MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002505	CAT	2	6	616008	616013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640608
10002	NC_002505	GT	3	6	616070	616075	0 %	50 %	50 %	0 %	15640608
10003	NC_002505	GAT	2	6	616156	616161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640608
10004	NC_002505	GCT	2	6	616188	616193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640608
10005	NC_002505	GAT	2	6	616239	616244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640608
10006	NC_002505	CAGCA	2	10	616273	616282	40 %	0 %	20 %	40 %	15640608
10007	NC_002505	GAT	2	6	616302	616307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640608
10008	NC_002505	TGAT	2	8	616331	616338	25 %	50 %	25 %	0 %	15640608
10009	NC_002505	TTGGC	2	10	616346	616355	0 %	40 %	40 %	20 %	15640608
10010	NC_002505	A	6	6	616421	616426	100 %	0 %	0 %	0 %	15640608
10011	NC_002505	AAC	2	6	616939	616944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640610
10012	NC_002505	A	6	6	617001	617006	100 %	0 %	0 %	0 %	15640610
10013	NC_002505	CTG	2	6	617022	617027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640610
10014	NC_002505	ACC	2	6	617052	617057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640610
10015	NC_002505	CAT	2	6	617063	617068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640610
10016	NC_002505	GCA	2	6	617216	617221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640610
10017	NC_002505	GC	3	6	617261	617266	0 %	0 %	50 %	50 %	15640610
10018	NC_002505	CT	3	6	617325	617330	0 %	50 %	0 %	50 %	15640610
10019	NC_002505	GGC	2	6	617331	617336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640610
10020	NC_002505	TGA	2	6	617350	617355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640610
10021	NC_002505	CTG	2	6	617385	617390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640610
10022	NC_002505	TGA	2	6	617396	617401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640610
10023	NC_002505	CAC	2	6	617489	617494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640610
10024	NC_002505	GAA	2	6	617505	617510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640610
10025	NC_002505	CAT	2	6	617537	617542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640610
10026	NC_002505	ACC	2	6	617568	617573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640610
10027	NC_002505	CAG	2	6	617667	617672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640610
10028	NC_002505	TGG	2	6	617674	617679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640610
10029	NC_002505	A	6	6	617704	617709	100 %	0 %	0 %	0 %	15640610
10030	NC_002505	CAA	2	6	617774	617779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640610
10031	NC_002505	TCA	2	6	617958	617963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640611
10032	NC_002505	ATG	2	6	618044	618049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640611
10033	NC_002505	CTTT	2	8	618087	618094	0 %	75 %	0 %	25 %	15640611
10034	NC_002505	GCG	2	6	618177	618182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640611
10035	NC_002505	CG	3	6	618184	618189	0 %	0 %	50 %	50 %	15640611
10036	NC_002505	TTG	2	6	618194	618199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640611
10037	NC_002505	TTGT	2	8	618230	618237	0 %	75 %	25 %	0 %	15640611
10038	NC_002505	CAT	2	6	618262	618267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640611
10039	NC_002505	GGT	2	6	618292	618297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640611
10040	NC_002505	GATT	2	8	618312	618319	25 %	50 %	25 %	0 %	15640611
10041	NC_002505	TGA	2	6	618343	618348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640611
10042	NC_002505	CGC	2	6	618378	618383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640611
10043	NC_002505	TGG	2	6	618394	618399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640611
10044	NC_002505	TGC	2	6	618420	618425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640611
10045	NC_002505	TGG	2	6	618552	618557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640611
10046	NC_002505	TG	3	6	618566	618571	0 %	50 %	50 %	0 %	15640611
10047	NC_002505	ATT	2	6	618576	618581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640611
10048	NC_002505	CAAAGG	2	12	618589	618600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15640611
10049	NC_002505	CTT	2	6	618682	618687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640612
10050	NC_002505	ATCA	2	8	618731	618738	50 %	25 %	0 %	25 %	15640612
10051	NC_002505	GCTT	2	8	618777	618784	0 %	50 %	25 %	25 %	15640612
10052	NC_002505	CTG	2	6	618792	618797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640612
10053	NC_002505	GTGC	2	8	618810	618817	0 %	25 %	50 %	25 %	15640612
10054	NC_002505	CGCA	2	8	618854	618861	25 %	0 %	25 %	50 %	15640612
10055	NC_002505	TGAT	2	8	618883	618890	25 %	50 %	25 %	0 %	15640612
10056	NC_002505	ATC	2	6	618896	618901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640612
10057	NC_002505	ACC	2	6	618905	618910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640612
10058	NC_002505	GC	3	6	618941	618946	0 %	0 %	50 %	50 %	15640612
10059	NC_002505	ATT	2	6	618986	618991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640612
10060	NC_002505	TCT	2	6	619065	619070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640612
10061	NC_002505	AAGC	2	8	619116	619123	50 %	0 %	25 %	25 %	15640612
10062	NC_002505	AG	3	6	619214	619219	50 %	0 %	50 %	0 %	15640612
10063	NC_002505	CAA	2	6	619231	619236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640612
10064	NC_002505	TCT	2	6	619326	619331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640612
10065	NC_002505	TCT	2	6	619359	619364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640612
10066	NC_002505	CAC	2	6	619400	619405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640612
10067	NC_002505	GAC	2	6	619406	619411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640612
10068	NC_002505	GAA	2	6	619528	619533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640612
10069	NC_002505	AT	3	6	619621	619626	50 %	50 %	0 %	0 %	15640613
10070	NC_002505	CTT	2	6	619847	619852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640613
10071	NC_002505	CCA	2	6	619918	619923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640613
10072	NC_002505	GCG	2	6	619940	619945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640613
10073	NC_002505	CA	4	8	619961	619968	50 %	0 %	0 %	50 %	15640613
10074	NC_002505	CAG	2	6	620121	620126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640613
10075	NC_002505	CA	3	6	620148	620153	50 %	0 %	0 %	50 %	15640613
10076	NC_002505	CAT	2	6	620285	620290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640613
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10078	NC_002505	T	7	7	620354	620360	0 %	100 %	0 %	0 %	15640613
10079	NC_002505	TTG	2	6	620420	620425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640614
10080	NC_002505	ATCGAG	2	12	620576	620587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15640614
10081	NC_002505	TG	3	6	620646	620651	0 %	50 %	50 %	0 %	15640614
10082	NC_002505	GGC	2	6	620690	620695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640614
10083	NC_002505	TGC	2	6	620740	620745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640614
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10085	NC_002505	TGT	2	6	620796	620801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640614
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10087	NC_002505	TTG	2	6	620891	620896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640615
10088	NC_002505	CGG	2	6	620909	620914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640615
10089	NC_002505	TGC	3	9	620928	620936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640615
10090	NC_002505	CACC	2	8	620955	620962	25 %	0 %	0 %	75 %	15640615
10091	NC_002505	CCA	2	6	621004	621009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640615
10092	NC_002505	GTTCA	2	10	621085	621094	20 %	40 %	20 %	20 %	15640615
10093	NC_002505	GTG	2	6	621167	621172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640615
10094	NC_002505	GGC	2	6	621174	621179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640615
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10099	NC_002505	GCA	2	6	621507	621512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640615
10100	NC_002505	TTC	2	6	621523	621528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640615
10101	NC_002505	GCA	2	6	621555	621560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640615
10102	NC_002505	TCT	2	6	621593	621598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640615
10103	NC_002505	CG	3	6	621634	621639	0 %	0 %	50 %	50 %	15640615
10104	NC_002505	GCC	2	6	621721	621726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640615
10105	NC_002505	TGT	2	6	621756	621761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640615
10106	NC_002505	TCA	2	6	621803	621808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640615
10107	NC_002505	AGC	2	6	621833	621838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640615
10108	NC_002505	GACTC	2	10	621876	621885	20 %	20 %	20 %	40 %	15640615
10109	NC_002505	TGA	2	6	621887	621892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640615
10110	NC_002505	CGA	2	6	621915	621920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640615
10111	NC_002505	TGG	2	6	622014	622019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640615
10112	NC_002505	CCG	3	9	622067	622075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640615
10113	NC_002505	CTG	2	6	622141	622146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640615
10114	NC_002505	ATG	2	6	622175	622180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640615
10115	NC_002505	TTA	2	6	622229	622234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640615
10116	NC_002505	CATC	2	8	622557	622564	25 %	25 %	0 %	50 %	15640616
10117	NC_002505	GCC	2	6	622626	622631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640616
10118	NC_002505	ACC	2	6	622661	622666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640616
10119	NC_002505	ATC	2	6	622687	622692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640616
10120	NC_002505	CAC	2	6	622696	622701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640616
10121	NC_002505	TAA	2	6	622737	622742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640616
10122	NC_002505	TCT	3	9	622748	622756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640616
10123	NC_002505	ATGGTG	2	12	622772	622783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15640616
10124	NC_002505	TTG	2	6	622804	622809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640616
10125	NC_002505	TGC	2	6	622847	622852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640616
10126	NC_002505	GGAT	2	8	622862	622869	25 %	25 %	50 %	0 %	15640616
10127	NC_002505	GCC	2	6	622891	622896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640616
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10130	NC_002505	TTG	2	6	623119	623124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640616
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10134	NC_002505	CTT	3	9	623508	623516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640617
10135	NC_002505	GCT	2	6	623549	623554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640617
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10140	NC_002505	CTT	2	6	623962	623967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640618
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10142	NC_002505	ACC	2	6	624330	624335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640618
10143	NC_002505	CG	3	6	624348	624353	0 %	0 %	50 %	50 %	15640618
10144	NC_002505	TCT	2	6	624604	624609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640618
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10146	NC_002505	ATC	2	6	624942	624947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640621
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10150	NC_002505	CTG	2	6	625073	625078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640621
10151	NC_002505	G	6	6	625203	625208	0 %	0 %	100 %	0 %	15640621
10152	NC_002505	AGCA	2	8	625292	625299	50 %	0 %	25 %	25 %	15640621
10153	NC_002505	GCT	2	6	625336	625341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640621
10154	NC_002505	GTG	2	6	625410	625415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640621
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10157	NC_002505	GC	3	6	625639	625644	0 %	0 %	50 %	50 %	15640621
10158	NC_002505	ATG	2	6	625671	625676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640621
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10162	NC_002505	GCTG	2	8	625778	625785	0 %	25 %	50 %	25 %	15640621
10163	NC_002505	TG	3	6	625852	625857	0 %	50 %	50 %	0 %	15640621
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10194	NC_002505	TGCG	2	8	627286	627293	0 %	25 %	50 %	25 %	15640622
10195	NC_002505	AGC	3	9	627317	627325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640622
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10200	NC_002505	TGC	2	6	627552	627557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640622
10201	NC_002505	TGC	2	6	627560	627565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640622
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10206	NC_002505	CAAA	2	8	627696	627703	75 %	0 %	0 %	25 %	15640622
10207	NC_002505	CTG	2	6	627706	627711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640622
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10212	NC_002505	CCG	3	9	627905	627913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640622
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10214	NC_002505	TCG	2	6	628107	628112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640622
10215	NC_002505	A	6	6	628139	628144	100 %	0 %	0 %	0 %	15640622
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10217	NC_002505	CGCTG	2	10	628234	628243	0 %	20 %	40 %	40 %	15640622
10218	NC_002505	AGA	2	6	628257	628262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640622
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10220	NC_002505	TCAG	2	8	628406	628413	25 %	25 %	25 %	25 %	15640622
10221	NC_002505	CAT	2	6	628438	628443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640622
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10223	NC_002505	A	7	7	628465	628471	100 %	0 %	0 %	0 %	15640622
10224	NC_002505	CG	3	6	628562	628567	0 %	0 %	50 %	50 %	15640622
10225	NC_002505	GTG	2	6	628570	628575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640622
10226	NC_002505	GGGC	2	8	628637	628644	0 %	0 %	75 %	25 %	15640622
10227	NC_002505	AAG	2	6	628652	628657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640622
10228	NC_002505	GAT	2	6	628702	628707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640622
10229	NC_002505	AGT	2	6	628767	628772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640623
10230	NC_002505	GC	3	6	628794	628799	0 %	0 %	50 %	50 %	15640623
10231	NC_002505	TCC	2	6	628818	628823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640623
10232	NC_002505	CTGG	2	8	628835	628842	0 %	25 %	50 %	25 %	15640623
10233	NC_002505	TATC	2	8	628907	628914	25 %	50 %	0 %	25 %	15640623
10234	NC_002505	TCGAT	2	10	628915	628924	20 %	40 %	20 %	20 %	15640623
10235	NC_002505	TCT	2	6	629094	629099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640623
10236	NC_002505	CCG	2	6	629120	629125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640623
10237	NC_002505	AGC	2	6	629287	629292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640623
10238	NC_002505	GTTG	2	8	629327	629334	0 %	50 %	50 %	0 %	15640623
10239	NC_002505	CAC	2	6	629386	629391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640623
10240	NC_002505	TGG	2	6	629410	629415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640623
10241	NC_002505	CAG	2	6	629463	629468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640623
10242	NC_002505	ATC	2	6	629541	629546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640623
10243	NC_002505	TTTA	2	8	629596	629603	25 %	75 %	0 %	0 %	15640623
10244	NC_002505	TTG	2	6	629700	629705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640623
10245	NC_002505	CTT	2	6	629725	629730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640623
10246	NC_002505	GC	3	6	629756	629761	0 %	0 %	50 %	50 %	15640623
10247	NC_002505	GCG	2	6	629768	629773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640623
10248	NC_002505	TGA	2	6	629791	629796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640623
10249	NC_002505	CAGC	2	8	629886	629893	25 %	0 %	25 %	50 %	15640623
10250	NC_002505	GAAA	2	8	629921	629928	75 %	0 %	25 %	0 %	15640623
10251	NC_002505	CTCG	2	8	629975	629982	0 %	25 %	25 %	50 %	15640623
10252	NC_002505	CGG	2	6	630116	630121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640623
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10254	NC_002505	CGA	2	6	630446	630451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640623
10255	NC_002505	TCAC	2	8	630489	630496	25 %	25 %	0 %	50 %	15640623
10256	NC_002505	A	6	6	630543	630548	100 %	0 %	0 %	0 %	15640623
10257	NC_002505	GAC	2	6	630653	630658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640623
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10259	NC_002505	GCA	2	6	630723	630728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640623
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10263	NC_002505	CAG	2	6	631035	631040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640623
10264	NC_002505	CCGA	2	8	631053	631060	25 %	0 %	25 %	50 %	15640623
10265	NC_002505	TGA	2	6	631326	631331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640624
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10273	NC_002505	GC	4	8	631726	631733	0 %	0 %	50 %	50 %	15640624
10274	NC_002505	TGC	2	6	631761	631766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640624
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10282	NC_002505	TGG	2	6	631972	631977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640624
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10287	NC_002505	CTG	3	9	632168	632176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640624
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10312	NC_002505	CGACA	2	10	633044	633053	40 %	0 %	20 %	40 %	15640624
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10334	NC_002505	GTGC	2	8	634898	634905	0 %	25 %	50 %	25 %	15640625
10335	NC_002505	GGT	2	6	634907	634912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640625
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10349	NC_002505	CAAG	2	8	635557	635564	50 %	0 %	25 %	25 %	15640625
10350	NC_002505	GCG	2	6	635693	635698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640625
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10352	NC_002505	GATTGA	2	12	635890	635901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640625
10353	NC_002505	CG	3	6	636035	636040	0 %	0 %	50 %	50 %	15640625
10354	NC_002505	CCAA	2	8	636101	636108	50 %	0 %	0 %	50 %	15640625
10355	NC_002505	TAC	2	6	636140	636145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640625
10356	NC_002505	GCGT	2	8	636165	636172	0 %	25 %	50 %	25 %	15640625
10357	NC_002505	CT	3	6	636296	636301	0 %	50 %	0 %	50 %	15640625
10358	NC_002505	CTG	2	6	636303	636308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640625
10359	NC_002505	GCG	2	6	636386	636391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640625
10360	NC_002505	TACC	2	8	636400	636407	25 %	25 %	0 %	50 %	15640625
10361	NC_002505	GAATTT	2	12	636639	636650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15640626
10362	NC_002505	TCG	2	6	636706	636711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640626
10363	NC_002505	AAG	2	6	636724	636729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640626
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10365	NC_002505	CT	3	6	636916	636921	0 %	50 %	0 %	50 %	15640626
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10487	NC_002505	AAC	2	6	644352	644357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640632
10488	NC_002505	CTGC	2	8	644374	644381	0 %	25 %	25 %	50 %	15640632
10489	NC_002505	GATC	2	8	644540	644547	25 %	25 %	25 %	25 %	15640632
10490	NC_002505	TGG	2	6	644588	644593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640632
10491	NC_002505	CCAG	2	8	644607	644614	25 %	0 %	25 %	50 %	15640632
10492	NC_002505	GGT	2	6	644633	644638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640632
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10494	NC_002505	ATG	2	6	644671	644676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640632
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