MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022247	ACT	2	6	376236	376241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392579
10502	NC_022247	GCC	2	6	376277	376282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392579
10503	NC_022247	CG	3	6	376320	376325	0 %	0 %	50 %	50 %	538392579
10504	NC_022247	GTGGC	2	10	376337	376346	0 %	20 %	60 %	20 %	538392579
10505	NC_022247	CCG	2	6	376359	376364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392579
10506	NC_022247	CCT	2	6	376380	376385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10507	NC_022247	CG	3	6	376437	376442	0 %	0 %	50 %	50 %	538392580
10508	NC_022247	TC	3	6	376496	376501	0 %	50 %	0 %	50 %	538392580
10509	NC_022247	GCT	2	6	376520	376525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10510	NC_022247	GCC	2	6	376527	376532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392580
10511	NC_022247	TCG	2	6	376561	376566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10512	NC_022247	CAG	2	6	376596	376601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10513	NC_022247	GTG	2	6	376635	376640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392580
10514	NC_022247	GCG	2	6	376654	376659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392580
10515	NC_022247	GGC	2	6	376668	376673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392580
10516	NC_022247	GGT	2	6	376677	376682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392580
10517	NC_022247	CG	3	6	376688	376693	0 %	0 %	50 %	50 %	538392580
10518	NC_022247	GC	3	6	376698	376703	0 %	0 %	50 %	50 %	538392580
10519	NC_022247	GC	3	6	376720	376725	0 %	0 %	50 %	50 %	538392580
10520	NC_022247	GCA	3	9	376739	376747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10521	NC_022247	GC	3	6	376766	376771	0 %	0 %	50 %	50 %	538392580
10522	NC_022247	TTC	2	6	376903	376908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392580
10523	NC_022247	AAGG	2	8	376911	376918	50 %	0 %	50 %	0 %	538392580
10524	NC_022247	CG	3	6	376952	376957	0 %	0 %	50 %	50 %	538392580
10525	NC_022247	AGC	2	6	376972	376977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10526	NC_022247	GGT	2	6	376991	376996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392580
10527	NC_022247	CGA	2	6	377045	377050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10528	NC_022247	GCC	2	6	377138	377143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392580
10529	NC_022247	CGA	2	6	377169	377174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10530	NC_022247	TGG	3	9	377252	377260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392580
10531	NC_022247	GATG	2	8	377264	377271	25 %	25 %	50 %	0 %	538392580
10532	NC_022247	GCA	2	6	377336	377341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10533	NC_022247	CTG	2	6	377361	377366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10534	NC_022247	CGG	2	6	377387	377392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392580
10535	NC_022247	GGC	2	6	377397	377402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392580
10536	NC_022247	TCA	2	6	377435	377440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392580
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10538	NC_022247	GCT	2	6	377529	377534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392580
10539	NC_022247	CG	3	6	377541	377546	0 %	0 %	50 %	50 %	538392580
10540	NC_022247	GGT	2	6	377649	377654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392580
10541	NC_022247	TCG	2	6	377766	377771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392581
10542	NC_022247	TCG	2	6	377867	377872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392581
10543	NC_022247	CGC	2	6	377907	377912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392581
10544	NC_022247	GCC	2	6	377923	377928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392581
10545	NC_022247	CGT	2	6	377937	377942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392581
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10547	NC_022247	GCG	2	6	378030	378035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392581
10548	NC_022247	TCG	2	6	378216	378221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392581
10549	NC_022247	GCC	2	6	378238	378243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392581
10550	NC_022247	TTC	2	6	378248	378253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392581
10551	NC_022247	GCC	2	6	378268	378273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392581
10552	NC_022247	GCC	2	6	378287	378292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392581
10553	NC_022247	CG	4	8	378309	378316	0 %	0 %	50 %	50 %	538392581
10554	NC_022247	GC	3	6	378366	378371	0 %	0 %	50 %	50 %	538392581
10555	NC_022247	CG	3	6	378393	378398	0 %	0 %	50 %	50 %	538392581
10556	NC_022247	GCA	2	6	378456	378461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392581
10557	NC_022247	GGC	2	6	378516	378521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392581
10558	NC_022247	CTG	2	6	378523	378528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392581
10559	NC_022247	GGCGC	2	10	378565	378574	0 %	0 %	60 %	40 %	538392581
10560	NC_022247	GAGC	2	8	378601	378608	25 %	0 %	50 %	25 %	538392581
10561	NC_022247	ATGC	2	8	378652	378659	25 %	25 %	25 %	25 %	538392581
10562	NC_022247	CAGCG	2	10	378707	378716	20 %	0 %	40 %	40 %	538392581
10563	NC_022247	GGC	2	6	378722	378727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392581
10564	NC_022247	GGT	2	6	378751	378756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392581
10565	NC_022247	ACC	2	6	378794	378799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392581
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10567	NC_022247	GGCGC	2	10	378840	378849	0 %	0 %	60 %	40 %	538392581
10568	NC_022247	AGC	2	6	378869	378874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392581
10569	NC_022247	GC	3	6	378896	378901	0 %	0 %	50 %	50 %	538392581
10570	NC_022247	ATGA	2	8	379035	379042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_022247	TGCG	2	8	379051	379058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10572	NC_022247	GC	4	8	379067	379074	0 %	0 %	50 %	50 %	538392582
10573	NC_022247	GCA	2	6	379092	379097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392582
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10575	NC_022247	CT	3	6	379157	379162	0 %	50 %	0 %	50 %	538392582
10576	NC_022247	TCG	2	6	379208	379213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392582
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10580	NC_022247	GC	3	6	379329	379334	0 %	0 %	50 %	50 %	538392583
10581	NC_022247	AC	3	6	379335	379340	50 %	0 %	0 %	50 %	538392583
10582	NC_022247	GCA	2	6	379355	379360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
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10585	NC_022247	CAG	2	6	379506	379511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
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10587	NC_022247	GC	3	6	379567	379572	0 %	0 %	50 %	50 %	538392583
10588	NC_022247	GCC	2	6	379588	379593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392583
10589	NC_022247	GCG	2	6	379594	379599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392583
10590	NC_022247	GCG	2	6	379646	379651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392583
10591	NC_022247	GCA	2	6	379658	379663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
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10593	NC_022247	GCC	2	6	379679	379684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392583
10594	NC_022247	GC	3	6	379701	379706	0 %	0 %	50 %	50 %	538392583
10595	NC_022247	GGCGT	2	10	379710	379719	0 %	20 %	60 %	20 %	538392583
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10598	NC_022247	TCG	2	6	379813	379818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392583
10599	NC_022247	GCTCGC	2	12	379826	379837	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392583
10600	NC_022247	AGC	2	6	379852	379857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
10601	NC_022247	AGC	2	6	380086	380091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
10602	NC_022247	GC	4	8	380090	380097	0 %	0 %	50 %	50 %	538392583
10603	NC_022247	GCA	3	9	380195	380203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
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10605	NC_022247	C	6	6	380266	380271	0 %	0 %	0 %	100 %	538392583
10606	NC_022247	C	7	7	380298	380304	0 %	0 %	0 %	100 %	538392583
10607	NC_022247	G	8	8	380307	380314	0 %	0 %	100 %	0 %	538392583
10608	NC_022247	CGG	3	9	380334	380342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392583
10609	NC_022247	CATC	2	8	380348	380355	25 %	25 %	0 %	50 %	538392583
10610	NC_022247	CGG	2	6	380462	380467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392583
10611	NC_022247	GCT	2	6	380522	380527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392583
10612	NC_022247	TTG	2	6	380542	380547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392583
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10615	NC_022247	CTG	2	6	380613	380618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392583
10616	NC_022247	TGA	2	6	380624	380629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392583
10617	NC_022247	GCA	2	6	380657	380662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
10618	NC_022247	TCG	2	6	380683	380688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392583
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10620	NC_022247	CGC	2	6	380741	380746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392583
10621	NC_022247	CG	4	8	380793	380800	0 %	0 %	50 %	50 %	538392583
10622	NC_022247	GTTGTC	2	12	380817	380828	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	538392583
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10625	NC_022247	CGA	2	6	380897	380902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392583
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10629	NC_022247	CGG	2	6	381280	381285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392584
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10639	NC_022247	CTGG	2	8	381665	381672	0 %	25 %	50 %	25 %	538392584
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10646	NC_022247	CCA	2	6	381823	381828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392584
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10651	NC_022247	CTT	2	6	381953	381958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392584
10652	NC_022247	GT	3	6	381972	381977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10653	NC_022247	CTT	2	6	382077	382082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10654	NC_022247	GAAC	2	8	382086	382093	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10655	NC_022247	CGC	2	6	382138	382143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
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10674	NC_022247	GCC	2	6	382675	382680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
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10722	NC_022247	ATG	2	6	384785	384790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392588
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10726	NC_022247	CGGC	2	8	384993	385000	0 %	0 %	50 %	50 %	538392589
10727	NC_022247	GTA	2	6	385018	385023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392589
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10732	NC_022247	CAG	2	6	385346	385351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392589
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10737	NC_022247	CAG	2	6	385491	385496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392590
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10982	NC_022247	GCA	2	6	394113	394118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392598
10983	NC_022247	TCG	2	6	394145	394150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392598
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10985	NC_022247	CG	3	6	394180	394185	0 %	0 %	50 %	50 %	538392598
10986	NC_022247	GCC	2	6	394255	394260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392598
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