MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_022234	GC	3	6	1018833	1018838	0 %	0 %	50 %	50 %	538345174
26502	NC_022234	GCC	2	6	1018872	1018877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345174
26503	NC_022234	CTGTC	2	10	1018941	1018950	0 %	40 %	20 %	40 %	538345174
26504	NC_022234	CG	3	6	1018958	1018963	0 %	0 %	50 %	50 %	538345174
26505	NC_022234	CGTC	2	8	1018990	1018997	0 %	25 %	25 %	50 %	538345174
26506	NC_022234	GCG	2	6	1019001	1019006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345174
26507	NC_022234	CAC	2	6	1019028	1019033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345174
26508	NC_022234	GCT	2	6	1019048	1019053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26509	NC_022234	GGAT	2	8	1019072	1019079	25 %	25 %	50 %	0 %	538345174
26510	NC_022234	CCA	2	6	1019143	1019148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345174
26511	NC_022234	TGA	2	6	1019171	1019176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345174
26512	NC_022234	CGC	2	6	1019195	1019200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345174
26513	NC_022234	TGG	2	6	1019245	1019250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345174
26514	NC_022234	TGA	2	6	1019267	1019272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345174
26515	NC_022234	GCA	2	6	1019275	1019280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26516	NC_022234	CGG	2	6	1019309	1019314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345174
26517	NC_022234	CGC	2	6	1019336	1019341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345174
26518	NC_022234	CG	3	6	1019349	1019354	0 %	0 %	50 %	50 %	538345174
26519	NC_022234	CGG	2	6	1019375	1019380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345174
26520	NC_022234	GCT	2	6	1019388	1019393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26521	NC_022234	GTC	2	6	1019404	1019409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26522	NC_022234	AGC	2	6	1019482	1019487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26523	NC_022234	CGA	2	6	1019494	1019499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26524	NC_022234	CGC	2	6	1019513	1019518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345174
26525	NC_022234	CGG	2	6	1019522	1019527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345174
26526	NC_022234	CTG	2	6	1019589	1019594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26527	NC_022234	CCA	2	6	1019648	1019653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345174
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26529	NC_022234	GAT	2	6	1019703	1019708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345174
26530	NC_022234	GCC	3	9	1019709	1019717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345174
26531	NC_022234	ACG	3	9	1019722	1019730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345174
26532	NC_022234	ATG	2	6	1019785	1019790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345174
26533	NC_022234	GCT	2	6	1019852	1019857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345175
26534	NC_022234	CAG	2	6	1019957	1019962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345175
26535	NC_022234	ATGCG	2	10	1019979	1019988	20 %	20 %	40 %	20 %	538345175
26536	NC_022234	GGT	2	6	1020001	1020006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345175
26537	NC_022234	GC	3	6	1020040	1020045	0 %	0 %	50 %	50 %	538345175
26538	NC_022234	CGT	2	6	1020046	1020051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345175
26539	NC_022234	CAG	2	6	1020092	1020097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345175
26540	NC_022234	CGC	2	6	1020157	1020162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345175
26541	NC_022234	TC	3	6	1020173	1020178	0 %	50 %	0 %	50 %	538345175
26542	NC_022234	GGC	2	6	1020215	1020220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345175
26543	NC_022234	GACC	2	8	1020268	1020275	25 %	0 %	25 %	50 %	538345175
26544	NC_022234	GCC	2	6	1020285	1020290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345175
26545	NC_022234	GCC	2	6	1020294	1020299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345175
26546	NC_022234	ACG	2	6	1020324	1020329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345175
26547	NC_022234	GTC	2	6	1020443	1020448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345175
26548	NC_022234	GCC	2	6	1020491	1020496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345175
26549	NC_022234	TCT	2	6	1020552	1020557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26550	NC_022234	CTC	2	6	1020631	1020636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345176
26551	NC_022234	CCGCG	2	10	1020745	1020754	0 %	0 %	40 %	60 %	538345176
26552	NC_022234	CGC	2	6	1020763	1020768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345176
26553	NC_022234	GC	3	6	1020792	1020797	0 %	0 %	50 %	50 %	538345176
26554	NC_022234	TCT	2	6	1020884	1020889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345176
26555	NC_022234	TGG	2	6	1020927	1020932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345176
26556	NC_022234	CCGG	2	8	1020963	1020970	0 %	0 %	50 %	50 %	538345176
26557	NC_022234	GCC	2	6	1020976	1020981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345176
26558	NC_022234	GC	3	6	1020993	1020998	0 %	0 %	50 %	50 %	538345176
26559	NC_022234	ATGCCG	2	12	1021007	1021018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538345176
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26561	NC_022234	CGTG	2	8	1021065	1021072	0 %	25 %	50 %	25 %	538345176
26562	NC_022234	CTG	2	6	1021075	1021080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345176
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26567	NC_022234	GGC	2	6	1021207	1021212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345176
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26569	NC_022234	GCC	3	9	1021313	1021321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345176
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26582	NC_022234	GCC	2	6	1021697	1021702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345176
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26584	NC_022234	GC	3	6	1021720	1021725	0 %	0 %	50 %	50 %	538345176
26585	NC_022234	GC	3	6	1021778	1021783	0 %	0 %	50 %	50 %	538345176
26586	NC_022234	GT	3	6	1021794	1021799	0 %	50 %	50 %	0 %	538345176
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26589	NC_022234	GCG	2	6	1021868	1021873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345176
26590	NC_022234	CAC	2	6	1021975	1021980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345176
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26592	NC_022234	GGA	2	6	1022041	1022046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345176
26593	NC_022234	C	6	6	1022093	1022098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26594	NC_022234	TGC	2	6	1022106	1022111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26595	NC_022234	GCA	2	6	1022157	1022162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26596	NC_022234	GC	4	8	1022216	1022223	0 %	0 %	50 %	50 %	538345177
26597	NC_022234	TCG	2	6	1022226	1022231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345177
26598	NC_022234	GCA	2	6	1022275	1022280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345177
26599	NC_022234	GTG	2	6	1022307	1022312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345177
26600	NC_022234	ATG	2	6	1022323	1022328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345177
26601	NC_022234	GTC	2	6	1022339	1022344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345177
26602	NC_022234	TCG	2	6	1022355	1022360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345177
26603	NC_022234	CG	4	8	1022359	1022366	0 %	0 %	50 %	50 %	538345177
26604	NC_022234	CG	3	6	1022437	1022442	0 %	0 %	50 %	50 %	538345177
26605	NC_022234	GCGACC	2	12	1022493	1022504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538345177
26606	NC_022234	CGA	2	6	1022506	1022511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345177
26607	NC_022234	CTG	3	9	1022582	1022590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345177
26608	NC_022234	CGG	2	6	1022605	1022610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345177
26609	NC_022234	CGA	2	6	1022611	1022616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345177
26610	NC_022234	CCT	2	6	1022620	1022625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345177
26611	NC_022234	CCTT	2	8	1022706	1022713	0 %	50 %	0 %	50 %	538345177
26612	NC_022234	CG	4	8	1022756	1022763	0 %	0 %	50 %	50 %	538345177
26613	NC_022234	CGA	2	6	1022946	1022951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345178
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26617	NC_022234	GCC	2	6	1023127	1023132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345178
26618	NC_022234	AGA	2	6	1023139	1023144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345178
26619	NC_022234	GAG	2	6	1023250	1023255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345178
26620	NC_022234	CATG	2	8	1023261	1023268	25 %	25 %	25 %	25 %	538345178
26621	NC_022234	CACG	2	8	1023273	1023280	25 %	0 %	25 %	50 %	538345178
26622	NC_022234	TGC	2	6	1023314	1023319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345178
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26682	NC_022234	CGA	2	6	1026059	1026064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345181
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26703	NC_022234	CTA	2	6	1027093	1027098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345183
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26713	NC_022234	TG	3	6	1027595	1027600	0 %	50 %	50 %	0 %	538345184
26714	NC_022234	CAA	2	6	1027618	1027623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345184
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26716	NC_022234	CA	3	6	1027740	1027745	50 %	0 %	0 %	50 %	538345184
26717	NC_022234	ACC	2	6	1027748	1027753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345184
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26719	NC_022234	CGA	2	6	1027846	1027851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345184
26720	NC_022234	TGG	2	6	1027866	1027871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345184
26721	NC_022234	CTC	2	6	1027896	1027901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345185
26722	NC_022234	GCC	2	6	1027935	1027940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345185
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26724	NC_022234	GA	3	6	1028071	1028076	50 %	0 %	50 %	0 %	538345185
26725	NC_022234	CG	3	6	1028117	1028122	0 %	0 %	50 %	50 %	538345185
26726	NC_022234	CG	3	6	1028207	1028212	0 %	0 %	50 %	50 %	538345185
26727	NC_022234	GAG	2	6	1028220	1028225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345185
26728	NC_022234	GAA	2	6	1028348	1028353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345185
26729	NC_022234	CAC	2	6	1028378	1028383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345185
26730	NC_022234	TGC	2	6	1028426	1028431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345185
26731	NC_022234	GC	3	6	1028463	1028468	0 %	0 %	50 %	50 %	538345185
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26852	NC_022234	CGA	2	6	1033028	1033033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345191
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26854	NC_022234	GC	3	6	1033142	1033147	0 %	0 %	50 %	50 %	538345191
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26858	NC_022234	GC	5	10	1033449	1033458	0 %	0 %	50 %	50 %	538345192
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26887	NC_022234	GCC	2	6	1035031	1035036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345195
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26914	NC_022234	GCCG	2	8	1036107	1036114	0 %	0 %	50 %	50 %	538345196
26915	NC_022234	CAG	3	9	1036131	1036139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345196
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26918	NC_022234	CGG	3	9	1036265	1036273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345196
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26920	NC_022234	GCC	2	6	1036311	1036316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345196
26921	NC_022234	GCC	2	6	1036351	1036356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345196
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26928	NC_022234	CGGC	2	8	1036563	1036570	0 %	0 %	50 %	50 %	538345197
26929	NC_022234	GCA	2	6	1036590	1036595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345197
26930	NC_022234	GC	3	6	1036632	1036637	0 %	0 %	50 %	50 %	538345197
26931	NC_022234	TCGGG	2	10	1036640	1036649	0 %	20 %	60 %	20 %	538345197
26932	NC_022234	GCC	2	6	1036733	1036738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345197
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26937	NC_022234	CGG	2	6	1036935	1036940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345197
26938	NC_022234	CGC	2	6	1036941	1036946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345197
26939	NC_022234	GTC	2	6	1036972	1036977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345197
26940	NC_022234	CGG	2	6	1036995	1037000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345197
26941	NC_022234	CGC	2	6	1037014	1037019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345197
26942	NC_022234	GC	3	6	1037087	1037092	0 %	0 %	50 %	50 %	538345197
26943	NC_022234	AGC	2	6	1037150	1037155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345197
26944	NC_022234	CGGC	2	8	1037192	1037199	0 %	0 %	50 %	50 %	538345197
26945	NC_022234	TCA	2	6	1037278	1037283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26946	NC_022234	ATG	2	6	1037302	1037307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345198
26947	NC_022234	GCT	2	6	1037337	1037342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345198
26948	NC_022234	GCTC	2	8	1037351	1037358	0 %	25 %	25 %	50 %	538345198
26949	NC_022234	GCG	2	6	1037365	1037370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345198
26950	NC_022234	CGCT	2	8	1037371	1037378	0 %	25 %	25 %	50 %	538345198
26951	NC_022234	CGCC	2	8	1037390	1037397	0 %	0 %	25 %	75 %	538345198
26952	NC_022234	CTG	2	6	1037518	1037523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345198
26953	NC_022234	CGA	2	6	1037556	1037561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345198
26954	NC_022234	CGC	2	6	1037589	1037594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345198
26955	NC_022234	CGCA	2	8	1037611	1037618	25 %	0 %	25 %	50 %	538345198
26956	NC_022234	GTG	2	6	1037722	1037727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345198
26957	NC_022234	TGGG	2	8	1037755	1037762	0 %	25 %	75 %	0 %	538345198
26958	NC_022234	CGCT	2	8	1037768	1037775	0 %	25 %	25 %	50 %	538345198
26959	NC_022234	GCACG	2	10	1037820	1037829	20 %	0 %	40 %	40 %	538345198
26960	NC_022234	CGG	2	6	1037840	1037845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345198
26961	NC_022234	CTGCAT	2	12	1037862	1037873	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538345198
26962	NC_022234	ACG	2	6	1037882	1037887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345198
26963	NC_022234	GCG	2	6	1037924	1037929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345198
26964	NC_022234	ACG	2	6	1037975	1037980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345198
26965	NC_022234	TGC	2	6	1038023	1038028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345198
26966	NC_022234	CGC	2	6	1038042	1038047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345198
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