MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_002505	TGA	2	6	122377	122382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640159
2003	NC_002505	GAT	3	9	122408	122416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640159
2004	NC_002505	CAA	2	6	122548	122553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640159
2005	NC_002505	TGCG	2	8	122802	122809	0 %	25 %	50 %	25 %	15640159
2006	NC_002505	GC	3	6	122912	122917	0 %	0 %	50 %	50 %	15640159
2007	NC_002505	TCA	2	6	123020	123025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640160
2008	NC_002505	GTT	2	6	123054	123059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640160
2009	NC_002505	TGG	2	6	123097	123102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640160
2010	NC_002505	GC	3	6	123124	123129	0 %	0 %	50 %	50 %	15640160
2011	NC_002505	ATG	2	6	123149	123154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640160
2012	NC_002505	GCA	2	6	123180	123185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640160
2013	NC_002505	GCG	2	6	123229	123234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640160
2014	NC_002505	A	6	6	123365	123370	100 %	0 %	0 %	0 %	15640160
2015	NC_002505	GC	3	6	123402	123407	0 %	0 %	50 %	50 %	15640160
2016	NC_002505	AGC	2	6	123453	123458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640160
2017	NC_002505	ACA	2	6	123459	123464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640160
2018	NC_002505	CTG	2	6	123552	123557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640160
2019	NC_002505	TCG	2	6	123582	123587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640160
2020	NC_002505	AGCG	2	8	123597	123604	25 %	0 %	50 %	25 %	15640160
2021	NC_002505	TC	3	6	123630	123635	0 %	50 %	0 %	50 %	15640160
2022	NC_002505	TC	3	6	123870	123875	0 %	50 %	0 %	50 %	15640161
2023	NC_002505	TGC	2	6	124002	124007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640161
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2025	NC_002505	TGG	2	6	124213	124218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640161
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2030	NC_002505	GAT	2	6	124406	124411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640161
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2046	NC_002505	CAG	2	6	124979	124984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640161
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2051	NC_002505	TGC	2	6	125448	125453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640161
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2055	NC_002505	TGA	2	6	125587	125592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640161
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2063	NC_002505	GAT	2	6	125938	125943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640161
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2108	NC_002505	GA	3	6	128197	128202	50 %	0 %	50 %	0 %	15640163
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2123	NC_002505	A	6	6	129701	129706	100 %	0 %	0 %	0 %	15640166
2124	NC_002505	AC	3	6	129847	129852	50 %	0 %	0 %	50 %	15640166
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2131	NC_002505	CTTCG	2	10	130572	130581	0 %	40 %	20 %	40 %	15640166
2132	NC_002505	T	7	7	130655	130661	0 %	100 %	0 %	0 %	15640166
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2231	NC_002505	GC	3	6	137219	137224	0 %	0 %	50 %	50 %	15640178
2232	NC_002505	CTT	2	6	137269	137274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640178
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2235	NC_002505	CTG	2	6	137333	137338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640178
2236	NC_002505	ATC	2	6	137372	137377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640178
2237	NC_002505	CTG	2	6	137438	137443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640178
2238	NC_002505	AGA	2	6	137446	137451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640178
2239	NC_002505	TC	4	8	137464	137471	0 %	50 %	0 %	50 %	15640178
2240	NC_002505	AGC	2	6	137478	137483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640178
2241	NC_002505	A	6	6	137504	137509	100 %	0 %	0 %	0 %	15640178
2242	NC_002505	TGG	2	6	137526	137531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640178
2243	NC_002505	GGGT	2	8	137541	137548	0 %	25 %	75 %	0 %	15640178
2244	NC_002505	GCAAG	2	10	137590	137599	40 %	0 %	40 %	20 %	15640178
2245	NC_002505	TGC	2	6	137632	137637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640178
2246	NC_002505	ATG	2	6	137727	137732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640178
2247	NC_002505	GCG	2	6	137741	137746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640178
2248	NC_002505	GC	3	6	137750	137755	0 %	0 %	50 %	50 %	15640178
2249	NC_002505	GTG	2	6	137765	137770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640178
2250	NC_002505	CAAAA	2	10	137795	137804	80 %	0 %	0 %	20 %	15640178
2251	NC_002505	TGA	2	6	137841	137846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640178
2252	NC_002505	AGA	2	6	137847	137852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640178
2253	NC_002505	TGA	2	6	137854	137859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640178
2254	NC_002505	TCAG	2	8	137916	137923	25 %	25 %	25 %	25 %	15640178
2255	NC_002505	GAC	2	6	138065	138070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640178
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2264	NC_002505	GCT	2	6	138570	138575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640179
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2268	NC_002505	GTG	2	6	138629	138634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640179
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2308	NC_002505	TGA	2	6	140700	140705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640181
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2323	NC_002505	GAC	2	6	141580	141585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640182
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2337	NC_002505	GTT	2	6	142237	142242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640182
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2341	NC_002505	T	6	6	142373	142378	0 %	100 %	0 %	0 %	15640182
2342	NC_002505	CAA	2	6	142796	142801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640183
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2344	NC_002505	CGC	2	6	142814	142819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640183
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2352	NC_002505	AAC	2	6	143465	143470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640184
2353	NC_002505	TGCTT	2	10	143536	143545	0 %	60 %	20 %	20 %	15640184
2354	NC_002505	CTCAG	2	10	143605	143614	20 %	20 %	20 %	40 %	15640184
2355	NC_002505	TCG	2	6	143685	143690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640184
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2358	NC_002505	AG	3	6	143923	143928	50 %	0 %	50 %	0 %	15640185
2359	NC_002505	CAC	2	6	143936	143941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640185
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2363	NC_002505	T	6	6	144376	144381	0 %	100 %	0 %	0 %	15640185
2364	NC_002505	TA	3	6	144427	144432	50 %	50 %	0 %	0 %	15640185
2365	NC_002505	CCA	2	6	144463	144468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640185
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2367	NC_002505	TTC	2	6	144578	144583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640185
2368	NC_002505	CAG	2	6	144602	144607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640185
2369	NC_002505	CATC	2	8	144691	144698	25 %	25 %	0 %	50 %	15640185
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2371	NC_002505	CGC	2	6	144731	144736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640185
2372	NC_002505	CG	3	6	144763	144768	0 %	0 %	50 %	50 %	15640185
2373	NC_002505	ATG	2	6	144783	144788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640185
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2380	NC_002505	TGC	2	6	145697	145702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640186
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2463	NC_002505	GCTTG	2	10	150148	150157	0 %	40 %	40 %	20 %	15640189
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2478	NC_002505	TC	3	6	157025	157030	0 %	50 %	0 %	50 %	15640191
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2482	NC_002505	GT	3	6	157163	157168	0 %	50 %	50 %	0 %	15640191
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2493	NC_002505	CTT	3	9	158058	158066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640192
2494	NC_002505	TGC	2	6	158121	158126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640192
2495	NC_002505	TTGG	2	8	158205	158212	0 %	50 %	50 %	0 %	15640192
2496	NC_002505	ATG	2	6	158255	158260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640192
2497	NC_002505	ACA	2	6	158337	158342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640192
2498	NC_002505	CAT	2	6	158356	158361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640192
2499	NC_002505	ATG	2	6	158384	158389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640192
2500	NC_002505	ATG	2	6	158403	158408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640192

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