MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 72477

< Previous12...3031323334353637383940...144145Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022269	CAA	2	6	896710	896715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867259
17002	NC_022269	TCTT	2	8	896725	896732	0 %	75 %	0 %	25 %	541867259
17003	NC_022269	CTT	2	6	896748	896753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_022269	CTT	2	6	896755	896760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867260
17005	NC_022269	AGC	2	6	896805	896810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867260
17006	NC_022269	TTTG	2	8	896861	896868	0 %	75 %	25 %	0 %	541867260
17007	NC_022269	ATC	2	6	896916	896921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867260
17008	NC_022269	CAA	2	6	896959	896964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867260
17009	NC_022269	GAC	2	6	896981	896986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867260
17010	NC_022269	CTTT	2	8	896995	897002	0 %	75 %	0 %	25 %	541867260
17011	NC_022269	T	6	6	897000	897005	0 %	100 %	0 %	0 %	541867260
17012	NC_022269	GCGT	2	8	897019	897026	0 %	25 %	50 %	25 %	541867260
17013	NC_022269	CAA	2	6	897103	897108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867260
17014	NC_022269	ACG	2	6	897111	897116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867260
17015	NC_022269	ACCA	2	8	897167	897174	50 %	0 %	0 %	50 %	541867260
17016	NC_022269	CG	3	6	897190	897195	0 %	0 %	50 %	50 %	541867260
17017	NC_022269	CAA	2	6	897211	897216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867260
17018	NC_022269	CGT	2	6	897220	897225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867260
17019	NC_022269	AGC	2	6	897524	897529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867261
17020	NC_022269	ATAA	2	8	897577	897584	75 %	25 %	0 %	0 %	541867261
17021	NC_022269	GC	3	6	897633	897638	0 %	0 %	50 %	50 %	541867261
17022	NC_022269	TTG	2	6	897700	897705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541867261
17023	NC_022269	AGC	2	6	897796	897801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867261
17024	NC_022269	GCAAAT	2	12	897840	897851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	541867261
17025	NC_022269	ACTG	2	8	897884	897891	25 %	25 %	25 %	25 %	541867261
17026	NC_022269	A	7	7	898050	898056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_022269	A	6	6	898066	898071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_022269	TTG	2	6	898138	898143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541867262
17029	NC_022269	GGTG	2	8	898175	898182	0 %	25 %	75 %	0 %	541867262
17030	NC_022269	CAT	2	6	898231	898236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867262
17031	NC_022269	GCA	2	6	898283	898288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867262
17032	NC_022269	ATC	2	6	898289	898294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867262
17033	NC_022269	AAG	2	6	898379	898384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541867262
17034	NC_022269	AC	3	6	898410	898415	50 %	0 %	0 %	50 %	541867262
17035	NC_022269	CAT	2	6	898426	898431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867262
17036	NC_022269	TCG	2	6	898454	898459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867262
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17039	NC_022269	CCAC	2	8	898799	898806	25 %	0 %	0 %	75 %	541867262
17040	NC_022269	CAT	2	6	898831	898836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867262
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17042	NC_022269	CGG	2	6	898869	898874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541867262
17043	NC_022269	CAGA	2	8	898890	898897	50 %	0 %	25 %	25 %	541867262
17044	NC_022269	AAC	2	6	898939	898944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867262
17045	NC_022269	T	6	6	899027	899032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_022269	ATT	2	6	899041	899046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_022269	T	6	6	899059	899064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_022269	ATA	2	6	899192	899197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_022269	TGT	2	6	899403	899408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541867263
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17052	NC_022269	CAC	2	6	899605	899610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541869355
17053	NC_022269	CGG	2	6	899632	899637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541869355
17054	NC_022269	CTC	2	6	899692	899697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541869355
17055	NC_022269	TTG	2	6	899706	899711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541869355
17056	NC_022269	GCC	2	6	899745	899750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541869355
17057	NC_022269	TGC	2	6	899901	899906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869355
17058	NC_022269	AGT	2	6	899928	899933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869355
17059	NC_022269	ACC	2	6	899972	899977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541869355
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17061	NC_022269	TTG	2	6	900111	900116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541869355
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17063	NC_022269	GTC	2	6	900226	900231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869355
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17070	NC_022269	TCCA	2	8	900733	900740	25 %	25 %	0 %	50 %	541869355
17071	NC_022269	TTC	3	9	900836	900844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541869355
17072	NC_022269	GGTT	2	8	900867	900874	0 %	50 %	50 %	0 %	541869355
17073	NC_022269	GAG	2	6	900875	900880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541869355
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17075	NC_022269	TTC	2	6	900952	900957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17076	NC_022269	GAT	2	6	901002	901007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_022269	ACTT	2	8	901048	901055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17078	NC_022269	AT	3	6	901060	901065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_022269	CTG	2	6	901115	901120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17080	NC_022269	CTT	2	6	901122	901127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17081	NC_022269	CA	3	6	901137	901142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17082	NC_022269	CTG	2	6	901149	901154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17083	NC_022269	ACAA	2	8	901172	901179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17084	NC_022269	AC	3	6	901237	901242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17085	NC_022269	TCTA	2	8	901266	901273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17086	NC_022269	CTA	2	6	901301	901306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17087	NC_022269	CTTC	2	8	901344	901351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17088	NC_022269	GAT	2	6	901625	901630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867264
17089	NC_022269	TGA	2	6	901702	901707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867264
17090	NC_022269	CTGT	2	8	901803	901810	0 %	50 %	25 %	25 %	541867264
17091	NC_022269	ACC	2	6	901832	901837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541867264
17092	NC_022269	GCG	2	6	901932	901937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541867264
17093	NC_022269	GAG	2	6	901942	901947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541867264
17094	NC_022269	TCG	2	6	901980	901985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867264
17095	NC_022269	ATGCA	2	10	902018	902027	40 %	20 %	20 %	20 %	541867264
17096	NC_022269	CCG	2	6	902047	902052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541867264
17097	NC_022269	A	6	6	902174	902179	100 %	0 %	0 %	0 %	541867264
17098	NC_022269	ATCA	2	8	902183	902190	50 %	25 %	0 %	25 %	541867264
17099	NC_022269	AAAC	2	8	902207	902214	75 %	0 %	0 %	25 %	541867265
17100	NC_022269	AGA	2	6	902231	902236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541867265
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17103	NC_022269	ATG	2	6	902404	902409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867265
17104	NC_022269	TAA	2	6	902457	902462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541867265
17105	NC_022269	CGA	2	6	902573	902578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867265
17106	NC_022269	TC	3	6	902580	902585	0 %	50 %	0 %	50 %	541867265
17107	NC_022269	CA	3	6	902605	902610	50 %	0 %	0 %	50 %	541867265
17108	NC_022269	A	6	6	902631	902636	100 %	0 %	0 %	0 %	541867265
17109	NC_022269	TCA	3	9	902651	902659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867265
17110	NC_022269	GCT	2	6	902715	902720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867265
17111	NC_022269	GA	3	6	902742	902747	50 %	0 %	50 %	0 %	541867265
17112	NC_022269	CGC	2	6	902751	902756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541867265
17113	NC_022269	GTT	2	6	902775	902780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541867265
17114	NC_022269	GA	3	6	902790	902795	50 %	0 %	50 %	0 %	541867265
17115	NC_022269	CAAG	2	8	902859	902866	50 %	0 %	25 %	25 %	541867265
17116	NC_022269	CGC	2	6	902890	902895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541867265
17117	NC_022269	CTG	2	6	902913	902918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867265
17118	NC_022269	CTT	2	6	902943	902948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867265
17119	NC_022269	TGCT	2	8	903009	903016	0 %	50 %	25 %	25 %	541867266
17120	NC_022269	ATC	2	6	903301	903306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867266
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17123	NC_022269	CAT	2	6	903533	903538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867266
17124	NC_022269	GCT	2	6	903561	903566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867266
17125	NC_022269	GAT	2	6	903638	903643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867266
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17154	NC_022269	T	6	6	905283	905288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17155	NC_022269	GTG	2	6	905403	905408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541867267
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17237	NC_022269	A	6	6	909571	909576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17238	NC_022269	CTT	2	6	909688	909693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17246	NC_022269	AGGTA	2	10	910329	910338	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_022269	TCA	2	6	910426	910431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17248	NC_022269	GA	3	6	910549	910554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17249	NC_022269	TCA	3	9	910593	910601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17251	NC_022269	TCT	2	6	910713	910718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17252	NC_022269	CTT	2	6	910722	910727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17253	NC_022269	GCC	2	6	910736	910741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17254	NC_022269	T	6	6	910743	910748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17255	NC_022269	TCTACT	2	12	910793	910804	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17260	NC_022269	A	7	7	910984	910990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17268	NC_022269	GCAA	2	8	911653	911660	50 %	0 %	25 %	25 %	541869361
17269	NC_022269	GA	3	6	911730	911735	50 %	0 %	50 %	0 %	541869361
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