MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_002505	GCA	3	9	850905	850913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642772
14002	NC_002505	GATCT	2	10	851038	851047	20 %	40 %	20 %	20 %	15642772
14003	NC_002505	TGC	2	6	851051	851056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642772
14004	NC_002505	GCA	2	6	851064	851069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642772
14005	NC_002505	GTC	2	6	851071	851076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642772
14006	NC_002505	TGT	2	6	851195	851200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640812
14007	NC_002505	TTG	2	6	851276	851281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640812
14008	NC_002505	T	6	6	851290	851295	0 %	100 %	0 %	0 %	15640812
14009	NC_002505	TGG	2	6	851298	851303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640812
14010	NC_002505	TGGC	2	8	851307	851314	0 %	25 %	50 %	25 %	15640812
14011	NC_002505	CGG	2	6	851320	851325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640812
14012	NC_002505	CAAT	2	8	851337	851344	50 %	25 %	0 %	25 %	15640812
14013	NC_002505	GA	3	6	851490	851495	50 %	0 %	50 %	0 %	15640812
14014	NC_002505	A	7	7	851495	851501	100 %	0 %	0 %	0 %	15640812
14015	NC_002505	GC	3	6	851503	851508	0 %	0 %	50 %	50 %	15640812
14016	NC_002505	GC	3	6	851512	851517	0 %	0 %	50 %	50 %	15640812
14017	NC_002505	AAT	2	6	851520	851525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640812
14018	NC_002505	AAAC	2	8	851551	851558	75 %	0 %	0 %	25 %	15640812
14019	NC_002505	ACG	2	6	851568	851573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640812
14020	NC_002505	GCC	2	6	851594	851599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640812
14021	NC_002505	AG	3	6	851627	851632	50 %	0 %	50 %	0 %	15640813
14022	NC_002505	GGC	2	6	851651	851656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640813
14023	NC_002505	GCC	2	6	851678	851683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640813
14024	NC_002505	CATA	2	8	851693	851700	50 %	25 %	0 %	25 %	15640813
14025	NC_002505	CTG	2	6	851704	851709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640813
14026	NC_002505	AGC	2	6	851756	851761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640813
14027	NC_002505	TGA	2	6	851824	851829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640813
14028	NC_002505	GAA	2	6	851894	851899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640813
14029	NC_002505	CTT	2	6	851920	851925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640813
14030	NC_002505	TCA	2	6	851931	851936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640813
14031	NC_002505	CGC	2	6	851948	851953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640813
14032	NC_002505	GAT	2	6	851966	851971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640813
14033	NC_002505	CAC	2	6	851972	851977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640813
14034	NC_002505	AC	3	6	852055	852060	50 %	0 %	0 %	50 %	15640813
14035	NC_002505	CTT	2	6	852118	852123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640813
14036	NC_002505	ATG	2	6	852192	852197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640813
14037	NC_002505	TGA	2	6	852199	852204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640813
14038	NC_002505	CGA	2	6	852214	852219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640813
14039	NC_002505	AGT	2	6	852262	852267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640813
14040	NC_002505	ACC	2	6	852335	852340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640813
14041	NC_002505	CAT	2	6	852365	852370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640813
14042	NC_002505	GCA	2	6	852423	852428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640813
14043	NC_002505	AGCC	2	8	852460	852467	25 %	0 %	25 %	50 %	15640813
14044	NC_002505	AG	3	6	852468	852473	50 %	0 %	50 %	0 %	15640813
14045	NC_002505	CAG	2	6	852479	852484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640813
14046	NC_002505	AGCC	2	8	852594	852601	25 %	0 %	25 %	50 %	15640813
14047	NC_002505	CCA	2	6	852622	852627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640813
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14049	NC_002505	TATT	2	8	852657	852664	25 %	75 %	0 %	0 %	15640813
14050	NC_002505	ACC	2	6	852728	852733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640813
14051	NC_002505	TAAAAA	2	12	852788	852799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15640813
14052	NC_002505	GAGTG	2	10	852806	852815	20 %	20 %	60 %	0 %	15640813
14053	NC_002505	TGG	2	6	853173	853178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640814
14054	NC_002505	TGG	2	6	853290	853295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640814
14055	NC_002505	ATC	2	6	853313	853318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640814
14056	NC_002505	TGA	2	6	853401	853406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640814
14057	NC_002505	AGCC	2	8	853464	853471	25 %	0 %	25 %	50 %	15640814
14058	NC_002505	ATTT	2	8	853479	853486	25 %	75 %	0 %	0 %	15640814
14059	NC_002505	T	6	6	853498	853503	0 %	100 %	0 %	0 %	15640814
14060	NC_002505	TTA	2	6	853535	853540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640814
14061	NC_002505	TTA	2	6	853586	853591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640814
14062	NC_002505	TGA	2	6	853623	853628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640814
14063	NC_002505	TCA	2	6	853651	853656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640814
14064	NC_002505	ATTT	2	8	853698	853705	25 %	75 %	0 %	0 %	15640814
14065	NC_002505	GTA	2	6	853767	853772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640814
14066	NC_002505	ATTC	2	8	853793	853800	25 %	50 %	0 %	25 %	15640814
14067	NC_002505	ATTAT	2	10	853809	853818	40 %	60 %	0 %	0 %	15640814
14068	NC_002505	CG	4	8	853821	853828	0 %	0 %	50 %	50 %	15640814
14069	NC_002505	TTATT	2	10	853840	853849	20 %	80 %	0 %	0 %	15640814
14070	NC_002505	TCAA	2	8	853866	853873	50 %	25 %	0 %	25 %	15640814
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14074	NC_002505	TGC	2	6	854125	854130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640814
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14078	NC_002505	CGATG	2	10	854437	854446	20 %	20 %	40 %	20 %	15640815
14079	NC_002505	TG	3	6	854495	854500	0 %	50 %	50 %	0 %	15640815
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14089	NC_002505	CG	3	6	854824	854829	0 %	0 %	50 %	50 %	15640816
14090	NC_002505	GTG	2	6	854838	854843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640816
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14093	NC_002505	CAA	2	6	854975	854980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640816
14094	NC_002505	CGC	2	6	855006	855011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640816
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14105	NC_002505	GC	4	8	855532	855539	0 %	0 %	50 %	50 %	471237052
14106	NC_002505	CGC	2	6	855545	855550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471237052
14107	NC_002505	A	7	7	855571	855577	100 %	0 %	0 %	0 %	471237052
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14109	NC_002505	GGC	2	6	855667	855672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237052
14110	NC_002505	TTGA	2	8	855769	855776	25 %	50 %	25 %	0 %	471237052
14111	NC_002505	TGA	2	6	855861	855866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237052
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14120	NC_002505	GC	3	6	856306	856311	0 %	0 %	50 %	50 %	471237052
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14122	NC_002505	TGC	2	6	856328	856333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237052
14123	NC_002505	CTT	2	6	856349	856354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237052
14124	NC_002505	GGT	2	6	856363	856368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237052
14125	NC_002505	TGAT	2	8	856406	856413	25 %	50 %	25 %	0 %	471237052
14126	NC_002505	GGC	2	6	856446	856451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237052
14127	NC_002505	GC	3	6	856462	856467	0 %	0 %	50 %	50 %	471237052
14128	NC_002505	CAT	2	6	856474	856479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237052
14129	NC_002505	GCG	2	6	856525	856530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237052
14130	NC_002505	TAACGT	2	12	856584	856595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	471237052
14131	NC_002505	CGG	2	6	856632	856637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237052
14132	NC_002505	CGG	2	6	856649	856654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237052
14133	NC_002505	ATT	2	6	856672	856677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471237052
14134	NC_002505	TCA	2	6	856733	856738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237052
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14140	NC_002505	GCCA	2	8	857136	857143	25 %	0 %	25 %	50 %	15640818
14141	NC_002505	GATG	2	8	857150	857157	25 %	25 %	50 %	0 %	15640818
14142	NC_002505	GGC	2	6	857200	857205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640818
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14145	NC_002505	CCGGA	2	10	857236	857245	20 %	0 %	40 %	40 %	15640818
14146	NC_002505	A	6	6	857286	857291	100 %	0 %	0 %	0 %	15640818
14147	NC_002505	ATG	2	6	857295	857300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640818
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14149	NC_002505	CTGC	2	8	857405	857412	0 %	25 %	25 %	50 %	15640818
14150	NC_002505	TG	3	6	857413	857418	0 %	50 %	50 %	0 %	15640818
14151	NC_002505	GCTC	2	8	857439	857446	0 %	25 %	25 %	50 %	15640818
14152	NC_002505	CGG	2	6	857448	857453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640818
14153	NC_002505	GAG	2	6	857484	857489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640818
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14155	NC_002505	CTG	2	6	857521	857526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640818
14156	NC_002505	CCATG	2	10	857607	857616	20 %	20 %	20 %	40 %	15640819
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14160	NC_002505	CA	3	6	857844	857849	50 %	0 %	0 %	50 %	15640819
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14163	NC_002505	GCA	2	6	857943	857948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640819
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14193	NC_002505	GCG	2	6	860256	860261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640822
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14196	NC_002505	CA	4	8	860393	860400	50 %	0 %	0 %	50 %	15640822
14197	NC_002505	CA	3	6	860480	860485	50 %	0 %	0 %	50 %	15640822
14198	NC_002505	GAC	2	6	860519	860524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640822
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14200	NC_002505	TGC	2	6	860845	860850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640824
14201	NC_002505	CT	3	6	860879	860884	0 %	50 %	0 %	50 %	15640824
14202	NC_002505	A	7	7	860918	860924	100 %	0 %	0 %	0 %	15640824
14203	NC_002505	ACCT	2	8	861060	861067	25 %	25 %	0 %	50 %	15640824
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14209	NC_002505	ATC	2	6	861434	861439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640824
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14216	NC_002505	TGAT	2	8	861669	861676	25 %	50 %	25 %	0 %	15640824
14217	NC_002505	GTG	2	6	861797	861802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640824
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14222	NC_002505	TCAAA	2	10	862162	862171	60 %	20 %	0 %	20 %	15640824
14223	NC_002505	GCGG	2	8	862307	862314	0 %	0 %	75 %	25 %	15640824
14224	NC_002505	CAG	2	6	862323	862328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640824
14225	NC_002505	ATG	2	6	862370	862375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640824
14226	NC_002505	GC	3	6	862535	862540	0 %	0 %	50 %	50 %	15640825
14227	NC_002505	CAT	2	6	862542	862547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640825
14228	NC_002505	A	6	6	862683	862688	100 %	0 %	0 %	0 %	15640825
14229	NC_002505	CTT	2	6	862740	862745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640825
14230	NC_002505	AGC	2	6	862801	862806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640825
14231	NC_002505	ACC	2	6	862843	862848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640825
14232	NC_002505	CGC	2	6	862875	862880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640825
14233	NC_002505	TA	3	6	862893	862898	50 %	50 %	0 %	0 %	15640825
14234	NC_002505	GCA	2	6	862913	862918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640825
14235	NC_002505	CAG	2	6	863010	863015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640825
14236	NC_002505	CCA	2	6	863033	863038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640825
14237	NC_002505	CAC	2	6	863088	863093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640825
14238	NC_002505	TTGG	2	8	863133	863140	0 %	50 %	50 %	0 %	15640825
14239	NC_002505	ACAA	2	8	863148	863155	75 %	0 %	0 %	25 %	15640825
14240	NC_002505	GGC	2	6	863215	863220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640826
14241	NC_002505	AAC	2	6	863346	863351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640827
14242	NC_002505	CTC	2	6	863381	863386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640827
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14244	NC_002505	GCG	2	6	863583	863588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640827
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