MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
146001	NC_022247	GCC	2	6	5361308	5361313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397250
146002	NC_022247	TGA	2	6	5361319	5361324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397250
146003	NC_022247	CAC	2	6	5361359	5361364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397250
146004	NC_022247	GCCG	2	8	5361389	5361396	0 %	0 %	50 %	50 %	538397250
146005	NC_022247	TGC	2	6	5361409	5361414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397250
146006	NC_022247	GCA	2	6	5361490	5361495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397250
146007	NC_022247	TGGCC	2	10	5361505	5361514	0 %	20 %	40 %	40 %	538397250
146008	NC_022247	GCG	2	6	5361520	5361525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397250
146009	NC_022247	GCC	2	6	5361560	5361565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397250
146010	NC_022247	GCG	2	6	5361574	5361579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397250
146011	NC_022247	CG	3	6	5361628	5361633	0 %	0 %	50 %	50 %	538397250
146012	NC_022247	CGGC	2	8	5361655	5361662	0 %	0 %	50 %	50 %	538397250
146013	NC_022247	CAT	2	6	5361698	5361703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397250
146014	NC_022247	GGC	2	6	5361725	5361730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146015	NC_022247	CTG	2	6	5361779	5361784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146016	NC_022247	CGG	2	6	5361889	5361894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397251
146017	NC_022247	CCG	2	6	5361896	5361901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146018	NC_022247	ACG	2	6	5361905	5361910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146019	NC_022247	GGCG	2	8	5361928	5361935	0 %	0 %	75 %	25 %	538397251
146020	NC_022247	TTG	2	6	5361968	5361973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397251
146021	NC_022247	CGT	2	6	5361984	5361989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146022	NC_022247	GCC	2	6	5362015	5362020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146023	NC_022247	CCG	2	6	5362061	5362066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146024	NC_022247	TCGT	2	8	5362067	5362074	0 %	50 %	25 %	25 %	538397251
146025	NC_022247	CCG	2	6	5362082	5362087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146026	NC_022247	CAAG	2	8	5362125	5362132	50 %	0 %	25 %	25 %	538397251
146027	NC_022247	GCC	2	6	5362175	5362180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146028	NC_022247	GGAT	2	8	5362187	5362194	25 %	25 %	50 %	0 %	538397251
146029	NC_022247	CTG	2	6	5362264	5362269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146030	NC_022247	CGG	2	6	5362335	5362340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397251
146031	NC_022247	CG	3	6	5362364	5362369	0 %	0 %	50 %	50 %	538397251
146032	NC_022247	CTG	2	6	5362375	5362380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146033	NC_022247	GCCG	2	8	5362384	5362391	0 %	0 %	50 %	50 %	538397251
146034	NC_022247	GTC	2	6	5362507	5362512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146035	NC_022247	GAAG	2	8	5362519	5362526	50 %	0 %	50 %	0 %	538397251
146036	NC_022247	GTA	2	6	5362531	5362536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397251
146037	NC_022247	TGC	2	6	5362623	5362628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146038	NC_022247	CGA	2	6	5362635	5362640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146039	NC_022247	GGT	2	6	5362645	5362650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397251
146040	NC_022247	TTG	2	6	5362691	5362696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397251
146041	NC_022247	GCC	2	6	5362796	5362801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146042	NC_022247	GCC	2	6	5362909	5362914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146043	NC_022247	ATC	2	6	5362997	5363002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397251
146044	NC_022247	GTC	2	6	5363038	5363043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146045	NC_022247	GGT	2	6	5363044	5363049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397251
146046	NC_022247	TGC	2	6	5363074	5363079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397251
146047	NC_022247	CCA	2	6	5363091	5363096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397251
146048	NC_022247	GCG	2	6	5363120	5363125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397251
146049	NC_022247	GCC	2	6	5363227	5363232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146050	NC_022247	ACC	2	6	5363233	5363238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397251
146051	NC_022247	CGC	4	12	5363244	5363255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397251
146052	NC_022247	TTG	2	6	5363358	5363363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146053	NC_022247	GAA	2	6	5363369	5363374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146054	NC_022247	A	7	7	5363412	5363418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146055	NC_022247	GCCG	2	8	5363500	5363507	0 %	0 %	50 %	50 %	538397252
146056	NC_022247	TCA	2	6	5363520	5363525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397252
146057	NC_022247	GTCG	2	8	5363542	5363549	0 %	25 %	50 %	25 %	538397252
146058	NC_022247	CGA	2	6	5363553	5363558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397252
146059	NC_022247	GTGC	2	8	5363575	5363582	0 %	25 %	50 %	25 %	538397252
146060	NC_022247	CG	3	6	5363598	5363603	0 %	0 %	50 %	50 %	538397252
146061	NC_022247	TTG	2	6	5363609	5363614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397252
146062	NC_022247	GCG	2	6	5363619	5363624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397252
146063	NC_022247	GCC	2	6	5363717	5363722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397252
146064	NC_022247	GCGGAT	2	12	5363758	5363769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538397252
146065	NC_022247	T	6	6	5363769	5363774	0 %	100 %	0 %	0 %	538397252
146066	NC_022247	ACG	2	6	5363831	5363836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146067	NC_022247	GCC	2	6	5363854	5363859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397253
146068	NC_022247	CTT	2	6	5363883	5363888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397253
146069	NC_022247	TCCTTG	2	12	5363951	5363962	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	538397253
146070	NC_022247	CGTC	2	8	5363985	5363992	0 %	25 %	25 %	50 %	538397253
146071	NC_022247	GTT	2	6	5364019	5364024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397253
146072	NC_022247	GAA	2	6	5364025	5364030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397253
146073	NC_022247	CGCC	2	8	5364041	5364048	0 %	0 %	25 %	75 %	538397253
146074	NC_022247	CGG	2	6	5364075	5364080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397253
146075	NC_022247	CTT	2	6	5364138	5364143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397253
146076	NC_022247	GCA	3	9	5364159	5364167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146077	NC_022247	CAG	2	6	5364199	5364204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146078	NC_022247	GGT	2	6	5364232	5364237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397253
146079	NC_022247	CGGA	2	8	5364247	5364254	25 %	0 %	50 %	25 %	538397253
146080	NC_022247	CGA	2	6	5364258	5364263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146081	NC_022247	CACGC	2	10	5364289	5364298	20 %	0 %	20 %	60 %	538397253
146082	NC_022247	CAC	2	6	5364313	5364318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397253
146083	NC_022247	GC	3	6	5364380	5364385	0 %	0 %	50 %	50 %	538397253
146084	NC_022247	ATG	2	6	5364428	5364433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397253
146085	NC_022247	GAT	2	6	5364490	5364495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397253
146086	NC_022247	GTC	2	6	5364502	5364507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146087	NC_022247	CGA	2	6	5364552	5364557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146088	NC_022247	CGT	2	6	5364573	5364578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146089	NC_022247	CCA	2	6	5364579	5364584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397253
146090	NC_022247	GAT	2	6	5364607	5364612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397253
146091	NC_022247	CACC	2	8	5364621	5364628	25 %	0 %	0 %	75 %	538397253
146092	NC_022247	GC	3	6	5364631	5364636	0 %	0 %	50 %	50 %	538397253
146093	NC_022247	CAG	2	6	5364637	5364642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397253
146094	NC_022247	CGG	2	6	5364675	5364680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397253
146095	NC_022247	CA	3	6	5364686	5364691	50 %	0 %	0 %	50 %	538397253
146096	NC_022247	GGC	2	6	5364712	5364717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397253
146097	NC_022247	TTC	2	6	5364835	5364840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397253
146098	NC_022247	CGC	2	6	5364876	5364881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397253
146099	NC_022247	CGC	2	6	5364910	5364915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397253
146100	NC_022247	CGG	2	6	5365082	5365087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146101	NC_022247	ACTT	2	8	5365142	5365149	25 %	50 %	0 %	25 %	538397254
146102	NC_022247	AGC	2	6	5365156	5365161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397254
146103	NC_022247	G	6	6	5365185	5365190	0 %	0 %	100 %	0 %	538397254
146104	NC_022247	GCC	2	6	5365306	5365311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397254
146105	NC_022247	GTC	2	6	5365321	5365326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397254
146106	NC_022247	CAT	2	6	5365411	5365416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397254
146107	NC_022247	CCTT	2	8	5365451	5365458	0 %	50 %	0 %	50 %	538397254
146108	NC_022247	TTCG	2	8	5365492	5365499	0 %	50 %	25 %	25 %	538397254
146109	NC_022247	CGT	2	6	5365506	5365511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397254
146110	NC_022247	CGA	2	6	5365545	5365550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397254
146111	NC_022247	CGC	2	6	5365632	5365637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397254
146112	NC_022247	CGA	2	6	5365650	5365655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397254
146113	NC_022247	ACG	2	6	5365697	5365702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397254
146114	NC_022247	GCC	2	6	5365720	5365725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397254
146115	NC_022247	CGAA	2	8	5365733	5365740	50 %	0 %	25 %	25 %	538397254
146116	NC_022247	CTT	2	6	5365752	5365757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397254
146117	NC_022247	GAT	2	6	5365846	5365851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397254
146118	NC_022247	GAT	2	6	5365879	5365884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397254
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146231	NC_022247	CG	4	8	5370199	5370206	0 %	0 %	50 %	50 %	538397258
146232	NC_022247	CAC	2	6	5370217	5370222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397258
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