MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002505	CAT	2	6	341640	341645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237035
5502	NC_002505	TGA	2	6	341651	341656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237035
5503	NC_002505	ACC	2	6	341705	341710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471237035
5504	NC_002505	CGT	2	6	341719	341724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5505	NC_002505	CTG	3	9	341864	341872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5506	NC_002505	TTC	2	6	341889	341894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237035
5507	NC_002505	AAC	2	6	341920	341925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237035
5508	NC_002505	CGT	2	6	341950	341955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5509	NC_002505	GTC	2	6	342035	342040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5510	NC_002505	TGAC	2	8	342164	342171	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
5511	NC_002505	CT	3	6	342184	342189	0 %	50 %	0 %	50 %	471237035
5512	NC_002505	GAA	2	6	342196	342201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5513	NC_002505	AGA	2	6	342240	342245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5514	NC_002505	TGA	2	6	342258	342263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237035
5515	NC_002505	ATCG	2	8	342351	342358	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
5516	NC_002505	ACG	2	6	342386	342391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5517	NC_002505	TGGT	2	8	342464	342471	0 %	50 %	50 %	0 %	471237035
5518	NC_002505	CAGT	2	8	342541	342548	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
5519	NC_002505	TCGTA	2	10	342558	342567	20 %	40 %	20 %	20 %	471237035
5520	NC_002505	GAA	2	6	342580	342585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5521	NC_002505	TG	3	6	342676	342681	0 %	50 %	50 %	0 %	471237035
5522	NC_002505	GAC	2	6	342841	342846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5523	NC_002505	TAC	2	6	342852	342857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237035
5524	NC_002505	TG	3	6	342880	342885	0 %	50 %	50 %	0 %	471237035
5525	NC_002505	AGA	2	6	342909	342914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5526	NC_002505	GGC	2	6	343003	343008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237035
5527	NC_002505	TGGT	2	8	343016	343023	0 %	50 %	50 %	0 %	471237035
5528	NC_002505	AGA	2	6	343059	343064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5529	NC_002505	CTG	2	6	343069	343074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5530	NC_002505	GAA	2	6	343236	343241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5531	NC_002505	CTGA	2	8	343246	343253	25 %	25 %	25 %	25 %	471237035
5532	NC_002505	TCT	2	6	343278	343283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237035
5533	NC_002505	GTTC	2	8	343291	343298	0 %	50 %	25 %	25 %	471237035
5534	NC_002505	CTG	2	6	343303	343308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5535	NC_002505	GGT	2	6	343312	343317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237035
5536	NC_002505	ACG	2	6	343421	343426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5537	NC_002505	AAG	2	6	343447	343452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5538	NC_002505	GAAGC	2	10	343456	343465	40 %	0 %	40 %	20 %	471237035
5539	NC_002505	TGA	2	6	343485	343490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237035
5540	NC_002505	GTC	2	6	343571	343576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5541	NC_002505	GGC	2	6	343725	343730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237035
5542	NC_002505	AAC	2	6	343769	343774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237035
5543	NC_002505	TGA	2	6	343860	343865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237035
5544	NC_002505	TACATG	2	12	344050	344061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	471237035
5545	NC_002505	GAC	2	6	344083	344088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5546	NC_002505	GGT	2	6	344143	344148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237035
5547	NC_002505	GGT	2	6	344161	344166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237035
5548	NC_002505	TGC	2	6	344211	344216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5549	NC_002505	GAC	2	6	344251	344256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5550	NC_002505	TCGC	2	8	344355	344362	0 %	25 %	25 %	50 %	471237035
5551	NC_002505	AGA	2	6	344382	344387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5552	NC_002505	AAT	2	6	344390	344395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471237035
5553	NC_002505	TTA	2	6	344508	344513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640356
5554	NC_002505	GAA	2	6	344541	344546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640356
5555	NC_002505	GTGAA	2	10	344605	344614	40 %	20 %	40 %	0 %	15640356
5556	NC_002505	A	6	6	344613	344618	100 %	0 %	0 %	0 %	15640356
5557	NC_002505	TCTGT	2	10	344663	344672	0 %	60 %	20 %	20 %	15640356
5558	NC_002505	GTG	2	6	344740	344745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640356
5559	NC_002505	TCG	2	6	344789	344794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
5560	NC_002505	TACTT	2	10	344911	344920	20 %	60 %	0 %	20 %	15640356
5561	NC_002505	TGAC	2	8	344950	344957	25 %	25 %	25 %	25 %	15640356
5562	NC_002505	CTGA	2	8	344976	344983	25 %	25 %	25 %	25 %	15640356
5563	NC_002505	CTG	2	6	345060	345065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
5564	NC_002505	CTGC	2	8	345078	345085	0 %	25 %	25 %	50 %	15640356
5565	NC_002505	AGCAG	2	10	345089	345098	40 %	0 %	40 %	20 %	15640356
5566	NC_002505	TCG	2	6	345178	345183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
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5568	NC_002505	TAC	2	6	345220	345225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640356
5569	NC_002505	GCC	2	6	345233	345238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640356
5570	NC_002505	TCA	2	6	345313	345318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640356
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5572	NC_002505	GGC	2	6	345353	345358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640356
5573	NC_002505	CAT	2	6	345365	345370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640356
5574	NC_002505	CGTA	2	8	345371	345378	25 %	25 %	25 %	25 %	15640356
5575	NC_002505	TGC	2	6	345391	345396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
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5583	NC_002505	TGC	2	6	345760	345765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
5584	NC_002505	GT	3	6	345855	345860	0 %	50 %	50 %	0 %	15640356
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5588	NC_002505	ATC	2	6	345993	345998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640356
5589	NC_002505	TAC	2	6	346029	346034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640356
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5591	NC_002505	CGTAC	2	10	346105	346114	20 %	20 %	20 %	40 %	15640356
5592	NC_002505	CTG	2	6	346120	346125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
5593	NC_002505	GAT	2	6	346202	346207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640356
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5599	NC_002505	ACA	2	6	346534	346539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640356
5600	NC_002505	CAAC	2	8	346561	346568	50 %	0 %	0 %	50 %	15640356
5601	NC_002505	GAT	2	6	346586	346591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640356
5602	NC_002505	CT	3	6	346599	346604	0 %	50 %	0 %	50 %	15640356
5603	NC_002505	ATG	2	6	346668	346673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640356
5604	NC_002505	CTG	2	6	346696	346701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
5605	NC_002505	ATC	2	6	346758	346763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640356
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5608	NC_002505	TCG	2	6	346889	346894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
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5611	NC_002505	ACTG	2	8	347000	347007	25 %	25 %	25 %	25 %	15640356
5612	NC_002505	AGA	2	6	347033	347038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640356
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5616	NC_002505	CGGT	2	8	347239	347246	0 %	25 %	50 %	25 %	15640356
5617	NC_002505	GGT	2	6	347310	347315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640356
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5621	NC_002505	ATC	2	6	347577	347582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640356
5622	NC_002505	GTCT	2	8	347662	347669	0 %	50 %	25 %	25 %	15640356
5623	NC_002505	AAGTG	2	10	347672	347681	40 %	20 %	40 %	0 %	15640356
5624	NC_002505	GCA	2	6	347703	347708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640356
5625	NC_002505	GAC	2	6	347826	347831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640356
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5633	NC_002505	TGC	2	6	348274	348279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640356
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5653	NC_002505	TGC	2	6	349729	349734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640358
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5724	NC_002505	TCA	2	6	353757	353762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640362
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5728	NC_002505	CTG	2	6	353974	353979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640362
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5730	NC_002505	GC	3	6	354030	354035	0 %	0 %	50 %	50 %	15640362
5731	NC_002505	A	6	6	354094	354099	100 %	0 %	0 %	0 %	15640362
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5739	NC_002505	ATAA	2	8	354425	354432	75 %	25 %	0 %	0 %	15640362
5740	NC_002505	CAG	2	6	354442	354447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640362
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5851	NC_002505	CGA	2	6	360640	360645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640367
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5854	NC_002505	T	6	6	360964	360969	0 %	100 %	0 %	0 %	15640367
5855	NC_002505	GT	3	6	361003	361008	0 %	50 %	50 %	0 %	15640367
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5862	NC_002505	AGAC	2	8	361484	361491	50 %	0 %	25 %	25 %	15640368
5863	NC_002505	CGC	2	6	361575	361580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640368
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5865	NC_002505	AAT	2	6	363597	363602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640369
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5992	NC_002505	GCCG	2	8	371173	371180	0 %	0 %	50 %	50 %	15640375
5993	NC_002505	TTG	2	6	371226	371231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640375
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5995	NC_002505	TGT	2	6	371284	371289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640375
5996	NC_002505	TGA	2	6	371382	371387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640375
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6000	NC_002505	GTG	2	6	371531	371536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640375

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