MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
142501	NC_022247	GCC	2	6	5240624	5240629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397119
142502	NC_022247	CAG	2	6	5240690	5240695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397119
142503	NC_022247	GTG	3	9	5240696	5240704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397119
142504	NC_022247	GC	3	6	5240728	5240733	0 %	0 %	50 %	50 %	538397119
142505	NC_022247	CCA	2	6	5240766	5240771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397119
142506	NC_022247	GCC	2	6	5240792	5240797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397119
142507	NC_022247	GC	4	8	5240823	5240830	0 %	0 %	50 %	50 %	538397119
142508	NC_022247	CGAAG	2	10	5240904	5240913	40 %	0 %	40 %	20 %	538397119
142509	NC_022247	GCCA	2	8	5240921	5240928	25 %	0 %	25 %	50 %	538397119
142510	NC_022247	GTC	2	6	5240932	5240937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397119
142511	NC_022247	GCT	2	6	5240982	5240987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397119
142512	NC_022247	CGA	2	6	5241009	5241014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397119
142513	NC_022247	GCT	2	6	5241018	5241023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397119
142514	NC_022247	CCG	2	6	5241093	5241098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397119
142515	NC_022247	CG	3	6	5241147	5241152	0 %	0 %	50 %	50 %	538397119
142516	NC_022247	TGC	3	9	5241182	5241190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142517	NC_022247	TGCCGC	2	12	5241227	5241238	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538397120
142518	NC_022247	CCG	2	6	5241443	5241448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397120
142519	NC_022247	CAG	2	6	5241474	5241479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397120
142520	NC_022247	CGT	2	6	5241512	5241517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397120
142521	NC_022247	GCA	2	6	5241551	5241556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142522	NC_022247	GCCCG	2	10	5241582	5241591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142523	NC_022247	GCA	2	6	5241604	5241609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142524	NC_022247	T	7	7	5241614	5241620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142525	NC_022247	GCC	2	6	5241625	5241630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142526	NC_022247	CCTT	2	8	5241674	5241681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142527	NC_022247	GCC	2	6	5241697	5241702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142528	NC_022247	CTT	3	9	5241705	5241713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142529	NC_022247	CGTC	2	8	5241719	5241726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142530	NC_022247	GTT	2	6	5241749	5241754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142531	NC_022247	GCC	2	6	5241768	5241773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397121
142532	NC_022247	GCGG	2	8	5241776	5241783	0 %	0 %	75 %	25 %	538397121
142533	NC_022247	GCG	2	6	5241788	5241793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397121
142534	NC_022247	CTT	2	6	5241800	5241805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397121
142535	NC_022247	GGC	4	12	5241806	5241817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397121
142536	NC_022247	CTT	3	9	5241847	5241855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397121
142537	NC_022247	CGG	2	6	5241892	5241897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397121
142538	NC_022247	ACC	2	6	5241963	5241968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397121
142539	NC_022247	GAC	2	6	5241974	5241979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397121
142540	NC_022247	CG	3	6	5241991	5241996	0 %	0 %	50 %	50 %	538397121
142541	NC_022247	CGGC	2	8	5242002	5242009	0 %	0 %	50 %	50 %	538397121
142542	NC_022247	GTG	2	6	5242029	5242034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397121
142543	NC_022247	GCG	2	6	5242038	5242043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397121
142544	NC_022247	GGC	2	6	5242087	5242092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397121
142545	NC_022247	GC	3	6	5242120	5242125	0 %	0 %	50 %	50 %	538397121
142546	NC_022247	GCTC	2	8	5242147	5242154	0 %	25 %	25 %	50 %	538397121
142547	NC_022247	GGC	2	6	5242168	5242173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397121
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142549	NC_022247	CCG	2	6	5242206	5242211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397121
142550	NC_022247	CACC	2	8	5242240	5242247	25 %	0 %	0 %	75 %	538397121
142551	NC_022247	CGT	2	6	5242261	5242266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397121
142552	NC_022247	GAAG	2	8	5242301	5242308	50 %	0 %	50 %	0 %	538397121
142553	NC_022247	TCT	2	6	5242369	5242374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142554	NC_022247	GCCT	2	8	5242445	5242452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142555	NC_022247	GCC	2	6	5242471	5242476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397122
142556	NC_022247	GGCG	2	8	5242488	5242495	0 %	0 %	75 %	25 %	538397122
142557	NC_022247	CGG	2	6	5242496	5242501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397122
142558	NC_022247	GCGCG	2	10	5242506	5242515	0 %	0 %	60 %	40 %	538397122
142559	NC_022247	GGC	2	6	5242551	5242556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397122
142560	NC_022247	CGG	2	6	5242599	5242604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397122
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142562	NC_022247	TGC	2	6	5242611	5242616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397122
142563	NC_022247	CCTT	2	8	5242619	5242626	0 %	50 %	0 %	50 %	538397122
142564	NC_022247	GCC	2	6	5242666	5242671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397122
142565	NC_022247	CAG	2	6	5242722	5242727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397122
142566	NC_022247	CG	3	6	5242776	5242781	0 %	0 %	50 %	50 %	538397122
142567	NC_022247	GCCGT	2	10	5242843	5242852	0 %	20 %	40 %	40 %	538397122
142568	NC_022247	GTA	2	6	5242872	5242877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397122
142569	NC_022247	GC	3	6	5242889	5242894	0 %	0 %	50 %	50 %	538397122
142570	NC_022247	GC	3	6	5242916	5242921	0 %	0 %	50 %	50 %	538397122
142571	NC_022247	GGC	2	6	5242947	5242952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397122
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142573	NC_022247	CAG	2	6	5242959	5242964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397122
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142577	NC_022247	CGA	2	6	5243088	5243093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397122
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142586	NC_022247	CTT	2	6	5243427	5243432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397122
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142589	NC_022247	TCG	2	6	5243467	5243472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397122
142590	NC_022247	GCC	2	6	5243484	5243489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397122
142591	NC_022247	CTG	2	6	5243535	5243540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397122
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142601	NC_022247	CCAC	2	8	5243894	5243901	25 %	0 %	0 %	75 %	538397122
142602	NC_022247	CGGC	2	8	5243968	5243975	0 %	0 %	50 %	50 %	538397122
142603	NC_022247	GAGC	2	8	5244039	5244046	25 %	0 %	50 %	25 %	538397122
142604	NC_022247	CG	4	8	5244219	5244226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142605	NC_022247	GGCA	2	8	5244264	5244271	25 %	0 %	50 %	25 %	538397123
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142609	NC_022247	CGCC	2	8	5244428	5244435	0 %	0 %	25 %	75 %	538397123
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142613	NC_022247	GGCCGA	2	12	5244633	5244644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538397123
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142616	NC_022247	TCG	2	6	5244773	5244778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397123
142617	NC_022247	CGC	2	6	5244920	5244925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397123
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142713	NC_022247	GC	3	6	5248097	5248102	0 %	0 %	50 %	50 %	538397125
142714	NC_022247	GCCG	2	8	5248104	5248111	0 %	0 %	50 %	50 %	538397125
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142720	NC_022247	CTG	2	6	5248281	5248286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397125
142721	NC_022247	GCC	2	6	5248293	5248298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397125
142722	NC_022247	CAT	2	6	5248326	5248331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397125
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142724	NC_022247	GCA	3	9	5248411	5248419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397126
142725	NC_022247	GC	4	8	5248420	5248427	0 %	0 %	50 %	50 %	538397126
142726	NC_022247	CGC	2	6	5248432	5248437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397126
142727	NC_022247	CG	3	6	5248474	5248479	0 %	0 %	50 %	50 %	538397126
142728	NC_022247	GCG	2	6	5248555	5248560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397126
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142914	NC_022247	AGC	2	6	5254352	5254357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397132
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142929	NC_022247	CG	3	6	5255022	5255027	0 %	0 %	50 %	50 %	538397132
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142941	NC_022247	CGGG	2	8	5255388	5255395	0 %	0 %	75 %	25 %	538397132
142942	NC_022247	TTC	2	6	5255417	5255422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397132
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142947	NC_022247	GCA	2	6	5255604	5255609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397132
142948	NC_022247	CGG	3	9	5255629	5255637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397132
142949	NC_022247	GGC	2	6	5255640	5255645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397132
142950	NC_022247	GGC	4	12	5255668	5255679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397132
142951	NC_022247	CGG	2	6	5255682	5255687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397132
142952	NC_022247	GC	3	6	5255697	5255702	0 %	0 %	50 %	50 %	538397132
142953	NC_022247	CGAG	2	8	5255706	5255713	25 %	0 %	50 %	25 %	538397132
142954	NC_022247	GAC	2	6	5255728	5255733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397132
142955	NC_022247	AT	3	6	5255805	5255810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142956	NC_022247	A	6	6	5255826	5255831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142957	NC_022247	CTGGAT	2	12	5255867	5255878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538397133
142958	NC_022247	GCT	2	6	5255893	5255898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397133
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142960	NC_022247	TGG	2	6	5255949	5255954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397133
142961	NC_022247	CCG	2	6	5255967	5255972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397133
142962	NC_022247	CG	3	6	5255997	5256002	0 %	0 %	50 %	50 %	538397133
142963	NC_022247	TCG	2	6	5256069	5256074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397133
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142966	NC_022247	CGA	2	6	5256139	5256144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397133
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142976	NC_022247	GGCGCG	2	12	5256463	5256474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397134
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142982	NC_022247	GCG	2	6	5256651	5256656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397134
142983	NC_022247	GCCG	2	8	5256665	5256672	0 %	0 %	50 %	50 %	538397134
142984	NC_022247	TTG	2	6	5256752	5256757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397134
142985	NC_022247	CG	3	6	5256793	5256798	0 %	0 %	50 %	50 %	538397134
142986	NC_022247	CCT	2	6	5256831	5256836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397134
142987	NC_022247	CGC	2	6	5256868	5256873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397134
142988	NC_022247	CAG	2	6	5256919	5256924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397134
142989	NC_022247	GTC	2	6	5256994	5256999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397134
142990	NC_022247	ATC	2	6	5257004	5257009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397134
142991	NC_022247	GAG	2	6	5257056	5257061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142992	NC_022247	CTG	2	6	5257081	5257086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397135
142993	NC_022247	CGGC	2	8	5257127	5257134	0 %	0 %	50 %	50 %	538397135
142994	NC_022247	GCC	2	6	5257137	5257142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397135
142995	NC_022247	GAT	2	6	5257143	5257148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397135
142996	NC_022247	GCG	2	6	5257167	5257172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397135
142997	NC_022247	CAT	2	6	5257224	5257229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397135
142998	NC_022247	CG	3	6	5257299	5257304	0 %	0 %	50 %	50 %	538397135
142999	NC_022247	GC	3	6	5257330	5257335	0 %	0 %	50 %	50 %	538397135
143000	NC_022247	GCG	3	9	5257339	5257347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397135

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