MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_022543	TTG	2	6	1642678	1642683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719759
30003	NC_022543	A	6	6	1642703	1642708	100 %	0 %	0 %	0 %	549719759
30004	NC_022543	TTCTA	2	10	1642814	1642823	20 %	60 %	0 %	20 %	549719759
30005	NC_022543	GAAT	2	8	1643025	1643032	50 %	25 %	25 %	0 %	549719759
30006	NC_022543	T	6	6	1643159	1643164	0 %	100 %	0 %	0 %	549719759
30007	NC_022543	AAAT	2	8	1643260	1643267	75 %	25 %	0 %	0 %	549719759
30008	NC_022543	TCT	2	6	1643268	1643273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719759
30009	NC_022543	T	8	8	1643284	1643291	0 %	100 %	0 %	0 %	549719759
30010	NC_022543	GAA	2	6	1643304	1643309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719759
30011	NC_022543	CTG	2	6	1643344	1643349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719759
30012	NC_022543	CTG	2	6	1643361	1643366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719759
30013	NC_022543	CT	3	6	1643457	1643462	0 %	50 %	0 %	50 %	549719760
30014	NC_022543	CTT	2	6	1643606	1643611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719760
30015	NC_022543	CAC	2	6	1643634	1643639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719760
30016	NC_022543	TTTG	2	8	1643760	1643767	0 %	75 %	25 %	0 %	549719760
30017	NC_022543	T	7	7	1643787	1643793	0 %	100 %	0 %	0 %	549719760
30018	NC_022543	ATG	2	6	1643923	1643928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719760
30019	NC_022543	CTT	2	6	1644005	1644010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719760
30020	NC_022543	GAC	2	6	1644020	1644025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719760
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30022	NC_022543	CTG	2	6	1644103	1644108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719761
30023	NC_022543	CTT	2	6	1644127	1644132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719761
30024	NC_022543	GTTTT	2	10	1644152	1644161	0 %	80 %	20 %	0 %	549719761
30025	NC_022543	CTTTT	2	10	1644169	1644178	0 %	80 %	0 %	20 %	549719761
30026	NC_022543	T	6	6	1644175	1644180	0 %	100 %	0 %	0 %	549719761
30027	NC_022543	TTG	2	6	1644184	1644189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719761
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30031	NC_022543	CCTT	2	8	1644270	1644277	0 %	50 %	0 %	50 %	549719761
30032	NC_022543	AGAC	2	8	1644298	1644305	50 %	0 %	25 %	25 %	549719761
30033	NC_022543	CAG	2	6	1644313	1644318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719761
30034	NC_022543	CGT	2	6	1644484	1644489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719761
30035	NC_022543	CAT	2	6	1644506	1644511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719761
30036	NC_022543	CACT	2	8	1644636	1644643	25 %	25 %	0 %	50 %	549719761
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30038	NC_022543	CA	3	6	1644746	1644751	50 %	0 %	0 %	50 %	549719761
30039	NC_022543	CTG	2	6	1644764	1644769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719761
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30050	NC_022543	A	6	6	1645192	1645197	100 %	0 %	0 %	0 %	549719761
30051	NC_022543	TCAT	2	8	1645235	1645242	25 %	50 %	0 %	25 %	549719762
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30053	NC_022543	AATT	2	8	1645350	1645357	50 %	50 %	0 %	0 %	549719762
30054	NC_022543	CAT	2	6	1645375	1645380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719762
30055	NC_022543	AGT	2	6	1645388	1645393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719762
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30057	NC_022543	GAAG	2	8	1645440	1645447	50 %	0 %	50 %	0 %	549719762
30058	NC_022543	TA	3	6	1645465	1645470	50 %	50 %	0 %	0 %	549719762
30059	NC_022543	T	7	7	1645473	1645479	0 %	100 %	0 %	0 %	549719762
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30072	NC_022543	TAGG	2	8	1646074	1646081	25 %	25 %	50 %	0 %	549719762
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30094	NC_022543	A	7	7	1647448	1647454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30108	NC_022543	CG	3	6	1647922	1647927	0 %	0 %	50 %	50 %	549719764
30109	NC_022543	AAG	2	6	1647984	1647989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719764
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30114	NC_022543	TCT	2	6	1648181	1648186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719764
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30118	NC_022543	CTG	2	6	1648392	1648397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719765
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30221	NC_022543	TCAA	2	8	1654949	1654956	50 %	25 %	0 %	25 %	549719769
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30224	NC_022543	CAATGA	2	12	1655178	1655189	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549719770
30225	NC_022543	T	7	7	1655265	1655271	0 %	100 %	0 %	0 %	549719770
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30229	NC_022543	AAAG	2	8	1655552	1655559	75 %	0 %	25 %	0 %	549719770
30230	NC_022543	CGC	2	6	1655629	1655634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719770
30231	NC_022543	AG	3	6	1655656	1655661	50 %	0 %	50 %	0 %	549719770
30232	NC_022543	A	7	7	1655671	1655677	100 %	0 %	0 %	0 %	549719770
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30345	NC_022543	CA	3	6	1661683	1661688	50 %	0 %	0 %	50 %	549719777
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30350	NC_022543	CAAT	2	8	1661909	1661916	50 %	25 %	0 %	25 %	549719777
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30353	NC_022543	TTC	2	6	1662208	1662213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30356	NC_022543	CAA	2	6	1662420	1662425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719778
30357	NC_022543	ATC	2	6	1662430	1662435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719778
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30463	NC_022543	GCG	2	6	1668824	1668829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719784
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30471	NC_022543	T	6	6	1669227	1669232	0 %	100 %	0 %	0 %	549719784
30472	NC_022543	TCACCT	2	12	1669313	1669324	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549719784
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30474	NC_022543	CGT	2	6	1669420	1669425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719784
30475	NC_022543	ATC	3	9	1669427	1669435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719784
30476	NC_022543	CTGTG	2	10	1669438	1669447	0 %	40 %	40 %	20 %	549719784
30477	NC_022543	CGA	2	6	1669488	1669493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719784
30478	NC_022543	GTAC	2	8	1669512	1669519	25 %	25 %	25 %	25 %	549719784
30479	NC_022543	AAC	2	6	1669525	1669530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719784
30480	NC_022543	CGT	2	6	1669545	1669550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719784
30481	NC_022543	AGT	2	6	1669586	1669591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719784
30482	NC_022543	ATTGGT	2	12	1669624	1669635	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549719784
30483	NC_022543	AGTC	2	8	1669674	1669681	25 %	25 %	25 %	25 %	549719784
30484	NC_022543	AAG	2	6	1669720	1669725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719784
30485	NC_022543	TTCAC	2	10	1669802	1669811	20 %	40 %	0 %	40 %	549719784
30486	NC_022543	AGA	2	6	1669852	1669857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719784
30487	NC_022543	GAA	2	6	1669867	1669872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719784
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30490	NC_022543	TGT	2	6	1670032	1670037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719784
30491	NC_022543	ACTG	2	8	1670038	1670045	25 %	25 %	25 %	25 %	549719784
30492	NC_022543	TGAA	2	8	1670051	1670058	50 %	25 %	25 %	0 %	549719784
30493	NC_022543	TGT	2	6	1670061	1670066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719784
30494	NC_022543	CAG	2	6	1670079	1670084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719784
30495	NC_022543	AAG	2	6	1670089	1670094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719784
30496	NC_022543	GA	3	6	1670097	1670102	50 %	0 %	50 %	0 %	549719784
30497	NC_022543	GGAA	2	8	1670140	1670147	50 %	0 %	50 %	0 %	549719784
30498	NC_022543	TGG	2	6	1670217	1670222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719784
30499	NC_022543	AAGC	2	8	1670223	1670230	50 %	0 %	25 %	25 %	549719784
30500	NC_022543	AG	5	10	1670275	1670284	50 %	0 %	50 %	0 %	549719784

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