MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022247	CAA	2	6	411553	411558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_022247	ATCCG	2	10	411643	411652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11503	NC_022247	TTA	2	6	411677	411682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538392615
11504	NC_022247	GCA	2	6	411721	411726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392615
11505	NC_022247	AGC	2	6	411768	411773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392615
11506	NC_022247	CCT	2	6	411924	411929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392616
11507	NC_022247	GC	3	6	411930	411935	0 %	0 %	50 %	50 %	538392616
11508	NC_022247	GCG	2	6	411963	411968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392616
11509	NC_022247	GGT	2	6	411982	411987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392616
11510	NC_022247	GAT	2	6	412001	412006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392616
11511	NC_022247	GCC	2	6	412022	412027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392616
11512	NC_022247	GCT	2	6	412048	412053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392616
11513	NC_022247	GCC	2	6	412071	412076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392616
11514	NC_022247	GC	4	8	412172	412179	0 %	0 %	50 %	50 %	538392616
11515	NC_022247	GC	3	6	412210	412215	0 %	0 %	50 %	50 %	538392616
11516	NC_022247	GCC	2	6	412235	412240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392616
11517	NC_022247	TCGA	2	8	412295	412302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11518	NC_022247	TCT	2	6	412305	412310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_022247	CTT	2	6	412314	412319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_022247	GCC	3	9	412396	412404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392617
11521	NC_022247	TCCC	2	8	412519	412526	0 %	25 %	0 %	75 %	538392617
11522	NC_022247	GCT	2	6	412527	412532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11523	NC_022247	GC	4	8	412575	412582	0 %	0 %	50 %	50 %	538392617
11524	NC_022247	CG	3	6	412598	412603	0 %	0 %	50 %	50 %	538392617
11525	NC_022247	GCA	2	6	412644	412649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11526	NC_022247	GATCGC	2	12	412668	412679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11527	NC_022247	CGG	2	6	412683	412688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392617
11528	NC_022247	GAT	2	6	412707	412712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392617
11529	NC_022247	GCG	3	9	412721	412729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392617
11530	NC_022247	GTG	2	6	412738	412743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392617
11531	NC_022247	GCC	2	6	412754	412759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392617
11532	NC_022247	TGG	2	6	412769	412774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392617
11533	NC_022247	TGCTCG	2	12	412808	412819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11534	NC_022247	GAG	2	6	412855	412860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392617
11535	NC_022247	GCT	2	6	412878	412883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11536	NC_022247	CTG	2	6	412903	412908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11537	NC_022247	CCCG	2	8	412923	412930	0 %	0 %	25 %	75 %	538392617
11538	NC_022247	CCG	2	6	413043	413048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392617
11539	NC_022247	GCT	2	6	413055	413060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11540	NC_022247	CTG	2	6	413068	413073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11541	NC_022247	TCG	2	6	413105	413110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11542	NC_022247	GCA	2	6	413115	413120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392617
11543	NC_022247	GCG	2	6	413122	413127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392617
11544	NC_022247	GTG	2	6	413245	413250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392617
11545	NC_022247	CGAC	2	8	413255	413262	25 %	0 %	25 %	50 %	538392617
11546	NC_022247	CGC	2	6	413265	413270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392617
11547	NC_022247	GTG	2	6	413299	413304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392617
11548	NC_022247	CACC	2	8	413327	413334	25 %	0 %	0 %	75 %	538392617
11549	NC_022247	CG	3	6	413365	413370	0 %	0 %	50 %	50 %	538392617
11550	NC_022247	CG	3	6	413459	413464	0 %	0 %	50 %	50 %	538392617
11551	NC_022247	CGG	2	6	413526	413531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392617
11552	NC_022247	AAG	2	6	413554	413559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392617
11553	NC_022247	GC	3	6	413568	413573	0 %	0 %	50 %	50 %	538392617
11554	NC_022247	GGC	2	6	413574	413579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392617
11555	NC_022247	CGCT	2	8	413582	413589	0 %	25 %	25 %	50 %	538392617
11556	NC_022247	GC	3	6	413644	413649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_022247	GC	3	6	413662	413667	0 %	0 %	50 %	50 %	538392618
11558	NC_022247	GAT	2	6	413718	413723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392618
11559	NC_022247	GGT	2	6	413724	413729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392618
11560	NC_022247	CG	4	8	413804	413811	0 %	0 %	50 %	50 %	538392618
11561	NC_022247	CGC	2	6	413869	413874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392618
11562	NC_022247	CG	3	6	413896	413901	0 %	0 %	50 %	50 %	538392618
11563	NC_022247	ATC	2	6	413911	413916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392618
11564	NC_022247	GATC	2	8	413927	413934	25 %	25 %	25 %	25 %	538392618
11565	NC_022247	GTC	2	6	414036	414041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392618
11566	NC_022247	GAA	2	6	414102	414107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392618
11567	NC_022247	GAT	2	6	414120	414125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392618
11568	NC_022247	CGA	2	6	414140	414145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392618
11569	NC_022247	ACC	2	6	414157	414162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392618
11570	NC_022247	CG	3	6	414188	414193	0 %	0 %	50 %	50 %	538392618
11571	NC_022247	CAC	2	6	414222	414227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392618
11572	NC_022247	CTG	2	6	414252	414257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392618
11573	NC_022247	A	6	6	414362	414367	100 %	0 %	0 %	0 %	538392618
11574	NC_022247	GCA	2	6	414368	414373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392618
11575	NC_022247	CAAG	2	8	414386	414393	50 %	0 %	25 %	25 %	538392618
11576	NC_022247	TGCCGA	2	12	414398	414409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392618
11577	NC_022247	TGG	2	6	414419	414424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392618
11578	NC_022247	GC	3	6	414469	414474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11579	NC_022247	CG	3	6	414501	414506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11580	NC_022247	GCC	2	6	414537	414542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11581	NC_022247	GCC	3	9	414566	414574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11582	NC_022247	ATC	3	9	414576	414584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392619
11583	NC_022247	GCTC	2	8	414607	414614	0 %	25 %	25 %	50 %	538392619
11584	NC_022247	GCC	2	6	414638	414643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11585	NC_022247	GCGTG	2	10	414685	414694	0 %	20 %	60 %	20 %	538392619
11586	NC_022247	CGGC	2	8	414741	414748	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11587	NC_022247	CCA	2	6	414823	414828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392619
11588	NC_022247	GCG	2	6	414861	414866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392619
11589	NC_022247	CG	3	6	414883	414888	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11590	NC_022247	TCG	2	6	414903	414908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392619
11591	NC_022247	AGGC	2	8	414909	414916	25 %	0 %	50 %	25 %	538392619
11592	NC_022247	GC	3	6	414931	414936	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11593	NC_022247	CTT	2	6	414997	415002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392619
11594	NC_022247	GC	3	6	415016	415021	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11595	NC_022247	CAC	2	6	415065	415070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392619
11596	NC_022247	CGCGTG	2	12	415089	415100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392619
11597	NC_022247	GGCC	2	8	415102	415109	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11598	NC_022247	CAG	2	6	415124	415129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392619
11599	NC_022247	CTC	2	6	415154	415159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392619
11600	NC_022247	GC	3	6	415191	415196	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11601	NC_022247	TGA	2	6	415207	415212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392619
11602	NC_022247	CAC	2	6	415229	415234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392619
11603	NC_022247	GTG	2	6	415260	415265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392619
11604	NC_022247	GCC	2	6	415272	415277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11605	NC_022247	GCC	3	9	415286	415294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11606	NC_022247	GCG	2	6	415314	415319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392619
11607	NC_022247	TCT	2	6	415321	415326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392619
11608	NC_022247	CGC	2	6	415327	415332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11609	NC_022247	GCA	2	6	415333	415338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392619
11610	NC_022247	GGC	2	6	415341	415346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392619
11611	NC_022247	TCGC	2	8	415368	415375	0 %	25 %	25 %	50 %	538392619
11612	NC_022247	GCA	2	6	415378	415383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392619
11613	NC_022247	TGT	2	6	415402	415407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392619
11614	NC_022247	CGC	3	9	415429	415437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11615	NC_022247	GC	3	6	415448	415453	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11616	NC_022247	GCC	2	6	415499	415504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392619
11617	NC_022247	GCCGAG	2	12	415520	415531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538392619
11618	NC_022247	CG	4	8	415547	415554	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
11619	NC_022247	GC	3	6	415561	415566	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
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11621	NC_022247	CG	3	6	415652	415657	0 %	0 %	50 %	50 %	538392619
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11742	NC_022247	CGA	2	6	419745	419750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392622
11743	NC_022247	GCG	2	6	419792	419797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392622
11744	NC_022247	GCTT	2	8	419801	419808	0 %	50 %	25 %	25 %	538392622
11745	NC_022247	GGC	2	6	419811	419816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392622
11746	NC_022247	GCGCT	2	10	419820	419829	0 %	20 %	40 %	40 %	538392622
11747	NC_022247	GCATCG	2	12	419872	419883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392623
11748	NC_022247	CG	4	8	419913	419920	0 %	0 %	50 %	50 %	538392623
11749	NC_022247	CG	3	6	419924	419929	0 %	0 %	50 %	50 %	538392623
11750	NC_022247	CGT	2	6	419942	419947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392623
11751	NC_022247	AGC	2	6	419950	419955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392623
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11753	NC_022247	CTG	2	6	420006	420011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392623
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11757	NC_022247	GCGCG	2	10	420159	420168	0 %	0 %	60 %	40 %	538392623
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11864	NC_022247	CAG	2	6	424031	424036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392625
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11869	NC_022247	GCAG	2	8	424141	424148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11984	NC_022247	CAC	2	6	428742	428747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392629
11985	NC_022247	CAA	2	6	428766	428771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392629
11986	NC_022247	TCGA	2	8	428818	428825	25 %	25 %	25 %	25 %	538392629
11987	NC_022247	ACG	2	6	428885	428890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392629
11988	NC_022247	CTA	2	6	428916	428921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392629
11989	NC_022247	CCA	2	6	428927	428932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392629
11990	NC_022247	CCGAGG	2	12	428939	428950	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538392629
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11992	NC_022247	TCG	2	6	428981	428986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392629
11993	NC_022247	TGC	2	6	428999	429004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392629
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11999	NC_022247	ATCGGC	2	12	429240	429251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392629
12000	NC_022247	CGC	2	6	429262	429267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392630

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