MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_022543	TGC	2	6	2190202	2190207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720258
40002	NC_022543	TTC	2	6	2190288	2190293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720258
40003	NC_022543	CAAATG	2	12	2190357	2190368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549720258
40004	NC_022543	TGA	2	6	2190373	2190378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720258
40005	NC_022543	TAAAG	2	10	2190518	2190527	60 %	20 %	20 %	0 %	549720258
40006	NC_022543	CAA	2	6	2190539	2190544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720258
40007	NC_022543	ACC	2	6	2190606	2190611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720258
40008	NC_022543	GAA	2	6	2190642	2190647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720258
40009	NC_022543	A	6	6	2190769	2190774	100 %	0 %	0 %	0 %	549720259
40010	NC_022543	CTT	2	6	2190903	2190908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720259
40011	NC_022543	ACC	2	6	2190938	2190943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720259
40012	NC_022543	TC	3	6	2191083	2191088	0 %	50 %	0 %	50 %	549720259
40013	NC_022543	TTG	2	6	2191132	2191137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720259
40014	NC_022543	AT	3	6	2191168	2191173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40015	NC_022543	AAG	2	6	2191182	2191187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40016	NC_022543	CAC	2	6	2191333	2191338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720260
40017	NC_022543	CAG	2	6	2191448	2191453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720260
40018	NC_022543	A	6	6	2191503	2191508	100 %	0 %	0 %	0 %	549720260
40019	NC_022543	CCA	2	6	2191550	2191555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720260
40020	NC_022543	CAT	2	6	2191636	2191641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720260
40021	NC_022543	T	6	6	2191903	2191908	0 %	100 %	0 %	0 %	549720261
40022	NC_022543	ATT	2	6	2191946	2191951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549720261
40023	NC_022543	T	6	6	2191950	2191955	0 %	100 %	0 %	0 %	549720261
40024	NC_022543	TAA	2	6	2191961	2191966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549720261
40025	NC_022543	GTAA	2	8	2192006	2192013	50 %	25 %	25 %	0 %	549720261
40026	NC_022543	CAA	2	6	2192059	2192064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720261
40027	NC_022543	AATA	2	8	2192095	2192102	75 %	25 %	0 %	0 %	549720261
40028	NC_022543	AGG	2	6	2192123	2192128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549720261
40029	NC_022543	TTC	2	6	2192144	2192149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720261
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40031	NC_022543	AAG	2	6	2192279	2192284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720262
40032	NC_022543	TCCA	2	8	2192309	2192316	25 %	25 %	0 %	50 %	549720262
40033	NC_022543	A	7	7	2192316	2192322	100 %	0 %	0 %	0 %	549720262
40034	NC_022543	TGT	2	6	2192327	2192332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720262
40035	NC_022543	CCA	2	6	2192399	2192404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720262
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40037	NC_022543	TCTCT	2	10	2192457	2192466	0 %	60 %	0 %	40 %	549720262
40038	NC_022543	GCC	2	6	2192515	2192520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549720262
40039	NC_022543	TGC	2	6	2192544	2192549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720262
40040	NC_022543	GAC	2	6	2192587	2192592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720262
40041	NC_022543	CTGG	2	8	2192719	2192726	0 %	25 %	50 %	25 %	549720263
40042	NC_022543	TGT	2	6	2192730	2192735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720263
40043	NC_022543	CCA	2	6	2192898	2192903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720263
40044	NC_022543	AGAT	2	8	2193205	2193212	50 %	25 %	25 %	0 %	549720264
40045	NC_022543	CA	3	6	2193230	2193235	50 %	0 %	0 %	50 %	549720264
40046	NC_022543	ATC	2	6	2193285	2193290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720264
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40048	NC_022543	ATA	2	6	2193398	2193403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40049	NC_022543	ATCA	2	8	2193407	2193414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40050	NC_022543	A	7	7	2193441	2193447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40051	NC_022543	CAT	2	6	2193457	2193462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720265
40052	NC_022543	CGT	2	6	2193574	2193579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720265
40053	NC_022543	GAT	2	6	2193644	2193649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720265
40054	NC_022543	CCTGA	2	10	2193755	2193764	20 %	20 %	20 %	40 %	549720265
40055	NC_022543	A	6	6	2193920	2193925	100 %	0 %	0 %	0 %	549720265
40056	NC_022543	CA	3	6	2193933	2193938	50 %	0 %	0 %	50 %	549720265
40057	NC_022543	GCG	2	6	2193959	2193964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549720265
40058	NC_022543	A	6	6	2193974	2193979	100 %	0 %	0 %	0 %	549720265
40059	NC_022543	GGC	2	6	2194046	2194051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549720265
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40063	NC_022543	ATG	2	6	2194220	2194225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720265
40064	NC_022543	GCTT	2	8	2194340	2194347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40065	NC_022543	GTTC	2	8	2194362	2194369	0 %	50 %	25 %	25 %	549720266
40066	NC_022543	T	6	6	2194419	2194424	0 %	100 %	0 %	0 %	549720266
40067	NC_022543	TGC	2	6	2194506	2194511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720266
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40070	NC_022543	TGGCAG	2	12	2194599	2194610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549720266
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40072	NC_022543	TGC	2	6	2194762	2194767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720266
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40088	NC_022543	GTGCAG	2	12	2195456	2195467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549720267
40089	NC_022543	TCG	2	6	2195561	2195566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720267
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40101	NC_022543	ATC	2	6	2196202	2196207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720267
40102	NC_022543	TTG	2	6	2196217	2196222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720267
40103	NC_022543	C	6	6	2196274	2196279	0 %	0 %	0 %	100 %	549720267
40104	NC_022543	TTTA	3	12	2196328	2196339	25 %	75 %	0 %	0 %	549720267
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40106	NC_022543	A	6	6	2196455	2196460	100 %	0 %	0 %	0 %	549720268
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40113	NC_022543	AG	3	6	2196662	2196667	50 %	0 %	50 %	0 %	549720268
40114	NC_022543	AGA	2	6	2196721	2196726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720268
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40116	NC_022543	GGT	2	6	2196803	2196808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549720268
40117	NC_022543	CAT	2	6	2196856	2196861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720268
40118	NC_022543	CTG	2	6	2196863	2196868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720268
40119	NC_022543	GTC	2	6	2196959	2196964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720268
40120	NC_022543	GTA	2	6	2197010	2197015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720268
40121	NC_022543	GCTG	2	8	2197072	2197079	0 %	25 %	50 %	25 %	549720268
40122	NC_022543	TAT	2	6	2197102	2197107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549720268
40123	NC_022543	GAC	2	6	2197109	2197114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720268
40124	NC_022543	CGC	2	6	2197190	2197195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40125	NC_022543	GCG	2	6	2197214	2197219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40126	NC_022543	A	7	7	2197393	2197399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40127	NC_022543	GCC	2	6	2197454	2197459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549720269
40128	NC_022543	CTGT	2	8	2197511	2197518	0 %	50 %	25 %	25 %	549720269
40129	NC_022543	AG	3	6	2197519	2197524	50 %	0 %	50 %	0 %	549720269
40130	NC_022543	CAC	2	6	2197549	2197554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720269
40131	NC_022543	GAA	2	6	2197628	2197633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720269
40132	NC_022543	CAGT	2	8	2197678	2197685	25 %	25 %	25 %	25 %	549720269
40133	NC_022543	ATT	3	9	2197748	2197756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549720269
40134	NC_022543	AGT	2	6	2197759	2197764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720269
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40141	NC_022543	ATT	2	6	2198330	2198335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40142	NC_022543	TGA	2	6	2198342	2198347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40143	NC_022543	TTG	2	6	2198363	2198368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40144	NC_022543	CAAG	2	8	2198440	2198447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40145	NC_022543	CTG	2	6	2198472	2198477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40146	NC_022543	CAA	2	6	2198516	2198521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40147	NC_022543	TTCAAT	2	12	2198539	2198550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40148	NC_022543	GTTG	2	8	2198692	2198699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40149	NC_022543	AC	4	8	2198730	2198737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40150	NC_022543	CAT	2	6	2198751	2198756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720270
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40153	NC_022543	AAC	2	6	2198876	2198881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720270
40154	NC_022543	GAA	2	6	2199048	2199053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720271
40155	NC_022543	GCA	2	6	2199111	2199116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720271
40156	NC_022543	CTTG	2	8	2199155	2199162	0 %	50 %	25 %	25 %	549720271
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40158	NC_022543	AAT	2	6	2199230	2199235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549720271
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40161	NC_022543	GATT	2	8	2199309	2199316	25 %	50 %	25 %	0 %	549720271
40162	NC_022543	C	6	6	2199351	2199356	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40163	NC_022543	CTT	2	6	2199423	2199428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720272
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40165	NC_022543	CGCT	2	8	2199457	2199464	0 %	25 %	25 %	50 %	549720272
40166	NC_022543	AAT	2	6	2199484	2199489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549720272
40167	NC_022543	GTT	2	6	2199573	2199578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720272
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40169	NC_022543	GCT	2	6	2199653	2199658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40170	NC_022543	CCAA	2	8	2199715	2199722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40171	NC_022543	TACT	2	8	2199772	2199779	25 %	50 %	0 %	25 %	549720273
40172	NC_022543	TA	3	6	2199809	2199814	50 %	50 %	0 %	0 %	549720273
40173	NC_022543	TTG	2	6	2200031	2200036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720273
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40176	NC_022543	AT	4	8	2200407	2200414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40177	NC_022543	TTA	2	6	2200424	2200429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40178	NC_022543	CTGA	2	8	2200446	2200453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40179	NC_022543	A	6	6	2200475	2200480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40180	NC_022543	CGC	2	6	2200481	2200486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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40201	NC_022543	AGA	2	6	2201328	2201333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40212	NC_022543	CTT	2	6	2202224	2202229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40213	NC_022543	CAA	2	6	2202272	2202277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720276
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40221	NC_022543	CCA	2	6	2202788	2202793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720277
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40223	NC_022543	CAC	2	6	2202869	2202874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720277
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40225	NC_022543	CAT	2	6	2202936	2202941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720277
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40228	NC_022543	AC	3	6	2203115	2203120	50 %	0 %	0 %	50 %	549720277
40229	NC_022543	CAAA	2	8	2203331	2203338	75 %	0 %	0 %	25 %	549720277
40230	NC_022543	GC	3	6	2203349	2203354	0 %	0 %	50 %	50 %	549720277
40231	NC_022543	TTC	2	6	2203380	2203385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720277
40232	NC_022543	GAG	2	6	2203415	2203420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549720277
40233	NC_022543	C	6	6	2203429	2203434	0 %	0 %	0 %	100 %	549720277
40234	NC_022543	AC	3	6	2203578	2203583	50 %	0 %	0 %	50 %	549720277
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40339	NC_022543	GAA	2	6	2209044	2209049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40340	NC_022543	AGATC	2	10	2209092	2209101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40341	NC_022543	GT	3	6	2209145	2209150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40342	NC_022543	TTC	2	6	2209176	2209181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720281
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40345	NC_022543	CGA	2	6	2209234	2209239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720281
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40347	NC_022543	AT	3	6	2209467	2209472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40348	NC_022543	ATT	2	6	2209486	2209491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40349	NC_022543	AGA	2	6	2209525	2209530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40350	NC_022543	CT	3	6	2209534	2209539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40351	NC_022543	ATT	2	6	2209578	2209583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40352	NC_022543	ATT	2	6	2209599	2209604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40353	NC_022543	TCA	2	6	2209704	2209709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40354	NC_022543	CGAC	2	8	2209718	2209725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40355	NC_022543	T	6	6	2209729	2209734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40356	NC_022543	TGAG	2	8	2209792	2209799	25 %	25 %	50 %	0 %	549720282
40357	NC_022543	TTC	2	6	2209834	2209839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720282
40358	NC_022543	ATTAC	2	10	2209861	2209870	40 %	40 %	0 %	20 %	549720282
40359	NC_022543	TGA	2	6	2210063	2210068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720282
40360	NC_022543	CT	3	6	2210126	2210131	0 %	50 %	0 %	50 %	549720282
40361	NC_022543	GAA	2	6	2210151	2210156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720282
40362	NC_022543	CCA	2	6	2210177	2210182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720282
40363	NC_022543	GC	3	6	2210213	2210218	0 %	0 %	50 %	50 %	549720282
40364	NC_022543	GCT	2	6	2210225	2210230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720282
40365	NC_022543	GTG	2	6	2210284	2210289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549720282
40366	NC_022543	ATC	2	6	2210343	2210348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720282
40367	NC_022543	GCA	2	6	2210399	2210404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720282
40368	NC_022543	TCA	2	6	2210446	2210451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720282
40369	NC_022543	TGA	2	6	2210467	2210472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720282
40370	NC_022543	AAGA	2	8	2210616	2210623	75 %	0 %	25 %	0 %	549720282
40371	NC_022543	AAC	2	6	2210663	2210668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720283
40372	NC_022543	GGC	3	9	2210690	2210698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549720283
40373	NC_022543	CAC	2	6	2210975	2210980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720283
40374	NC_022543	A	6	6	2211086	2211091	100 %	0 %	0 %	0 %	549720283
40375	NC_022543	AGA	2	6	2211244	2211249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720283
40376	NC_022543	GAA	2	6	2211308	2211313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720283
40377	NC_022543	GCA	2	6	2211379	2211384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720283
40378	NC_022543	CTG	2	6	2211398	2211403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720283
40379	NC_022543	GCA	2	6	2211588	2211593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720284
40380	NC_022543	CTT	2	6	2211652	2211657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720284
40381	NC_022543	GCC	2	6	2211663	2211668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549720284
40382	NC_022543	TC	3	6	2211746	2211751	0 %	50 %	0 %	50 %	549720284
40383	NC_022543	TAC	2	6	2211754	2211759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720284
40384	NC_022543	ACC	2	6	2211884	2211889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720284
40385	NC_022543	CAG	2	6	2211982	2211987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720284
40386	NC_022543	TTC	2	6	2212047	2212052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40387	NC_022543	ATC	2	6	2212087	2212092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720285
40388	NC_022543	ATC	2	6	2212113	2212118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720285
40389	NC_022543	GTT	2	6	2212143	2212148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720285
40390	NC_022543	GAA	2	6	2212188	2212193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720285
40391	NC_022543	ACA	2	6	2212223	2212228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40392	NC_022543	A	7	7	2212232	2212238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40393	NC_022543	TGAA	2	8	2212276	2212283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40394	NC_022543	TTA	2	6	2212296	2212301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40395	NC_022543	ACA	2	6	2212317	2212322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40396	NC_022543	TTG	2	6	2212323	2212328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40397	NC_022543	TGT	2	6	2212356	2212361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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