MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022247	CGCC	2	8	480450	480457	0 %	0 %	25 %	75 %	538392677
13502	NC_022247	GC	3	6	480479	480484	0 %	0 %	50 %	50 %	538392677
13503	NC_022247	CAC	2	6	480491	480496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392677
13504	NC_022247	T	6	6	480583	480588	0 %	100 %	0 %	0 %	538392677
13505	NC_022247	GCC	2	6	480611	480616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392677
13506	NC_022247	ATC	2	6	480651	480656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392677
13507	NC_022247	GC	3	6	480684	480689	0 %	0 %	50 %	50 %	538392677
13508	NC_022247	GCAC	2	8	480706	480713	25 %	0 %	25 %	50 %	538392677
13509	NC_022247	GCA	2	6	480739	480744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392677
13510	NC_022247	CAC	3	9	480755	480763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392677
13511	NC_022247	GCA	2	6	480790	480795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392677
13512	NC_022247	GCA	2	6	480814	480819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392677
13513	NC_022247	GCA	2	6	480913	480918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392677
13514	NC_022247	CGG	2	6	480958	480963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392677
13515	NC_022247	GTT	2	6	481064	481069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392677
13516	NC_022247	CAG	2	6	481070	481075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392677
13517	NC_022247	TGTCT	2	10	481091	481100	0 %	60 %	20 %	20 %	538392677
13518	NC_022247	GGAA	2	8	481110	481117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_022247	TTG	2	6	481122	481127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_022247	CGC	2	6	481176	481181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392678
13521	NC_022247	CGCCGG	2	12	481223	481234	0 %	0 %	50 %	50 %	538392678
13522	NC_022247	CTG	2	6	481248	481253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392678
13523	NC_022247	CG	4	8	481259	481266	0 %	0 %	50 %	50 %	538392678
13524	NC_022247	ATC	2	6	481312	481317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392678
13525	NC_022247	AGCCG	2	10	481334	481343	20 %	0 %	40 %	40 %	538392678
13526	NC_022247	CTC	2	6	481362	481367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392678
13527	NC_022247	GAA	2	6	481368	481373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392678
13528	NC_022247	TGG	2	6	481415	481420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392678
13529	NC_022247	GTC	2	6	481428	481433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392678
13530	NC_022247	CGA	2	6	481488	481493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392678
13531	NC_022247	CTT	2	6	481668	481673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392678
13532	NC_022247	AGC	2	6	481681	481686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392678
13533	NC_022247	GTG	2	6	481711	481716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392678
13534	NC_022247	TCG	2	6	481777	481782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392678
13535	NC_022247	GAA	2	6	481842	481847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392678
13536	NC_022247	GTGC	2	8	481848	481855	0 %	25 %	50 %	25 %	538392678
13537	NC_022247	GGC	2	6	481907	481912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392678
13538	NC_022247	CGC	3	9	482036	482044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392678
13539	NC_022247	CATC	2	8	482049	482056	25 %	25 %	0 %	50 %	538392678
13540	NC_022247	TCT	2	6	482120	482125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392678
13541	NC_022247	TCA	2	6	482126	482131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392678
13542	NC_022247	AGG	2	6	482160	482165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392679
13543	NC_022247	CAC	2	6	482255	482260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392679
13544	NC_022247	CAG	2	6	482264	482269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392679
13545	NC_022247	CGC	2	6	482323	482328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392679
13546	NC_022247	CGG	2	6	482338	482343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392679
13547	NC_022247	GGC	2	6	482384	482389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392679
13548	NC_022247	CCG	2	6	482425	482430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392679
13549	NC_022247	AGCAC	2	10	482437	482446	40 %	0 %	20 %	40 %	538392679
13550	NC_022247	TGC	2	6	482506	482511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392679
13551	NC_022247	CGC	2	6	482526	482531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392679
13552	NC_022247	GCG	2	6	482543	482548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392679
13553	NC_022247	TGCCC	2	10	482617	482626	0 %	20 %	20 %	60 %	538392679
13554	NC_022247	TGAACT	2	12	482629	482640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538392679
13555	NC_022247	CGGC	2	8	482641	482648	0 %	0 %	50 %	50 %	538392679
13556	NC_022247	GCG	2	6	482665	482670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392679
13557	NC_022247	AG	3	6	482721	482726	50 %	0 %	50 %	0 %	538392679
13558	NC_022247	GCC	2	6	482762	482767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392679
13559	NC_022247	ATC	2	6	482769	482774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392679
13560	NC_022247	CGA	2	6	482779	482784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392679
13561	NC_022247	CCA	2	6	482803	482808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392679
13562	NC_022247	ACC	2	6	482856	482861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392679
13563	NC_022247	ACC	2	6	482874	482879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392679
13564	NC_022247	GCC	2	6	482900	482905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392679
13565	NC_022247	CAG	2	6	482912	482917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392679
13566	NC_022247	CAC	3	9	482930	482938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392679
13567	NC_022247	TCGA	2	8	482946	482953	25 %	25 %	25 %	25 %	538392679
13568	NC_022247	ACA	2	6	482959	482964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392679
13569	NC_022247	GC	3	6	482970	482975	0 %	0 %	50 %	50 %	538392679
13570	NC_022247	CAG	3	9	483041	483049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392679
13571	NC_022247	TTG	2	6	483075	483080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392679
13572	NC_022247	GCC	2	6	483095	483100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392679
13573	NC_022247	GCA	2	6	483186	483191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392680
13574	NC_022247	TCC	2	6	483197	483202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392680
13575	NC_022247	AATTC	2	10	483216	483225	40 %	40 %	0 %	20 %	538392680
13576	NC_022247	GAT	2	6	483274	483279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392680
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13578	NC_022247	ATCACG	2	12	483299	483310	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538392680
13579	NC_022247	TGG	2	6	483344	483349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392680
13580	NC_022247	CGC	2	6	483375	483380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392680
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13583	NC_022247	CAG	2	6	483421	483426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392680
13584	NC_022247	CTG	2	6	483445	483450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392680
13585	NC_022247	GCC	2	6	483454	483459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392680
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13588	NC_022247	CGA	2	6	483592	483597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392680
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13590	NC_022247	CG	3	6	483732	483737	0 %	0 %	50 %	50 %	538392680
13591	NC_022247	CGGC	2	8	483779	483786	0 %	0 %	50 %	50 %	538392680
13592	NC_022247	CGC	2	6	483816	483821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392680
13593	NC_022247	CGG	2	6	483916	483921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392680
13594	NC_022247	GTA	2	6	483922	483927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392680
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13597	NC_022247	GCA	2	6	484017	484022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392680
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13599	NC_022247	GAT	2	6	484075	484080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392680
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13602	NC_022247	CCA	2	6	484209	484214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392680
13603	NC_022247	GCT	2	6	484215	484220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392680
13604	NC_022247	GGC	2	6	484291	484296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392680
13605	NC_022247	GC	4	8	484295	484302	0 %	0 %	50 %	50 %	538392680
13606	NC_022247	CAC	2	6	484453	484458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392680
13607	NC_022247	TCG	2	6	484487	484492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392680
13608	NC_022247	GAT	2	6	484510	484515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392680
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13612	NC_022247	GC	3	6	484683	484688	0 %	0 %	50 %	50 %	538392681
13613	NC_022247	GTC	2	6	484710	484715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392681
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13619	NC_022247	GGC	2	6	485094	485099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392681
13620	NC_022247	GCG	2	6	485160	485165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392681
13621	NC_022247	GCC	2	6	485214	485219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392681
13622	NC_022247	GCC	2	6	485242	485247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392681
13623	NC_022247	AGG	2	6	485282	485287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392681
13624	NC_022247	GCA	2	6	485390	485395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392681
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13626	NC_022247	GCT	2	6	485441	485446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392681
13627	NC_022247	CGT	2	6	485453	485458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392681
13628	NC_022247	GCT	2	6	485507	485512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392681
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13630	NC_022247	TCA	2	6	485564	485569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392681
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13635	NC_022247	GCT	2	6	485846	485851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13640	NC_022247	CCGCG	2	10	486035	486044	0 %	0 %	40 %	60 %	538392682
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13643	NC_022247	CG	4	8	486085	486092	0 %	0 %	50 %	50 %	538392682
13644	NC_022247	GC	3	6	486197	486202	0 %	0 %	50 %	50 %	538392682
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13657	NC_022247	GGC	2	6	486915	486920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392682
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13736	NC_022247	TGCGCC	2	12	489005	489016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392683
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13980	NC_022247	GCC	2	6	498209	498214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13981	NC_022247	C	6	6	498213	498218	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13982	NC_022247	ACCC	2	8	498235	498242	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13983	NC_022247	ATC	2	6	498257	498262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13984	NC_022247	ACTGA	2	10	498273	498282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13985	NC_022247	CCG	2	6	498321	498326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392691
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13989	NC_022247	TTCGT	2	10	498497	498506	0 %	60 %	20 %	20 %	538392691
13990	NC_022247	TCG	2	6	498581	498586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392691
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13997	NC_022247	GCCGG	2	10	498778	498787	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13998	NC_022247	CGG	2	6	498897	498902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13999	NC_022247	GATC	2	8	498907	498914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14000	NC_022247	GCCG	2	8	498988	498995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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