MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_022234	CCG	2	6	1100247	1100252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345263
28502	NC_022234	CGC	2	6	1100276	1100281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345263
28503	NC_022234	TCG	2	6	1100282	1100287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28504	NC_022234	GC	4	8	1100305	1100312	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28505	NC_022234	GGCC	2	8	1100313	1100320	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28506	NC_022234	CGC	2	6	1100384	1100389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345263
28507	NC_022234	TGGC	2	8	1100506	1100513	0 %	25 %	50 %	25 %	538345263
28508	NC_022234	GCT	2	6	1100517	1100522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28509	NC_022234	TGA	2	6	1100549	1100554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345263
28510	NC_022234	GCCG	2	8	1100559	1100566	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28511	NC_022234	TCG	2	6	1100572	1100577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28512	NC_022234	CCA	2	6	1100582	1100587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345263
28513	NC_022234	CCG	2	6	1100604	1100609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345263
28514	NC_022234	CGA	2	6	1100616	1100621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28515	NC_022234	TTC	2	6	1100649	1100654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345263
28516	NC_022234	GACC	2	8	1100700	1100707	25 %	0 %	25 %	50 %	538345263
28517	NC_022234	CGCGC	2	10	1100712	1100721	0 %	0 %	40 %	60 %	538345263
28518	NC_022234	GCA	2	6	1100727	1100732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28519	NC_022234	TGGTGC	2	12	1100738	1100749	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538345263
28520	NC_022234	CG	3	6	1100750	1100755	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28521	NC_022234	TGC	2	6	1100774	1100779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28522	NC_022234	ACG	3	9	1100801	1100809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28523	NC_022234	TGC	2	6	1100831	1100836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28524	NC_022234	GGA	2	6	1100838	1100843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345263
28525	NC_022234	GGC	2	6	1100906	1100911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345263
28526	NC_022234	TCA	2	6	1100928	1100933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345263
28527	NC_022234	GCC	2	6	1100953	1100958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345263
28528	NC_022234	GC	4	8	1100961	1100968	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28529	NC_022234	CAA	2	6	1101126	1101131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345263
28530	NC_022234	GC	4	8	1101136	1101143	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28531	NC_022234	GAT	2	6	1101153	1101158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345263
28532	NC_022234	GGT	2	6	1101162	1101167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345263
28533	NC_022234	GGT	2	6	1101189	1101194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345263
28534	NC_022234	GCC	2	6	1101220	1101225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345263
28535	NC_022234	TCG	2	6	1101284	1101289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28536	NC_022234	CGA	2	6	1101297	1101302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345263
28537	NC_022234	GCCGG	2	10	1101346	1101355	0 %	0 %	60 %	40 %	538345263
28538	NC_022234	CG	4	8	1101356	1101363	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28539	NC_022234	GCT	2	6	1101470	1101475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345264
28540	NC_022234	CGA	2	6	1101478	1101483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345264
28541	NC_022234	CTG	2	6	1101494	1101499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345264
28542	NC_022234	CTG	2	6	1101506	1101511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345264
28543	NC_022234	TCAGG	2	10	1101514	1101523	20 %	20 %	40 %	20 %	538345264
28544	NC_022234	GCG	2	6	1101534	1101539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345264
28545	NC_022234	GAT	2	6	1101563	1101568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345264
28546	NC_022234	CGGC	2	8	1101571	1101578	0 %	0 %	50 %	50 %	538345264
28547	NC_022234	CAT	3	9	1101749	1101757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345264
28548	NC_022234	GCCC	2	8	1101766	1101773	0 %	0 %	25 %	75 %	538345264
28549	NC_022234	GGTC	2	8	1101778	1101785	0 %	25 %	50 %	25 %	538345264
28550	NC_022234	GTGCCG	2	12	1101787	1101798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538345264
28551	NC_022234	CGC	2	6	1101799	1101804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345264
28552	NC_022234	AGC	2	6	1101846	1101851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345264
28553	NC_022234	GCG	2	6	1101865	1101870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345264
28554	NC_022234	CGG	2	6	1101883	1101888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345264
28555	NC_022234	CCA	3	9	1101967	1101975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345264
28556	NC_022234	CCG	2	6	1101979	1101984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345264
28557	NC_022234	CCG	2	6	1102075	1102080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345264
28558	NC_022234	CAG	2	6	1102088	1102093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345264
28559	NC_022234	CGG	2	6	1102105	1102110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345264
28560	NC_022234	GCC	2	6	1102142	1102147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345264
28561	NC_022234	GCC	2	6	1102151	1102156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345264
28562	NC_022234	TTG	2	6	1102158	1102163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345264
28563	NC_022234	GAT	3	9	1102166	1102174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345264
28564	NC_022234	CCG	2	6	1102236	1102241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345264
28565	NC_022234	GCG	2	6	1102395	1102400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28566	NC_022234	GCT	2	6	1102428	1102433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28567	NC_022234	CGC	2	6	1102615	1102620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345265
28568	NC_022234	CGA	2	6	1102690	1102695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345265
28569	NC_022234	GAAG	2	8	1102747	1102754	50 %	0 %	50 %	0 %	538345265
28570	NC_022234	CTA	2	6	1102759	1102764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345265
28571	NC_022234	AGA	2	6	1102824	1102829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345265
28572	NC_022234	TCA	2	6	1102830	1102835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345265
28573	NC_022234	GC	3	6	1102892	1102897	0 %	0 %	50 %	50 %	538345265
28574	NC_022234	CGC	2	6	1102982	1102987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345265
28575	NC_022234	TGA	2	6	1103031	1103036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345265
28576	NC_022234	GCC	2	6	1103058	1103063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345265
28577	NC_022234	CGG	3	9	1103065	1103073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345265
28578	NC_022234	TCG	2	6	1103097	1103102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345265
28579	NC_022234	TGA	2	6	1103106	1103111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345265
28580	NC_022234	CCG	2	6	1103124	1103129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345265
28581	NC_022234	GC	3	6	1103150	1103155	0 %	0 %	50 %	50 %	538345265
28582	NC_022234	GCAACG	2	12	1103268	1103279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345265
28583	NC_022234	ACG	2	6	1103349	1103354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345265
28584	NC_022234	TGC	2	6	1103463	1103468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345265
28585	NC_022234	GAG	2	6	1103567	1103572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345265
28586	NC_022234	GC	3	6	1103585	1103590	0 %	0 %	50 %	50 %	538345265
28587	NC_022234	CGC	2	6	1103631	1103636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345265
28588	NC_022234	CGC	2	6	1103688	1103693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345265
28589	NC_022234	CGA	2	6	1103713	1103718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345265
28590	NC_022234	CGG	2	6	1103745	1103750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345265
28591	NC_022234	TGA	2	6	1103840	1103845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345266
28592	NC_022234	CTG	2	6	1103866	1103871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345266
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28595	NC_022234	TTCGA	2	10	1103989	1103998	20 %	40 %	20 %	20 %	538345266
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28597	NC_022234	CGC	2	6	1104047	1104052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345266
28598	NC_022234	GC	3	6	1104061	1104066	0 %	0 %	50 %	50 %	538345266
28599	NC_022234	GCGCT	2	10	1104073	1104082	0 %	20 %	40 %	40 %	538345266
28600	NC_022234	CTC	2	6	1104103	1104108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345266
28601	NC_022234	CGC	2	6	1104168	1104173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345266
28602	NC_022234	GC	3	6	1104357	1104362	0 %	0 %	50 %	50 %	538345266
28603	NC_022234	CTT	2	6	1104368	1104373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345266
28604	NC_022234	CGAT	2	8	1104389	1104396	25 %	25 %	25 %	25 %	538345266
28605	NC_022234	TCG	2	6	1104473	1104478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345267
28606	NC_022234	CGGC	2	8	1104479	1104486	0 %	0 %	50 %	50 %	538345267
28607	NC_022234	AGC	2	6	1104506	1104511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345267
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28610	NC_022234	CGGC	2	8	1104611	1104618	0 %	0 %	50 %	50 %	538345267
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28614	NC_022234	GCC	2	6	1104742	1104747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345267
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28616	NC_022234	ACCGGC	2	12	1104764	1104775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538345267
28617	NC_022234	CGG	2	6	1104789	1104794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345267
28618	NC_022234	AGG	2	6	1104885	1104890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345267
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28623	NC_022234	GCA	3	9	1105038	1105046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345267
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28628	NC_022234	TGC	2	6	1105264	1105269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345268
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28682	NC_022234	GCA	2	6	1107051	1107056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345270
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28710	NC_022234	CG	3	6	1108320	1108325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28711	NC_022234	CGC	2	6	1108408	1108413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345272
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28715	NC_022234	GCCCT	2	10	1108509	1108518	0 %	20 %	20 %	60 %	538345272
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28722	NC_022234	GC	3	6	1108916	1108921	0 %	0 %	50 %	50 %	538345273
28723	NC_022234	CAT	2	6	1109073	1109078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345273
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28726	NC_022234	TGC	2	6	1109344	1109349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28727	NC_022234	GCA	2	6	1109360	1109365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28728	NC_022234	GAAG	2	8	1109425	1109432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28729	NC_022234	GC	3	6	1109439	1109444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28730	NC_022234	TGC	2	6	1109476	1109481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28731	NC_022234	CCGCG	2	10	1109560	1109569	0 %	0 %	40 %	60 %	538345274
28732	NC_022234	TGC	2	6	1109638	1109643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345274
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28734	NC_022234	GGC	2	6	1109669	1109674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345274
28735	NC_022234	CGA	2	6	1109681	1109686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345274
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28737	NC_022234	CA	3	6	1109709	1109714	50 %	0 %	0 %	50 %	538345274
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28743	NC_022234	TCG	2	6	1110073	1110078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345274
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28745	NC_022234	CCG	3	9	1110164	1110172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345274
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28800	NC_022234	GGCA	2	8	1112860	1112867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28801	NC_022234	ACA	2	6	1112889	1112894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345278
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28835	NC_022234	CAG	3	9	1114150	1114158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345278
28836	NC_022234	ATC	2	6	1114171	1114176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345278
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28843	NC_022234	CAG	2	6	1114333	1114338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345278
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28846	NC_022234	GCAT	2	8	1114425	1114432	25 %	25 %	25 %	25 %	538345278
28847	NC_022234	GCG	6	18	1114450	1114467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345278
28848	NC_022234	GCCG	2	8	1114474	1114481	0 %	0 %	50 %	50 %	538345278
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28852	NC_022234	GGCC	2	8	1114711	1114718	0 %	0 %	50 %	50 %	538345279
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28901	NC_022234	ACG	2	6	1116404	1116409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345280
28902	NC_022234	CGC	2	6	1116495	1116500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345280
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28904	NC_022234	GCA	2	6	1116545	1116550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345280
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28912	NC_022234	GCG	2	6	1116889	1116894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345280
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28967	NC_022234	GCA	2	6	1119180	1119185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345281
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28993	NC_022234	CGC	2	6	1120030	1120035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345282
28994	NC_022234	GCA	2	6	1120047	1120052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345282
28995	NC_022234	GTC	2	6	1120094	1120099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28996	NC_022234	G	6	6	1120148	1120153	0 %	0 %	100 %	0 %	538345283
28997	NC_022234	GTC	2	6	1120242	1120247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345283
28998	NC_022234	TGG	2	6	1120253	1120258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345283
28999	NC_022234	CGT	2	6	1120386	1120391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345283
29000	NC_022234	AGGC	2	8	1120492	1120499	25 %	0 %	50 %	25 %	538345283

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