MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022247	ACG	2	6	226692	226697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6502	NC_022247	CG	3	6	226721	226726	0 %	0 %	50 %	50 %	538392450
6503	NC_022247	CGA	2	6	226741	226746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6504	NC_022247	GGCGCT	2	12	226747	226758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392450
6505	NC_022247	TCGCGA	2	12	226839	226850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6506	NC_022247	GCT	3	9	226867	226875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6507	NC_022247	GTG	2	6	226994	226999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392450
6508	NC_022247	GCC	2	6	227037	227042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392450
6509	NC_022247	ACC	2	6	227076	227081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392450
6510	NC_022247	AGG	2	6	227091	227096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392450
6511	NC_022247	GCC	2	6	227141	227146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392450
6512	NC_022247	AGC	2	6	227167	227172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6513	NC_022247	GCAC	2	8	227180	227187	25 %	0 %	25 %	50 %	538392451
6514	NC_022247	ACG	2	6	227246	227251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6515	NC_022247	GCG	2	6	227265	227270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392451
6516	NC_022247	GTC	2	6	227278	227283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6517	NC_022247	TCA	2	6	227403	227408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392451
6518	NC_022247	CCG	2	6	227445	227450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392451
6519	NC_022247	AGC	2	6	227495	227500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6520	NC_022247	CGC	2	6	227506	227511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392451
6521	NC_022247	GGC	2	6	227599	227604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392451
6522	NC_022247	GCG	3	9	227612	227620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392451
6523	NC_022247	AGC	2	6	227621	227626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6524	NC_022247	GC	3	6	227641	227646	0 %	0 %	50 %	50 %	538392451
6525	NC_022247	TGC	2	6	227672	227677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6526	NC_022247	CGA	2	6	227679	227684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6527	NC_022247	TCG	2	6	227711	227716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6528	NC_022247	CTG	2	6	227767	227772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392451
6529	NC_022247	CCA	2	6	227852	227857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392451
6530	NC_022247	CG	3	6	227917	227922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6531	NC_022247	CTT	2	6	227928	227933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_022247	ACC	2	6	227946	227951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6533	NC_022247	CTG	2	6	228015	228020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392452
6534	NC_022247	GCT	2	6	228077	228082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392452
6535	NC_022247	TCG	2	6	228106	228111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392452
6536	NC_022247	CGG	2	6	228113	228118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392452
6537	NC_022247	GGT	2	6	228146	228151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392452
6538	NC_022247	TCA	2	6	228157	228162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392452
6539	NC_022247	CGT	2	6	228226	228231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392452
6540	NC_022247	GC	3	6	228238	228243	0 %	0 %	50 %	50 %	538392452
6541	NC_022247	CAG	2	6	228263	228268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392452
6542	NC_022247	CGA	2	6	228326	228331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392452
6543	NC_022247	TCA	2	6	228373	228378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392452
6544	NC_022247	GAG	2	6	228423	228428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392452
6545	NC_022247	GGC	2	6	228456	228461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392452
6546	NC_022247	AGC	2	6	228469	228474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392452
6547	NC_022247	CG	3	6	228542	228547	0 %	0 %	50 %	50 %	538392452
6548	NC_022247	CG	3	6	228586	228591	0 %	0 %	50 %	50 %	538392452
6549	NC_022247	GCTC	2	8	228607	228614	0 %	25 %	25 %	50 %	538392452
6550	NC_022247	CCG	2	6	228664	228669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392452
6551	NC_022247	CCGCA	2	10	228693	228702	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6552	NC_022247	CCCG	2	8	228709	228716	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6553	NC_022247	CAA	2	6	228718	228723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_022247	ACA	2	6	228726	228731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_022247	GC	3	6	228768	228773	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
6556	NC_022247	TGG	2	6	228776	228781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392453
6557	NC_022247	GCG	2	6	228785	228790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392453
6558	NC_022247	CTT	2	6	228814	228819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392453
6559	NC_022247	CG	3	6	228829	228834	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
6560	NC_022247	CGGCC	2	10	228888	228897	0 %	0 %	40 %	60 %	538392453
6561	NC_022247	CG	3	6	228919	228924	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
6562	NC_022247	CAA	2	6	228951	228956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392453
6563	NC_022247	GCG	2	6	228962	228967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392453
6564	NC_022247	ACG	2	6	228998	229003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392453
6565	NC_022247	GCC	2	6	229027	229032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392453
6566	NC_022247	CGA	2	6	229050	229055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392453
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6568	NC_022247	CGC	2	6	229148	229153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392453
6569	NC_022247	TGG	2	6	229154	229159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392453
6570	NC_022247	CAC	2	6	229161	229166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392453
6571	NC_022247	CTG	2	6	229192	229197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392453
6572	NC_022247	GC	3	6	229206	229211	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
6573	NC_022247	ATC	2	6	229237	229242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392453
6574	NC_022247	TC	3	6	229248	229253	0 %	50 %	0 %	50 %	538392453
6575	NC_022247	TCG	2	6	229267	229272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392453
6576	NC_022247	GGT	2	6	229278	229283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392453
6577	NC_022247	AGC	2	6	229328	229333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392453
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6579	NC_022247	GCC	2	6	229384	229389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392453
6580	NC_022247	CAGG	2	8	229398	229405	25 %	0 %	50 %	25 %	538392453
6581	NC_022247	TGA	2	6	229445	229450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392453
6582	NC_022247	TGG	2	6	229466	229471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392453
6583	NC_022247	GTCG	2	8	229527	229534	0 %	25 %	50 %	25 %	538392453
6584	NC_022247	GCC	3	9	229608	229616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392453
6585	NC_022247	ACC	2	6	229693	229698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392453
6586	NC_022247	CATCG	2	10	229710	229719	20 %	20 %	20 %	40 %	538392453
6587	NC_022247	CG	3	6	229718	229723	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
6588	NC_022247	CG	3	6	229744	229749	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
6589	NC_022247	CG	3	6	229763	229768	0 %	0 %	50 %	50 %	538392453
6590	NC_022247	GCA	2	6	229799	229804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392453
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6592	NC_022247	GCG	2	6	229899	229904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392453
6593	NC_022247	CG	3	6	229959	229964	0 %	0 %	50 %	50 %	538392454
6594	NC_022247	GCT	2	6	229972	229977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392454
6595	NC_022247	CTG	2	6	229982	229987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392454
6596	NC_022247	GCG	2	6	230040	230045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392454
6597	NC_022247	GGC	2	6	230071	230076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392454
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6599	NC_022247	GCC	2	6	230171	230176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392454
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6601	NC_022247	GC	3	6	230249	230254	0 %	0 %	50 %	50 %	538392454
6602	NC_022247	GC	3	6	230273	230278	0 %	0 %	50 %	50 %	538392454
6603	NC_022247	GCAC	2	8	230316	230323	25 %	0 %	25 %	50 %	538392454
6604	NC_022247	GC	3	6	230347	230352	0 %	0 %	50 %	50 %	538392454
6605	NC_022247	GC	3	6	230365	230370	0 %	0 %	50 %	50 %	538392454
6606	NC_022247	GCC	2	6	230387	230392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_022247	GGAG	2	8	230411	230418	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_022247	CGCGC	2	10	230437	230446	0 %	0 %	40 %	60 %	538392455
6609	NC_022247	CG	3	6	230463	230468	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6610	NC_022247	GCC	2	6	230478	230483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392455
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6612	NC_022247	CGC	2	6	230512	230517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392455
6613	NC_022247	TGCCG	2	10	230549	230558	0 %	20 %	40 %	40 %	538392455
6614	NC_022247	CGA	2	6	230576	230581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392455
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6617	NC_022247	ATG	2	6	230715	230720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392455
6618	NC_022247	CG	5	10	230732	230741	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6619	NC_022247	CGA	2	6	230755	230760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392455
6620	NC_022247	GATCCA	2	12	230774	230785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538392455
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6622	NC_022247	GC	4	8	230817	230824	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6623	NC_022247	GCT	2	6	230828	230833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392455
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6652	NC_022247	CG	3	6	231724	231729	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6653	NC_022247	GGC	2	6	231783	231788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392455
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6711	NC_022247	CTG	2	6	233982	233987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392455
6712	NC_022247	CGA	2	6	234062	234067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392455
6713	NC_022247	GC	5	10	234098	234107	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
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6715	NC_022247	GCCG	2	8	234140	234147	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6716	NC_022247	GC	3	6	234153	234158	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6717	NC_022247	GC	3	6	234161	234166	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6718	NC_022247	CG	4	8	234167	234174	0 %	0 %	50 %	50 %	538392455
6719	NC_022247	CATT	2	8	234237	234244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6720	NC_022247	AACCC	2	10	234263	234272	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6721	NC_022247	ACA	2	6	234300	234305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392456
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6724	NC_022247	GC	3	6	234352	234357	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6725	NC_022247	TCG	2	6	234363	234368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392456
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6727	NC_022247	TC	3	6	234433	234438	0 %	50 %	0 %	50 %	538392456
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6729	NC_022247	GC	3	6	234502	234507	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
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6731	NC_022247	CG	3	6	234528	234533	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6732	NC_022247	CG	4	8	234574	234581	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6733	NC_022247	CGAAG	2	10	234583	234592	40 %	0 %	40 %	20 %	538392456
6734	NC_022247	GCT	2	6	234598	234603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392456
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6737	NC_022247	CG	3	6	234702	234707	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6738	NC_022247	CG	3	6	234719	234724	0 %	0 %	50 %	50 %	538392456
6739	NC_022247	GCG	2	6	234732	234737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392456
6740	NC_022247	AGG	2	6	234795	234800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392456
6741	NC_022247	TC	3	6	234883	234888	0 %	50 %	0 %	50 %	538392456
6742	NC_022247	AAC	2	6	234938	234943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392456
6743	NC_022247	CCCGAG	2	12	234944	234955	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392456
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6745	NC_022247	ACG	2	6	235008	235013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392456
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6869	NC_022247	GATC	2	8	239713	239720	25 %	25 %	25 %	25 %	538392461
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6873	NC_022247	GCCG	2	8	239806	239813	0 %	0 %	50 %	50 %	538392461
6874	NC_022247	CGC	3	9	239851	239859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392461
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6882	NC_022247	GC	3	6	240222	240227	0 %	0 %	50 %	50 %	538392461
6883	NC_022247	GAC	2	6	240239	240244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392461
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6894	NC_022247	TGA	2	6	240551	240556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392462
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6897	NC_022247	GCT	2	6	240600	240605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392462
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6922	NC_022247	GCT	2	6	241734	241739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392463
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6932	NC_022247	GTTC	2	8	242090	242097	0 %	50 %	25 %	25 %	538392463
6933	NC_022247	GCC	2	6	242098	242103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392463
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6936	NC_022247	TCG	2	6	242222	242227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392463
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6989	NC_022247	CG	3	6	244380	244385	0 %	0 %	50 %	50 %	538392465
6990	NC_022247	GAC	2	6	244454	244459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392465
6991	NC_022247	GCC	2	6	244487	244492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392465
6992	NC_022247	GCA	2	6	244493	244498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392465
6993	NC_022247	AGGGCG	2	12	244509	244520	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	538392465
6994	NC_022247	GGC	2	6	244529	244534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392465
6995	NC_022247	CGA	3	9	244609	244617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392465
6996	NC_022247	ATC	2	6	244628	244633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392465
6997	NC_022247	CGG	2	6	244649	244654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392465
6998	NC_022247	GCT	2	6	244666	244671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392465
6999	NC_022247	CGG	2	6	244731	244736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392465
7000	NC_022247	GCC	2	6	244744	244749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392465

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