MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_022234	AGC	2	6	1080210	1080215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345244
28003	NC_022234	CGG	2	6	1080262	1080267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345244
28004	NC_022234	GCCC	2	8	1080289	1080296	0 %	0 %	25 %	75 %	538345244
28005	NC_022234	CGGC	2	8	1080298	1080305	0 %	0 %	50 %	50 %	538345244
28006	NC_022234	GC	3	6	1080314	1080319	0 %	0 %	50 %	50 %	538345244
28007	NC_022234	CAGCG	2	10	1080413	1080422	20 %	0 %	40 %	40 %	538345244
28008	NC_022234	GCC	2	6	1080428	1080433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345244
28009	NC_022234	GC	3	6	1080469	1080474	0 %	0 %	50 %	50 %	538345244
28010	NC_022234	CAG	2	6	1080491	1080496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345244
28011	NC_022234	GCC	2	6	1080544	1080549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345244
28012	NC_022234	CCGG	2	8	1080573	1080580	0 %	0 %	50 %	50 %	538345244
28013	NC_022234	GGTC	2	8	1080652	1080659	0 %	25 %	50 %	25 %	538345244
28014	NC_022234	GGC	2	6	1080785	1080790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345244
28015	NC_022234	CG	3	6	1080810	1080815	0 %	0 %	50 %	50 %	538345245
28016	NC_022234	CCA	2	6	1080836	1080841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345245
28017	NC_022234	CCG	2	6	1080850	1080855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345245
28018	NC_022234	GAA	2	6	1080873	1080878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345245
28019	NC_022234	CGC	2	6	1080885	1080890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345245
28020	NC_022234	GAAGC	2	10	1080921	1080930	40 %	0 %	40 %	20 %	538345245
28021	NC_022234	GCC	2	6	1080957	1080962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345245
28022	NC_022234	CAGCGC	2	12	1080963	1080974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538345245
28023	NC_022234	CACCGC	2	12	1081035	1081046	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538345245
28024	NC_022234	TTG	2	6	1081114	1081119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345245
28025	NC_022234	GCCC	2	8	1081121	1081128	0 %	0 %	25 %	75 %	538345245
28026	NC_022234	CAG	4	12	1081146	1081157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345245
28027	NC_022234	GGT	2	6	1081182	1081187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345245
28028	NC_022234	CAG	2	6	1081212	1081217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345246
28029	NC_022234	GC	3	6	1081228	1081233	0 %	0 %	50 %	50 %	538345246
28030	NC_022234	TGC	2	6	1081267	1081272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345246
28031	NC_022234	GGCGCA	2	12	1081316	1081327	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538345246
28032	NC_022234	GCG	2	6	1081360	1081365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
28033	NC_022234	GCC	2	6	1081385	1081390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345246
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28035	NC_022234	GCG	2	6	1081403	1081408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
28036	NC_022234	GGC	2	6	1081437	1081442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
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28038	NC_022234	TCG	2	6	1081449	1081454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345246
28039	NC_022234	ACC	2	6	1081482	1081487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345246
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28043	NC_022234	CG	3	6	1081765	1081770	0 %	0 %	50 %	50 %	538345246
28044	NC_022234	GCCG	2	8	1081781	1081788	0 %	0 %	50 %	50 %	538345246
28045	NC_022234	CGG	2	6	1081823	1081828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
28046	NC_022234	TGC	2	6	1081893	1081898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345246
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28048	NC_022234	GCG	2	6	1081920	1081925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
28049	NC_022234	TCGA	2	8	1081932	1081939	25 %	25 %	25 %	25 %	538345246
28050	NC_022234	GAA	2	6	1081967	1081972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345246
28051	NC_022234	GCG	2	6	1081990	1081995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
28052	NC_022234	GC	3	6	1082026	1082031	0 %	0 %	50 %	50 %	538345246
28053	NC_022234	TCG	2	6	1082043	1082048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345246
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28055	NC_022234	CGG	2	6	1082167	1082172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
28056	NC_022234	AGT	2	6	1082212	1082217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345246
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28061	NC_022234	GCG	2	6	1082575	1082580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345246
28062	NC_022234	GC	3	6	1082607	1082612	0 %	0 %	50 %	50 %	538345246
28063	NC_022234	GCGCC	2	10	1082614	1082623	0 %	0 %	40 %	60 %	538345246
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28082	NC_022234	GC	3	6	1083208	1083213	0 %	0 %	50 %	50 %	538345247
28083	NC_022234	GCCCG	2	10	1083220	1083229	0 %	0 %	40 %	60 %	538345247
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28102	NC_022234	ATCG	2	8	1084029	1084036	25 %	25 %	25 %	25 %	538345248
28103	NC_022234	ATC	2	6	1084072	1084077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345248
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28106	NC_022234	TGGA	2	8	1084132	1084139	25 %	25 %	50 %	0 %	538345248
28107	NC_022234	A	8	8	1084167	1084174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28108	NC_022234	GAAG	2	8	1084289	1084296	50 %	0 %	50 %	0 %	538345249
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28111	NC_022234	CG	3	6	1084380	1084385	0 %	0 %	50 %	50 %	538345249
28112	NC_022234	CG	3	6	1084429	1084434	0 %	0 %	50 %	50 %	538345249
28113	NC_022234	TCG	3	9	1084488	1084496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345249
28114	NC_022234	GCGA	2	8	1084533	1084540	25 %	0 %	50 %	25 %	538345249
28115	NC_022234	CCGT	2	8	1084542	1084549	0 %	25 %	25 %	50 %	538345249
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28117	NC_022234	TTC	2	6	1084589	1084594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345249
28118	NC_022234	CTG	2	6	1084610	1084615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345249
28119	NC_022234	CGA	2	6	1084685	1084690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345249
28120	NC_022234	TCA	2	6	1084726	1084731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345249
28121	NC_022234	GC	3	6	1084789	1084794	0 %	0 %	50 %	50 %	538345249
28122	NC_022234	GTC	2	6	1084868	1084873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345249
28123	NC_022234	AGCC	2	8	1084953	1084960	25 %	0 %	25 %	50 %	538345249
28124	NC_022234	T	6	6	1085017	1085022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28125	NC_022234	GAA	2	6	1085060	1085065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28127	NC_022234	TTTC	2	8	1085090	1085097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28128	NC_022234	ATC	2	6	1085131	1085136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28129	NC_022234	GAT	2	6	1085146	1085151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28130	NC_022234	CG	3	6	1085216	1085221	0 %	0 %	50 %	50 %	538345250
28131	NC_022234	GCC	2	6	1085235	1085240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345250
28132	NC_022234	GC	4	8	1085245	1085252	0 %	0 %	50 %	50 %	538345250
28133	NC_022234	GAG	2	6	1085298	1085303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345250
28134	NC_022234	TGC	2	6	1085314	1085319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345250
28135	NC_022234	CG	3	6	1085338	1085343	0 %	0 %	50 %	50 %	538345250
28136	NC_022234	GAA	2	6	1085364	1085369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345250
28137	NC_022234	GCTG	2	8	1085386	1085393	0 %	25 %	50 %	25 %	538345250
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28141	NC_022234	TGG	2	6	1085659	1085664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345250
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28145	NC_022234	GC	3	6	1085922	1085927	0 %	0 %	50 %	50 %	538345250
28146	NC_022234	CG	3	6	1085959	1085964	0 %	0 %	50 %	50 %	538345250
28147	NC_022234	CTGG	2	8	1085978	1085985	0 %	25 %	50 %	25 %	538345250
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28174	NC_022234	ACT	2	6	1087083	1087088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28175	NC_022234	CAC	2	6	1087124	1087129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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28178	NC_022234	GCC	2	6	1087200	1087205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28179	NC_022234	GAG	2	6	1087256	1087261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28180	NC_022234	GTTC	2	8	1087302	1087309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28181	NC_022234	GCACCT	2	12	1087311	1087322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28182	NC_022234	CG	3	6	1087323	1087328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28183	NC_022234	GTCG	2	8	1087336	1087343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28184	NC_022234	GCA	3	9	1087353	1087361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28189	NC_022234	CTT	2	6	1087491	1087496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345252
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28193	NC_022234	TTG	2	6	1087663	1087668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345252
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28204	NC_022234	CG	4	8	1088195	1088202	0 %	0 %	50 %	50 %	538345252
28205	NC_022234	ATG	2	6	1088239	1088244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345252
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28209	NC_022234	GCTCGA	2	12	1088394	1088405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28210	NC_022234	TTA	2	6	1088450	1088455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28211	NC_022234	TCA	2	6	1088458	1088463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28212	NC_022234	GC	3	6	1088582	1088587	0 %	0 %	50 %	50 %	538345253
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28221	NC_022234	CGA	2	6	1088950	1088955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345253
28222	NC_022234	CG	3	6	1089011	1089016	0 %	0 %	50 %	50 %	538345253
28223	NC_022234	GC	3	6	1089035	1089040	0 %	0 %	50 %	50 %	538345253
28224	NC_022234	ACG	2	6	1089091	1089096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345254
28225	NC_022234	TCG	2	6	1089103	1089108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345254
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28228	NC_022234	TC	3	6	1089158	1089163	0 %	50 %	0 %	50 %	538345254
28229	NC_022234	GGT	3	9	1089164	1089172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345254
28230	NC_022234	GAAG	2	8	1089179	1089186	50 %	0 %	50 %	0 %	538345254
28231	NC_022234	GCG	2	6	1089187	1089192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345254
28232	NC_022234	CCAT	2	8	1089211	1089218	25 %	25 %	0 %	50 %	538345254
28233	NC_022234	TGC	2	6	1089232	1089237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345254
28234	NC_022234	GCCCG	2	10	1089282	1089291	0 %	0 %	40 %	60 %	538345254
28235	NC_022234	CGG	2	6	1089344	1089349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345254
28236	NC_022234	AAC	2	6	1089381	1089386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345254
28237	NC_022234	TAC	2	6	1089387	1089392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345254
28238	NC_022234	TGC	2	6	1089418	1089423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345254
28239	NC_022234	GC	3	6	1089435	1089440	0 %	0 %	50 %	50 %	538345254
28240	NC_022234	CG	4	8	1089552	1089559	0 %	0 %	50 %	50 %	538345254
28241	NC_022234	CGT	2	6	1089563	1089568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345254
28242	NC_022234	GC	3	6	1089582	1089587	0 %	0 %	50 %	50 %	538345254
28243	NC_022234	TGC	2	6	1089664	1089669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345254
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28249	NC_022234	CTG	3	9	1089927	1089935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345254
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28266	NC_022234	AT	3	6	1090496	1090501	50 %	50 %	0 %	0 %	538345254
28267	NC_022234	CG	3	6	1090511	1090516	0 %	0 %	50 %	50 %	538345254
28268	NC_022234	GGA	2	6	1090575	1090580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28269	NC_022234	CGA	2	6	1090643	1090648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345255
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28272	NC_022234	CTG	2	6	1090746	1090751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345255
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28336	NC_022234	CG	3	6	1093687	1093692	0 %	0 %	50 %	50 %	538345257
28337	NC_022234	CGA	2	6	1093753	1093758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345257
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28344	NC_022234	GCA	2	6	1094023	1094028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345257
28345	NC_022234	TGT	2	6	1094074	1094079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345257
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28347	NC_022234	CCG	2	6	1094111	1094116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345257
28348	NC_022234	TCG	2	6	1094142	1094147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345257
28349	NC_022234	AGC	2	6	1094169	1094174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345257
28350	NC_022234	GAC	2	6	1094249	1094254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345257
28351	NC_022234	GCG	2	6	1094318	1094323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345257
28352	NC_022234	CGC	2	6	1094347	1094352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345257
28353	NC_022234	TCT	2	6	1094365	1094370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345257
28354	NC_022234	GAC	2	6	1094411	1094416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345257
28355	NC_022234	GAC	2	6	1094552	1094557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345257
28356	NC_022234	CGA	2	6	1094677	1094682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345257
28357	NC_022234	TGG	2	6	1094683	1094688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345257
28358	NC_022234	CCGC	2	8	1094695	1094702	0 %	0 %	25 %	75 %	538345257
28359	NC_022234	CCT	2	6	1094703	1094708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345257
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28363	NC_022234	ACCG	2	8	1094815	1094822	25 %	0 %	25 %	50 %	538345257
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28370	NC_022234	CG	3	6	1095153	1095158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28371	NC_022234	GCC	2	6	1095220	1095225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28372	NC_022234	GCG	2	6	1095244	1095249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345258
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28378	NC_022234	GATC	2	8	1095507	1095514	25 %	25 %	25 %	25 %	538345258
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28382	NC_022234	TCG	2	6	1095743	1095748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345258
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28396	NC_022234	ACGCG	2	10	1096261	1096270	20 %	0 %	40 %	40 %	538345259
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28422	NC_022234	CCA	2	6	1097287	1097292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345260
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28468	NC_022234	GC	3	6	1099025	1099030	0 %	0 %	50 %	50 %	538345261
28469	NC_022234	GCG	2	6	1099046	1099051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345261
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28491	NC_022234	GCG	2	6	1100026	1100031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28495	NC_022234	AGCG	2	8	1100088	1100095	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28496	NC_022234	GCT	2	6	1100166	1100171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345263
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28499	NC_022234	GC	3	6	1100218	1100223	0 %	0 %	50 %	50 %	538345263
28500	NC_022234	ACC	2	6	1100225	1100230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345263

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