MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22004	NC_002505	GCT	2	6	1333180	1333185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641272
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22117	NC_002505	TTGGAC	2	12	1339926	1339937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15641278
22118	NC_002505	TTA	2	6	1339964	1339969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641278
22119	NC_002505	CGATGG	2	12	1339993	1340004	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15641278
22120	NC_002505	CCAAC	2	10	1340083	1340092	40 %	0 %	0 %	60 %	15641278
22121	NC_002505	GCA	2	6	1340098	1340103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641278
22122	NC_002505	GGC	2	6	1340204	1340209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641278
22123	NC_002505	CGT	2	6	1340279	1340284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641278
22124	NC_002505	GCTG	2	8	1340377	1340384	0 %	25 %	50 %	25 %	15641278
22125	NC_002505	AGC	2	6	1340403	1340408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641278
22126	NC_002505	CTG	3	9	1340429	1340437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641278
22127	NC_002505	GTC	2	6	1340466	1340471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641278
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22130	NC_002505	ATG	2	6	1340565	1340570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641278
22131	NC_002505	GC	3	6	1340576	1340581	0 %	0 %	50 %	50 %	15641278
22132	NC_002505	TGG	2	6	1340673	1340678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641278
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22135	NC_002505	CGA	2	6	1340880	1340885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641279
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22137	NC_002505	CAG	2	6	1340951	1340956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641279
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22144	NC_002505	CT	3	6	1341326	1341331	0 %	50 %	0 %	50 %	15641279
22145	NC_002505	TTG	2	6	1341428	1341433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641279
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22220	NC_002505	GT	3	6	1345169	1345174	0 %	50 %	50 %	0 %	15641282
22221	NC_002505	GCG	2	6	1345195	1345200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641282
22222	NC_002505	GCGG	2	8	1345213	1345220	0 %	0 %	75 %	25 %	15641282
22223	NC_002505	GGCG	2	8	1345303	1345310	0 %	0 %	75 %	25 %	15641282
22224	NC_002505	GGT	2	6	1345374	1345379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641283
22225	NC_002505	GTGTG	2	10	1345414	1345423	0 %	40 %	60 %	0 %	15641283
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22227	NC_002505	GTG	2	6	1345457	1345462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641283
22228	NC_002505	TGG	2	6	1345548	1345553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641283
22229	NC_002505	GCAAA	2	10	1345641	1345650	60 %	0 %	20 %	20 %	15641283
22230	NC_002505	TGA	2	6	1345686	1345691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641283
22231	NC_002505	GAT	2	6	1345699	1345704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641283
22232	NC_002505	TGT	2	6	1345773	1345778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641283
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22234	NC_002505	TGA	2	6	1346227	1346232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641284
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22348	NC_002505	A	7	7	1352619	1352625	100 %	0 %	0 %	0 %	15641290
22349	NC_002505	TCCAC	2	10	1352698	1352707	20 %	20 %	0 %	60 %	15641290
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22464	NC_002505	GGTG	2	8	1359672	1359679	0 %	25 %	75 %	0 %	15641297
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22467	NC_002505	A	7	7	1359811	1359817	100 %	0 %	0 %	0 %	15641297
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22469	NC_002505	TTG	2	6	1359965	1359970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641297
22470	NC_002505	AAT	2	6	1359982	1359987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15641297
22471	NC_002505	ATG	2	6	1360046	1360051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641297
22472	NC_002505	GGT	2	6	1360071	1360076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641297
22473	NC_002505	AGC	2	6	1360160	1360165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641297
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22477	NC_002505	TGG	2	6	1360452	1360457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641298
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22480	NC_002505	GAAA	2	8	1360559	1360566	75 %	0 %	25 %	0 %	15641298
22481	NC_002505	CAT	2	6	1360712	1360717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641298
22482	NC_002505	A	6	6	1360766	1360771	100 %	0 %	0 %	0 %	15641298
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22485	NC_002505	AGA	3	9	1360990	1360998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641298
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22489	NC_002505	ATC	2	6	1361268	1361273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641299
22490	NC_002505	AGCA	2	8	1361317	1361324	50 %	0 %	25 %	25 %	15641299
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22492	NC_002505	ATG	2	6	1361388	1361393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641299
22493	NC_002505	TCT	2	6	1361396	1361401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641299
22494	NC_002505	T	6	6	1361424	1361429	0 %	100 %	0 %	0 %	15641299
22495	NC_002505	ATG	2	6	1361436	1361441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641299
22496	NC_002505	GA	5	10	1361515	1361524	50 %	0 %	50 %	0 %	15641299
22497	NC_002505	GAT	2	6	1361592	1361597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641299
22498	NC_002505	CAG	2	6	1361613	1361618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641299
22499	NC_002505	TTC	2	6	1361632	1361637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641299
22500	NC_002505	GTG	2	6	1361706	1361711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641299

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