MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022247	GCCCTT	2	12	18818	18829	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538392250
502	NC_022247	GGC	2	6	18831	18836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392250
503	NC_022247	GGC	3	9	18866	18874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392250
504	NC_022247	GGCGT	2	10	18888	18897	0 %	20 %	60 %	20 %	538392250
505	NC_022247	GC	3	6	19000	19005	0 %	0 %	50 %	50 %	538392250
506	NC_022247	CTTC	2	8	19030	19037	0 %	50 %	0 %	50 %	538392250
507	NC_022247	AGG	2	6	19102	19107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392250
508	NC_022247	GGCC	2	8	19156	19163	0 %	0 %	50 %	50 %	538392250
509	NC_022247	GTG	2	6	19170	19175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392250
510	NC_022247	CGCC	2	8	19183	19190	0 %	0 %	25 %	75 %	538392250
511	NC_022247	AAG	2	6	19218	19223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392250
512	NC_022247	AC	3	6	19230	19235	50 %	0 %	0 %	50 %	538392250
513	NC_022247	GTC	2	6	19236	19241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392250
514	NC_022247	CAG	2	6	19253	19258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392250
515	NC_022247	TCA	2	6	19299	19304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392251
516	NC_022247	GCC	3	9	19357	19365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392251
517	NC_022247	CAA	2	6	19457	19462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392251
518	NC_022247	GC	3	6	19500	19505	0 %	0 %	50 %	50 %	538392251
519	NC_022247	GC	3	6	19526	19531	0 %	0 %	50 %	50 %	538392251
520	NC_022247	CGG	2	6	19541	19546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392251
521	NC_022247	GCA	2	6	19553	19558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392251
522	NC_022247	CG	3	6	19578	19583	0 %	0 %	50 %	50 %	538392251
523	NC_022247	GCT	2	6	19649	19654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392251
524	NC_022247	CTGG	2	8	19698	19705	0 %	25 %	50 %	25 %	538392251
525	NC_022247	GCT	2	6	19720	19725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392251
526	NC_022247	GCC	2	6	19726	19731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392251
527	NC_022247	GCG	5	15	19733	19747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392251
528	NC_022247	CG	3	6	19746	19751	0 %	0 %	50 %	50 %	538392251
529	NC_022247	CAG	2	6	19782	19787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392251
530	NC_022247	TGA	2	6	19826	19831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392251
531	NC_022247	GGC	2	6	19872	19877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
532	NC_022247	GC	3	6	19933	19938	0 %	0 %	50 %	50 %	538392252
533	NC_022247	GGCG	2	8	19950	19957	0 %	0 %	75 %	25 %	538392252
534	NC_022247	GCC	2	6	19960	19965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392252
535	NC_022247	CGG	2	6	19971	19976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
536	NC_022247	CCAGCA	2	12	19977	19988	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538392252
537	NC_022247	GCC	2	6	20071	20076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392252
538	NC_022247	CAG	2	6	20083	20088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392252
539	NC_022247	GCG	2	6	20128	20133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
540	NC_022247	CGA	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392252
541	NC_022247	ACC	2	6	20228	20233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392252
542	NC_022247	GCT	2	6	20236	20241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392252
543	NC_022247	CG	3	6	20247	20252	0 %	0 %	50 %	50 %	538392252
544	NC_022247	CAG	2	6	20272	20277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392252
545	NC_022247	CGA	2	6	20335	20340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392252
546	NC_022247	CAG	2	6	20341	20346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392252
547	NC_022247	GGCC	2	8	20367	20374	0 %	0 %	50 %	50 %	538392252
548	NC_022247	CGC	2	6	20393	20398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392252
549	NC_022247	CAG	2	6	20410	20415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392252
550	NC_022247	CGCCAG	2	12	20422	20433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392252
551	NC_022247	CCA	2	6	20439	20444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392252
552	NC_022247	CGC	2	6	20449	20454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392252
553	NC_022247	GCG	2	6	20457	20462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
554	NC_022247	GCAG	2	8	20468	20475	25 %	0 %	50 %	25 %	538392252
555	NC_022247	GCC	2	6	20479	20484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392252
556	NC_022247	GCA	2	6	20496	20501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392252
557	NC_022247	GCCA	2	8	20534	20541	25 %	0 %	25 %	50 %	538392252
558	NC_022247	GCG	2	6	20550	20555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
559	NC_022247	TGCCA	2	10	20579	20588	20 %	20 %	20 %	40 %	538392252
560	NC_022247	GGC	2	6	20599	20604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
561	NC_022247	TCG	2	6	20627	20632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392252
562	NC_022247	GCG	2	6	20681	20686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
563	NC_022247	AGCC	2	8	20699	20706	25 %	0 %	25 %	50 %	538392252
564	NC_022247	GGC	2	6	20707	20712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392252
565	NC_022247	TTTTC	2	10	20784	20793	0 %	80 %	0 %	20 %	538392252
566	NC_022247	GCG	2	6	20818	20823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
567	NC_022247	GCG	2	6	20833	20838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
568	NC_022247	CG	4	8	20837	20844	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
569	NC_022247	GCG	3	9	20842	20850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
570	NC_022247	CAC	2	6	20872	20877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392253
571	NC_022247	GCTC	2	8	20937	20944	0 %	25 %	25 %	50 %	538392253
572	NC_022247	GCGGCA	2	12	20952	20963	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538392253
573	NC_022247	GCG	2	6	20991	20996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
574	NC_022247	CAC	2	6	21007	21012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392253
575	NC_022247	CAG	2	6	21046	21051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
576	NC_022247	GCC	3	9	21094	21102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392253
577	NC_022247	GCGCA	2	10	21157	21166	20 %	0 %	40 %	40 %	538392253
578	NC_022247	CG	3	6	21274	21279	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
579	NC_022247	CGT	2	6	21342	21347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392253
580	NC_022247	CCG	2	6	21359	21364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392253
581	NC_022247	CCA	2	6	21399	21404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392253
582	NC_022247	GCG	2	6	21406	21411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
583	NC_022247	GC	3	6	21415	21420	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
584	NC_022247	TGA	3	9	21450	21458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392253
585	NC_022247	GC	4	8	21476	21483	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
586	NC_022247	CGA	2	6	21511	21516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
587	NC_022247	CCGT	2	8	21599	21606	0 %	25 %	25 %	50 %	538392253
588	NC_022247	CAC	2	6	21613	21618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392253
589	NC_022247	CTTC	2	8	21636	21643	0 %	50 %	0 %	50 %	538392253
590	NC_022247	TGC	2	6	21684	21689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392253
591	NC_022247	GCC	2	6	21694	21699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392253
592	NC_022247	TGG	2	6	21711	21716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392253
593	NC_022247	GC	3	6	21737	21742	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
594	NC_022247	TTG	2	6	21773	21778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392253
595	NC_022247	CAG	2	6	21790	21795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
596	NC_022247	GCC	2	6	21823	21828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392253
597	NC_022247	CG	3	6	21912	21917	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
598	NC_022247	GGC	2	6	21931	21936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
599	NC_022247	GGC	2	6	21947	21952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
600	NC_022247	AGAA	2	8	21965	21972	75 %	0 %	25 %	0 %	538392253
601	NC_022247	CGG	2	6	22074	22079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
602	NC_022247	GGC	2	6	22080	22085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
603	NC_022247	ACG	2	6	22100	22105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
604	NC_022247	CTT	2	6	22129	22134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392253
605	NC_022247	GAC	2	6	22151	22156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
606	NC_022247	CCT	2	6	22164	22169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392253
607	NC_022247	CG	3	6	22231	22236	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
608	NC_022247	CCAC	2	8	22251	22258	25 %	0 %	0 %	75 %	538392253
609	NC_022247	TGT	2	6	22287	22292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392253
610	NC_022247	CAC	2	6	22303	22308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392253
611	NC_022247	CAG	2	6	22348	22353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
612	NC_022247	CGT	2	6	22380	22385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392253
613	NC_022247	TGC	2	6	22433	22438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392253
614	NC_022247	AGC	2	6	22442	22447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
615	NC_022247	GCG	2	6	22448	22453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392253
616	NC_022247	CCTT	2	8	22460	22467	0 %	50 %	0 %	50 %	538392253
617	NC_022247	CTG	2	6	22495	22500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392253
618	NC_022247	GC	3	6	22604	22609	0 %	0 %	50 %	50 %	538392253
619	NC_022247	TCG	2	6	22715	22720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392253
620	NC_022247	GAA	2	6	22729	22734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392253
621	NC_022247	CGA	2	6	22803	22808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
622	NC_022247	CCG	2	6	22812	22817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392253
623	NC_022247	GAGCCA	2	12	22837	22848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392253
624	NC_022247	CG	3	6	22936	22941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_022247	GCT	2	6	22958	22963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_022247	TG	3	6	22990	22995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022247	TG	3	6	23001	23006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022247	CCG	2	6	23011	23016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_022247	GAG	2	6	23077	23082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022247	GTT	2	6	23099	23104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392254
631	NC_022247	GCT	2	6	23144	23149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392254
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636	NC_022247	GCT	3	9	23282	23290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392254
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639	NC_022247	GCA	2	6	23362	23367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392254
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661	NC_022247	CTG	4	12	24237	24248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392254
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663	NC_022247	TGC	3	9	24307	24315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392254
664	NC_022247	CGCGG	2	10	24354	24363	0 %	0 %	60 %	40 %	538392254
665	NC_022247	GC	3	6	24394	24399	0 %	0 %	50 %	50 %	538392254
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668	NC_022247	CTG	2	6	24447	24452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392254
669	NC_022247	T	7	7	24589	24595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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753	NC_022247	CGG	2	6	27357	27362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392256
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755	NC_022247	GCC	2	6	27419	27424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392256
756	NC_022247	CG	4	8	27457	27464	0 %	0 %	50 %	50 %	538392256
757	NC_022247	AAGGCC	2	12	27506	27517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392256
758	NC_022247	GCA	2	6	27547	27552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392256
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772	NC_022247	TTC	2	6	28247	28252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392257
773	NC_022247	GCGCTC	2	12	28258	28269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392257
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777	NC_022247	TGCGC	2	10	28464	28473	0 %	20 %	40 %	40 %	538392257
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789	NC_022247	GC	4	8	28735	28742	0 %	0 %	50 %	50 %	538392257
790	NC_022247	AGT	2	6	28785	28790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392257
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819	NC_022247	CGTG	2	8	29960	29967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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825	NC_022247	CCT	2	6	30521	30526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392259
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863	NC_022247	GC	3	6	31902	31907	0 %	0 %	50 %	50 %	538392261
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865	NC_022247	TGAA	2	8	32071	32078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
866	NC_022247	ATG	2	6	32104	32109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
867	NC_022247	ATG	2	6	32156	32161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
868	NC_022247	CTG	2	6	32191	32196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392262
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872	NC_022247	GTG	2	6	32344	32349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392262
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880	NC_022247	GCT	2	6	32511	32516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392262
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883	NC_022247	GGC	2	6	32583	32588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392262
884	NC_022247	GC	4	8	32609	32616	0 %	0 %	50 %	50 %	538392262
885	NC_022247	CG	3	6	32623	32628	0 %	0 %	50 %	50 %	538392262
886	NC_022247	CTG	2	6	32668	32673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392262
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890	NC_022247	GC	3	6	32738	32743	0 %	0 %	50 %	50 %	538392262
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896	NC_022247	CG	3	6	32863	32868	0 %	0 %	50 %	50 %	538392262
897	NC_022247	GCA	2	6	32871	32876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392262
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899	NC_022247	CG	3	6	32909	32914	0 %	0 %	50 %	50 %	538392262
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910	NC_022247	TGCC	2	8	33345	33352	0 %	25 %	25 %	50 %	538392262
911	NC_022247	GC	3	6	33356	33361	0 %	0 %	50 %	50 %	538392262
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946	NC_022247	GCT	3	9	34398	34406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392262
947	NC_022247	GCG	2	6	34407	34412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392262
948	NC_022247	CAG	2	6	34448	34453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392263
949	NC_022247	CAG	2	6	34457	34462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392263
950	NC_022247	GTC	2	6	34466	34471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392263
951	NC_022247	CG	3	6	34730	34735	0 %	0 %	50 %	50 %	538392263
952	NC_022247	CGTAGA	2	12	34765	34776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538392263
953	NC_022247	CAC	2	6	34853	34858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392263
954	NC_022247	GAA	2	6	34946	34951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
955	NC_022247	TTC	2	6	34985	34990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392264
956	NC_022247	GCC	2	6	35019	35024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392264
957	NC_022247	CGAA	2	8	35030	35037	50 %	0 %	25 %	25 %	538392264
958	NC_022247	CG	3	6	35069	35074	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
959	NC_022247	AGGTCG	2	12	35089	35100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538392264
960	NC_022247	CCA	2	6	35171	35176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392264
961	NC_022247	GCC	3	9	35187	35195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392264
962	NC_022247	C	6	6	35194	35199	0 %	0 %	0 %	100 %	538392264
963	NC_022247	ATGG	2	8	35211	35218	25 %	25 %	50 %	0 %	538392264
964	NC_022247	TGG	2	6	35222	35227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392264
965	NC_022247	GGC	2	6	35268	35273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
966	NC_022247	CGG	2	6	35276	35281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
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969	NC_022247	GCGCG	2	10	35357	35366	0 %	0 %	60 %	40 %	538392264
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971	NC_022247	CGG	2	6	35384	35389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
972	NC_022247	TGG	2	6	35423	35428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392264
973	NC_022247	CG	3	6	35470	35475	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
974	NC_022247	GCG	3	9	35506	35514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
975	NC_022247	CG	3	6	35535	35540	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
976	NC_022247	CGGC	2	8	35553	35560	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
977	NC_022247	GGC	2	6	35587	35592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
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980	NC_022247	GC	3	6	35692	35697	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
981	NC_022247	TCGCC	2	10	35699	35708	0 %	20 %	20 %	60 %	538392264
982	NC_022247	GAG	2	6	35722	35727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392264
983	NC_022247	GCGCAG	2	12	35728	35739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538392264
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985	NC_022247	GCG	2	6	35835	35840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
986	NC_022247	GC	3	6	35857	35862	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
987	NC_022247	GTG	2	6	35863	35868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392264
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989	NC_022247	AGA	2	6	35906	35911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392264
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991	NC_022247	GCG	2	6	35959	35964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
992	NC_022247	CG	4	8	35969	35976	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
993	NC_022247	TCGA	2	8	36000	36007	25 %	25 %	25 %	25 %	538392264
994	NC_022247	TGC	2	6	36023	36028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392264
995	NC_022247	CGG	2	6	36032	36037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
996	NC_022247	GGC	2	6	36054	36059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
997	NC_022247	CG	4	8	36103	36110	0 %	0 %	50 %	50 %	538392264
998	NC_022247	TCG	2	6	36139	36144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392264
999	NC_022247	GCG	2	6	36167	36172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392264
1000	NC_022247	GGC	2	6	36277	36282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392265

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