MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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151002	NC_022247	GC	3	6	5532666	5532671	0 %	0 %	50 %	50 %	538397416
151003	NC_022247	GCG	2	6	5532677	5532682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397416
151004	NC_022247	ATC	2	6	5532688	5532693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397416
151005	NC_022247	GAT	2	6	5532714	5532719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397416
151006	NC_022247	GGC	2	6	5532756	5532761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397416
151007	NC_022247	CG	4	8	5532762	5532769	0 %	0 %	50 %	50 %	538397416
151008	NC_022247	CGCT	2	8	5532778	5532785	0 %	25 %	25 %	50 %	538397416
151009	NC_022247	GC	3	6	5532787	5532792	0 %	0 %	50 %	50 %	538397416
151010	NC_022247	TGA	2	6	5532842	5532847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397416
151011	NC_022247	GCG	2	6	5532901	5532906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397416
151012	NC_022247	TGCC	2	8	5532910	5532917	0 %	25 %	25 %	50 %	538397416
151013	NC_022247	GGA	2	6	5532933	5532938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397416
151014	NC_022247	GGC	2	6	5532963	5532968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397416
151015	NC_022247	CGA	2	6	5532969	5532974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397416
151016	NC_022247	GTG	2	6	5533003	5533008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397416
151017	NC_022247	GCC	2	6	5533188	5533193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397417
151018	NC_022247	GGC	2	6	5533197	5533202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397417
151019	NC_022247	CGG	2	6	5533280	5533285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397417
151020	NC_022247	GCT	2	6	5533289	5533294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397417
151021	NC_022247	GC	3	6	5533296	5533301	0 %	0 %	50 %	50 %	538397417
151022	NC_022247	GCT	2	6	5533308	5533313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397417
151023	NC_022247	GAG	2	6	5533323	5533328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397417
151024	NC_022247	TCA	2	6	5533331	5533336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397417
151025	NC_022247	CGA	2	6	5533340	5533345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397417
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151028	NC_022247	GGCG	2	8	5533419	5533426	0 %	0 %	75 %	25 %	538397417
151029	NC_022247	CGG	3	9	5533436	5533444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397417
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151032	NC_022247	TGC	2	6	5533523	5533528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397417
151033	NC_022247	GC	3	6	5533582	5533587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151034	NC_022247	GTGC	2	8	5533588	5533595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151035	NC_022247	GCG	3	9	5533623	5533631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151036	NC_022247	CGGC	2	8	5533640	5533647	0 %	0 %	50 %	50 %	538397418
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151055	NC_022247	CG	3	6	5534311	5534316	0 %	0 %	50 %	50 %	538397418
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151114	NC_022247	GGC	2	6	5536070	5536075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151115	NC_022247	GGCG	2	8	5536110	5536117	0 %	0 %	75 %	25 %	538397421
151116	NC_022247	CAGC	2	8	5536210	5536217	25 %	0 %	25 %	50 %	538397421
151117	NC_022247	CGT	2	6	5536242	5536247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397421
151118	NC_022247	GAA	2	6	5536294	5536299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397421
151119	NC_022247	ACC	2	6	5536310	5536315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397421
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151121	NC_022247	GCTG	2	8	5536365	5536372	0 %	25 %	50 %	25 %	538397421
151122	NC_022247	CAGC	2	8	5536462	5536469	25 %	0 %	25 %	50 %	538397421
151123	NC_022247	GAAG	2	8	5536504	5536511	50 %	0 %	50 %	0 %	538397421
151124	NC_022247	GGT	2	6	5536558	5536563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397421
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151126	NC_022247	GC	3	6	5536709	5536714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151127	NC_022247	GCT	2	6	5536756	5536761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397422
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151130	NC_022247	TGGCCA	2	12	5536849	5536860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538397422
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151139	NC_022247	GCA	2	6	5537059	5537064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397422
151140	NC_022247	GCC	2	6	5537097	5537102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397422
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151151	NC_022247	GC	4	8	5537525	5537532	0 %	0 %	50 %	50 %	538397422
151152	NC_022247	GCTG	2	8	5537542	5537549	0 %	25 %	50 %	25 %	538397422
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151216	NC_022247	GGGT	2	8	5539718	5539725	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151217	NC_022247	TC	3	6	5539751	5539756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151218	NC_022247	T	6	6	5539808	5539813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151219	NC_022247	CCT	2	6	5539818	5539823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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151225	NC_022247	GC	3	6	5540035	5540040	0 %	0 %	50 %	50 %	538397424
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151230	NC_022247	GGC	2	6	5540169	5540174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397424
151231	NC_022247	CAT	2	6	5540232	5540237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397424
151232	NC_022247	GGC	2	6	5540291	5540296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397424
151233	NC_022247	TTC	2	6	5540317	5540322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397424
151234	NC_022247	GTG	2	6	5540332	5540337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397424
151235	NC_022247	ACT	2	6	5540342	5540347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397424
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151237	NC_022247	CGGCC	2	10	5540364	5540373	0 %	0 %	40 %	60 %	538397424
151238	NC_022247	GCT	3	9	5540379	5540387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397424
151239	NC_022247	CGCT	2	8	5540407	5540414	0 %	25 %	25 %	50 %	538397424
151240	NC_022247	GCA	3	9	5540463	5540471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397424
151241	NC_022247	GACC	2	8	5540475	5540482	25 %	0 %	25 %	50 %	538397424
151242	NC_022247	GCC	2	6	5540491	5540496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397424
151243	NC_022247	GCT	3	9	5540517	5540525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397424
151244	NC_022247	GCGCC	2	10	5540565	5540574	0 %	0 %	40 %	60 %	538397424
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151246	NC_022247	GTGC	2	8	5540624	5540631	0 %	25 %	50 %	25 %	538397425
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151249	NC_022247	GTC	2	6	5540656	5540661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397425
151250	NC_022247	GAG	2	6	5540666	5540671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397425
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151252	NC_022247	GAT	2	6	5540701	5540706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397425
151253	NC_022247	GC	3	6	5540729	5540734	0 %	0 %	50 %	50 %	538397425
151254	NC_022247	CGC	2	6	5540751	5540756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397425
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151258	NC_022247	AAGG	2	8	5540908	5540915	50 %	0 %	50 %	0 %	538397425
151259	NC_022247	GCC	2	6	5540959	5540964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397425
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151262	NC_022247	GTT	2	6	5541186	5541191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397425
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151264	NC_022247	GC	4	8	5541277	5541284	0 %	0 %	50 %	50 %	538397425
151265	NC_022247	TGGC	2	8	5541333	5541340	0 %	25 %	50 %	25 %	538397425
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151267	NC_022247	CCCG	2	8	5541432	5541439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151268	NC_022247	CGG	2	6	5541453	5541458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397426
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151277	NC_022247	GC	3	6	5541799	5541804	0 %	0 %	50 %	50 %	538397426
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151297	NC_022247	CGG	2	6	5542192	5542197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397426
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151300	NC_022247	GTA	2	6	5542313	5542318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397427
151301	NC_022247	GAGCCA	2	12	5542397	5542408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397427
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151312	NC_022247	CGGC	2	8	5542962	5542969	0 %	0 %	50 %	50 %	538397428
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151330	NC_022247	CGG	2	6	5543575	5543580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397429
151331	NC_022247	CAG	3	9	5543585	5543593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397429
151332	NC_022247	TCG	2	6	5543622	5543627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397429
151333	NC_022247	TGC	2	6	5543683	5543688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397429
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151340	NC_022247	GGC	2	6	5543911	5543916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397429
151341	NC_022247	GC	3	6	5543915	5543920	0 %	0 %	50 %	50 %	538397429
151342	NC_022247	CAC	2	6	5543921	5543926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397429
151343	NC_022247	CAG	2	6	5543940	5543945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397429
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151345	NC_022247	GCA	2	6	5544004	5544009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397429
151346	NC_022247	ACC	2	6	5544024	5544029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397429
151347	NC_022247	GCA	2	6	5544088	5544093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397429
151348	NC_022247	CAG	2	6	5544104	5544109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397429
151349	NC_022247	GAA	3	9	5544167	5544175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397429
151350	NC_022247	CAG	2	6	5544188	5544193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397429
151351	NC_022247	CGC	2	6	5544205	5544210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397429
151352	NC_022247	GCG	2	6	5544247	5544252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397429
151353	NC_022247	CGA	2	6	5544266	5544271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397429
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151355	NC_022247	GC	3	6	5544353	5544358	0 %	0 %	50 %	50 %	538397429
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151357	NC_022247	GCC	2	6	5544566	5544571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397430
151358	NC_022247	GCG	2	6	5544607	5544612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397430
151359	NC_022247	GCG	2	6	5544618	5544623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397430
151360	NC_022247	CAG	2	6	5544644	5544649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397430
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151379	NC_022247	GCA	2	6	5545180	5545185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397430
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151393	NC_022247	CTG	2	6	5545668	5545673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397431
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151405	NC_022247	CTTC	2	8	5546023	5546030	0 %	50 %	0 %	50 %	538397432
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151409	NC_022247	CG	3	6	5546136	5546141	0 %	0 %	50 %	50 %	538397432
151410	NC_022247	TGG	2	6	5546157	5546162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397432
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151413	NC_022247	GCCTG	2	10	5546190	5546199	0 %	20 %	40 %	40 %	538397432
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151417	NC_022247	GCT	3	9	5546395	5546403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397432
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151430	NC_022247	GC	3	6	5546812	5546817	0 %	0 %	50 %	50 %	538397432
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151445	NC_022247	GCG	3	9	5547137	5547145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397432
151446	NC_022247	TGC	2	6	5547156	5547161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397432
151447	NC_022247	CGC	2	6	5547177	5547182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397432
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151449	NC_022247	GC	4	8	5547241	5547248	0 %	0 %	50 %	50 %	538397432
151450	NC_022247	GCG	2	6	5547258	5547263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397432
151451	NC_022247	CGGC	2	8	5547297	5547304	0 %	0 %	50 %	50 %	538397432
151452	NC_022247	GCC	2	6	5547333	5547338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397432
151453	NC_022247	TGG	2	6	5547348	5547353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397432
151454	NC_022247	GC	4	8	5547383	5547390	0 %	0 %	50 %	50 %	538397432
151455	NC_022247	GCG	2	6	5547416	5547421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397432
151456	NC_022247	GGC	2	6	5547453	5547458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151457	NC_022247	CGC	2	6	5547488	5547493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151458	NC_022247	TTCGA	2	10	5547533	5547542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151459	NC_022247	CGG	2	6	5547615	5547620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397433
151460	NC_022247	GCT	3	9	5547627	5547635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397433
151461	NC_022247	GGC	2	6	5547636	5547641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397433
151462	NC_022247	GCG	2	6	5547644	5547649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397433
151463	NC_022247	G	8	8	5547655	5547662	0 %	0 %	100 %	0 %	538397433
151464	NC_022247	CGG	2	6	5547663	5547668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397433
151465	NC_022247	CATCGG	2	12	5547669	5547680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538397433
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151467	NC_022247	GTC	2	6	5547718	5547723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397433
151468	NC_022247	CCCG	2	8	5547729	5547736	0 %	0 %	25 %	75 %	538397433
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151472	NC_022247	CCA	2	6	5547887	5547892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397433
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151483	NC_022247	GCT	2	6	5548233	5548238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397433
151484	NC_022247	GGC	2	6	5548258	5548263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397433
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151489	NC_022247	GCA	3	9	5548431	5548439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397433
151490	NC_022247	GCA	2	6	5548457	5548462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397433
151491	NC_022247	CTG	2	6	5548507	5548512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397433
151492	NC_022247	CCG	2	6	5548577	5548582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397433
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151496	NC_022247	GCC	2	6	5548720	5548725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397433
151497	NC_022247	CGC	2	6	5548742	5548747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397433
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151499	NC_022247	GGC	2	6	5548779	5548784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397433
151500	NC_022247	GC	4	8	5548783	5548790	0 %	0 %	50 %	50 %	538397433

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