MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_022543	TGC	2	6	1617680	1617685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719736
29502	NC_022543	GCA	2	6	1617745	1617750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719736
29503	NC_022543	TCA	2	6	1617782	1617787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719736
29504	NC_022543	CCA	2	6	1617913	1617918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29505	NC_022543	GCA	2	6	1617927	1617932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29506	NC_022543	TCCAT	2	10	1617933	1617942	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29507	NC_022543	AGT	2	6	1617947	1617952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29508	NC_022543	ATA	2	6	1617972	1617977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29509	NC_022543	CAT	2	6	1617990	1617995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29510	NC_022543	TAT	2	6	1618013	1618018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29511	NC_022543	TAAA	2	8	1618143	1618150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29512	NC_022543	TAAG	2	8	1618257	1618264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29513	NC_022543	GA	3	6	1618296	1618301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29514	NC_022543	AAAGC	2	10	1618318	1618327	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29515	NC_022543	CAT	2	6	1618387	1618392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29516	NC_022543	CAT	2	6	1618434	1618439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29517	NC_022543	T	6	6	1618497	1618502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29518	NC_022543	CGT	2	6	1618605	1618610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719737
29519	NC_022543	T	6	6	1618615	1618620	0 %	100 %	0 %	0 %	549719737
29520	NC_022543	TTC	2	6	1618644	1618649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719737
29521	NC_022543	CTT	2	6	1618859	1618864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719737
29522	NC_022543	CTT	3	9	1618877	1618885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719737
29523	NC_022543	TTTG	2	8	1618932	1618939	0 %	75 %	25 %	0 %	549719737
29524	NC_022543	TCT	2	6	1618966	1618971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719737
29525	NC_022543	CAA	2	6	1619062	1619067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29526	NC_022543	GTT	2	6	1619085	1619090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29527	NC_022543	GGC	2	6	1619123	1619128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29528	NC_022543	TA	3	6	1619155	1619160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29529	NC_022543	TCCC	2	8	1619187	1619194	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29530	NC_022543	ATT	2	6	1619257	1619262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29531	NC_022543	A	6	6	1619274	1619279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29532	NC_022543	AAT	2	6	1619305	1619310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29533	NC_022543	ATT	2	6	1619315	1619320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29534	NC_022543	CTG	2	6	1619435	1619440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719738
29535	NC_022543	GGT	2	6	1619489	1619494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719738
29536	NC_022543	TGGC	2	8	1619501	1619508	0 %	25 %	50 %	25 %	549719738
29537	NC_022543	GCT	2	6	1619668	1619673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719738
29538	NC_022543	CACT	2	8	1619687	1619694	25 %	25 %	0 %	50 %	549719738
29539	NC_022543	TGG	2	6	1619735	1619740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719738
29540	NC_022543	GGA	2	6	1619762	1619767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549719738
29541	NC_022543	GGCT	2	8	1619780	1619787	0 %	25 %	50 %	25 %	549719738
29542	NC_022543	G	6	6	1619809	1619814	0 %	0 %	100 %	0 %	549719738
29543	NC_022543	CAA	2	6	1619819	1619824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719738
29544	NC_022543	TCT	2	6	1619913	1619918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719738
29545	NC_022543	TGA	2	6	1619934	1619939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719738
29546	NC_022543	TGA	2	6	1620003	1620008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719738
29547	NC_022543	AAG	2	6	1620027	1620032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719738
29548	NC_022543	ATT	2	6	1620047	1620052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549719738
29549	NC_022543	TGA	2	6	1620094	1620099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719738
29550	NC_022543	CAT	2	6	1620169	1620174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719738
29551	NC_022543	T	6	6	1620240	1620245	0 %	100 %	0 %	0 %	549719738
29552	NC_022543	ATT	2	6	1620274	1620279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549719738
29553	NC_022543	GTT	2	6	1620406	1620411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719739
29554	NC_022543	ACA	2	6	1620473	1620478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719739
29555	NC_022543	CT	3	6	1620493	1620498	0 %	50 %	0 %	50 %	549719739
29556	NC_022543	TC	3	6	1620507	1620512	0 %	50 %	0 %	50 %	549719739
29557	NC_022543	CTG	2	6	1620513	1620518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719739
29558	NC_022543	CATC	2	8	1620534	1620541	25 %	25 %	0 %	50 %	549719739
29559	NC_022543	CTT	2	6	1620606	1620611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719739
29560	NC_022543	CTGG	2	8	1620647	1620654	0 %	25 %	50 %	25 %	549719739
29561	NC_022543	TA	3	6	1620714	1620719	50 %	50 %	0 %	0 %	549719739
29562	NC_022543	AG	3	6	1620728	1620733	50 %	0 %	50 %	0 %	549719739
29563	NC_022543	CG	3	6	1620739	1620744	0 %	0 %	50 %	50 %	549719739
29564	NC_022543	AGT	2	6	1620801	1620806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719739
29565	NC_022543	AGT	2	6	1620810	1620815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719739
29566	NC_022543	AAT	2	6	1620835	1620840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549719739
29567	NC_022543	GAT	2	6	1620860	1620865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719739
29568	NC_022543	GCTG	2	8	1620941	1620948	0 %	25 %	50 %	25 %	549719739
29569	NC_022543	TCA	2	6	1621011	1621016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719739
29570	NC_022543	AG	3	6	1621024	1621029	50 %	0 %	50 %	0 %	549719739
29571	NC_022543	AGAA	2	8	1621093	1621100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29572	NC_022543	ATT	2	6	1621107	1621112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29573	NC_022543	GCC	2	6	1621204	1621209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719740
29574	NC_022543	TTGT	2	8	1621260	1621267	0 %	75 %	25 %	0 %	549719740
29575	NC_022543	CTGA	2	8	1621430	1621437	25 %	25 %	25 %	25 %	549719740
29576	NC_022543	TGC	2	6	1621449	1621454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719740
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29580	NC_022543	ATC	2	6	1621587	1621592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719740
29581	NC_022543	CT	3	6	1621649	1621654	0 %	50 %	0 %	50 %	549719740
29582	NC_022543	GAG	2	6	1621755	1621760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549719740
29583	NC_022543	TGCA	2	8	1621809	1621816	25 %	25 %	25 %	25 %	549719740
29584	NC_022543	GAT	3	9	1621847	1621855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719740
29585	NC_022543	AAT	2	6	1622049	1622054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549719740
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29587	NC_022543	T	6	6	1622281	1622286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29588	NC_022543	A	7	7	1622299	1622305	100 %	0 %	0 %	0 %	549719741
29589	NC_022543	GACT	2	8	1622324	1622331	25 %	25 %	25 %	25 %	549719741
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29596	NC_022543	GGAAT	2	10	1622559	1622568	40 %	20 %	40 %	0 %	549719741
29597	NC_022543	GC	3	6	1622580	1622585	0 %	0 %	50 %	50 %	549719741
29598	NC_022543	TTG	2	6	1622612	1622617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719741
29599	NC_022543	TA	3	6	1622667	1622672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29600	NC_022543	AAAG	2	8	1622679	1622686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29601	NC_022543	TAT	2	6	1622707	1622712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549719742
29602	NC_022543	GCTT	2	8	1622716	1622723	0 %	50 %	25 %	25 %	549719742
29603	NC_022543	TGTT	2	8	1622746	1622753	0 %	75 %	25 %	0 %	549719742
29604	NC_022543	TTC	2	6	1622779	1622784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719742
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29609	NC_022543	AG	3	6	1623016	1623021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29610	NC_022543	TTTC	2	8	1623065	1623072	0 %	75 %	0 %	25 %	549719743
29611	NC_022543	A	6	6	1623088	1623093	100 %	0 %	0 %	0 %	549719743
29612	NC_022543	GTG	2	6	1623165	1623170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719743
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29622	NC_022543	TAA	2	6	1623829	1623834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29625	NC_022543	AT	3	6	1623911	1623916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29626	NC_022543	CCA	2	6	1623941	1623946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29628	NC_022543	AT	3	6	1624030	1624035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29629	NC_022543	T	7	7	1624083	1624089	0 %	100 %	0 %	0 %	549719744
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29766	NC_022543	T	6	6	1631915	1631920	0 %	100 %	0 %	0 %	549719750
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29804	NC_022543	A	6	6	1634046	1634051	100 %	0 %	0 %	0 %	549719752
29805	NC_022543	ACCC	2	8	1634105	1634112	25 %	0 %	0 %	75 %	549719752
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29823	NC_022543	CTT	2	6	1634945	1634950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719753
29824	NC_022543	CTGAT	2	10	1634962	1634971	20 %	40 %	20 %	20 %	549719753
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29826	NC_022543	AC	3	6	1635034	1635039	50 %	0 %	0 %	50 %	549719753
29827	NC_022543	CCTG	2	8	1635052	1635059	0 %	25 %	25 %	50 %	549719753
29828	NC_022543	CTT	2	6	1635065	1635070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719753
29829	NC_022543	GTTT	2	8	1635092	1635099	0 %	75 %	25 %	0 %	549719753
29830	NC_022543	CAT	2	6	1635108	1635113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719753
29831	NC_022543	A	6	6	1635230	1635235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29832	NC_022543	TTATTG	2	12	1635245	1635256	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29833	NC_022543	TTG	2	6	1635287	1635292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29834	NC_022543	TCA	2	6	1635332	1635337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719754
29835	NC_022543	CT	3	6	1635339	1635344	0 %	50 %	0 %	50 %	549719754
29836	NC_022543	CCG	2	6	1635427	1635432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719754
29837	NC_022543	TCTG	2	8	1635536	1635543	0 %	50 %	25 %	25 %	549719754
29838	NC_022543	TGG	2	6	1635572	1635577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719754
29839	NC_022543	CGT	2	6	1635578	1635583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719754
29840	NC_022543	ACA	2	6	1635759	1635764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719754
29841	NC_022543	ACC	2	6	1635783	1635788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719754
29842	NC_022543	GTTGC	2	10	1635884	1635893	0 %	40 %	40 %	20 %	549719754
29843	NC_022543	TGC	2	6	1635909	1635914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719754
29844	NC_022543	CTGAA	2	10	1635956	1635965	40 %	20 %	20 %	20 %	549719754
29845	NC_022543	ATG	2	6	1635966	1635971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719754
29846	NC_022543	GTGAA	2	10	1636021	1636030	40 %	20 %	40 %	0 %	549719754
29847	NC_022543	AAG	2	6	1636040	1636045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719754
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29851	NC_022543	TTG	2	6	1636173	1636178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719754
29852	NC_022543	CTG	2	6	1636208	1636213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719754
29853	NC_022543	CAG	2	6	1636307	1636312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719754
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