MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
145001	NC_022247	CCG	2	6	5324807	5324812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397203
145002	NC_022247	CACC	2	8	5324866	5324873	25 %	0 %	0 %	75 %	538397204
145003	NC_022247	GCC	2	6	5324876	5324881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145004	NC_022247	GCG	2	6	5324893	5324898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397204
145005	NC_022247	GCGA	2	8	5324931	5324938	25 %	0 %	50 %	25 %	538397204
145006	NC_022247	GCC	2	6	5324964	5324969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145007	NC_022247	GCC	3	9	5324996	5325004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145008	NC_022247	GAA	2	6	5325026	5325031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397204
145009	NC_022247	CAC	2	6	5325035	5325040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397204
145010	NC_022247	GAT	2	6	5325080	5325085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397204
145011	NC_022247	GCC	2	6	5325195	5325200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145012	NC_022247	GGCC	2	8	5325221	5325228	0 %	0 %	50 %	50 %	538397204
145013	NC_022247	GCCG	2	8	5325311	5325318	0 %	0 %	50 %	50 %	538397204
145014	NC_022247	GCCG	2	8	5325320	5325327	0 %	0 %	50 %	50 %	538397204
145015	NC_022247	CGC	2	6	5325328	5325333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145016	NC_022247	GTT	2	6	5325398	5325403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397204
145017	NC_022247	AGCG	2	8	5325405	5325412	25 %	0 %	50 %	25 %	538397204
145018	NC_022247	GCC	2	6	5325418	5325423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145019	NC_022247	CGT	2	6	5325451	5325456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145020	NC_022247	CGA	2	6	5325460	5325465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145021	NC_022247	GCG	2	6	5325532	5325537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397204
145022	NC_022247	GCCGAT	3	18	5325581	5325598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145023	NC_022247	CAC	2	6	5325665	5325670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397204
145024	NC_022247	CGG	2	6	5325691	5325696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397204
145025	NC_022247	TGC	2	6	5325705	5325710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145026	NC_022247	AGC	2	6	5325714	5325719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145027	NC_022247	GCA	2	6	5325733	5325738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145028	NC_022247	TGG	2	6	5325754	5325759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397204
145029	NC_022247	GCC	2	6	5325824	5325829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145030	NC_022247	GAG	2	6	5325831	5325836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397204
145031	NC_022247	CAG	2	6	5325857	5325862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145032	NC_022247	GCT	2	6	5325919	5325924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397204
145033	NC_022247	CATGG	2	10	5325929	5325938	20 %	20 %	40 %	20 %	538397204
145034	NC_022247	GCC	2	6	5325944	5325949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397204
145035	NC_022247	GGT	2	6	5325962	5325967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397204
145036	NC_022247	CGC	2	6	5326044	5326049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145037	NC_022247	GGCGAA	2	12	5326069	5326080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145038	NC_022247	CAC	2	6	5326203	5326208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145039	NC_022247	GAT	2	6	5326264	5326269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145040	NC_022247	TCG	2	6	5326315	5326320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145041	NC_022247	GGCG	2	8	5326335	5326342	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145042	NC_022247	GCC	2	6	5326343	5326348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145043	NC_022247	ACT	2	6	5326350	5326355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145044	NC_022247	CTG	2	6	5326363	5326368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145045	NC_022247	CCA	2	6	5326379	5326384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145046	NC_022247	CGC	2	6	5326443	5326448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145047	NC_022247	GCTTC	2	10	5326618	5326627	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145048	NC_022247	GGA	2	6	5326649	5326654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145049	NC_022247	A	6	6	5326695	5326700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145050	NC_022247	GCC	2	6	5326701	5326706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145051	NC_022247	GGC	2	6	5326711	5326716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145052	NC_022247	GAA	2	6	5326729	5326734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145053	NC_022247	CTT	2	6	5326739	5326744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145054	NC_022247	CT	3	6	5326745	5326750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145055	NC_022247	GCGCA	2	10	5326779	5326788	20 %	0 %	40 %	40 %	538397206
145056	NC_022247	GCTGC	2	10	5326793	5326802	0 %	20 %	40 %	40 %	538397206
145057	NC_022247	CGATGT	2	12	5326832	5326843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538397206
145058	NC_022247	GCC	2	6	5326876	5326881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397206
145059	NC_022247	TCG	3	9	5326900	5326908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397206
145060	NC_022247	ACGGTG	2	12	5326942	5326953	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538397206
145061	NC_022247	GCC	2	6	5326974	5326979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397206
145062	NC_022247	CGC	2	6	5327000	5327005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397206
145063	NC_022247	GCACC	2	10	5327024	5327033	20 %	0 %	20 %	60 %	538397206
145064	NC_022247	CGGA	2	8	5327034	5327041	25 %	0 %	50 %	25 %	538397206
145065	NC_022247	CGA	2	6	5327105	5327110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397206
145066	NC_022247	TGCC	2	8	5327168	5327175	0 %	25 %	25 %	50 %	538397206
145067	NC_022247	CTT	2	6	5327186	5327191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397207
145068	NC_022247	CTT	2	6	5327199	5327204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397207
145069	NC_022247	TCG	2	6	5327221	5327226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397207
145070	NC_022247	CCA	2	6	5327234	5327239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397207
145071	NC_022247	GGT	2	6	5327261	5327266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397207
145072	NC_022247	ATC	2	6	5327284	5327289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397207
145073	NC_022247	GCGGGC	2	12	5327391	5327402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397207
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145075	NC_022247	CGG	2	6	5327573	5327578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397207
145076	NC_022247	AGCGA	2	10	5327590	5327599	40 %	0 %	40 %	20 %	538397207
145077	NC_022247	CG	3	6	5327603	5327608	0 %	0 %	50 %	50 %	538397207
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145082	NC_022247	CGG	2	6	5327780	5327785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397207
145083	NC_022247	AG	3	6	5327801	5327806	50 %	0 %	50 %	0 %	538397207
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145087	NC_022247	ACG	2	6	5327998	5328003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397207
145088	NC_022247	TGT	2	6	5328098	5328103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397207
145089	NC_022247	TGA	2	6	5328104	5328109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397207
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145092	NC_022247	GCC	2	6	5328165	5328170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397207
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145098	NC_022247	CAC	2	6	5328441	5328446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397207
145099	NC_022247	GCT	3	9	5328458	5328466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397207
145100	NC_022247	CGC	2	6	5328485	5328490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397207
145101	NC_022247	AAT	2	6	5328611	5328616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145102	NC_022247	GCCG	2	8	5328729	5328736	0 %	0 %	50 %	50 %	538397208
145103	NC_022247	CAG	2	6	5328737	5328742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397208
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145108	NC_022247	GC	3	6	5328867	5328872	0 %	0 %	50 %	50 %	538397208
145109	NC_022247	CAG	2	6	5328936	5328941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397208
145110	NC_022247	TCG	2	6	5328943	5328948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397208
145111	NC_022247	GCA	2	6	5329031	5329036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397208
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145114	NC_022247	TGA	2	6	5329070	5329075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397208
145115	NC_022247	AGC	2	6	5329129	5329134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397208
145116	NC_022247	GCG	2	6	5329166	5329171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397208
145117	NC_022247	GGTG	2	8	5329181	5329188	0 %	25 %	75 %	0 %	538397208
145118	NC_022247	CCA	2	6	5329196	5329201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397208
145119	NC_022247	CG	3	6	5329202	5329207	0 %	0 %	50 %	50 %	538397208
145120	NC_022247	TTG	2	6	5329237	5329242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397208
145121	NC_022247	GCA	2	6	5329310	5329315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397208
145122	NC_022247	GCC	2	6	5329329	5329334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397208
145123	NC_022247	GAT	2	6	5329359	5329364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397208
145124	NC_022247	TGGCCT	2	12	5329373	5329384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397208
145125	NC_022247	TTC	3	9	5329387	5329395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397208
145126	NC_022247	CGTG	2	8	5329403	5329410	0 %	25 %	50 %	25 %	538397208
145127	NC_022247	GCGG	2	8	5329470	5329477	0 %	0 %	75 %	25 %	538397208
145128	NC_022247	TCT	2	6	5329541	5329546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397208
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145131	NC_022247	AGC	2	6	5329711	5329716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397209
145132	NC_022247	GCA	2	6	5329717	5329722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397209
145133	NC_022247	CTT	2	6	5329770	5329775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397209
145134	NC_022247	GTC	2	6	5329785	5329790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397209
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145136	NC_022247	GCT	2	6	5329898	5329903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397209
145137	NC_022247	TCG	2	6	5329915	5329920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397209
145138	NC_022247	TGA	2	6	5330000	5330005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397209
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145141	NC_022247	GGCGG	2	10	5330058	5330067	0 %	0 %	80 %	20 %	538397209
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145153	NC_022247	CGA	2	6	5330547	5330552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397209
145154	NC_022247	TGA	2	6	5330606	5330611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397209
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145163	NC_022247	GCC	2	6	5331226	5331231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397210
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145189	NC_022247	ACG	2	6	5332281	5332286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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145202	NC_022247	CGAAAA	2	12	5332614	5332625	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145203	NC_022247	GAT	2	6	5332628	5332633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397213
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145207	NC_022247	GAT	2	6	5332741	5332746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397213
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145213	NC_022247	GTA	2	6	5332993	5332998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397213
145214	NC_022247	CAG	2	6	5333008	5333013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397213
145215	NC_022247	ACG	2	6	5333060	5333065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397213
145216	NC_022247	CAG	2	6	5333161	5333166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397213
145217	NC_022247	TGG	2	6	5333217	5333222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397213
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145219	NC_022247	CAGC	2	8	5333322	5333329	25 %	0 %	25 %	50 %	538397213
145220	NC_022247	AGC	2	6	5333333	5333338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397213
145221	NC_022247	GTG	2	6	5333443	5333448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397213
145222	NC_022247	ATG	2	6	5333450	5333455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397213
145223	NC_022247	CAG	2	6	5333493	5333498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397213
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145226	NC_022247	AAC	2	6	5333634	5333639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397214
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145343	NC_022247	CAG	2	6	5338099	5338104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397219
145344	NC_022247	GCG	2	6	5338110	5338115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397219
145345	NC_022247	CAC	2	6	5338168	5338173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397219
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145380	NC_022247	CCCG	2	8	5339664	5339671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145381	NC_022247	CTG	2	6	5339711	5339716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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145385	NC_022247	GCG	2	6	5339978	5339983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397221
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145455	NC_022247	CGG	2	6	5342104	5342109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397222
145456	NC_022247	GCT	2	6	5342117	5342122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397222
145457	NC_022247	GC	3	6	5342150	5342155	0 %	0 %	50 %	50 %	538397222
145458	NC_022247	CGC	2	6	5342162	5342167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397222
145459	NC_022247	TCG	2	6	5342170	5342175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397222
145460	NC_022247	TCA	2	6	5342185	5342190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397222
145461	NC_022247	CGC	2	6	5342246	5342251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397222
145462	NC_022247	GGC	2	6	5342265	5342270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397222
145463	NC_022247	CTG	2	6	5342370	5342375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397222
145464	NC_022247	GCT	3	9	5342393	5342401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397222
145465	NC_022247	CAGG	2	8	5342415	5342422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145466	NC_022247	CG	3	6	5342500	5342505	0 %	0 %	50 %	50 %	538397223
145467	NC_022247	TCGAGG	2	12	5342563	5342574	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538397223
145468	NC_022247	GGT	2	6	5342609	5342614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397223
145469	NC_022247	GC	3	6	5342643	5342648	0 %	0 %	50 %	50 %	538397223
145470	NC_022247	GGCAGC	2	12	5342649	5342660	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538397223
145471	NC_022247	GC	3	6	5342688	5342693	0 %	0 %	50 %	50 %	538397223
145472	NC_022247	GC	4	8	5342711	5342718	0 %	0 %	50 %	50 %	538397223
145473	NC_022247	GC	3	6	5342748	5342753	0 %	0 %	50 %	50 %	538397223
145474	NC_022247	AGC	2	6	5342773	5342778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397223
145475	NC_022247	GCA	2	6	5342780	5342785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397223
145476	NC_022247	TCGCGC	2	12	5342788	5342799	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538397223
145477	NC_022247	GCA	2	6	5342801	5342806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397223
145478	NC_022247	CGTCGC	2	12	5342862	5342873	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538397223
145479	NC_022247	GCCT	2	8	5342952	5342959	0 %	25 %	25 %	50 %	538397223
145480	NC_022247	CAGC	2	8	5342966	5342973	25 %	0 %	25 %	50 %	538397223
145481	NC_022247	CGGCTG	2	12	5343027	5343038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538397223
145482	NC_022247	GC	3	6	5343045	5343050	0 %	0 %	50 %	50 %	538397223
145483	NC_022247	GGCGTC	2	12	5343066	5343077	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538397223
145484	NC_022247	CG	3	6	5343086	5343091	0 %	0 %	50 %	50 %	538397223
145485	NC_022247	CCG	2	6	5343124	5343129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397223
145486	NC_022247	CGT	2	6	5343162	5343167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145487	NC_022247	CGA	2	6	5343172	5343177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145488	NC_022247	CGGC	2	8	5343196	5343203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145489	NC_022247	CTCGC	2	10	5343271	5343280	0 %	20 %	20 %	60 %	538397224
145490	NC_022247	GCC	2	6	5343303	5343308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397224
145491	NC_022247	ATC	2	6	5343334	5343339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397224
145492	NC_022247	TGC	2	6	5343365	5343370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397224
145493	NC_022247	CG	3	6	5343376	5343381	0 %	0 %	50 %	50 %	538397224
145494	NC_022247	GCC	2	6	5343393	5343398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397224
145495	NC_022247	GC	4	8	5343399	5343406	0 %	0 %	50 %	50 %	538397224
145496	NC_022247	CTG	2	6	5343445	5343450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397224
145497	NC_022247	GCAC	2	8	5343465	5343472	25 %	0 %	25 %	50 %	538397224
145498	NC_022247	TGG	2	6	5343518	5343523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397224
145499	NC_022247	TGC	3	9	5343536	5343544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397224
145500	NC_022247	GTG	2	6	5343571	5343576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397224

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