MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_002505	ACA	2	6	1153802	1153807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641099
19003	NC_002505	CT	3	6	1153821	1153826	0 %	50 %	0 %	50 %	15641099
19004	NC_002505	GAT	2	6	1153920	1153925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641099
19005	NC_002505	TG	3	6	1153957	1153962	0 %	50 %	50 %	0 %	15641099
19006	NC_002505	GAT	2	6	1154048	1154053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641099
19007	NC_002505	TTAG	2	8	1154160	1154167	25 %	50 %	25 %	0 %	15641099
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19009	NC_002505	A	6	6	1154224	1154229	100 %	0 %	0 %	0 %	15641099
19010	NC_002505	TGA	3	9	1154289	1154297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641100
19011	NC_002505	GT	3	6	1154324	1154329	0 %	50 %	50 %	0 %	15641100
19012	NC_002505	GGAT	2	8	1154333	1154340	25 %	25 %	50 %	0 %	15641100
19013	NC_002505	CAT	3	9	1154406	1154414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641100
19014	NC_002505	GATG	2	8	1154436	1154443	25 %	25 %	50 %	0 %	15641100
19015	NC_002505	TGC	2	6	1154495	1154500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641100
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19017	NC_002505	GCC	2	6	1154614	1154619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641100
19018	NC_002505	GAA	2	6	1154668	1154673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641100
19019	NC_002505	AG	3	6	1154787	1154792	50 %	0 %	50 %	0 %	15641100
19020	NC_002505	CTTG	2	8	1154811	1154818	0 %	50 %	25 %	25 %	15641100
19021	NC_002505	GCCA	2	8	1154965	1154972	25 %	0 %	25 %	50 %	15641100
19022	NC_002505	TTTA	2	8	1154975	1154982	25 %	75 %	0 %	0 %	15641100
19023	NC_002505	TCA	2	6	1155153	1155158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641100
19024	NC_002505	ATG	2	6	1155170	1155175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641100
19025	NC_002505	GTG	2	6	1155200	1155205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641100
19026	NC_002505	GTC	2	6	1155238	1155243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641100
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19028	NC_002505	CAG	2	6	1155322	1155327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641100
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19031	NC_002505	ATCT	2	8	1155463	1155470	25 %	50 %	0 %	25 %	15641100
19032	NC_002505	TGAG	2	8	1155509	1155516	25 %	25 %	50 %	0 %	15641100
19033	NC_002505	TTA	2	6	1155520	1155525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641100
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19037	NC_002505	TGC	2	6	1155709	1155714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641101
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19044	NC_002505	TTTGG	2	10	1156202	1156211	0 %	60 %	40 %	0 %	15641101
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19055	NC_002505	CAT	2	6	1157000	1157005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641101
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19058	NC_002505	CAT	2	6	1157110	1157115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641101
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19092	NC_002505	GTGG	2	8	1159323	1159330	0 %	25 %	75 %	0 %	15641104
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19119	NC_002505	CAT	2	6	1160827	1160832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641105
19120	NC_002505	GTG	2	6	1160852	1160857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641105
19121	NC_002505	TCGT	2	8	1160864	1160871	0 %	50 %	25 %	25 %	15641105
19122	NC_002505	AT	4	8	1160888	1160895	50 %	50 %	0 %	0 %	15641105
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19233	NC_002505	CAG	2	6	1167341	1167346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641110
19234	NC_002505	TCT	2	6	1167355	1167360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641110
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19236	NC_002505	GTCAG	2	10	1167444	1167453	20 %	20 %	40 %	20 %	15641110
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19239	NC_002505	GC	3	6	1167525	1167530	0 %	0 %	50 %	50 %	15641110
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19342	NC_002505	GGC	2	6	1175436	1175441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641118
19343	NC_002505	GC	3	6	1175483	1175488	0 %	0 %	50 %	50 %	15641118
19344	NC_002505	CAAT	2	8	1175570	1175577	50 %	25 %	0 %	25 %	15641118
19345	NC_002505	GC	3	6	1175655	1175660	0 %	0 %	50 %	50 %	15641118
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19350	NC_002505	CGGA	2	8	1175981	1175988	25 %	0 %	50 %	25 %	15641118
19351	NC_002505	GCA	3	9	1176041	1176049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641118
19352	NC_002505	TGA	2	6	1176167	1176172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641118
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19354	NC_002505	GATC	2	8	1176344	1176351	25 %	25 %	25 %	25 %	15641119
19355	NC_002505	GTG	2	6	1176396	1176401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641119
19356	NC_002505	CGC	2	6	1176404	1176409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641119
19357	NC_002505	TTA	2	6	1176480	1176485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15641119
19358	NC_002505	GCT	2	6	1176521	1176526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641119
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19456	NC_002505	GCT	2	6	1182279	1182284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641125
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19461	NC_002505	CAT	2	6	1182435	1182440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641125
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19463	NC_002505	CGTG	2	8	1182483	1182490	0 %	25 %	50 %	25 %	15641125
19464	NC_002505	G	6	6	1182513	1182518	0 %	0 %	100 %	0 %	15641125
19465	NC_002505	GAT	2	6	1182652	1182657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641125
19466	NC_002505	GC	3	6	1182694	1182699	0 %	0 %	50 %	50 %	15641125
19467	NC_002505	ATG	2	6	1182703	1182708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641125
19468	NC_002505	ATGA	2	8	1182748	1182755	50 %	25 %	25 %	0 %	15641125
19469	NC_002505	CTG	2	6	1182814	1182819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641125
19470	NC_002505	ACC	2	6	1182820	1182825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641125
19471	NC_002505	TGC	2	6	1182851	1182856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641125
19472	NC_002505	GTT	2	6	1182924	1182929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641125
19473	NC_002505	CG	3	6	1182954	1182959	0 %	0 %	50 %	50 %	15641125
19474	NC_002505	ATTT	2	8	1182974	1182981	25 %	75 %	0 %	0 %	15641125
19475	NC_002505	ATG	2	6	1183149	1183154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641126
19476	NC_002505	GC	3	6	1183187	1183192	0 %	0 %	50 %	50 %	15641126
19477	NC_002505	GCAG	2	8	1183199	1183206	25 %	0 %	50 %	25 %	15641126
19478	NC_002505	CGAG	2	8	1183285	1183292	25 %	0 %	50 %	25 %	15641126
19479	NC_002505	CTG	2	6	1183331	1183336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641126
19480	NC_002505	TGC	3	9	1183362	1183370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641126
19481	NC_002505	CCT	2	6	1183389	1183394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15641126
19482	NC_002505	CCA	2	6	1183422	1183427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641126
19483	NC_002505	GAGCA	2	10	1183478	1183487	40 %	0 %	40 %	20 %	15641126
19484	NC_002505	GTG	2	6	1183496	1183501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641126
19485	NC_002505	ATGG	2	8	1183520	1183527	25 %	25 %	50 %	0 %	15641126
19486	NC_002505	GC	3	6	1183570	1183575	0 %	0 %	50 %	50 %	15641126
19487	NC_002505	TGG	2	6	1183584	1183589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641126
19488	NC_002505	ATG	2	6	1183590	1183595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641126
19489	NC_002505	GCG	2	6	1183706	1183711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641126
19490	NC_002505	TG	3	6	1183716	1183721	0 %	50 %	50 %	0 %	15641126
19491	NC_002505	CCA	2	6	1183759	1183764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641126
19492	NC_002505	TGC	2	6	1183813	1183818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641126
19493	NC_002505	GAT	2	6	1183822	1183827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641126
19494	NC_002505	AGTC	2	8	1183832	1183839	25 %	25 %	25 %	25 %	15641126
19495	NC_002505	GCT	2	6	1183864	1183869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641126
19496	NC_002505	TGA	2	6	1183879	1183884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641126
19497	NC_002505	GTT	2	6	1183939	1183944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641126
19498	NC_002505	AGC	2	6	1183986	1183991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641126
19499	NC_002505	ACC	2	6	1184017	1184022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641126
19500	NC_002505	CGG	2	6	1184064	1184069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641126

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