MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022247	GCC	2	6	570840	570845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392753
16002	NC_022247	GCC	2	6	570848	570853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392753
16003	NC_022247	GCCG	2	8	570855	570862	0 %	0 %	50 %	50 %	538392753
16004	NC_022247	TGCG	2	8	570863	570870	0 %	25 %	50 %	25 %	538392753
16005	NC_022247	GAAAA	2	10	570912	570921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_022247	A	6	6	570946	570951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_022247	GCC	2	6	570952	570957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16008	NC_022247	CGG	3	9	570963	570971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_022247	GCA	2	6	571050	571055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392754
16010	NC_022247	CGG	2	6	571070	571075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392754
16011	NC_022247	CG	3	6	571209	571214	0 %	0 %	50 %	50 %	538392754
16012	NC_022247	AG	4	8	571327	571334	50 %	0 %	50 %	0 %	538392754
16013	NC_022247	GAAT	2	8	571374	571381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_022247	TGCA	2	8	571427	571434	25 %	25 %	25 %	25 %	538392755
16015	NC_022247	GTGG	2	8	571463	571470	0 %	25 %	75 %	0 %	538392755
16016	NC_022247	CCG	2	6	571478	571483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16017	NC_022247	GCT	2	6	571489	571494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392755
16018	NC_022247	GGC	3	9	571507	571515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392755
16019	NC_022247	CCG	2	6	571516	571521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16020	NC_022247	GGC	2	6	571537	571542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392755
16021	NC_022247	CAG	2	6	571586	571591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392755
16022	NC_022247	AGCC	2	8	571597	571604	25 %	0 %	25 %	50 %	538392755
16023	NC_022247	TGC	2	6	571611	571616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392755
16024	NC_022247	GCC	2	6	571626	571631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16025	NC_022247	CG	3	6	571634	571639	0 %	0 %	50 %	50 %	538392755
16026	NC_022247	GGCG	2	8	571654	571661	0 %	0 %	75 %	25 %	538392755
16027	NC_022247	GTGC	2	8	571721	571728	0 %	25 %	50 %	25 %	538392755
16028	NC_022247	CCGCG	2	10	571734	571743	0 %	0 %	40 %	60 %	538392755
16029	NC_022247	CAC	3	9	571756	571764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392755
16030	NC_022247	GC	3	6	571802	571807	0 %	0 %	50 %	50 %	538392755
16031	NC_022247	AGC	2	6	571874	571879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392755
16032	NC_022247	CGC	2	6	571965	571970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16033	NC_022247	CGC	2	6	571975	571980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16034	NC_022247	CCG	2	6	572058	572063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16035	NC_022247	CGA	2	6	572095	572100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392755
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16037	NC_022247	GTG	2	6	572174	572179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392755
16038	NC_022247	CGGC	2	8	572182	572189	0 %	0 %	50 %	50 %	538392755
16039	NC_022247	GCT	2	6	572194	572199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392755
16040	NC_022247	CGGC	2	8	572218	572225	0 %	0 %	50 %	50 %	538392755
16041	NC_022247	TGG	2	6	572226	572231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392755
16042	NC_022247	CGC	2	6	572232	572237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16043	NC_022247	GCC	2	6	572291	572296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392755
16044	NC_022247	CGA	2	6	572335	572340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392755
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16046	NC_022247	CGC	2	6	572373	572378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_022247	GAA	2	6	572394	572399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_022247	GCA	3	9	572411	572419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392756
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16051	NC_022247	GCC	2	6	572514	572519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392756
16052	NC_022247	TCG	2	6	572525	572530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392756
16053	NC_022247	GCC	2	6	572541	572546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392756
16054	NC_022247	GCC	3	9	572571	572579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392756
16055	NC_022247	CCAT	2	8	572608	572615	25 %	25 %	0 %	50 %	538392756
16056	NC_022247	CCGG	2	8	572616	572623	0 %	0 %	50 %	50 %	538392756
16057	NC_022247	CAC	2	6	572625	572630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392756
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16059	NC_022247	GCCG	2	8	572694	572701	0 %	0 %	50 %	50 %	538392756
16060	NC_022247	TCG	2	6	572723	572728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392756
16061	NC_022247	CCA	2	6	572768	572773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392756
16062	NC_022247	CGT	2	6	572802	572807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392756
16063	NC_022247	CGA	2	6	572834	572839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392756
16064	NC_022247	TCG	2	6	572846	572851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392756
16065	NC_022247	CCA	2	6	572870	572875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392756
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16067	NC_022247	TGC	2	6	572897	572902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392756
16068	NC_022247	CATGCC	2	12	572907	572918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538392756
16069	NC_022247	T	6	6	572967	572972	0 %	100 %	0 %	0 %	538392756
16070	NC_022247	CAG	2	6	573025	573030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_022247	CGC	2	6	573093	573098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16072	NC_022247	CG	3	6	573118	573123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16073	NC_022247	GTGC	2	8	573143	573150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16074	NC_022247	CGA	2	6	573203	573208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_022247	GGC	2	6	573220	573225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_022247	ACCG	2	8	573267	573274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16077	NC_022247	CCGG	2	8	573277	573284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16078	NC_022247	CCG	2	6	573301	573306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16079	NC_022247	CGA	3	9	573396	573404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392757
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16082	NC_022247	GC	3	6	573475	573480	0 %	0 %	50 %	50 %	538392757
16083	NC_022247	CGAAT	2	10	573483	573492	40 %	20 %	20 %	20 %	538392757
16084	NC_022247	GCAC	2	8	573515	573522	25 %	0 %	25 %	50 %	538392757
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16088	NC_022247	GC	3	6	573565	573570	0 %	0 %	50 %	50 %	538392757
16089	NC_022247	GC	3	6	573662	573667	0 %	0 %	50 %	50 %	538392758
16090	NC_022247	ACC	2	6	573721	573726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392758
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16092	NC_022247	CCGT	2	8	573785	573792	0 %	25 %	25 %	50 %	538392758
16093	NC_022247	GAGC	2	8	573806	573813	25 %	0 %	50 %	25 %	538392758
16094	NC_022247	GCA	2	6	573835	573840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392758
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16100	NC_022247	CGGCG	3	15	574026	574040	0 %	0 %	60 %	40 %	538392758
16101	NC_022247	GGT	2	6	574079	574084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392758
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16106	NC_022247	ACG	2	6	574225	574230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392758
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16111	NC_022247	GGCC	2	8	574308	574315	0 %	0 %	50 %	50 %	538392758
16112	NC_022247	CG	3	6	574350	574355	0 %	0 %	50 %	50 %	538392758
16113	NC_022247	CG	3	6	574418	574423	0 %	0 %	50 %	50 %	538392759
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16116	NC_022247	ACG	2	6	574548	574553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392759
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16118	NC_022247	GC	4	8	574620	574627	0 %	0 %	50 %	50 %	538392759
16119	NC_022247	GCC	2	6	574637	574642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392759
16120	NC_022247	GGC	2	6	574648	574653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392759
16121	NC_022247	GT	3	6	574656	574661	0 %	50 %	50 %	0 %	538392759
16122	NC_022247	GCA	2	6	574671	574676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392759
16123	NC_022247	GCGA	2	8	574727	574734	25 %	0 %	50 %	25 %	538392759
16124	NC_022247	GCCGC	2	10	574798	574807	0 %	0 %	40 %	60 %	538392759
16125	NC_022247	GC	3	6	574806	574811	0 %	0 %	50 %	50 %	538392759
16126	NC_022247	GGC	2	6	574824	574829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392759
16127	NC_022247	TCA	2	6	574863	574868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392759
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16133	NC_022247	CACG	2	8	575028	575035	25 %	0 %	25 %	50 %	538392759
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16137	NC_022247	CAG	2	6	575170	575175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392759
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16141	NC_022247	GC	3	6	575301	575306	0 %	0 %	50 %	50 %	538392759
16142	NC_022247	AGC	2	6	575333	575338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392759
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16144	NC_022247	TCGA	2	8	575432	575439	25 %	25 %	25 %	25 %	538392759
16145	NC_022247	GCG	2	6	575535	575540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392759
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16150	NC_022247	GCA	2	6	575791	575796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392760
16151	NC_022247	GCT	2	6	575818	575823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392760
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16215	NC_022247	GCGG	2	8	577919	577926	0 %	0 %	75 %	25 %	538392760
16216	NC_022247	TC	3	6	577936	577941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16217	NC_022247	TGAA	2	8	577961	577968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16218	NC_022247	GAG	2	6	577971	577976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16219	NC_022247	AGA	2	6	577988	577993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392761
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16227	NC_022247	GCT	3	9	578396	578404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392761
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16229	NC_022247	AGCGC	2	10	578447	578456	20 %	0 %	40 %	40 %	538392761
16230	NC_022247	GC	3	6	578458	578463	0 %	0 %	50 %	50 %	538392761
16231	NC_022247	GC	3	6	578489	578494	0 %	0 %	50 %	50 %	538392761
16232	NC_022247	TGG	2	6	578504	578509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392761
16233	NC_022247	GAAG	2	8	578743	578750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16234	NC_022247	TTC	2	6	578760	578765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16235	NC_022247	T	6	6	578769	578774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16236	NC_022247	GCC	2	6	578801	578806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392762
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16238	NC_022247	GC	3	6	578827	578832	0 %	0 %	50 %	50 %	538392762
16239	NC_022247	CCG	2	6	578865	578870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392762
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16241	NC_022247	CGT	2	6	578970	578975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392762
16242	NC_022247	CG	3	6	578997	579002	0 %	0 %	50 %	50 %	538392762
16243	NC_022247	GCGCCG	2	12	579041	579052	0 %	0 %	50 %	50 %	538392762
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16361	NC_022247	GTTC	2	8	582681	582688	0 %	50 %	25 %	25 %	538392765
16362	NC_022247	ATC	2	6	582800	582805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392766
16363	NC_022247	GC	3	6	582809	582814	0 %	0 %	50 %	50 %	538392766
16364	NC_022247	CGC	2	6	582846	582851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392766
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16370	NC_022247	GCC	2	6	583272	583277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392766
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16373	NC_022247	GC	3	6	583378	583383	0 %	0 %	50 %	50 %	538392766
16374	NC_022247	CTG	2	6	583388	583393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392766
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16378	NC_022247	CCG	2	6	583764	583769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16379	NC_022247	CGG	2	6	583819	583824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392767
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