MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
154501	NC_022247	GCA	2	6	5658319	5658324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397532
154502	NC_022247	GAA	2	6	5658338	5658343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397532
154503	NC_022247	AGGG	2	8	5658351	5658358	25 %	0 %	75 %	0 %	538397532
154504	NC_022247	GC	3	6	5658377	5658382	0 %	0 %	50 %	50 %	538397532
154505	NC_022247	CT	3	6	5658437	5658442	0 %	50 %	0 %	50 %	538397532
154506	NC_022247	GTT	2	6	5658485	5658490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397532
154507	NC_022247	GCT	3	9	5658556	5658564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397532
154508	NC_022247	A	6	6	5658589	5658594	100 %	0 %	0 %	0 %	538397532
154509	NC_022247	CGT	2	6	5658613	5658618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397532
154510	NC_022247	CAA	2	6	5658680	5658685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397532
154511	NC_022247	GC	3	6	5658689	5658694	0 %	0 %	50 %	50 %	538397532
154512	NC_022247	TC	3	6	5658812	5658817	0 %	50 %	0 %	50 %	538397532
154513	NC_022247	TCGT	2	8	5658866	5658873	0 %	50 %	25 %	25 %	538397532
154514	NC_022247	CA	3	6	5658885	5658890	50 %	0 %	0 %	50 %	538397532
154515	NC_022247	GC	3	6	5658932	5658937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154516	NC_022247	TCA	2	6	5658963	5658968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154517	NC_022247	CAT	2	6	5658983	5658988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397533
154518	NC_022247	TAA	2	6	5659005	5659010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397533
154519	NC_022247	CTG	2	6	5659012	5659017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397533
154520	NC_022247	GCCC	2	8	5659055	5659062	0 %	0 %	25 %	75 %	538397533
154521	NC_022247	GC	3	6	5659063	5659068	0 %	0 %	50 %	50 %	538397533
154522	NC_022247	GCTC	2	8	5659079	5659086	0 %	25 %	25 %	50 %	538397533
154523	NC_022247	CGG	2	6	5659128	5659133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397533
154524	NC_022247	CTCTGC	2	12	5659165	5659176	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538397533
154525	NC_022247	CAT	2	6	5659225	5659230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397533
154526	NC_022247	CCT	2	6	5659309	5659314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397533
154527	NC_022247	AGGA	2	8	5659320	5659327	50 %	0 %	50 %	0 %	538397533
154528	NC_022247	TCA	2	6	5659376	5659381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397533
154529	NC_022247	CG	3	6	5659391	5659396	0 %	0 %	50 %	50 %	538397533
154530	NC_022247	CAA	2	6	5659422	5659427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397533
154531	NC_022247	GCA	2	6	5659452	5659457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397533
154532	NC_022247	AAG	2	6	5659471	5659476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397533
154533	NC_022247	ATC	2	6	5659600	5659605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397533
154534	NC_022247	GCA	2	6	5659683	5659688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397533
154535	NC_022247	CGT	2	6	5659719	5659724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397533
154536	NC_022247	ACA	2	6	5659740	5659745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397533
154537	NC_022247	TCAAT	2	10	5659776	5659785	40 %	40 %	0 %	20 %	538397533
154538	NC_022247	GGCC	2	8	5659792	5659799	0 %	0 %	50 %	50 %	538397533
154539	NC_022247	CAA	2	6	5659835	5659840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397533
154540	NC_022247	CGG	2	6	5659926	5659931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397533
154541	NC_022247	GGC	2	6	5659974	5659979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397533
154542	NC_022247	CAGC	2	8	5660011	5660018	25 %	0 %	25 %	50 %	538397533
154543	NC_022247	TCAA	2	8	5660033	5660040	50 %	25 %	0 %	25 %	538397533
154544	NC_022247	GGC	2	6	5660066	5660071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397533
154545	NC_022247	GCG	2	6	5660099	5660104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397533
154546	NC_022247	CA	4	8	5660107	5660114	50 %	0 %	0 %	50 %	538397533
154547	NC_022247	CT	3	6	5660137	5660142	0 %	50 %	0 %	50 %	538397533
154548	NC_022247	TAG	2	6	5660150	5660155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397533
154549	NC_022247	CCATG	2	10	5660166	5660175	20 %	20 %	20 %	40 %	538397533
154550	NC_022247	TGAT	2	8	5660195	5660202	25 %	50 %	25 %	0 %	538397533
154551	NC_022247	CAA	2	6	5660217	5660222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397533
154552	NC_022247	CGC	2	6	5660272	5660277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154553	NC_022247	CGTT	2	8	5660349	5660356	0 %	50 %	25 %	25 %	538397534
154554	NC_022247	T	6	6	5660355	5660360	0 %	100 %	0 %	0 %	538397534
154555	NC_022247	TTG	2	6	5660405	5660410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397534
154556	NC_022247	CTT	2	6	5660425	5660430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397534
154557	NC_022247	TCT	2	6	5660434	5660439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397534
154558	NC_022247	CAA	2	6	5660618	5660623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397534
154559	NC_022247	GAA	2	6	5660704	5660709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397534
154560	NC_022247	TGCT	2	8	5660727	5660734	0 %	50 %	25 %	25 %	538397534
154561	NC_022247	A	6	6	5660959	5660964	100 %	0 %	0 %	0 %	538397534
154562	NC_022247	GCCT	2	8	5661042	5661049	0 %	25 %	25 %	50 %	538397534
154563	NC_022247	CCAG	2	8	5661056	5661063	25 %	0 %	25 %	50 %	538397534
154564	NC_022247	GGC	2	6	5661149	5661154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397534
154565	NC_022247	GAGG	2	8	5661265	5661272	25 %	0 %	75 %	0 %	538397534
154566	NC_022247	GCA	2	6	5661274	5661279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397534
154567	NC_022247	TCGA	2	8	5661297	5661304	25 %	25 %	25 %	25 %	538397534
154568	NC_022247	TTC	2	6	5661422	5661427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397535
154569	NC_022247	GT	3	6	5661442	5661447	0 %	50 %	50 %	0 %	538397535
154570	NC_022247	ACC	2	6	5661483	5661488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397535
154571	NC_022247	C	6	6	5661487	5661492	0 %	0 %	0 %	100 %	538397535
154572	NC_022247	TTAC	2	8	5661512	5661519	25 %	50 %	0 %	25 %	538397535
154573	NC_022247	AAG	2	6	5661563	5661568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397535
154574	NC_022247	CA	3	6	5661592	5661597	50 %	0 %	0 %	50 %	538397535
154575	NC_022247	CGT	2	6	5661633	5661638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397535
154576	NC_022247	ACT	2	6	5661794	5661799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397535
154577	NC_022247	C	6	6	5661852	5661857	0 %	0 %	0 %	100 %	538397535
154578	NC_022247	AT	3	6	5661858	5661863	50 %	50 %	0 %	0 %	538397535
154579	NC_022247	AGT	2	6	5661888	5661893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397535
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154581	NC_022247	GCT	2	6	5662230	5662235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397536
154582	NC_022247	GCA	2	6	5662242	5662247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397536
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154584	NC_022247	TCA	2	6	5662369	5662374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397536
154585	NC_022247	TCC	2	6	5662397	5662402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397536
154586	NC_022247	AG	3	6	5662414	5662419	50 %	0 %	50 %	0 %	538397536
154587	NC_022247	CGA	2	6	5662543	5662548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397536
154588	NC_022247	TCGAAG	2	12	5662550	5662561	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538397536
154589	NC_022247	CAC	2	6	5662655	5662660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397536
154590	NC_022247	ATGC	2	8	5662693	5662700	25 %	25 %	25 %	25 %	538397536
154591	NC_022247	GAC	2	6	5662762	5662767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397536
154592	NC_022247	TGA	2	6	5662804	5662809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397536
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154594	NC_022247	TGGAT	2	10	5662886	5662895	20 %	40 %	40 %	0 %	538397536
154595	NC_022247	TGG	2	6	5662976	5662981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397536
154596	NC_022247	A	6	6	5662990	5662995	100 %	0 %	0 %	0 %	538397536
154597	NC_022247	AG	3	6	5663082	5663087	50 %	0 %	50 %	0 %	538397536
154598	NC_022247	GAA	2	6	5663136	5663141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397536
154599	NC_022247	AG	3	6	5663156	5663161	50 %	0 %	50 %	0 %	538397536
154600	NC_022247	GTTG	2	8	5663164	5663171	0 %	50 %	50 %	0 %	538397536
154601	NC_022247	TGC	2	6	5663254	5663259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397536
154602	NC_022247	CTG	2	6	5663313	5663318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397536
154603	NC_022247	CGG	2	6	5663396	5663401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397536
154604	NC_022247	CGA	2	6	5663532	5663537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397537
154605	NC_022247	ATG	2	6	5663590	5663595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397537
154606	NC_022247	GATC	2	8	5663598	5663605	25 %	25 %	25 %	25 %	538397537
154607	NC_022247	CGA	2	6	5663615	5663620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397537
154608	NC_022247	ACC	2	6	5663831	5663836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397537
154609	NC_022247	CCA	2	6	5663934	5663939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397537
154610	NC_022247	AGC	2	6	5664001	5664006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397537
154611	NC_022247	TAG	2	6	5664010	5664015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397537
154612	NC_022247	AC	3	6	5664200	5664205	50 %	0 %	0 %	50 %	538397538
154613	NC_022247	ATG	2	6	5664216	5664221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397538
154614	NC_022247	A	7	7	5664233	5664239	100 %	0 %	0 %	0 %	538397538
154615	NC_022247	TCCA	2	8	5664506	5664513	25 %	25 %	0 %	50 %	538397538
154616	NC_022247	AGA	2	6	5664528	5664533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397538
154617	NC_022247	GATA	2	8	5664538	5664545	50 %	25 %	25 %	0 %	538397538
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154619	NC_022247	CTG	2	6	5664814	5664819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397538
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154626	NC_022247	GCC	2	6	5665256	5665261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397538
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154634	NC_022247	CGA	2	6	5665664	5665669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397539
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154654	NC_022247	ATG	2	6	5666661	5666666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397539
154655	NC_022247	TCG	2	6	5666700	5666705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397539
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154676	NC_022247	CG	3	6	5667838	5667843	0 %	0 %	50 %	50 %	538397541
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154678	NC_022247	CGA	2	6	5667929	5667934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397541
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154706	NC_022247	GCAATA	2	12	5669829	5669840	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538397543
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154722	NC_022247	AC	3	6	5670772	5670777	50 %	0 %	0 %	50 %	538397543
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154727	NC_022247	TCG	2	6	5670990	5670995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397543
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