	2168605	2168612	0 %	50 %	50 %	0 %	15642016
35625	NC_002505	TCAA	2	8	2168659	2168666	50 %	25 %	0 %	25 %	15642016
35626	NC_002505	CAC	3	9	2168810	2168818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642016
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35629	NC_002505	TTG	2	6	2168859	2168864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642016
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35631	NC_002505	CTG	2	6	2168919	2168924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642016
35632	NC_002505	CGG	2	6	2168948	2168953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642016
35633	NC_002505	TGG	2	6	2169022	2169027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642016
35634	NC_002505	CGAG	2	8	2169035	2169042	25 %	0 %	50 %	25 %	15642016
35635	NC_002505	CAC	2	6	2169071	2169076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642016
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35646	NC_002505	CGT	2	6	2169671	2169676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642017
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35649	NC_002505	AAAT	2	8	2169793	2169800	75 %	25 %	0 %	0 %	15642017
35650	NC_002505	ATTC	2	8	2169853	2169860	25 %	50 %	0 %	25 %	15642017
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35722	NC_002505	T	7	7	2173797	2173803	0 %	100 %	0 %	0 %	15642021
35723	NC_002505	GGCC	2	8	2173901	2173908	0 %	0 %	50 %	50 %	15642021
35724	NC_002505	ACA	2	6	2173952	2173957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642021
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35726	NC_002505	ATA	2	6	2173996	2174001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642021
35727	NC_002505	AATTGA	2	12	2174010	2174021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15642021
35728	NC_002505	ATCG	2	8	2174107	2174114	25 %	25 %	25 %	25 %	161581996
35729	NC_002505	AGT	2	6	2174125	2174130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161581996
35730	NC_002505	TCT	2	6	2174133	2174138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161581996
35731	NC_002505	CTT	2	6	2174142	2174147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161581996
35732	NC_002505	AGA	2	6	2174236	2174241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161581996
35733	NC_002505	CAA	2	6	2174280	2174285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161581996
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35854	NC_002505	TC	3	6	2182903	2182908	0 %	50 %	0 %	50 %	15642032
35855	NC_002505	AAG	2	6	2182941	2182946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642032
35856	NC_002505	AAG	2	6	2182956	2182961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642032
35857	NC_002505	GT	3	6	2183121	2183126	0 %	50 %	50 %	0 %	15642032
35858	NC_002505	TCG	2	6	2183215	2183220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642032
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35958	NC_002505	ACG	3	9	2187959	2187967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642035
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35960	NC_002505	GTTT	2	8	2187999	2188006	0 %	75 %	25 %	0 %	15642035
35961	NC_002505	GGTTG	2	10	2188007	2188016	0 %	40 %	60 %	0 %	15642035
35962	NC_002505	TAC	2	6	2188034	2188039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642035
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35965	NC_002505	TTCG	2	8	2188274	2188281	0 %	50 %	25 %	25 %	15642035
35966	NC_002505	ACC	2	6	2188328	2188333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642035
35967	NC_002505	TCA	2	6	2188360	2188365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642035
35968	NC_002505	GTC	2	6	2188439	2188444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642035
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