MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_002505	AGC	2	6	672337	672342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640651
11003	NC_002505	GAT	2	6	672422	672427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640651
11004	NC_002505	TGA	2	6	672470	672475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640651
11005	NC_002505	ACA	2	6	672490	672495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640651
11006	NC_002505	TGA	2	6	672661	672666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640651
11007	NC_002505	CTG	2	6	672672	672677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640651
11008	NC_002505	GAA	2	6	672695	672700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640651
11009	NC_002505	TGA	2	6	672779	672784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640651
11010	NC_002505	CTA	2	6	672797	672802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640651
11011	NC_002505	GCT	2	6	672806	672811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640651
11012	NC_002505	CT	3	6	672810	672815	0 %	50 %	0 %	50 %	15640651
11013	NC_002505	TCCG	2	8	672817	672824	0 %	25 %	25 %	50 %	15640651
11014	NC_002505	AGA	2	6	672827	672832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640651
11015	NC_002505	ATC	2	6	672906	672911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640651
11016	NC_002505	GCA	2	6	672942	672947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640651
11017	NC_002505	TCA	2	6	672958	672963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640651
11018	NC_002505	AGA	2	6	673127	673132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640651
11019	NC_002505	CGG	2	6	673351	673356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640652
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11021	NC_002505	GCG	2	6	673515	673520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640652
11022	NC_002505	GCA	2	6	673569	673574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640652
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11024	NC_002505	TCT	2	6	673691	673696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640652
11025	NC_002505	A	6	6	673719	673724	100 %	0 %	0 %	0 %	15640652
11026	NC_002505	TGA	2	6	673868	673873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640652
11027	NC_002505	GCTG	2	8	673944	673951	0 %	25 %	50 %	25 %	15640652
11028	NC_002505	CA	3	6	674088	674093	50 %	0 %	0 %	50 %	15640652
11029	NC_002505	CT	3	6	674099	674104	0 %	50 %	0 %	50 %	15640652
11030	NC_002505	CG	3	6	674172	674177	0 %	0 %	50 %	50 %	15640652
11031	NC_002505	CTGG	2	8	674240	674247	0 %	25 %	50 %	25 %	15640652
11032	NC_002505	TAT	2	6	674316	674321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640652
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11034	NC_002505	GCG	2	6	674495	674500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640652
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11036	NC_002505	G	6	6	674530	674535	0 %	0 %	100 %	0 %	15640652
11037	NC_002505	CTG	2	6	674569	674574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640652
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11045	NC_002505	TTG	2	6	674997	675002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640653
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11052	NC_002505	TGT	2	6	675373	675378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640653
11053	NC_002505	T	6	6	675400	675405	0 %	100 %	0 %	0 %	15640653
11054	NC_002505	TGT	2	6	675541	675546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640653
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11069	NC_002505	TGC	2	6	677220	677225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640655
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11078	NC_002505	TCGA	2	8	677696	677703	25 %	25 %	25 %	25 %	15640656
11079	NC_002505	CCAG	2	8	677706	677713	25 %	0 %	25 %	50 %	15640656
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11107	NC_002505	CAAC	2	8	678996	679003	50 %	0 %	0 %	50 %	15640657
11108	NC_002505	TGC	2	6	679029	679034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640657
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11243	NC_002505	GGT	2	6	686618	686623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640663
11244	NC_002505	GCG	2	6	686699	686704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640663
11245	NC_002505	GTG	2	6	686724	686729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640663
11246	NC_002505	GTA	2	6	686747	686752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640663
11247	NC_002505	GTT	2	6	686756	686761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640663
11248	NC_002505	GCG	2	6	686816	686821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640663
11249	NC_002505	TTG	2	6	686835	686840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640663
11250	NC_002505	AACTG	2	10	686887	686896	40 %	20 %	20 %	20 %	15640663
11251	NC_002505	ACA	2	6	686934	686939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640663
11252	NC_002505	TGTT	2	8	686940	686947	0 %	75 %	25 %	0 %	15640663
11253	NC_002505	CTG	2	6	686999	687004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640663
11254	NC_002505	TG	3	6	687147	687152	0 %	50 %	50 %	0 %	15640663
11255	NC_002505	TGA	2	6	687184	687189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640663
11256	NC_002505	GAA	2	6	687206	687211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640663
11257	NC_002505	GTCT	2	8	687243	687250	0 %	50 %	25 %	25 %	15640663
11258	NC_002505	TGA	2	6	687268	687273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640663
11259	NC_002505	GTA	2	6	687281	687286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640663
11260	NC_002505	TGA	2	6	687289	687294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640663
11261	NC_002505	GCTGA	2	10	687413	687422	20 %	20 %	40 %	20 %	15640663
11262	NC_002505	TCG	2	6	687513	687518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640663
11263	NC_002505	GGT	2	6	687530	687535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640663
11264	NC_002505	GGC	3	9	687559	687567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640663
11265	NC_002505	ACGT	2	8	687594	687601	25 %	25 %	25 %	25 %	15640663
11266	NC_002505	TAC	2	6	687653	687658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640663
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11268	NC_002505	ATC	2	6	687734	687739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640663
11269	NC_002505	GAA	2	6	687919	687924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640663
11270	NC_002505	ATG	2	6	687960	687965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640663
11271	NC_002505	ACT	2	6	688031	688036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640663
11272	NC_002505	GAT	2	6	688188	688193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582021
11273	NC_002505	GCA	2	6	688330	688335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582021
11274	NC_002505	ATG	2	6	688363	688368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582021
11275	NC_002505	CTA	2	6	688413	688418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582021
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11278	NC_002505	TCG	2	6	688532	688537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582021
11279	NC_002505	ACG	2	6	688600	688605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640665
11280	NC_002505	GC	3	6	688657	688662	0 %	0 %	50 %	50 %	15640665
11281	NC_002505	GCT	2	6	688844	688849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640665
11282	NC_002505	TCCA	2	8	688889	688896	25 %	25 %	0 %	50 %	15640665
11283	NC_002505	GTC	2	6	688921	688926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640665
11284	NC_002505	GC	3	6	688971	688976	0 %	0 %	50 %	50 %	15640665
11285	NC_002505	TGA	2	6	689018	689023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640665
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11294	NC_002505	ACC	2	6	689716	689721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640666
11295	NC_002505	CA	3	6	689740	689745	50 %	0 %	0 %	50 %	15640666
11296	NC_002505	CAC	2	6	689754	689759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640666
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11312	NC_002505	CTGA	2	8	690827	690834	25 %	25 %	25 %	25 %	15640667
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11317	NC_002505	GCT	2	6	690980	690985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640667
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11329	NC_002505	TGC	2	6	691474	691479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640667
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11332	NC_002505	GATG	2	8	691591	691598	25 %	25 %	50 %	0 %	15640667
11333	NC_002505	AGA	2	6	691651	691656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640667
11334	NC_002505	TCTG	2	8	691672	691679	0 %	50 %	25 %	25 %	15640667
11335	NC_002505	TGA	2	6	691690	691695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640667
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11338	NC_002505	GCGGT	2	10	691956	691965	0 %	20 %	60 %	20 %	15640667
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11344	NC_002505	CCG	2	6	692088	692093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640667
11345	NC_002505	TTC	2	6	692163	692168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640667
11346	NC_002505	TC	3	6	692193	692198	0 %	50 %	0 %	50 %	15640667
11347	NC_002505	CTGA	2	8	692237	692244	25 %	25 %	25 %	25 %	15640667
11348	NC_002505	AAG	2	6	692250	692255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640667
11349	NC_002505	AAG	2	6	692310	692315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640667
11350	NC_002505	TGC	2	6	692332	692337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640667
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11352	NC_002505	CAC	2	6	692352	692357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640667
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11354	NC_002505	CTG	2	6	692526	692531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640668
11355	NC_002505	GAAT	2	8	692549	692556	50 %	25 %	25 %	0 %	15640668
11356	NC_002505	CAA	2	6	692610	692615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640668
11357	NC_002505	ATT	2	6	692642	692647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640668
11358	NC_002505	ATT	2	6	692704	692709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640668
11359	NC_002505	GGCTC	2	10	692735	692744	0 %	20 %	40 %	40 %	15640668
11360	NC_002505	CGC	2	6	692834	692839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640668
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11362	NC_002505	CAT	2	6	693008	693013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640668
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11484	NC_002505	TTC	2	6	699969	699974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640674
11485	NC_002505	ACA	2	6	700049	700054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640674
11486	NC_002505	TTA	2	6	700141	700146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640674
11487	NC_002505	CTG	2	6	700169	700174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640674
11488	NC_002505	TGG	2	6	700181	700186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640675
11489	NC_002505	TGG	2	6	700277	700282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640675
11490	NC_002505	GAT	2	6	700288	700293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640675
11491	NC_002505	TTG	2	6	700304	700309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640675
11492	NC_002505	AGA	2	6	700386	700391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640675
11493	NC_002505	AAG	2	6	700427	700432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640675
11494	NC_002505	TG	3	6	700468	700473	0 %	50 %	50 %	0 %	15640675
11495	NC_002505	CTA	2	6	700491	700496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640675
11496	NC_002505	CG	3	6	700521	700526	0 %	0 %	50 %	50 %	15640675
11497	NC_002505	GTG	2	6	700573	700578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640675
11498	NC_002505	ATCCA	2	10	700651	700660	40 %	20 %	0 %	40 %	15640675
11499	NC_002505	TCT	2	6	700767	700772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640676
11500	NC_002505	CAA	2	6	700800	700805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640676

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