MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
152501	NC_022247	GTG	2	6	5584778	5584783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397467
152502	NC_022247	TGC	2	6	5584806	5584811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397467
152503	NC_022247	CGC	2	6	5584812	5584817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397467
152504	NC_022247	CAA	2	6	5584822	5584827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397467
152505	NC_022247	GCT	2	6	5584837	5584842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397467
152506	NC_022247	CG	3	6	5584894	5584899	0 %	0 %	50 %	50 %	538397467
152507	NC_022247	GGCG	2	8	5584906	5584913	0 %	0 %	75 %	25 %	538397467
152508	NC_022247	GC	3	6	5584919	5584924	0 %	0 %	50 %	50 %	538397467
152509	NC_022247	GGT	2	6	5584951	5584956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397467
152510	NC_022247	TGA	2	6	5584965	5584970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397467
152511	NC_022247	CAC	2	6	5584981	5584986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397467
152512	NC_022247	TGC	2	6	5584989	5584994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397467
152513	NC_022247	GGC	2	6	5584995	5585000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397467
152514	NC_022247	GC	3	6	5585015	5585020	0 %	0 %	50 %	50 %	538397467
152515	NC_022247	CG	3	6	5585051	5585056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152516	NC_022247	CGGCC	2	10	5585136	5585145	0 %	0 %	40 %	60 %	538397468
152517	NC_022247	GCC	2	6	5585149	5585154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397468
152518	NC_022247	GGC	2	6	5585161	5585166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397468
152519	NC_022247	ACG	2	6	5585244	5585249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152520	NC_022247	GGC	3	9	5585251	5585259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397468
152521	NC_022247	GAT	2	6	5585263	5585268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397468
152522	NC_022247	ACC	2	6	5585279	5585284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397468
152523	NC_022247	CTG	2	6	5585336	5585341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152524	NC_022247	CCG	2	6	5585377	5585382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397468
152525	NC_022247	GCTG	2	8	5585385	5585392	0 %	25 %	50 %	25 %	538397468
152526	NC_022247	CTGG	2	8	5585407	5585414	0 %	25 %	50 %	25 %	538397468
152527	NC_022247	GCG	2	6	5585438	5585443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397468
152528	NC_022247	TGA	2	6	5585457	5585462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397468
152529	NC_022247	CGC	2	6	5585466	5585471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397468
152530	NC_022247	TGC	2	6	5585472	5585477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152531	NC_022247	GCGCT	2	10	5585510	5585519	0 %	20 %	40 %	40 %	538397468
152532	NC_022247	CCCG	2	8	5585556	5585563	0 %	0 %	25 %	75 %	538397468
152533	NC_022247	CGG	2	6	5585631	5585636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397468
152534	NC_022247	GTG	2	6	5585711	5585716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397468
152535	NC_022247	TCA	2	6	5585766	5585771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397468
152536	NC_022247	TCGCA	2	10	5585807	5585816	20 %	20 %	20 %	40 %	538397468
152537	NC_022247	TCT	3	9	5585844	5585852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397468
152538	NC_022247	TGC	2	6	5585877	5585882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152539	NC_022247	GC	3	6	5585891	5585896	0 %	0 %	50 %	50 %	538397468
152540	NC_022247	GCG	2	6	5585907	5585912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397468
152541	NC_022247	GCT	3	9	5585929	5585937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152542	NC_022247	GCC	2	6	5585939	5585944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397468
152543	NC_022247	TGC	2	6	5586018	5586023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152544	NC_022247	TGC	2	6	5586033	5586038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152545	NC_022247	TCGC	2	8	5586041	5586048	0 %	25 %	25 %	50 %	538397468
152546	NC_022247	GTGG	2	8	5586079	5586086	0 %	25 %	75 %	0 %	538397468
152547	NC_022247	TTC	2	6	5586101	5586106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397468
152548	NC_022247	GGC	2	6	5586107	5586112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397468
152549	NC_022247	GC	5	10	5586178	5586187	0 %	0 %	50 %	50 %	538397468
152550	NC_022247	CGC	3	9	5586292	5586300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397468
152551	NC_022247	CTG	2	6	5586311	5586316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152552	NC_022247	TGG	2	6	5586321	5586326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397468
152553	NC_022247	GAC	2	6	5586359	5586364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397468
152554	NC_022247	CCG	2	6	5586372	5586377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397468
152555	NC_022247	CGGC	2	8	5586390	5586397	0 %	0 %	50 %	50 %	538397468
152556	NC_022247	CCG	2	6	5586398	5586403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397468
152557	NC_022247	GTG	2	6	5586431	5586436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397468
152558	NC_022247	GC	4	8	5586464	5586471	0 %	0 %	50 %	50 %	538397468
152559	NC_022247	GCA	2	6	5586493	5586498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397468
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152561	NC_022247	GC	4	8	5586507	5586514	0 %	0 %	50 %	50 %	538397468
152562	NC_022247	GCT	2	6	5586541	5586546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
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152564	NC_022247	TCG	2	6	5586585	5586590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397468
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152572	NC_022247	CAG	2	6	5586809	5586814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397469
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152577	NC_022247	AGT	2	6	5586955	5586960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397469
152578	NC_022247	CAG	2	6	5586992	5586997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397469
152579	NC_022247	TGC	2	6	5587029	5587034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397469
152580	NC_022247	GTC	2	6	5587056	5587061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152581	NC_022247	CGA	2	6	5587137	5587142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397470
152582	NC_022247	CGC	2	6	5587170	5587175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397470
152583	NC_022247	GCCG	2	8	5587213	5587220	0 %	0 %	50 %	50 %	538397470
152584	NC_022247	GAA	2	6	5587252	5587257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397470
152585	NC_022247	GCCGA	2	10	5587259	5587268	20 %	0 %	40 %	40 %	538397470
152586	NC_022247	CTC	2	6	5587309	5587314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397470
152587	NC_022247	CGA	2	6	5587350	5587355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397470
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152589	NC_022247	CGC	2	6	5587410	5587415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397470
152590	NC_022247	GCCATC	2	12	5587433	5587444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538397470
152591	NC_022247	GCT	3	9	5587450	5587458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397470
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152593	NC_022247	C	6	6	5587508	5587513	0 %	0 %	0 %	100 %	538397470
152594	NC_022247	CTCG	2	8	5587531	5587538	0 %	25 %	25 %	50 %	538397470
152595	NC_022247	CACGG	2	10	5587547	5587556	20 %	0 %	40 %	40 %	538397470
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152597	NC_022247	CAT	2	6	5587633	5587638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397470
152598	NC_022247	GGC	2	6	5587711	5587716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397470
152599	NC_022247	TGC	2	6	5587738	5587743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397470
152600	NC_022247	GTT	2	6	5587756	5587761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397470
152601	NC_022247	CCT	2	6	5587771	5587776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397471
152602	NC_022247	GC	3	6	5587797	5587802	0 %	0 %	50 %	50 %	538397471
152603	NC_022247	CCCAG	2	10	5587817	5587826	20 %	0 %	20 %	60 %	538397471
152604	NC_022247	GC	3	6	5587872	5587877	0 %	0 %	50 %	50 %	538397471
152605	NC_022247	GCCC	2	8	5587952	5587959	0 %	0 %	25 %	75 %	538397471
152606	NC_022247	AGA	2	6	5587994	5587999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397471
152607	NC_022247	CCG	2	6	5588006	5588011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397471
152608	NC_022247	GCCG	2	8	5588016	5588023	0 %	0 %	50 %	50 %	538397471
152609	NC_022247	GC	3	6	5588033	5588038	0 %	0 %	50 %	50 %	538397471
152610	NC_022247	CAG	2	6	5588040	5588045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397471
152611	NC_022247	GC	3	6	5588066	5588071	0 %	0 %	50 %	50 %	538397471
152612	NC_022247	GCC	2	6	5588094	5588099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397471
152613	NC_022247	CAG	3	9	5588103	5588111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397471
152614	NC_022247	AGC	2	6	5588185	5588190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397471
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152658	NC_022247	GCA	2	6	5589607	5589612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397472
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152702	NC_022247	GAAGCG	2	12	5590963	5590974	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538397473
152703	NC_022247	CCATTG	2	12	5590975	5590986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538397473
152704	NC_022247	CGT	2	6	5591013	5591018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397473
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152706	NC_022247	ATG	2	6	5591072	5591077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397473
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152709	NC_022247	CAGC	2	8	5591098	5591105	25 %	0 %	25 %	50 %	538397473
152710	NC_022247	CGA	2	6	5591181	5591186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397473
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152714	NC_022247	CGT	2	6	5591275	5591280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397473
152715	NC_022247	CCA	2	6	5591281	5591286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397473
152716	NC_022247	CCGAG	2	10	5591310	5591319	20 %	0 %	40 %	40 %	538397473
152717	NC_022247	GC	3	6	5591390	5591395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152718	NC_022247	GCA	2	6	5591459	5591464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397474
152719	NC_022247	CG	5	10	5591479	5591488	0 %	0 %	50 %	50 %	538397474
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152721	NC_022247	CAG	2	6	5591508	5591513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397474
152722	NC_022247	CCA	2	6	5591621	5591626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397474
152723	NC_022247	CAG	2	6	5591670	5591675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397474
152724	NC_022247	CGA	3	9	5591690	5591698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397474
152725	NC_022247	CAC	2	6	5591715	5591720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397474
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152727	NC_022247	GGC	2	6	5591733	5591738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397474
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