MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_002505	AGC	2	6	1094991	1094996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641039
18003	NC_002505	CGG	2	6	1095058	1095063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641039
18004	NC_002505	GGC	2	6	1095071	1095076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641039
18005	NC_002505	T	6	6	1095200	1095205	0 %	100 %	0 %	0 %	15641040
18006	NC_002505	TGG	2	6	1095222	1095227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641040
18007	NC_002505	TGG	2	6	1095240	1095245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641040
18008	NC_002505	GCA	2	6	1095292	1095297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641040
18009	NC_002505	GGC	2	6	1095340	1095345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641040
18010	NC_002505	AATC	2	8	1095350	1095357	50 %	25 %	0 %	25 %	15641040
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18013	NC_002505	CGCGTT	2	12	1095660	1095671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641041
18014	NC_002505	CATCG	2	10	1095675	1095684	20 %	20 %	20 %	40 %	15641041
18015	NC_002505	GCG	2	6	1095697	1095702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641041
18016	NC_002505	GTTG	2	8	1095713	1095720	0 %	50 %	50 %	0 %	15641041
18017	NC_002505	CAG	2	6	1095725	1095730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641041
18018	NC_002505	TGC	2	6	1095743	1095748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641041
18019	NC_002505	TCA	2	6	1095766	1095771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641041
18020	NC_002505	CG	3	6	1095789	1095794	0 %	0 %	50 %	50 %	15641041
18021	NC_002505	A	6	6	1095804	1095809	100 %	0 %	0 %	0 %	15641041
18022	NC_002505	GAC	2	6	1095815	1095820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641041
18023	NC_002505	GATT	2	8	1095836	1095843	25 %	50 %	25 %	0 %	15641041
18024	NC_002505	ATC	2	6	1095856	1095861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641041
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18032	NC_002505	CGT	2	6	1096276	1096281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641042
18033	NC_002505	ATC	2	6	1096308	1096313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641042
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18035	NC_002505	GCT	2	6	1096322	1096327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641042
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18053	NC_002505	TGAT	2	8	1097220	1097227	25 %	50 %	25 %	0 %	15641044
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18059	NC_002505	GTGA	2	8	1097423	1097430	25 %	25 %	50 %	0 %	15641044
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18117	NC_002505	CCA	2	6	1101273	1101278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641048
18118	NC_002505	TGG	2	6	1101312	1101317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641048
18119	NC_002505	CT	3	6	1101353	1101358	0 %	50 %	0 %	50 %	15641048
18120	NC_002505	CTG	2	6	1101371	1101376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641048
18121	NC_002505	TCA	2	6	1101524	1101529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641048
18122	NC_002505	TTG	2	6	1101574	1101579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641048
18123	NC_002505	TCA	2	6	1101596	1101601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641048
18124	NC_002505	TTC	2	6	1101607	1101612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641048
18125	NC_002505	CAAGC	2	10	1101627	1101636	40 %	0 %	20 %	40 %	15641048
18126	NC_002505	CAC	2	6	1101640	1101645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641048
18127	NC_002505	ATC	2	6	1101646	1101651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641048
18128	NC_002505	T	6	6	1101698	1101703	0 %	100 %	0 %	0 %	15641048
18129	NC_002505	AGG	2	6	1101765	1101770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15641048
18130	NC_002505	TGT	2	6	1101774	1101779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641048
18131	NC_002505	TTG	2	6	1101871	1101876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641048
18132	NC_002505	TGA	2	6	1101887	1101892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641048
18133	NC_002505	GGC	2	6	1101909	1101914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641048
18134	NC_002505	CAG	2	6	1101943	1101948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641048
18135	NC_002505	TGT	2	6	1101962	1101967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641048
18136	NC_002505	GA	3	6	1101984	1101989	50 %	0 %	50 %	0 %	15641048
18137	NC_002505	GTGTTG	2	12	1102058	1102069	0 %	50 %	50 %	0 %	15641048
18138	NC_002505	A	6	6	1102124	1102129	100 %	0 %	0 %	0 %	15641048
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18141	NC_002505	TCT	2	6	1102511	1102516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161582014
18142	NC_002505	AGA	2	6	1102542	1102547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161582014
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18145	NC_002505	AAGA	2	8	1102617	1102624	75 %	0 %	25 %	0 %	161582014
18146	NC_002505	ATC	2	6	1102657	1102662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582014
18147	NC_002505	CCG	2	6	1102674	1102679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161582014
18148	NC_002505	CTG	2	6	1102731	1102736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582014
18149	NC_002505	GCC	2	6	1102751	1102756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161582014
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18152	NC_002505	TGA	2	6	1103202	1103207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582014
18153	NC_002505	CAC	2	6	1103245	1103250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161582014
18154	NC_002505	ATC	2	6	1103296	1103301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582014
18155	NC_002505	GTA	3	9	1103326	1103334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582014
18156	NC_002505	TGAA	2	8	1103607	1103614	50 %	25 %	25 %	0 %	161582014
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18158	NC_002505	CTG	2	6	1103716	1103721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582014
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18170	NC_002505	GCTG	2	8	1104594	1104601	0 %	25 %	50 %	25 %	15641050
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18172	NC_002505	CTG	2	6	1104713	1104718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641050
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18185	NC_002505	GCG	2	6	1105380	1105385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641050
18186	NC_002505	CTG	2	6	1105448	1105453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641050
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18189	NC_002505	GGCAA	2	10	1105587	1105596	40 %	0 %	40 %	20 %	15641050
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18193	NC_002505	GCTTCT	2	12	1105855	1105866	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15641051
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18199	NC_002505	CTGA	2	8	1106176	1106183	25 %	25 %	25 %	25 %	15641051
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18202	NC_002505	CAT	2	6	1106373	1106378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641051
18203	NC_002505	GTG	2	6	1106387	1106392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641051
18204	NC_002505	TCT	2	6	1106572	1106577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641052
18205	NC_002505	TTG	2	6	1106595	1106600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641052
18206	NC_002505	CTG	2	6	1106606	1106611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641052
18207	NC_002505	GTT	2	6	1106620	1106625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641052
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18210	NC_002505	TGGC	2	8	1106710	1106717	0 %	25 %	50 %	25 %	15641052
18211	NC_002505	AGCC	2	8	1107012	1107019	25 %	0 %	25 %	50 %	15641052
18212	NC_002505	GCG	2	6	1107020	1107025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15641052
18213	NC_002505	A	6	6	1107083	1107088	100 %	0 %	0 %	0 %	15641052
18214	NC_002505	CAG	2	6	1107191	1107196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641052
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18218	NC_002505	AAGTT	2	10	1107515	1107524	40 %	40 %	20 %	0 %	15641052
18219	NC_002505	TGC	2	6	1107570	1107575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641052
18220	NC_002505	CAA	2	6	1107577	1107582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641052
18221	NC_002505	CTT	2	6	1107688	1107693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15641052
18222	NC_002505	GCCA	2	8	1107724	1107731	25 %	0 %	25 %	50 %	15641052
18223	NC_002505	CAG	2	6	1107777	1107782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641052
18224	NC_002505	CGTGG	2	10	1107902	1107911	0 %	20 %	60 %	20 %	15641052
18225	NC_002505	GC	3	6	1107963	1107968	0 %	0 %	50 %	50 %	15641052
18226	NC_002505	GAA	2	6	1108006	1108011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641052
18227	NC_002505	AAC	2	6	1108058	1108063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641052
18228	NC_002505	GAA	2	6	1108247	1108252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15641052
18229	NC_002505	GAC	3	9	1108288	1108296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641052
18230	NC_002505	TTG	2	6	1108352	1108357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641052
18231	NC_002505	TTG	2	6	1108425	1108430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641052
18232	NC_002505	TGA	2	6	1108537	1108542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641052
18233	NC_002505	CAAA	2	8	1108549	1108556	75 %	0 %	0 %	25 %	15641052
18234	NC_002505	AAGA	2	8	1108562	1108569	75 %	0 %	25 %	0 %	15641052
18235	NC_002505	A	6	6	1108622	1108627	100 %	0 %	0 %	0 %	15641052
18236	NC_002505	GTT	2	6	1108639	1108644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641052
18237	NC_002505	TCAA	2	8	1108820	1108827	50 %	25 %	0 %	25 %	15641053
18238	NC_002505	GCGCC	2	10	1108838	1108847	0 %	0 %	40 %	60 %	15641053
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18254	NC_002505	AGCTG	2	10	1109698	1109707	20 %	20 %	40 %	20 %	15641054
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18268	NC_002505	AT	3	6	1110578	1110583	50 %	50 %	0 %	0 %	15641055
18269	NC_002505	GTT	2	6	1110616	1110621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15641055
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18271	NC_002505	CAC	3	9	1110696	1110704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641055
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18274	NC_002505	TAGT	2	8	1110827	1110834	25 %	50 %	25 %	0 %	15641055
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18346	NC_002505	CT	3	6	1115368	1115373	0 %	50 %	0 %	50 %	471237058
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18349	NC_002505	TC	3	6	1115471	1115476	0 %	50 %	0 %	50 %	471237058
18350	NC_002505	TGA	2	6	1115558	1115563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237058
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18352	NC_002505	TGGATA	2	12	1115594	1115605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237058
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18461	NC_002505	GCA	2	6	1121719	1121724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641065
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18464	NC_002505	CAA	2	6	1121967	1121972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15641065
18465	NC_002505	A	6	6	1122176	1122181	100 %	0 %	0 %	0 %	15641066
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18469	NC_002505	GGT	2	6	1122503	1122508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641066
18470	NC_002505	TGG	2	6	1122592	1122597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15641066
18471	NC_002505	ACC	2	6	1122833	1122838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15641067
18472	NC_002505	GTTT	2	8	1122846	1122853	0 %	75 %	25 %	0 %	15641067
18473	NC_002505	CG	3	6	1122990	1122995	0 %	0 %	50 %	50 %	15641067
18474	NC_002505	GCC	2	6	1123114	1123119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15641067
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18478	NC_002505	GGAT	2	8	1123513	1123520	25 %	25 %	50 %	0 %	15641067
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18480	NC_002505	TAC	2	6	1123658	1123663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15641067
18481	NC_002505	TGC	2	6	1123734	1123739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15641067
18482	NC_002505	ATG	2	6	1123742	1123747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15641067
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18492	NC_002505	AG	3	6	1124187	1124192	50 %	0 %	50 %	0 %	15641067
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18499	NC_002505	CAG	2	6	1124648	1124653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15641067
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