MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_022234	TCGT	2	8	1333404	1333411	0 %	50 %	25 %	25 %	538345494
34502	NC_022234	CAG	2	6	1333431	1333436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34503	NC_022234	CCG	2	6	1333438	1333443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345494
34504	NC_022234	TGC	2	6	1333453	1333458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34505	NC_022234	CGC	2	6	1333511	1333516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345494
34506	NC_022234	GAT	2	6	1333520	1333525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345494
34507	NC_022234	CTG	2	6	1333572	1333577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34508	NC_022234	GGC	3	9	1333641	1333649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345494
34509	NC_022234	CCG	2	6	1333700	1333705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345494
34510	NC_022234	GGTGA	2	10	1333707	1333716	20 %	20 %	60 %	0 %	538345494
34511	NC_022234	TCG	2	6	1333747	1333752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34512	NC_022234	CCA	2	6	1333760	1333765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345494
34513	NC_022234	TCGA	2	8	1333779	1333786	25 %	25 %	25 %	25 %	538345494
34514	NC_022234	CGACG	2	10	1333845	1333854	20 %	0 %	40 %	40 %	538345494
34515	NC_022234	GCA	2	6	1333856	1333861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34516	NC_022234	ATC	2	6	1333866	1333871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345494
34517	NC_022234	CGG	2	6	1333900	1333905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345494
34518	NC_022234	GCCG	2	8	1333910	1333917	0 %	0 %	50 %	50 %	538345494
34519	NC_022234	GGT	2	6	1333937	1333942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345494
34520	NC_022234	TGC	2	6	1334161	1334166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34521	NC_022234	AGC	2	6	1334185	1334190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34522	NC_022234	GCG	2	6	1334193	1334198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345494
34523	NC_022234	TGG	2	6	1334200	1334205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345494
34524	NC_022234	TCC	2	6	1334242	1334247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345494
34525	NC_022234	GTTG	2	8	1334261	1334268	0 %	50 %	50 %	0 %	538345494
34526	NC_022234	ACC	2	6	1334281	1334286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345494
34527	NC_022234	CGC	2	6	1334287	1334292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345494
34528	NC_022234	GCA	2	6	1334339	1334344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34529	NC_022234	ATC	2	6	1334394	1334399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345494
34530	NC_022234	TGC	2	6	1334428	1334433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345494
34531	NC_022234	GCAAAT	3	18	1334523	1334540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34532	NC_022234	GCAGAT	7	42	1334541	1334582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34533	NC_022234	TCG	3	9	1334629	1334637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34534	NC_022234	AG	3	6	1334648	1334653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34535	NC_022234	CGT	2	6	1334713	1334718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34536	NC_022234	TGA	2	6	1334719	1334724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34537	NC_022234	CGA	2	6	1334748	1334753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345495
34538	NC_022234	CGTC	2	8	1334789	1334796	0 %	25 %	25 %	50 %	538345495
34539	NC_022234	GCC	2	6	1334847	1334852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345495
34540	NC_022234	CGG	3	9	1334917	1334925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345495
34541	NC_022234	GCG	2	6	1334931	1334936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345495
34542	NC_022234	GCCT	2	8	1334962	1334969	0 %	25 %	25 %	50 %	538345495
34543	NC_022234	GCT	2	6	1334970	1334975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345495
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34545	NC_022234	TCG	2	6	1335029	1335034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345495
34546	NC_022234	AGC	2	6	1335035	1335040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345495
34547	NC_022234	CGC	2	6	1335061	1335066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345495
34548	NC_022234	CCCAGT	2	12	1335096	1335107	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538345495
34549	NC_022234	GC	3	6	1335139	1335144	0 %	0 %	50 %	50 %	538345495
34550	NC_022234	AGCTG	2	10	1335189	1335198	20 %	20 %	40 %	20 %	538345495
34551	NC_022234	CTT	2	6	1335260	1335265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345496
34552	NC_022234	TGC	2	6	1335272	1335277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345496
34553	NC_022234	GA	3	6	1335305	1335310	50 %	0 %	50 %	0 %	538345496
34554	NC_022234	CCA	2	6	1335344	1335349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345496
34555	NC_022234	TTC	2	6	1335369	1335374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345496
34556	NC_022234	CT	3	6	1335479	1335484	0 %	50 %	0 %	50 %	538345496
34557	NC_022234	CCT	2	6	1335527	1335532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345496
34558	NC_022234	AGG	2	6	1335594	1335599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345496
34559	NC_022234	GCG	2	6	1335603	1335608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345496
34560	NC_022234	GTT	2	6	1335668	1335673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34561	NC_022234	GT	3	6	1335674	1335679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34562	NC_022234	AG	3	6	1335753	1335758	50 %	0 %	50 %	0 %	538345497
34563	NC_022234	GGC	2	6	1335896	1335901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345497
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34565	NC_022234	GC	3	6	1335916	1335921	0 %	0 %	50 %	50 %	538345497
34566	NC_022234	TTC	2	6	1336041	1336046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345497
34567	NC_022234	GGCGC	2	10	1336055	1336064	0 %	0 %	60 %	40 %	538345497
34568	NC_022234	GC	3	6	1336082	1336087	0 %	0 %	50 %	50 %	538345497
34569	NC_022234	GCT	2	6	1336142	1336147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345497
34570	NC_022234	CTG	2	6	1336155	1336160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345497
34571	NC_022234	TCG	2	6	1336174	1336179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345497
34572	NC_022234	GCT	2	6	1336196	1336201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345497
34573	NC_022234	CGG	2	6	1336286	1336291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345497
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34575	NC_022234	GCT	2	6	1336322	1336327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345497
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34580	NC_022234	TCT	2	6	1336580	1336585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34581	NC_022234	GCG	2	6	1336613	1336618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34582	NC_022234	GATG	2	8	1336645	1336652	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34583	NC_022234	CGG	2	6	1336676	1336681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34584	NC_022234	GAC	2	6	1336688	1336693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34585	NC_022234	TCG	2	6	1337002	1337007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345498
34586	NC_022234	CG	3	6	1337015	1337020	0 %	0 %	50 %	50 %	538345498
34587	NC_022234	CGA	2	6	1337060	1337065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345498
34588	NC_022234	GCTG	2	8	1337089	1337096	0 %	25 %	50 %	25 %	538345498
34589	NC_022234	CG	3	6	1337184	1337189	0 %	0 %	50 %	50 %	538345498
34590	NC_022234	GGC	2	6	1337192	1337197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345498
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34600	NC_022234	GC	3	6	1337524	1337529	0 %	0 %	50 %	50 %	538345499
34601	NC_022234	CGCGG	2	10	1337545	1337554	0 %	0 %	60 %	40 %	538345499
34602	NC_022234	CG	3	6	1337564	1337569	0 %	0 %	50 %	50 %	538345499
34603	NC_022234	CGG	2	6	1337610	1337615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345499
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34605	NC_022234	CGGC	2	8	1337745	1337752	0 %	0 %	50 %	50 %	538345499
34606	NC_022234	CGA	2	6	1337775	1337780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345499
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34618	NC_022234	CCGA	2	8	1338275	1338282	25 %	0 %	25 %	50 %	538345499
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34700	NC_022234	CAGG	2	8	1341100	1341107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34701	NC_022234	CGAC	2	8	1341124	1341131	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34702	NC_022234	GTC	2	6	1341245	1341250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345503
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34722	NC_022234	TCG	2	6	1341900	1341905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345503
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34727	NC_022234	AGATCG	2	12	1342042	1342053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538345503
34728	NC_022234	GGC	2	6	1342097	1342102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345503
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34730	NC_022234	GGC	2	6	1342132	1342137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345503
34731	NC_022234	GGT	2	6	1342166	1342171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345503
34732	NC_022234	CGT	2	6	1342189	1342194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345503
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34851	NC_022234	GCC	2	6	1346958	1346963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345507
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