MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_022543	GGCA	2	8	1369736	1369743	25 %	0 %	50 %	25 %	549719520
25003	NC_022543	TGG	2	6	1369751	1369756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719520
25004	NC_022543	GAAG	2	8	1369791	1369798	50 %	0 %	50 %	0 %	549719520
25005	NC_022543	TG	3	6	1369831	1369836	0 %	50 %	50 %	0 %	549719520
25006	NC_022543	CTGA	2	8	1369878	1369885	25 %	25 %	25 %	25 %	549719520
25007	NC_022543	GCA	2	6	1369900	1369905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719520
25008	NC_022543	GTT	2	6	1369922	1369927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719520
25009	NC_022543	ATG	2	6	1369950	1369955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719520
25010	NC_022543	AAG	2	6	1369985	1369990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719520
25011	NC_022543	ACTTA	2	10	1370129	1370138	40 %	40 %	0 %	20 %	549719520
25012	NC_022543	GTA	2	6	1370148	1370153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719520
25013	NC_022543	TTAT	2	8	1370160	1370167	25 %	75 %	0 %	0 %	549719520
25014	NC_022543	TGCAGG	2	12	1370189	1370200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549719520
25015	NC_022543	TGC	2	6	1370261	1370266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719520
25016	NC_022543	TGTTC	2	10	1370285	1370294	0 %	60 %	20 %	20 %	549719520
25017	NC_022543	GACCA	2	10	1370307	1370316	40 %	0 %	20 %	40 %	549719520
25018	NC_022543	TGGT	2	8	1370329	1370336	0 %	50 %	50 %	0 %	549719520
25019	NC_022543	GTT	2	6	1370369	1370374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719520
25020	NC_022543	CAA	2	6	1370383	1370388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719520
25021	NC_022543	CTGC	2	8	1370493	1370500	0 %	25 %	25 %	50 %	549719520
25022	NC_022543	GT	3	6	1370535	1370540	0 %	50 %	50 %	0 %	549719520
25023	NC_022543	CAA	2	6	1370592	1370597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719520
25024	NC_022543	TATTTA	2	12	1370735	1370746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25025	NC_022543	ATA	2	6	1370753	1370758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25026	NC_022543	A	6	6	1370777	1370782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25027	NC_022543	AAC	2	6	1370856	1370861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719521
25028	NC_022543	CCT	2	6	1370892	1370897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549719521
25029	NC_022543	TTTA	2	8	1370901	1370908	25 %	75 %	0 %	0 %	549719521
25030	NC_022543	CG	3	6	1370932	1370937	0 %	0 %	50 %	50 %	549719521
25031	NC_022543	CAAA	2	8	1370956	1370963	75 %	0 %	0 %	25 %	549719521
25032	NC_022543	TAC	2	6	1371003	1371008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719521
25033	NC_022543	ATC	2	6	1371054	1371059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719521
25034	NC_022543	ACT	2	6	1371220	1371225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719521
25035	NC_022543	TGT	2	6	1371266	1371271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719521
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25037	NC_022543	TCC	2	6	1371479	1371484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549719521
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25039	NC_022543	AT	3	6	1371536	1371541	50 %	50 %	0 %	0 %	549719521
25040	NC_022543	GAC	2	6	1371550	1371555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719521
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25043	NC_022543	TCAG	2	8	1371766	1371773	25 %	25 %	25 %	25 %	549719521
25044	NC_022543	CACT	2	8	1371863	1371870	25 %	25 %	0 %	50 %	549719521
25045	NC_022543	ACAG	2	8	1371881	1371888	50 %	0 %	25 %	25 %	549719521
25046	NC_022543	AAC	2	6	1371899	1371904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719521
25047	NC_022543	TGG	2	6	1372010	1372015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719521
25048	NC_022543	GCA	2	6	1372029	1372034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719521
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25050	NC_022543	AT	3	6	1372073	1372078	50 %	50 %	0 %	0 %	549719521
25051	NC_022543	CTGC	2	8	1372110	1372117	0 %	25 %	25 %	50 %	549719521
25052	NC_022543	TAA	2	6	1372143	1372148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549719521
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25056	NC_022543	TCA	2	6	1372315	1372320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719521
25057	NC_022543	T	6	6	1372331	1372336	0 %	100 %	0 %	0 %	549719521
25058	NC_022543	TGAG	2	8	1372391	1372398	25 %	25 %	50 %	0 %	549719521
25059	NC_022543	CA	3	6	1372400	1372405	50 %	0 %	0 %	50 %	549719521
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25089	NC_022543	TGC	2	6	1374146	1374151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719522
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25092	NC_022543	ATT	2	6	1374271	1374276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25102	NC_022543	AAG	2	6	1375148	1375153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719523
25103	NC_022543	CAC	2	6	1375210	1375215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719523
25104	NC_022543	CA	3	6	1375234	1375239	50 %	0 %	0 %	50 %	549719523
25105	NC_022543	CTA	2	6	1375318	1375323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719523
25106	NC_022543	CAC	2	6	1375324	1375329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719523
25107	NC_022543	GAT	2	6	1375339	1375344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719523
25108	NC_022543	TCC	2	6	1375448	1375453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549719523
25109	NC_022543	A	7	7	1375500	1375506	100 %	0 %	0 %	0 %	549719523
25110	NC_022543	ACC	2	6	1375512	1375517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719523
25111	NC_022543	TGTTT	2	10	1375570	1375579	0 %	80 %	20 %	0 %	549719523
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25118	NC_022543	TGA	2	6	1375897	1375902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719523
25119	NC_022543	TTG	2	6	1376025	1376030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719523
25120	NC_022543	TGA	2	6	1376125	1376130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719523
25121	NC_022543	A	6	6	1376146	1376151	100 %	0 %	0 %	0 %	549719523
25122	NC_022543	TGG	2	6	1376226	1376231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719523
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25124	NC_022543	ATT	2	6	1376380	1376385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25125	NC_022543	T	6	6	1376405	1376410	0 %	100 %	0 %	0 %	549719524
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25137	NC_022543	CTT	2	6	1376889	1376894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25138	NC_022543	AAT	2	6	1376926	1376931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25139	NC_022543	AAG	2	6	1376957	1376962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25140	NC_022543	CGA	2	6	1377031	1377036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25143	NC_022543	CAT	2	6	1377370	1377375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719525
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25158	NC_022543	TTTAA	2	10	1378061	1378070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25159	NC_022543	TCAC	2	8	1378078	1378085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25160	NC_022543	TAA	2	6	1378110	1378115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25162	NC_022543	ACC	2	6	1378228	1378233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25183	NC_022543	TAA	2	6	1379264	1379269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25220	NC_022543	CCTTC	2	10	1380845	1380854	0 %	40 %	0 %	60 %	549719528
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25222	NC_022543	CTT	2	6	1381004	1381009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719528
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25227	NC_022543	AGA	2	6	1381257	1381262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25228	NC_022543	AGA	2	6	1381321	1381326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25229	NC_022543	GAA	2	6	1381338	1381343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719529
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25234	NC_022543	CTG	3	9	1381493	1381501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719529
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25237	NC_022543	TTC	2	6	1381656	1381661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719529
25238	NC_022543	TGC	2	6	1381776	1381781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719529
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25243	NC_022543	CTG	3	9	1381988	1381996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719529
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25258	NC_022543	A	6	6	1383162	1383167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25259	NC_022543	ATT	2	6	1383179	1383184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25263	NC_022543	GTT	2	6	1383333	1383338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25265	NC_022543	ATT	2	6	1383481	1383486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25270	NC_022543	CA	3	6	1383704	1383709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25271	NC_022543	CTTT	2	8	1383745	1383752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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25352	NC_022543	GGC	2	6	1387405	1387410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719531
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