MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 1592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022271	AAT	2	6	83515	83520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_022271	GT	3	6	83541	83546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_022271	TTA	2	6	83582	83587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_022271	AGAA	2	8	83601	83608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_022271	A	6	6	83615	83620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_022271	TTA	2	6	83633	83638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_022271	TTA	2	6	83650	83655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022271	CCA	2	6	83767	83772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872240
1509	NC_022271	TCT	2	6	83851	83856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872240
1510	NC_022271	TCAT	2	8	83932	83939	25 %	50 %	0 %	25 %	541872240
1511	NC_022271	AAC	2	6	83946	83951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872240
1512	NC_022271	AGG	2	6	84026	84031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541872240
1513	NC_022271	TAAAA	2	10	84036	84045	80 %	20 %	0 %	0 %	541872240
1514	NC_022271	GCA	2	6	84046	84051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872240
1515	NC_022271	TAA	2	6	84061	84066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872240
1516	NC_022271	T	6	6	84072	84077	0 %	100 %	0 %	0 %	541872240
1517	NC_022271	CAT	2	6	84078	84083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872240
1518	NC_022271	TCC	2	6	84330	84335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_022271	ATG	2	6	84373	84378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_022271	TGA	2	6	84411	84416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_022271	AG	3	6	84455	84460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_022271	AGG	2	6	84612	84617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_022271	GATACA	2	12	84646	84657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1524	NC_022271	GAA	2	6	84719	84724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_022271	ATG	2	6	84747	84752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872241
1526	NC_022271	ACTC	2	8	84909	84916	25 %	25 %	0 %	50 %	541872241
1527	NC_022271	CTT	2	6	84930	84935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872241
1528	NC_022271	CGC	2	6	85011	85016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872241
1529	NC_022271	TCAA	2	8	85027	85034	50 %	25 %	0 %	25 %	541872241
1530	NC_022271	GCA	2	6	85139	85144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872241
1531	NC_022271	TCT	2	6	85154	85159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872241
1532	NC_022271	CTG	2	6	85228	85233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872241
1533	NC_022271	AAC	2	6	85344	85349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872241
1534	NC_022271	AGC	2	6	85492	85497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872241
1535	NC_022271	CGA	2	6	85553	85558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872241
1536	NC_022271	TCG	2	6	85561	85566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872241
1537	NC_022271	AC	3	6	85756	85761	50 %	0 %	0 %	50 %	541872241
1538	NC_022271	TGT	2	6	85762	85767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872241
1539	NC_022271	TCA	2	6	85789	85794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872241
1540	NC_022271	CCAA	2	8	85956	85963	50 %	0 %	0 %	50 %	541872241
1541	NC_022271	TCA	2	6	85993	85998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872241
1542	NC_022271	AGA	2	6	86032	86037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872241
1543	NC_022271	AG	3	6	86090	86095	50 %	0 %	50 %	0 %	541872241
1544	NC_022271	GCT	2	6	86208	86213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872241
1545	NC_022271	GTC	2	6	86317	86322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_022271	GTT	2	6	86460	86465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872242
1547	NC_022271	CGA	2	6	86580	86585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872242
1548	NC_022271	GT	3	6	86622	86627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_022271	T	6	6	86642	86647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022271	ATT	2	6	86686	86691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_022271	GATA	2	8	86695	86702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_022271	CTC	2	6	86854	86859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872243
1553	NC_022271	TTCT	2	8	87025	87032	0 %	75 %	0 %	25 %	541872243
1554	NC_022271	TGG	2	6	87053	87058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872243
1555	NC_022271	AAGC	2	8	87065	87072	50 %	0 %	25 %	25 %	541872243
1556	NC_022271	CAC	2	6	87207	87212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872243
1557	NC_022271	CA	3	6	87247	87252	50 %	0 %	0 %	50 %	541872243
1558	NC_022271	TGA	2	6	87257	87262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872243
1559	NC_022271	CAA	2	6	87364	87369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872243
1560	NC_022271	ACA	2	6	87417	87422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872243
1561	NC_022271	ATT	2	6	87444	87449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872243
1562	NC_022271	AG	4	8	87543	87550	50 %	0 %	50 %	0 %	541872243
1563	NC_022271	ATC	2	6	87576	87581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872243
1564	NC_022271	GCG	2	6	87624	87629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872243
1565	NC_022271	AATG	2	8	87707	87714	50 %	25 %	25 %	0 %	541872243
1566	NC_022271	AAC	2	6	87726	87731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872243
1567	NC_022271	GGC	2	6	87761	87766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872243
1568	NC_022271	T	6	6	87777	87782	0 %	100 %	0 %	0 %	541872243
1569	NC_022271	TTA	2	6	87883	87888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022271	TTG	2	6	87890	87895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_022271	TTACCT	2	12	88047	88058	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_022271	CTT	2	6	88064	88069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_022271	CAAC	2	8	88104	88111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_022271	TGA	2	6	88122	88127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_022271	CAT	2	6	88132	88137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_022271	AAG	2	6	88182	88187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_022271	CG	3	6	88205	88210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_022271	TTC	2	6	88239	88244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_022271	TCT	2	6	88311	88316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_022271	GCG	2	6	88330	88335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_022271	ACC	2	6	88350	88355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_022271	TTG	2	6	88358	88363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_022271	GGC	2	6	88382	88387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_022271	GAT	2	6	88520	88525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_022271	GAT	2	6	88562	88567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_022271	TGT	2	6	88600	88605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_022271	GAC	2	6	88624	88629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_022271	GCA	2	6	88730	88735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_022271	GTC	2	6	88754	88759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_022271	CTT	2	6	88820	88825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_022271	GTC	2	6	88836	88841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_022271	CTT	2	6	88858	88863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.