MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_002505	CA	3	6	1302535	1302540	50 %	0 %	0 %	50 %	15641239
21503	NC_002505	GAA	2	6	1302563	1302568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641239
21504	NC_002505	TGACTC	2	12	1302593	1302604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15641239
21505	NC_002505	A	6	6	1302629	1302634	100 %	0 %	0 %	0 %	15641240
21506	NC_002505	GC	3	6	1302635	1302640	0 %	0 %	50 %	50 %	15641240
21507	NC_002505	GC	3	6	1302648	1302653	0 %	0 %	50 %	50 %	15641240
21508	NC_002505	TGA	2	6	1302667	1302672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641240
21509	NC_002505	CG	3	6	1302724	1302729	0 %	0 %	50 %	50 %	15641240
21510	NC_002505	CTT	2	6	1302738	1302743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641241
21511	NC_002505	CGT	2	6	1302745	1302750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641241
21512	NC_002505	CGA	3	9	1302779	1302787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641241
21513	NC_002505	TCA	2	6	1302845	1302850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641241
21514	NC_002505	CGC	2	6	1302895	1302900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641241
21515	NC_002505	CG	3	6	1302952	1302957	0 %	0 %	50 %	50 %	15641241
21516	NC_002505	AG	3	6	1302976	1302981	50 %	0 %	50 %	0 %	15641241
21517	NC_002505	ACC	2	6	1303090	1303095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641241
21518	NC_002505	ACC	2	6	1303106	1303111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641241
21519	NC_002505	TCT	2	6	1303190	1303195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641241
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21521	NC_002505	TTG	2	6	1303321	1303326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641241
21522	NC_002505	ATCA	2	8	1303654	1303661	50 %	25 %	0 %	25 %	15641241
21523	NC_002505	TTG	2	6	1303663	1303668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641241
21524	NC_002505	GCATCG	2	12	1303673	1303684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15641241
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21529	NC_002505	G	6	6	1304149	1304154	0 %	0 %	100 %	0 %	15641242
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21533	NC_002505	GCA	2	6	1304676	1304681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641242
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21535	NC_002505	TGC	2	6	1304717	1304722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641242
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21539	NC_002505	GA	3	6	1305058	1305063	50 %	0 %	50 %	0 %	15641244
21540	NC_002505	CT	3	6	1305142	1305147	0 %	50 %	0 %	50 %	15641244
21541	NC_002505	GCG	2	6	1305154	1305159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641244
21542	NC_002505	CAT	3	9	1305186	1305194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641244
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21545	NC_002505	TCA	2	6	1305370	1305375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641244
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21549	NC_002505	TTCA	2	8	1305525	1305532	25 %	50 %	0 %	25 %	15641244
21550	NC_002505	GGC	2	6	1305539	1305544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641244
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21555	NC_002505	CA	3	6	1306167	1306172	50 %	0 %	0 %	50 %	15641245
21556	NC_002505	CGA	2	6	1306338	1306343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641245
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21591	NC_002505	CAG	2	6	1308196	1308201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641247
21592	NC_002505	TCA	3	9	1308281	1308289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641247
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21594	NC_002505	GGGC	2	8	1308429	1308436	0 %	0 %	75 %	25 %	15641247
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21600	NC_002505	TGGC	2	8	1308916	1308923	0 %	25 %	50 %	25 %	15641248
21601	NC_002505	CCAC	2	8	1308954	1308961	25 %	0 %	0 %	75 %	15641248
21602	NC_002505	ATC	2	6	1308990	1308995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641248
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21855	NC_002505	TCA	2	6	1323853	1323858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641265
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21861	NC_002505	ACTG	2	8	1324376	1324383	25 %	25 %	25 %	25 %	15641266
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21867	NC_002505	AGAGCC	2	12	1324655	1324666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641266
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21971	NC_002505	ACC	2	6	1331260	1331265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641271
21972	NC_002505	GTG	2	6	1331274	1331279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641271
21973	NC_002505	TCG	2	6	1331282	1331287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641271
21974	NC_002505	CTGGCT	2	12	1331346	1331357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641271
21975	NC_002505	TGA	2	6	1331363	1331368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641271
21976	NC_002505	CCG	2	6	1331384	1331389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641271
21977	NC_002505	GCC	2	6	1331391	1331396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641271
21978	NC_002505	AAG	2	6	1331413	1331418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641271
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21980	NC_002505	CTGA	2	8	1331541	1331548	25 %	25 %	25 %	25 %	15641271
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21991	NC_002505	CTG	2	6	1331964	1331969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641271
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21997	NC_002505	CCAA	2	8	1332552	1332559	50 %	0 %	0 %	50 %	15641271
21998	NC_002505	TGA	2	6	1332644	1332649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641271
21999	NC_002505	ATG	2	6	1332654	1332659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641271
22000	NC_002505	GTAC	2	8	1332681	1332688	25 %	25 %	25 %	25 %	15641271

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