MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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20119	NC_002505	TGT	2	6	1217981	1217986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641160
20120	NC_002505	GAA	2	6	1218018	1218023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641160
20121	NC_002505	GTC	2	6	1218037	1218042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641160
20122	NC_002505	GGC	2	6	1218072	1218077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641160
20123	NC_002505	GT	3	6	1218082	1218087	0 %	50 %	50 %	0 %	15641160
20124	NC_002505	GGT	2	6	1218152	1218157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641160
20125	NC_002505	ACT	2	6	1218210	1218215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641160
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20128	NC_002505	GAT	2	6	1218476	1218481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641160
20129	NC_002505	GCT	2	6	1218487	1218492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641160
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20137	NC_002505	CG	3	6	1218638	1218643	0 %	0 %	50 %	50 %	15641160
20138	NC_002505	ATG	2	6	1218789	1218794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641160
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20212	NC_002505	TAAG	2	8	1224203	1224210	50 %	25 %	25 %	0 %	15641165
20213	NC_002505	CGA	2	6	1224343	1224348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641165
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20216	NC_002505	TGG	2	6	1225051	1225056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641166
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20218	NC_002505	TATG	2	8	1225081	1225088	25 %	50 %	25 %	0 %	15641166
20219	NC_002505	GTG	2	6	1225119	1225124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641166
20220	NC_002505	A	6	6	1225181	1225186	100 %	0 %	0 %	0 %	15641166
20221	NC_002505	ATT	2	6	1225259	1225264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641166
20222	NC_002505	CAG	2	6	1225311	1225316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641166
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20224	NC_002505	A	7	7	1225372	1225378	100 %	0 %	0 %	0 %	15641166
20225	NC_002505	TAA	2	6	1225432	1225437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15641166
20226	NC_002505	ACT	2	6	1225474	1225479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641166
20227	NC_002505	CTG	2	6	1225520	1225525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641166
20228	NC_002505	CAG	2	6	1225562	1225567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641166
20229	NC_002505	GTTAA	2	10	1225569	1225578	40 %	40 %	20 %	0 %	15641166
20230	NC_002505	TCG	2	6	1225703	1225708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641167
20231	NC_002505	GA	4	8	1225738	1225745	50 %	0 %	50 %	0 %	15641167
20232	NC_002505	GCGT	2	8	1225765	1225772	0 %	25 %	50 %	25 %	15641167
20233	NC_002505	ATC	2	6	1225789	1225794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641167
20234	NC_002505	TTG	2	6	1225796	1225801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641167
20235	NC_002505	ATC	2	6	1225909	1225914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641167
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20237	NC_002505	GC	3	6	1226098	1226103	0 %	0 %	50 %	50 %	15641167
20238	NC_002505	TACGG	2	10	1226134	1226143	20 %	20 %	40 %	20 %	15641167
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20240	NC_002505	AGT	2	6	1226186	1226191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641167
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20344	NC_002505	CGGCG	2	10	1234311	1234320	0 %	0 %	60 %	40 %	15641175
20345	NC_002505	TGG	2	6	1234335	1234340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641175
20346	NC_002505	TCA	2	6	1234409	1234414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641175
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20349	NC_002505	GGC	2	6	1234489	1234494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641175
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20351	NC_002505	G	11	11	1234643	1234653	0 %	0 %	100 %	0 %	15641175
20352	NC_002505	T	6	6	1234755	1234760	0 %	100 %	0 %	0 %	15641175
20353	NC_002505	TTA	2	6	1234893	1234898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641175
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20472	NC_002505	CGG	3	9	1241646	1241654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237063
20473	NC_002505	CAG	2	6	1241700	1241705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237063
20474	NC_002505	CTG	2	6	1241724	1241729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237063
20475	NC_002505	CCA	2	6	1241751	1241756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471237063
20476	NC_002505	TAA	2	6	1241784	1241789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471237063
20477	NC_002505	TGC	2	6	1241833	1241838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237063
20478	NC_002505	CAC	2	6	1241869	1241874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471237063
20479	NC_002505	TGT	2	6	1241886	1241891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237063
20480	NC_002505	T	6	6	1242253	1242258	0 %	100 %	0 %	0 %	15641182
20481	NC_002505	TCAG	2	8	1242284	1242291	25 %	25 %	25 %	25 %	15641182
20482	NC_002505	GAT	2	6	1242322	1242327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641182
20483	NC_002505	ACC	2	6	1242332	1242337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641182
20484	NC_002505	TGG	2	6	1242424	1242429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641182
20485	NC_002505	TTG	2	6	1242439	1242444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641182
20486	NC_002505	GC	3	6	1242506	1242511	0 %	0 %	50 %	50 %	15641182
20487	NC_002505	TCA	2	6	1242563	1242568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641182
20488	NC_002505	TGG	2	6	1242577	1242582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641182
20489	NC_002505	GCC	2	6	1242620	1242625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641182
20490	NC_002505	GGCT	2	8	1242632	1242639	0 %	25 %	50 %	25 %	15641182
20491	NC_002505	TGG	2	6	1242645	1242650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641182
20492	NC_002505	TCG	2	6	1242707	1242712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641182
20493	NC_002505	CGC	2	6	1242823	1242828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641182
20494	NC_002505	TCG	2	6	1242855	1242860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641182
20495	NC_002505	ATCA	2	8	1242919	1242926	50 %	25 %	0 %	25 %	15641182
20496	NC_002505	ATG	2	6	1242935	1242940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641182
20497	NC_002505	GCG	2	6	1243004	1243009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641182
20498	NC_002505	ATG	2	6	1243201	1243206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641183
20499	NC_002505	TCA	2	6	1243246	1243251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641183
20500	NC_002505	TGT	2	6	1243300	1243305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641183

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