MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_022247	TCCT	2	8	673212	673219	0 %	50 %	0 %	50 %	538392839
19002	NC_022247	CGA	2	6	673247	673252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19003	NC_022247	GA	3	6	673354	673359	50 %	0 %	50 %	0 %	538392839
19004	NC_022247	CGAG	2	8	673405	673412	25 %	0 %	50 %	25 %	538392839
19005	NC_022247	GCGGA	2	10	673459	673468	20 %	0 %	60 %	20 %	538392839
19006	NC_022247	CGG	2	6	673484	673489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392839
19007	NC_022247	GA	3	6	673500	673505	50 %	0 %	50 %	0 %	538392839
19008	NC_022247	CTG	2	6	673554	673559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19009	NC_022247	CGG	2	6	673582	673587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392839
19010	NC_022247	GC	3	6	673594	673599	0 %	0 %	50 %	50 %	538392839
19011	NC_022247	GCC	2	6	673715	673720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392839
19012	NC_022247	TGGA	2	8	673728	673735	25 %	25 %	50 %	0 %	538392839
19013	NC_022247	TCGA	2	8	673794	673801	25 %	25 %	25 %	25 %	538392839
19014	NC_022247	TCG	2	6	673834	673839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19015	NC_022247	GCC	2	6	673851	673856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392839
19016	NC_022247	ACG	2	6	673893	673898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19017	NC_022247	CGA	2	6	673964	673969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19018	NC_022247	CCT	2	6	673988	673993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392839
19019	NC_022247	ATC	2	6	674091	674096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392839
19020	NC_022247	TCT	2	6	674105	674110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392839
19021	NC_022247	CG	3	6	674225	674230	0 %	0 %	50 %	50 %	538392839
19022	NC_022247	GC	3	6	674286	674291	0 %	0 %	50 %	50 %	538392839
19023	NC_022247	GAAG	2	8	674342	674349	50 %	0 %	50 %	0 %	538392839
19024	NC_022247	GCA	2	6	674357	674362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19025	NC_022247	GCG	2	6	674367	674372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392839
19026	NC_022247	GAA	2	6	674423	674428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392839
19027	NC_022247	GCA	2	6	674447	674452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19028	NC_022247	GCC	2	6	674459	674464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392839
19029	NC_022247	CAACG	2	10	674510	674519	40 %	0 %	20 %	40 %	538392839
19030	NC_022247	GAG	2	6	674568	674573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392839
19031	NC_022247	GCC	2	6	674612	674617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392839
19032	NC_022247	TGCG	2	8	674653	674660	0 %	25 %	50 %	25 %	538392839
19033	NC_022247	CG	4	8	674670	674677	0 %	0 %	50 %	50 %	538392839
19034	NC_022247	TC	3	6	674679	674684	0 %	50 %	0 %	50 %	538392839
19035	NC_022247	TTC	2	6	674694	674699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392839
19036	NC_022247	TC	3	6	674801	674806	0 %	50 %	0 %	50 %	538392839
19037	NC_022247	GCG	2	6	674914	674919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392839
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19040	NC_022247	GAC	2	6	675020	675025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
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19042	NC_022247	TGC	2	6	675126	675131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392839
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19044	NC_022247	GC	3	6	675350	675355	0 %	0 %	50 %	50 %	538392839
19045	NC_022247	CGA	2	6	675392	675397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
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19047	NC_022247	GCG	2	6	675514	675519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392839
19048	NC_022247	CGC	2	6	675528	675533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392839
19049	NC_022247	GC	5	10	675608	675617	0 %	0 %	50 %	50 %	538392839
19050	NC_022247	CAG	2	6	675642	675647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392839
19051	NC_022247	GCT	2	6	675667	675672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392840
19052	NC_022247	GCG	2	6	675750	675755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392840
19053	NC_022247	TCT	2	6	675759	675764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392840
19054	NC_022247	CTG	2	6	675893	675898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392840
19055	NC_022247	GAC	2	6	676094	676099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392840
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19057	NC_022247	TGC	2	6	676167	676172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392840
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19059	NC_022247	CGA	2	6	676353	676358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392840
19060	NC_022247	TCT	2	6	676359	676364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392840
19061	NC_022247	GCG	2	6	676500	676505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392840
19062	NC_022247	TGC	2	6	676599	676604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392840
19063	NC_022247	GACC	2	8	676633	676640	25 %	0 %	25 %	50 %	538392840
19064	NC_022247	CGA	2	6	676757	676762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392841
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19072	NC_022247	CG	4	8	676925	676932	0 %	0 %	50 %	50 %	538392841
19073	NC_022247	TGC	2	6	677015	677020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392841
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19082	NC_022247	GAG	2	6	677429	677434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392841
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19085	NC_022247	GT	3	6	677651	677656	0 %	50 %	50 %	0 %	538392842
19086	NC_022247	TGC	2	6	677720	677725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392842
19087	NC_022247	AGCC	2	8	677806	677813	25 %	0 %	25 %	50 %	538392842
19088	NC_022247	GTG	2	6	677818	677823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392842
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19090	NC_022247	ACA	2	6	677840	677845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_022247	CGCC	2	8	677919	677926	0 %	0 %	25 %	75 %	538392843
19092	NC_022247	TCG	2	6	677952	677957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392843
19093	NC_022247	CG	5	10	677971	677980	0 %	0 %	50 %	50 %	538392843
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19099	NC_022247	AAG	2	6	678287	678292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392843
19100	NC_022247	GCAC	2	8	678315	678322	25 %	0 %	25 %	50 %	538392843
19101	NC_022247	GCA	2	6	678343	678348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392843
19102	NC_022247	CTG	2	6	678380	678385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392843
19103	NC_022247	CTA	2	6	678400	678405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392843
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19105	NC_022247	GC	3	6	678524	678529	0 %	0 %	50 %	50 %	538392843
19106	NC_022247	GC	3	6	678555	678560	0 %	0 %	50 %	50 %	538392843
19107	NC_022247	AAG	2	6	678614	678619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392843
19108	NC_022247	GGC	2	6	678635	678640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392843
19109	NC_022247	CGG	2	6	678688	678693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392843
19110	NC_022247	CGGG	2	8	678702	678709	0 %	0 %	75 %	25 %	538392843
19111	NC_022247	GAC	2	6	678716	678721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392843
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19115	NC_022247	CAC	2	6	678778	678783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392843
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19118	NC_022247	TCCG	2	8	679089	679096	0 %	25 %	25 %	50 %	538392843
19119	NC_022247	CG	3	6	679110	679115	0 %	0 %	50 %	50 %	538392843
19120	NC_022247	GTG	2	6	679145	679150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392843
19121	NC_022247	CGA	2	6	679177	679182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392843
19122	NC_022247	CGA	2	6	679231	679236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392843
19123	NC_022247	CTG	2	6	679246	679251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392843
19124	NC_022247	GGCA	2	8	679273	679280	25 %	0 %	50 %	25 %	538392843
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19126	NC_022247	TCG	2	6	679326	679331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392843
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19133	NC_022247	ACG	2	6	679599	679604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392843
19134	NC_022247	CACG	2	8	679609	679616	25 %	0 %	25 %	50 %	538392843
19135	NC_022247	ACA	2	6	679644	679649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392843
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19137	NC_022247	GCGA	2	8	679790	679797	25 %	0 %	50 %	25 %	538392843
19138	NC_022247	GCGCA	2	10	679860	679869	20 %	0 %	40 %	40 %	538392843
19139	NC_022247	AGC	2	6	679946	679951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392843
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19141	NC_022247	ACC	2	6	679994	679999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392843
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19149	NC_022247	CGG	2	6	680427	680432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392844
19150	NC_022247	GC	3	6	680441	680446	0 %	0 %	50 %	50 %	538392844
19151	NC_022247	GC	3	6	680466	680471	0 %	0 %	50 %	50 %	538392844
19152	NC_022247	CGGC	2	8	680476	680483	0 %	0 %	50 %	50 %	538392844
19153	NC_022247	GTG	2	6	680486	680491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392844
19154	NC_022247	TGC	2	6	680538	680543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392844
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19157	NC_022247	TGC	2	6	680640	680645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392844
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19174	NC_022247	GC	3	6	681374	681379	0 %	0 %	50 %	50 %	538392845
19175	NC_022247	ACG	2	6	681460	681465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392845
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19177	NC_022247	GACA	2	8	681477	681484	50 %	0 %	25 %	25 %	538392845
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19185	NC_022247	TGG	2	6	681822	681827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392845
19186	NC_022247	CAG	2	6	681828	681833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392845
19187	NC_022247	GCG	2	6	681989	681994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392846
19188	NC_022247	CAT	2	6	682054	682059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392846
19189	NC_022247	GCGG	2	8	682092	682099	0 %	0 %	75 %	25 %	538392846
19190	NC_022247	GGC	2	6	682117	682122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392846
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19199	NC_022247	GTC	2	6	682382	682387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392846
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19201	NC_022247	GCT	2	6	682444	682449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392846
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19203	NC_022247	ATTC	2	8	682471	682478	25 %	50 %	0 %	25 %	538392846
19204	NC_022247	GGGCGC	2	12	682486	682497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392846
19205	NC_022247	TGC	2	6	682500	682505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392846
19206	NC_022247	CGG	2	6	682516	682521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392846
19207	NC_022247	CCT	2	6	682528	682533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392846
19208	NC_022247	GGC	2	6	682621	682626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392846
19209	NC_022247	TAC	2	6	682694	682699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392846
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19212	NC_022247	CGG	2	6	682770	682775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392846
19213	NC_022247	GGC	2	6	682810	682815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392846
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19215	NC_022247	GCG	2	6	682954	682959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19216	NC_022247	GCC	2	6	682961	682966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19217	NC_022247	GCTC	2	8	682975	682982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19218	NC_022247	GC	3	6	682998	683003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19219	NC_022247	CAA	2	6	683027	683032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392847
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19221	NC_022247	CGCC	2	8	683125	683132	0 %	0 %	25 %	75 %	538392847
19222	NC_022247	CGC	2	6	683134	683139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392847
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19224	NC_022247	CAG	2	6	683220	683225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392847
19225	NC_022247	CAG	2	6	683258	683263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392847
19226	NC_022247	CGA	2	6	683267	683272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392847
19227	NC_022247	GC	3	6	683281	683286	0 %	0 %	50 %	50 %	538392847
19228	NC_022247	GAA	2	6	683288	683293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392847
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19232	NC_022247	GGC	2	6	683477	683482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392847
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19234	NC_022247	GGC	2	6	683510	683515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392847
19235	NC_022247	AAG	2	6	683529	683534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392847
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19237	NC_022247	AAG	2	6	683583	683588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392847
19238	NC_022247	GC	3	6	683595	683600	0 %	0 %	50 %	50 %	538392847
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19240	NC_022247	TGCG	2	8	683665	683672	0 %	25 %	50 %	25 %	538392847
19241	NC_022247	GCC	2	6	683680	683685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392847
19242	NC_022247	GCT	2	6	683722	683727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392847
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19244	NC_022247	GAA	2	6	683813	683818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392847
19245	NC_022247	GCG	2	6	683832	683837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392847
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19252	NC_022247	TGC	2	6	684229	684234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392848
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19310	NC_022247	T	6	6	686583	686588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19311	NC_022247	TCA	2	6	686667	686672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392850
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19357	NC_022247	GCT	3	9	687862	687870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392850
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19481	NC_022247	CTC	2	6	691801	691806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392855
19482	NC_022247	GC	3	6	691837	691842	0 %	0 %	50 %	50 %	538392855
19483	NC_022247	CGT	2	6	691878	691883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392855
19484	NC_022247	CG	3	6	691944	691949	0 %	0 %	50 %	50 %	538392855
19485	NC_022247	TGA	2	6	692004	692009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392855
19486	NC_022247	AGC	2	6	692051	692056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392855
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