MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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142002	NC_022247	CAC	2	6	5222910	5222915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397107
142003	NC_022247	GCA	2	6	5222930	5222935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397107
142004	NC_022247	GCC	2	6	5222964	5222969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397107
142005	NC_022247	ATC	2	6	5222986	5222991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397107
142006	NC_022247	CAG	2	6	5223021	5223026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397107
142007	NC_022247	GGC	2	6	5223030	5223035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397107
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142009	NC_022247	GCG	2	6	5223092	5223097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397107
142010	NC_022247	AACG	2	8	5223122	5223129	50 %	0 %	25 %	25 %	538397107
142011	NC_022247	CCA	3	9	5223221	5223229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397107
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142014	NC_022247	GCCC	2	8	5223314	5223321	0 %	0 %	25 %	75 %	538397107
142015	NC_022247	CGGA	2	8	5223341	5223348	25 %	0 %	50 %	25 %	538397107
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142018	NC_022247	GC	4	8	5223450	5223457	0 %	0 %	50 %	50 %	538397107
142019	NC_022247	CAG	2	6	5223471	5223476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397107
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142021	NC_022247	AAGT	2	8	5223511	5223518	50 %	25 %	25 %	0 %	538397107
142022	NC_022247	CAGC	2	8	5223576	5223583	25 %	0 %	25 %	50 %	538397107
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142033	NC_022247	GCAA	2	8	5223844	5223851	50 %	0 %	25 %	25 %	538397107
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142035	NC_022247	TGCG	2	8	5223919	5223926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142036	NC_022247	GCGAT	2	10	5223948	5223957	20 %	20 %	40 %	20 %	538397108
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142115	NC_022247	CG	3	6	5226741	5226746	0 %	0 %	50 %	50 %	538397110
142116	NC_022247	GGCC	2	8	5226786	5226793	0 %	0 %	50 %	50 %	538397110
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142127	NC_022247	ACAT	2	8	5227267	5227274	50 %	25 %	0 %	25 %	538397111
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142136	NC_022247	CACT	2	8	5227613	5227620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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142229	NC_022247	GC	3	6	5231009	5231014	0 %	0 %	50 %	50 %	538397113
142230	NC_022247	GC	4	8	5231061	5231068	0 %	0 %	50 %	50 %	538397113
142231	NC_022247	AGCG	2	8	5231069	5231076	25 %	0 %	50 %	25 %	538397113
142232	NC_022247	GCG	2	6	5231097	5231102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397113
142233	NC_022247	ACG	2	6	5231103	5231108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397113
142234	NC_022247	AGC	2	6	5231129	5231134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397113
142235	NC_022247	GCG	2	6	5231145	5231150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397113
142236	NC_022247	GC	3	6	5231215	5231220	0 %	0 %	50 %	50 %	538397113
142237	NC_022247	CG	3	6	5231240	5231245	0 %	0 %	50 %	50 %	538397113
142238	NC_022247	GCC	2	6	5231306	5231311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397113
142239	NC_022247	CGGC	2	8	5231315	5231322	0 %	0 %	50 %	50 %	538397113
142240	NC_022247	CGA	2	6	5231478	5231483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397113
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142243	NC_022247	GCC	2	6	5231738	5231743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397113
142244	NC_022247	GC	3	6	5231761	5231766	0 %	0 %	50 %	50 %	538397113
142245	NC_022247	CGCA	2	8	5231800	5231807	25 %	0 %	25 %	50 %	538397113
142246	NC_022247	CGCC	2	8	5231813	5231820	0 %	0 %	25 %	75 %	538397113
142247	NC_022247	CCG	3	9	5231822	5231830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397113
142248	NC_022247	ATC	2	6	5231840	5231845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397113
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142250	NC_022247	CTG	2	6	5231866	5231871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397113
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142253	NC_022247	GCT	2	6	5231991	5231996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397113
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142257	NC_022247	GC	4	8	5232255	5232262	0 %	0 %	50 %	50 %	538397113
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142262	NC_022247	GC	3	6	5232403	5232408	0 %	0 %	50 %	50 %	538397114
142263	NC_022247	TGT	2	6	5232428	5232433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397114
142264	NC_022247	CG	3	6	5232434	5232439	0 %	0 %	50 %	50 %	538397114
142265	NC_022247	GCGCC	2	10	5232467	5232476	0 %	0 %	40 %	60 %	538397114
142266	NC_022247	ACC	2	6	5232502	5232507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397114
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142268	NC_022247	GCC	2	6	5232712	5232717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397114
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142272	NC_022247	GGC	2	6	5232924	5232929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397114
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142279	NC_022247	CG	4	8	5233134	5233141	0 %	0 %	50 %	50 %	538397114
142280	NC_022247	ATCGA	2	10	5233143	5233152	40 %	20 %	20 %	20 %	538397114
142281	NC_022247	GCA	3	9	5233154	5233162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397114
142282	NC_022247	GCCGC	2	10	5233168	5233177	0 %	0 %	40 %	60 %	538397114
142283	NC_022247	GCG	2	6	5233226	5233231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397114
142284	NC_022247	AGC	2	6	5233240	5233245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397114
142285	NC_022247	CGT	2	6	5233247	5233252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397114
142286	NC_022247	GGT	2	6	5233338	5233343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397114
142287	NC_022247	CGT	2	6	5233370	5233375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397114
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142292	NC_022247	CAC	2	6	5233578	5233583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397114
142293	NC_022247	GCA	2	6	5233586	5233591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397114
142294	NC_022247	GCG	2	6	5233592	5233597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397114
142295	NC_022247	CGG	2	6	5233598	5233603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397114
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142297	NC_022247	CG	3	6	5233613	5233618	0 %	0 %	50 %	50 %	538397114
142298	NC_022247	TTG	2	6	5233657	5233662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397114
142299	NC_022247	TCT	2	6	5233694	5233699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397114
142300	NC_022247	CGA	2	6	5233715	5233720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397114
142301	NC_022247	TTG	2	6	5233735	5233740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397114
142302	NC_022247	CAC	2	6	5233749	5233754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397114
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142304	NC_022247	GCCGC	2	10	5233787	5233796	0 %	0 %	40 %	60 %	538397114
142305	NC_022247	TCGC	2	8	5233804	5233811	0 %	25 %	25 %	50 %	538397114
142306	NC_022247	CATGG	2	10	5233833	5233842	20 %	20 %	40 %	20 %	538397114
142307	NC_022247	CGC	2	6	5233868	5233873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397114
142308	NC_022247	CG	3	6	5233877	5233882	0 %	0 %	50 %	50 %	538397114
142309	NC_022247	GC	3	6	5233888	5233893	0 %	0 %	50 %	50 %	538397114
142310	NC_022247	GCC	2	6	5233968	5233973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142311	NC_022247	CAA	2	6	5234013	5234018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142312	NC_022247	GC	3	6	5234128	5234133	0 %	0 %	50 %	50 %	538397115
142313	NC_022247	GGC	3	9	5234176	5234184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397115
142314	NC_022247	GCG	2	6	5234195	5234200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397115
142315	NC_022247	ACC	2	6	5234216	5234221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397115
142316	NC_022247	CG	3	6	5234237	5234242	0 %	0 %	50 %	50 %	538397115
142317	NC_022247	TAC	3	9	5234267	5234275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397115
142318	NC_022247	CGGC	2	8	5234352	5234359	0 %	0 %	50 %	50 %	538397115
142319	NC_022247	CCGCG	2	10	5234363	5234372	0 %	0 %	40 %	60 %	538397115
142320	NC_022247	CGAG	2	8	5234373	5234380	25 %	0 %	50 %	25 %	538397115
142321	NC_022247	CCA	2	6	5234415	5234420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397115
142322	NC_022247	CAC	2	6	5234426	5234431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397115
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142324	NC_022247	CAC	2	6	5234507	5234512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397115
142325	NC_022247	GCT	2	6	5234533	5234538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397115
142326	NC_022247	GC	3	6	5234546	5234551	0 %	0 %	50 %	50 %	538397115
142327	NC_022247	GCC	2	6	5234597	5234602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397115
142328	NC_022247	CCGG	2	8	5234635	5234642	0 %	0 %	50 %	50 %	538397115
142329	NC_022247	CGA	2	6	5234659	5234664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397115
142330	NC_022247	GGT	2	6	5234665	5234670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397115
142331	NC_022247	GA	4	8	5234737	5234744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142332	NC_022247	GCCT	2	8	5234791	5234798	0 %	25 %	25 %	50 %	538397116
142333	NC_022247	CGG	2	6	5234811	5234816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397116
142334	NC_022247	GCA	2	6	5234826	5234831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142335	NC_022247	GAG	2	6	5234923	5234928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538397116
142336	NC_022247	CGG	2	6	5234952	5234957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397116
142337	NC_022247	AGCTGC	2	12	5234963	5234974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142338	NC_022247	GC	3	6	5235014	5235019	0 %	0 %	50 %	50 %	538397116
142339	NC_022247	GGC	2	6	5235024	5235029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397116
142340	NC_022247	CTC	2	6	5235072	5235077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397116
142341	NC_022247	GGT	2	6	5235078	5235083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397116
142342	NC_022247	GC	3	6	5235106	5235111	0 %	0 %	50 %	50 %	538397116
142343	NC_022247	TCG	2	6	5235157	5235162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142344	NC_022247	GATGAA	2	12	5235228	5235239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	538397116
142345	NC_022247	AAG	2	6	5235259	5235264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397116
142346	NC_022247	GAA	2	6	5235276	5235281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397116
142347	NC_022247	CTG	2	6	5235289	5235294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142348	NC_022247	GGCA	2	8	5235334	5235341	25 %	0 %	50 %	25 %	538397116
142349	NC_022247	TGG	2	6	5235344	5235349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397116
142350	NC_022247	TCG	2	6	5235374	5235379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142351	NC_022247	TCA	2	6	5235461	5235466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397116
142352	NC_022247	GCT	3	9	5235492	5235500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142353	NC_022247	CAGGC	2	10	5235586	5235595	20 %	0 %	40 %	40 %	538397116
142354	NC_022247	CGC	2	6	5235644	5235649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397116
142355	NC_022247	GC	3	6	5235648	5235653	0 %	0 %	50 %	50 %	538397116
142356	NC_022247	CGCGC	2	10	5235702	5235711	0 %	0 %	40 %	60 %	538397116
142357	NC_022247	CACGC	2	10	5235720	5235729	20 %	0 %	20 %	60 %	538397116
142358	NC_022247	CTG	2	6	5235730	5235735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142359	NC_022247	GCC	2	6	5235736	5235741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397116
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142362	NC_022247	GC	3	6	5235834	5235839	0 %	0 %	50 %	50 %	538397116
142363	NC_022247	GCT	3	9	5235852	5235860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397116
142364	NC_022247	GGT	2	6	5235867	5235872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397116
142365	NC_022247	CGGA	2	8	5235940	5235947	25 %	0 %	50 %	25 %	538397116
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142367	NC_022247	CTC	2	6	5236101	5236106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142368	NC_022247	CCG	2	6	5236198	5236203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142369	NC_022247	AGG	3	9	5236230	5236238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142370	NC_022247	CGG	2	6	5236278	5236283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142371	NC_022247	GCG	2	6	5236300	5236305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142372	NC_022247	CGC	2	6	5236354	5236359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142373	NC_022247	GGCA	2	8	5236435	5236442	25 %	0 %	50 %	25 %	538397117
142374	NC_022247	TCG	2	6	5236485	5236490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397117
142375	NC_022247	CTG	2	6	5236496	5236501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397117
142376	NC_022247	CGG	2	6	5236555	5236560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397117
142377	NC_022247	GTG	2	6	5236598	5236603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397117
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142381	NC_022247	CG	3	6	5236659	5236664	0 %	0 %	50 %	50 %	538397117
142382	NC_022247	GC	3	6	5236665	5236670	0 %	0 %	50 %	50 %	538397117
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142436	NC_022247	CGCC	2	8	5238393	5238400	0 %	0 %	25 %	75 %	538397117
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142446	NC_022247	GC	3	6	5238653	5238658	0 %	0 %	50 %	50 %	538397117
142447	NC_022247	CGC	2	6	5238850	5238855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397117
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142455	NC_022247	TCG	3	9	5239019	5239027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397117
142456	NC_022247	GC	3	6	5239074	5239079	0 %	0 %	50 %	50 %	538397117
142457	NC_022247	GC	4	8	5239130	5239137	0 %	0 %	50 %	50 %	538397117
142458	NC_022247	GC	3	6	5239276	5239281	0 %	0 %	50 %	50 %	538397117
142459	NC_022247	GCG	2	6	5239296	5239301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397117
142460	NC_022247	TTC	2	6	5239325	5239330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397117
142461	NC_022247	GCC	2	6	5239335	5239340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397117
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142492	NC_022247	CGC	2	6	5240320	5240325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397118
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142494	NC_022247	GCA	2	6	5240338	5240343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397118
142495	NC_022247	GC	4	8	5240382	5240389	0 %	0 %	50 %	50 %	538397118
142496	NC_022247	CAG	4	12	5240396	5240407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397118
142497	NC_022247	CGG	2	6	5240414	5240419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397118
142498	NC_022247	GGT	2	6	5240441	5240446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397118
142499	NC_022247	GGC	2	6	5240453	5240458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142500	NC_022247	ACA	2	6	5240523	5240528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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