MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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152002	NC_022247	AGT	2	6	5567376	5567381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397453
152003	NC_022247	CTG	2	6	5567407	5567412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397453
152004	NC_022247	CGG	2	6	5567428	5567433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397453
152005	NC_022247	GCG	2	6	5567497	5567502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397453
152006	NC_022247	GC	3	6	5567601	5567606	0 %	0 %	50 %	50 %	538397453
152007	NC_022247	CAG	2	6	5567614	5567619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397453
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152009	NC_022247	TCA	2	6	5567718	5567723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397453
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152011	NC_022247	CGGCCA	2	12	5567864	5567875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538397454
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152014	NC_022247	GCCG	2	8	5567922	5567929	0 %	0 %	50 %	50 %	538397454
152015	NC_022247	CAG	2	6	5567961	5567966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397454
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152033	NC_022247	GCG	4	12	5568529	5568540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397454
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152037	NC_022247	CG	4	8	5568722	5568729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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152115	NC_022247	CCG	2	6	5571517	5571522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397458
152116	NC_022247	GGT	2	6	5571585	5571590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397458
152117	NC_022247	CG	5	10	5571639	5571648	0 %	0 %	50 %	50 %	538397458
152118	NC_022247	GGT	2	6	5571669	5571674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397458
152119	NC_022247	CGGC	2	8	5571728	5571735	0 %	0 %	50 %	50 %	538397458
152120	NC_022247	CGC	2	6	5571740	5571745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397458
152121	NC_022247	GTG	2	6	5571763	5571768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397458
152122	NC_022247	CG	3	6	5571795	5571800	0 %	0 %	50 %	50 %	538397458
152123	NC_022247	GC	3	6	5571919	5571924	0 %	0 %	50 %	50 %	538397458
152124	NC_022247	TGG	2	6	5571932	5571937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397458
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152126	NC_022247	GCAAG	2	10	5571990	5571999	40 %	0 %	40 %	20 %	538397458
152127	NC_022247	CGC	2	6	5572031	5572036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397458
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152129	NC_022247	AGC	2	6	5572106	5572111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397458
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152131	NC_022247	GC	4	8	5572241	5572248	0 %	0 %	50 %	50 %	538397458
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152135	NC_022247	CGG	2	6	5572323	5572328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397458
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152138	NC_022247	GC	3	6	5572441	5572446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152139	NC_022247	GCG	2	6	5572547	5572552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397459
152140	NC_022247	TGCC	2	8	5572554	5572561	0 %	25 %	25 %	50 %	538397459
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152144	NC_022247	GC	3	6	5572724	5572729	0 %	0 %	50 %	50 %	538397459
152145	NC_022247	GAC	2	6	5572753	5572758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397459
152146	NC_022247	TCG	2	6	5572834	5572839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397459
152147	NC_022247	GC	3	6	5572878	5572883	0 %	0 %	50 %	50 %	538397459
152148	NC_022247	GGC	2	6	5572887	5572892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397459
152149	NC_022247	CGA	2	6	5572914	5572919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397459
152150	NC_022247	ATC	2	6	5572927	5572932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397459
152151	NC_022247	GC	4	8	5573029	5573036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152152	NC_022247	CAG	2	6	5573043	5573048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152153	NC_022247	CG	3	6	5573084	5573089	0 %	0 %	50 %	50 %	538397460
152154	NC_022247	GC	3	6	5573092	5573097	0 %	0 %	50 %	50 %	538397460
152155	NC_022247	CGGC	2	8	5573117	5573124	0 %	0 %	50 %	50 %	538397460
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152161	NC_022247	GGC	2	6	5573364	5573369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397460
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152164	NC_022247	GTC	2	6	5573430	5573435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
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152169	NC_022247	GCA	2	6	5573612	5573617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397460
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152176	NC_022247	GC	3	6	5574102	5574107	0 %	0 %	50 %	50 %	538397460
152177	NC_022247	TGC	2	6	5574112	5574117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
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152185	NC_022247	TGC	2	6	5574299	5574304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
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152188	NC_022247	CTG	2	6	5574327	5574332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
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152194	NC_022247	CGG	2	6	5574464	5574469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397460
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152198	NC_022247	CGA	2	6	5574545	5574550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397460
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152200	NC_022247	GC	4	8	5574578	5574585	0 %	0 %	50 %	50 %	538397460
152201	NC_022247	GGCG	2	8	5574587	5574594	0 %	0 %	75 %	25 %	538397460
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152204	NC_022247	CCTG	2	8	5574649	5574656	0 %	25 %	25 %	50 %	538397460
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152210	NC_022247	GCT	3	9	5574771	5574779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152211	NC_022247	GCG	2	6	5574786	5574791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397460
152212	NC_022247	GAC	2	6	5574867	5574872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152213	NC_022247	CGA	2	6	5574878	5574883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152214	NC_022247	GCT	3	9	5574884	5574892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152215	NC_022247	GGCC	2	8	5574932	5574939	0 %	0 %	50 %	50 %	538397460
152216	NC_022247	GCCA	2	8	5574940	5574947	25 %	0 %	25 %	50 %	538397460
152217	NC_022247	CCA	2	6	5574953	5574958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397460
152218	NC_022247	CGT	2	6	5574989	5574994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152219	NC_022247	TGC	2	6	5575103	5575108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152220	NC_022247	CATCG	2	10	5575113	5575122	20 %	20 %	20 %	40 %	538397460
152221	NC_022247	GAC	2	6	5575156	5575161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152222	NC_022247	GCGA	2	8	5575213	5575220	25 %	0 %	50 %	25 %	538397460
152223	NC_022247	GTC	2	6	5575257	5575262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397460
152224	NC_022247	GC	4	8	5575279	5575286	0 %	0 %	50 %	50 %	538397460
152225	NC_022247	ACGA	2	8	5575365	5575372	50 %	0 %	25 %	25 %	538397460
152226	NC_022247	GAG	2	6	5575405	5575410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397460
152227	NC_022247	GTC	2	6	5575594	5575599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397461
152228	NC_022247	GCC	2	6	5575606	5575611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397461
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152230	NC_022247	CGA	2	6	5575690	5575695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397461
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152328	NC_022247	AG	3	6	5578879	5578884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152329	NC_022247	CGGGC	2	10	5578904	5578913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
152330	NC_022247	GCG	2	6	5578961	5578966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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152333	NC_022247	G	6	6	5579033	5579038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
152334	NC_022247	CG	3	6	5579062	5579067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152335	NC_022247	CT	3	6	5579075	5579080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152336	NC_022247	CG	3	6	5579094	5579099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152337	NC_022247	GGCC	2	8	5579104	5579111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152338	NC_022247	GAA	2	6	5579133	5579138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152339	NC_022247	GGC	3	9	5579142	5579150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397464
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152343	NC_022247	GCGG	2	8	5579205	5579212	0 %	0 %	75 %	25 %	538397464
152344	NC_022247	CGG	2	6	5579297	5579302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397464
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152346	NC_022247	CG	3	6	5579331	5579336	0 %	0 %	50 %	50 %	538397464
152347	NC_022247	GC	4	8	5579351	5579358	0 %	0 %	50 %	50 %	538397464
152348	NC_022247	CAG	2	6	5579427	5579432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397464
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152433	NC_022247	GTC	2	6	5582688	5582693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397464
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152435	NC_022247	TGTC	2	8	5582751	5582758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152436	NC_022247	A	6	6	5582884	5582889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152437	NC_022247	GAA	2	6	5582901	5582906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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152443	NC_022247	TCA	2	6	5583073	5583078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397465
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152448	NC_022247	CG	3	6	5583293	5583298	0 %	0 %	50 %	50 %	538397465
152449	NC_022247	CAG	2	6	5583368	5583373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397465
152450	NC_022247	CCCG	2	8	5583420	5583427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152451	NC_022247	ACA	2	6	5583434	5583439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152452	NC_022247	CCG	2	6	5583485	5583490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397466
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152455	NC_022247	CCTTCG	2	12	5583586	5583597	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538397466
152456	NC_022247	TCG	2	6	5583616	5583621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397466
152457	NC_022247	TCGACA	2	12	5583625	5583636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538397466
152458	NC_022247	TCA	2	6	5583637	5583642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397466
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152492	NC_022247	CTG	2	6	5584532	5584537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397467
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