MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_022543	A	6	6	653655	653660	100 %	0 %	0 %	0 %	549718865
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12005	NC_022543	GCT	2	6	653744	653749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_022543	TG	3	6	653772	653777	0 %	50 %	50 %	0 %	549718866
12007	NC_022543	GC	3	6	653788	653793	0 %	0 %	50 %	50 %	549718866
12008	NC_022543	TGAA	2	8	653826	653833	50 %	25 %	25 %	0 %	549718866
12009	NC_022543	ATCG	2	8	653836	653843	25 %	25 %	25 %	25 %	549718866
12010	NC_022543	ATG	2	6	653957	653962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718866
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12012	NC_022543	TCG	2	6	654002	654007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718866
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12016	NC_022543	A	6	6	654341	654346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_022543	CAA	3	9	654387	654395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718867
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12021	NC_022543	TCG	2	6	654752	654757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718867
12022	NC_022543	GTT	2	6	654762	654767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718867
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12024	NC_022543	CAGTC	2	10	655185	655194	20 %	20 %	20 %	40 %	549718867
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12029	NC_022543	GGCA	2	8	655517	655524	25 %	0 %	50 %	25 %	549718868
12030	NC_022543	CTG	2	6	655622	655627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718868
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12057	NC_022543	GCC	2	6	656449	656454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718868
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12062	NC_022543	TA	3	6	656722	656727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12135	NC_022543	TCT	2	6	660210	660215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12237	NC_022543	TGA	2	6	666000	666005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12240	NC_022543	TGT	2	6	666119	666124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_022543	T	6	6	666132	666137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_022543	TCAG	2	8	666158	666165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12244	NC_022543	AGC	2	6	666213	666218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718879
12245	NC_022543	CAT	2	6	666306	666311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718879
12246	NC_022543	TTC	2	6	666314	666319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718879
12247	NC_022543	ATC	2	6	666382	666387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718879
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12249	NC_022543	CTG	2	6	666443	666448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718879
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12251	NC_022543	TA	3	6	666508	666513	50 %	50 %	0 %	0 %	549718879
12252	NC_022543	TC	3	6	666526	666531	0 %	50 %	0 %	50 %	549718879
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12281	NC_022543	AATG	2	8	667856	667863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12329	NC_022543	AGT	2	6	670512	670517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718883
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12349	NC_022543	A	6	6	672325	672330	100 %	0 %	0 %	0 %	549718885
12350	NC_022543	CGAG	2	8	672502	672509	25 %	0 %	50 %	25 %	549718885
12351	NC_022543	TGA	2	6	672599	672604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718885
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12355	NC_022543	TTC	2	6	672711	672716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718885
12356	NC_022543	TGA	2	6	672728	672733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718885
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12360	NC_022543	GTC	2	6	672856	672861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718885
12361	NC_022543	AT	3	6	672899	672904	50 %	50 %	0 %	0 %	549718885
12362	NC_022543	GC	3	6	672905	672910	0 %	0 %	50 %	50 %	549718885
12363	NC_022543	ATC	2	6	672994	672999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718885
12364	NC_022543	GCA	2	6	673098	673103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718886
12365	NC_022543	TGT	2	6	673121	673126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718886
12366	NC_022543	TGA	2	6	673130	673135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718886
12367	NC_022543	TTG	2	6	673186	673191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718886
12368	NC_022543	ATC	2	6	673231	673236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718886
12369	NC_022543	CCAA	2	8	673303	673310	50 %	0 %	0 %	50 %	549718886
12370	NC_022543	CT	3	6	673360	673365	0 %	50 %	0 %	50 %	549718886
12371	NC_022543	GATACC	2	12	673389	673400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549718886
12372	NC_022543	TGG	2	6	673457	673462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718886
12373	NC_022543	TTC	2	6	673542	673547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718886
12374	NC_022543	GACCA	2	10	673629	673638	40 %	0 %	20 %	40 %	549718886
12375	NC_022543	TGG	2	6	673727	673732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718886
12376	NC_022543	ACC	2	6	673793	673798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718887
12377	NC_022543	AAT	2	6	673801	673806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718887
12378	NC_022543	CAA	2	6	673896	673901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718887
12379	NC_022543	TCC	2	6	673942	673947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549718887
12380	NC_022543	CTG	2	6	673953	673958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718887
12381	NC_022543	GC	3	6	674004	674009	0 %	0 %	50 %	50 %	549718887
12382	NC_022543	CG	3	6	674134	674139	0 %	0 %	50 %	50 %	549718887
12383	NC_022543	ACA	2	6	674166	674171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718887
12384	NC_022543	AATCGC	2	12	674185	674196	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549718887
12385	NC_022543	GAA	2	6	674221	674226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718887
12386	NC_022543	GGGA	2	8	674287	674294	25 %	0 %	75 %	0 %	549718887
12387	NC_022543	CAC	2	6	674326	674331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718887
12388	NC_022543	AGCC	2	8	674437	674444	25 %	0 %	25 %	50 %	549718887
12389	NC_022543	ATC	2	6	674534	674539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718887
12390	NC_022543	CCA	2	6	674676	674681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718887
12391	NC_022543	TTA	2	6	674706	674711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718887
12392	NC_022543	TCT	2	6	674794	674799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718888
12393	NC_022543	AAC	2	6	674802	674807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718888
12394	NC_022543	CGG	2	6	674831	674836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718888
12395	NC_022543	GA	3	6	674839	674844	50 %	0 %	50 %	0 %	549718888
12396	NC_022543	CAA	2	6	674957	674962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718888
12397	NC_022543	GCC	2	6	674970	674975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718888
12398	NC_022543	ACGA	2	8	675135	675142	50 %	0 %	25 %	25 %	549718888
12399	NC_022543	CTT	2	6	675167	675172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718888
12400	NC_022543	GTT	2	6	675209	675214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718888
12401	NC_022543	CAA	2	6	675245	675250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718888
12402	NC_022543	CTT	2	6	675266	675271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718888
12403	NC_022543	GAA	2	6	675276	675281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718888
12404	NC_022543	TTC	2	6	675292	675297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718888
12405	NC_022543	GGC	2	6	675384	675389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718888
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12407	NC_022543	TCA	2	6	675430	675435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718888
12408	NC_022543	GTT	2	6	675441	675446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718888
12409	NC_022543	TGG	2	6	675479	675484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718888
12410	NC_022543	TTGC	2	8	675502	675509	0 %	50 %	25 %	25 %	549718888
12411	NC_022543	CTG	2	6	675510	675515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718888
12412	NC_022543	ATC	2	6	675544	675549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718888
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12414	NC_022543	T	7	7	675591	675597	0 %	100 %	0 %	0 %	549718888
12415	NC_022543	CGA	2	6	675624	675629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718888
12416	NC_022543	AGT	2	6	675705	675710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718888
12417	NC_022543	TCC	2	6	675727	675732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12418	NC_022543	CAC	2	6	676001	676006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718889
12419	NC_022543	CGG	2	6	676120	676125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718889
12420	NC_022543	ATG	2	6	676335	676340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718889
12421	NC_022543	GCC	2	6	676437	676442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718889
12422	NC_022543	GTC	2	6	676532	676537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718889
12423	NC_022543	CTT	2	6	676591	676596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718889
12424	NC_022543	ATTTC	2	10	676635	676644	20 %	60 %	0 %	20 %	549718889
12425	NC_022543	ACC	2	6	676652	676657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718889
12426	NC_022543	AAG	2	6	676658	676663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718889
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12428	NC_022543	TAAG	2	8	676763	676770	50 %	25 %	25 %	0 %	549718889
12429	NC_022543	CCAAT	2	10	676885	676894	40 %	20 %	0 %	40 %	549718889
12430	NC_022543	CCTA	2	8	676981	676988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12431	NC_022543	CAG	2	6	677011	677016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718890
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12435	NC_022543	CT	3	6	677140	677145	0 %	50 %	0 %	50 %	549718890
12436	NC_022543	ATC	2	6	677198	677203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718890
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12438	NC_022543	ATG	2	6	677267	677272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718890
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12442	NC_022543	CGT	2	6	677394	677399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718890
12443	NC_022543	CTG	2	6	677404	677409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718890
12444	NC_022543	TGG	2	6	677457	677462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718890
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12448	NC_022543	C	6	6	677625	677630	0 %	0 %	0 %	100 %	549718890
12449	NC_022543	TCAC	2	8	677660	677667	25 %	25 %	0 %	50 %	549718890
12450	NC_022543	GCT	2	6	677671	677676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718890
12451	NC_022543	ACA	2	6	677910	677915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12452	NC_022543	TA	3	6	678047	678052	50 %	50 %	0 %	0 %	549718891
12453	NC_022543	AAG	2	6	678054	678059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718891
12454	NC_022543	AG	3	6	678084	678089	50 %	0 %	50 %	0 %	549718891
12455	NC_022543	GAA	2	6	678326	678331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718891
12456	NC_022543	A	6	6	678451	678456	100 %	0 %	0 %	0 %	549718892
12457	NC_022543	GCA	2	6	678633	678638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718892
12458	NC_022543	ATTGTT	2	12	678670	678681	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549718892
12459	NC_022543	TGG	2	6	678691	678696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718892
12460	NC_022543	TAG	2	6	678818	678823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718892
12461	NC_022543	AATTT	2	10	678868	678877	40 %	60 %	0 %	0 %	549718892
12462	NC_022543	AAG	2	6	678889	678894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718892
12463	NC_022543	A	6	6	678989	678994	100 %	0 %	0 %	0 %	549718892
12464	NC_022543	TGGTT	2	10	679137	679146	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12465	NC_022543	A	6	6	679191	679196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12466	NC_022543	GTT	2	6	679223	679228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718893
12467	NC_022543	CTT	2	6	679258	679263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718893
12468	NC_022543	GCA	2	6	679395	679400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718893
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12470	NC_022543	AGC	2	6	679445	679450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718893
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12472	NC_022543	TC	3	6	679522	679527	0 %	50 %	0 %	50 %	549718893
12473	NC_022543	AGC	2	6	679533	679538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718893
12474	NC_022543	CCT	2	6	679564	679569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12475	NC_022543	CAG	2	6	679605	679610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12476	NC_022543	ATCC	2	8	679614	679621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12477	NC_022543	ACA	2	6	679624	679629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12478	NC_022543	GA	3	6	679704	679709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12479	NC_022543	CAA	2	6	679826	679831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718894
12480	NC_022543	ACG	2	6	679840	679845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718894
12481	NC_022543	ACT	2	6	679882	679887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718894
12482	NC_022543	T	6	6	679897	679902	0 %	100 %	0 %	0 %	549718894
12483	NC_022543	TTC	2	6	680032	680037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718894
12484	NC_022543	GGC	2	6	680040	680045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718894
12485	NC_022543	ACTTC	2	10	680069	680078	20 %	40 %	0 %	40 %	549718894
12486	NC_022543	GAC	2	6	680106	680111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718894
12487	NC_022543	ACTT	2	8	680117	680124	25 %	50 %	0 %	25 %	549718894
12488	NC_022543	CAA	2	6	680135	680140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718894
12489	NC_022543	TTC	2	6	680182	680187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718894
12490	NC_022543	TTTACT	2	12	680283	680294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549718894
12491	NC_022543	CGC	2	6	680311	680316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718894
12492	NC_022543	GAA	2	6	680345	680350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12493	NC_022543	GCT	2	6	680401	680406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12494	NC_022543	TA	3	6	680427	680432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12495	NC_022543	AATT	2	8	680439	680446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12496	NC_022543	TG	3	6	680465	680470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12497	NC_022543	GGA	2	6	680543	680548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12498	NC_022543	TGG	2	6	680578	680583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718895
12499	NC_022543	GCA	2	6	680620	680625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718895
12500	NC_022543	GAA	2	6	680702	680707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718895

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