MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_002505	GCC	2	6	1184206	1184211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471237060
19503	NC_002505	A	6	6	1184267	1184272	100 %	0 %	0 %	0 %	471237060
19504	NC_002505	GTG	2	6	1184362	1184367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237060
19505	NC_002505	AGCA	2	8	1184396	1184403	50 %	0 %	25 %	25 %	471237060
19506	NC_002505	TGA	2	6	1184418	1184423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237060
19507	NC_002505	ATC	3	9	1184639	1184647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237060
19508	NC_002505	ATCA	2	8	1184653	1184660	50 %	25 %	0 %	25 %	471237060
19509	NC_002505	ATCA	2	8	1184671	1184678	50 %	25 %	0 %	25 %	471237060
19510	NC_002505	ACTTAG	2	12	1184720	1184731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	471237060
19511	NC_002505	TGCC	2	8	1184894	1184901	0 %	25 %	25 %	50 %	471237060
19512	NC_002505	GTTT	2	8	1184911	1184918	0 %	75 %	25 %	0 %	471237060
19513	NC_002505	TTC	2	6	1185001	1185006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641128
19514	NC_002505	AC	3	6	1185018	1185023	50 %	0 %	0 %	50 %	15641128
19515	NC_002505	TGA	2	6	1185109	1185114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641128
19516	NC_002505	CAC	2	6	1185178	1185183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641128
19517	NC_002505	CGC	2	6	1185188	1185193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641128
19518	NC_002505	GATT	2	8	1185212	1185219	25 %	50 %	25 %	0 %	15641128
19519	NC_002505	GCT	2	6	1185224	1185229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641128
19520	NC_002505	TTCCGA	2	12	1185308	1185319	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15641128
19521	NC_002505	TGG	2	6	1185364	1185369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641128
19522	NC_002505	GGC	2	6	1185514	1185519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641128
19523	NC_002505	ACG	2	6	1185629	1185634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641128
19524	NC_002505	CGA	2	6	1185752	1185757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641129
19525	NC_002505	CTG	3	9	1185759	1185767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641129
19526	NC_002505	CTT	2	6	1185809	1185814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641129
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19528	NC_002505	AATC	2	8	1185845	1185852	50 %	25 %	0 %	25 %	15641129
19529	NC_002505	TTTG	2	8	1185891	1185898	0 %	75 %	25 %	0 %	15641129
19530	NC_002505	CAAC	2	8	1186172	1186179	50 %	0 %	0 %	50 %	15641130
19531	NC_002505	GTT	2	6	1186204	1186209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641130
19532	NC_002505	GTCTG	2	10	1186254	1186263	0 %	40 %	40 %	20 %	15641130
19533	NC_002505	GGC	2	6	1186272	1186277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641130
19534	NC_002505	TTTGGC	2	12	1186282	1186293	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15641130
19535	NC_002505	ATTT	2	8	1186299	1186306	25 %	75 %	0 %	0 %	15641130
19536	NC_002505	CTG	2	6	1186309	1186314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641130
19537	NC_002505	GTGG	2	8	1186342	1186349	0 %	25 %	75 %	0 %	15641130
19538	NC_002505	GTC	2	6	1186351	1186356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641130
19539	NC_002505	ATG	2	6	1186454	1186459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641130
19540	NC_002505	TGA	2	6	1186497	1186502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641130
19541	NC_002505	TGC	2	6	1186529	1186534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641130
19542	NC_002505	ACA	2	6	1186535	1186540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641130
19543	NC_002505	TGA	2	6	1186548	1186553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641130
19544	NC_002505	GTG	2	6	1186630	1186635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641130
19545	NC_002505	TCT	2	6	1186649	1186654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641130
19546	NC_002505	GAA	2	6	1186696	1186701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641130
19547	NC_002505	ATG	2	6	1186717	1186722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641130
19548	NC_002505	TCA	2	6	1186778	1186783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641130
19549	NC_002505	GCC	2	6	1186796	1186801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641130
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19551	NC_002505	GCG	2	6	1186861	1186866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641130
19552	NC_002505	GAT	2	6	1186911	1186916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641130
19553	NC_002505	CT	3	6	1186941	1186946	0 %	50 %	0 %	50 %	15641130
19554	NC_002505	ATG	2	6	1186957	1186962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641130
19555	NC_002505	CACC	2	8	1186966	1186973	25 %	0 %	0 %	75 %	15641130
19556	NC_002505	GCA	2	6	1186990	1186995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641130
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19559	NC_002505	ATC	2	6	1187302	1187307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641131
19560	NC_002505	CATCG	2	10	1187334	1187343	20 %	20 %	20 %	40 %	15641131
19561	NC_002505	T	6	6	1187369	1187374	0 %	100 %	0 %	0 %	15641131
19562	NC_002505	ATT	2	6	1187560	1187565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641131
19563	NC_002505	CG	3	6	1187619	1187624	0 %	0 %	50 %	50 %	15641131
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19567	NC_002505	CGA	2	6	1187899	1187904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641132
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19569	NC_002505	GT	3	6	1187934	1187939	0 %	50 %	50 %	0 %	15641132
19570	NC_002505	GCG	2	6	1187963	1187968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641132
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19577	NC_002505	GT	3	6	1188261	1188266	0 %	50 %	50 %	0 %	15641132
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19583	NC_002505	ATG	2	6	1188649	1188654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641133
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19585	NC_002505	GCGT	2	8	1188777	1188784	0 %	25 %	50 %	25 %	15641133
19586	NC_002505	GCG	2	6	1188882	1188887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641133
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19588	NC_002505	CG	3	6	1188938	1188943	0 %	0 %	50 %	50 %	15641133
19589	NC_002505	CGG	2	6	1189004	1189009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641133
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19601	NC_002505	A	6	6	1189512	1189517	100 %	0 %	0 %	0 %	15641133
19602	NC_002505	GTT	2	6	1189695	1189700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641134
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19613	NC_002505	GCA	2	6	1190143	1190148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641134
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19615	NC_002505	CG	3	6	1190222	1190227	0 %	0 %	50 %	50 %	15641134
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19617	NC_002505	GTA	2	6	1190253	1190258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641134
19618	NC_002505	GCAA	2	8	1190306	1190313	50 %	0 %	25 %	25 %	15641134
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19972	NC_002505	CAG	2	6	1209148	1209153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237061
19973	NC_002505	T	8	8	1209195	1209202	0 %	100 %	0 %	0 %	471237061
19974	NC_002505	TGG	2	6	1209236	1209241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237061
19975	NC_002505	GAA	2	6	1209294	1209299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237061
19976	NC_002505	GAG	2	6	1209300	1209305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471237061
19977	NC_002505	ATT	2	6	1209663	1209668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641154
19978	NC_002505	TGA	2	6	1209680	1209685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641154
19979	NC_002505	ATT	2	6	1209720	1209725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641154
19980	NC_002505	TCA	2	6	1209741	1209746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641154
19981	NC_002505	GAA	2	6	1209819	1209824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641154
19982	NC_002505	CAT	2	6	1209884	1209889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641154
19983	NC_002505	CTCAA	2	10	1209919	1209928	40 %	20 %	0 %	40 %	15641154
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19986	NC_002505	GAA	3	9	1209999	1210007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641154
19987	NC_002505	TTC	2	6	1210188	1210193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641154
19988	NC_002505	GCG	2	6	1210219	1210224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641154
19989	NC_002505	ATC	2	6	1210308	1210313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641154
19990	NC_002505	TGA	2	6	1210324	1210329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641154
19991	NC_002505	A	6	6	1210332	1210337	100 %	0 %	0 %	0 %	15641154
19992	NC_002505	CTT	2	6	1210349	1210354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641154
19993	NC_002505	ATG	2	6	1210419	1210424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641154
19994	NC_002505	TAC	2	6	1210467	1210472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641154
19995	NC_002505	TAA	2	6	1210526	1210531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15641154
19996	NC_002505	GCG	2	6	1210596	1210601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641154
19997	NC_002505	TGG	2	6	1210639	1210644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641154
19998	NC_002505	TTG	2	6	1210690	1210695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641154
19999	NC_002505	CGA	2	6	1210771	1210776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641154
20000	NC_002505	GCT	2	6	1210786	1210791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641154

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