MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_022234	CG	3	6	957072	957077	0 %	0 %	50 %	50 %	538345121
25002	NC_022234	CCG	2	6	957085	957090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345121
25003	NC_022234	CGC	2	6	957214	957219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345122
25004	NC_022234	ATC	2	6	957299	957304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345122
25005	NC_022234	ACC	2	6	957384	957389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345122
25006	NC_022234	GCG	2	6	957399	957404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345122
25007	NC_022234	CGA	3	9	957406	957414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345122
25008	NC_022234	CGG	2	6	957505	957510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345122
25009	NC_022234	TCC	2	6	957516	957521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345122
25010	NC_022234	A	6	6	957553	957558	100 %	0 %	0 %	0 %	538345122
25011	NC_022234	ATGG	2	8	957635	957642	25 %	25 %	50 %	0 %	538345122
25012	NC_022234	ACG	2	6	957723	957728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345122
25013	NC_022234	CGC	2	6	957835	957840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345122
25014	NC_022234	CAA	2	6	957854	957859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345122
25015	NC_022234	GCC	3	9	958055	958063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345122
25016	NC_022234	GCC	2	6	958163	958168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345122
25017	NC_022234	CGG	2	6	958189	958194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345122
25018	NC_022234	GAT	2	6	958259	958264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345122
25019	NC_022234	TCCTTG	2	12	958320	958331	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	538345122
25020	NC_022234	GCAA	2	8	958335	958342	50 %	0 %	25 %	25 %	538345122
25021	NC_022234	GCA	2	6	958389	958394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345122
25022	NC_022234	CTT	2	6	958436	958441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345122
25023	NC_022234	GCC	2	6	958469	958474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345122
25024	NC_022234	GCA	2	6	958518	958523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345122
25025	NC_022234	CGC	2	6	958540	958545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345122
25026	NC_022234	T	6	6	958602	958607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25027	NC_022234	CG	3	6	958622	958627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25028	NC_022234	TCG	2	6	958641	958646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25029	NC_022234	GGC	2	6	958703	958708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25030	NC_022234	CGT	2	6	958730	958735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25031	NC_022234	CGA	3	9	958793	958801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25032	NC_022234	AAC	2	6	958822	958827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25033	NC_022234	GAC	2	6	958850	958855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25034	NC_022234	AGCG	2	8	958863	958870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25035	NC_022234	CG	3	6	958900	958905	0 %	0 %	50 %	50 %	538345123
25036	NC_022234	TCC	2	6	958936	958941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345123
25037	NC_022234	GGC	2	6	959066	959071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345123
25038	NC_022234	GAGGCC	2	12	959115	959126	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538345123
25039	NC_022234	GC	3	6	959232	959237	0 %	0 %	50 %	50 %	538345123
25040	NC_022234	TCC	2	6	959281	959286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345123
25041	NC_022234	CCT	2	6	959420	959425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345123
25042	NC_022234	GAC	2	6	959511	959516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345123
25043	NC_022234	GC	3	6	959520	959525	0 %	0 %	50 %	50 %	538345123
25044	NC_022234	GCCCG	2	10	959567	959576	0 %	0 %	40 %	60 %	538345123
25045	NC_022234	CTCGA	2	10	959587	959596	20 %	20 %	20 %	40 %	538345123
25046	NC_022234	TC	3	6	959837	959842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25047	NC_022234	CGG	2	6	959948	959953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25048	NC_022234	CAA	2	6	959954	959959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25049	NC_022234	CG	3	6	959994	959999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25050	NC_022234	AAG	2	6	960051	960056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345124
25051	NC_022234	GTC	2	6	960069	960074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25052	NC_022234	GGT	2	6	960089	960094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345124
25053	NC_022234	GCA	2	6	960103	960108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25054	NC_022234	GCC	3	9	960144	960152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345124
25055	NC_022234	GGC	2	6	960220	960225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345124
25056	NC_022234	TCG	2	6	960241	960246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25057	NC_022234	GCT	2	6	960272	960277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25058	NC_022234	GC	3	6	960422	960427	0 %	0 %	50 %	50 %	538345124
25059	NC_022234	GCT	2	6	960440	960445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25060	NC_022234	CG	3	6	960461	960466	0 %	0 %	50 %	50 %	538345124
25061	NC_022234	GCG	2	6	960492	960497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345124
25062	NC_022234	CG	3	6	960496	960501	0 %	0 %	50 %	50 %	538345124
25063	NC_022234	CAGCT	2	10	960555	960564	20 %	20 %	20 %	40 %	538345124
25064	NC_022234	CG	3	6	960576	960581	0 %	0 %	50 %	50 %	538345124
25065	NC_022234	CGG	2	6	960616	960621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345124
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25067	NC_022234	GGGC	2	8	960745	960752	0 %	0 %	75 %	25 %	538345124
25068	NC_022234	CACCGA	2	12	960782	960793	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538345124
25069	NC_022234	GC	3	6	960867	960872	0 %	0 %	50 %	50 %	538345124
25070	NC_022234	GC	3	6	960912	960917	0 %	0 %	50 %	50 %	538345124
25071	NC_022234	TGG	2	6	960955	960960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345124
25072	NC_022234	CGT	2	6	960968	960973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25073	NC_022234	TCG	2	6	961003	961008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25074	NC_022234	GTC	2	6	961038	961043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
25075	NC_022234	TGC	2	6	961054	961059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
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25077	NC_022234	CCG	2	6	961183	961188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345124
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25080	NC_022234	CGT	2	6	961293	961298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25081	NC_022234	GTCG	2	8	961339	961346	0 %	25 %	50 %	25 %	538345125
25082	NC_022234	GCG	2	6	961464	961469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345125
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25087	NC_022234	CTGG	2	8	961777	961784	0 %	25 %	50 %	25 %	538345125
25088	NC_022234	GCC	2	6	961790	961795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345125
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25091	NC_022234	GAG	2	6	961949	961954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345125
25092	NC_022234	TCA	2	6	961968	961973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345125
25093	NC_022234	GC	3	6	962015	962020	0 %	0 %	50 %	50 %	538345125
25094	NC_022234	CGCC	2	8	962070	962077	0 %	0 %	25 %	75 %	538345125
25095	NC_022234	GAGCC	2	10	962201	962210	20 %	0 %	40 %	40 %	538345125
25096	NC_022234	GCT	2	6	962248	962253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
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25099	NC_022234	CAT	2	6	962314	962319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345125
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25101	NC_022234	CTG	3	9	962366	962374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25102	NC_022234	CGCTGT	2	12	962394	962405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25103	NC_022234	GTG	2	6	962432	962437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345125
25104	NC_022234	GTC	2	6	962453	962458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25105	NC_022234	CAT	2	6	962539	962544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345125
25106	NC_022234	CTG	2	6	962565	962570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25107	NC_022234	TTC	2	6	962574	962579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345125
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25109	NC_022234	CTG	2	6	962702	962707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
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25111	NC_022234	GGA	2	6	962816	962821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345125
25112	NC_022234	CTG	2	6	962834	962839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25113	NC_022234	TCG	2	6	962859	962864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25114	NC_022234	G	6	6	962881	962886	0 %	0 %	100 %	0 %	538345125
25115	NC_022234	TGG	2	6	962891	962896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345125
25116	NC_022234	GGGT	2	8	962914	962921	0 %	25 %	75 %	0 %	538345125
25117	NC_022234	GCA	2	6	963195	963200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345125
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25119	NC_022234	CCG	2	6	963233	963238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345125
25120	NC_022234	GGC	2	6	963260	963265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345125
25121	NC_022234	ACG	2	6	963303	963308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25122	NC_022234	TCA	2	6	963333	963338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345125
25123	NC_022234	CAG	2	6	963434	963439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345125
25124	NC_022234	TCCT	2	8	963479	963486	0 %	50 %	0 %	50 %	538345125
25125	NC_022234	CTA	2	6	963493	963498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345125
25126	NC_022234	CGT	2	6	963630	963635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
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25143	NC_022234	TGCGGC	2	12	964129	964140	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538345125
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25150	NC_022234	CTG	2	6	964478	964483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345127
25151	NC_022234	GGC	2	6	964599	964604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345127
25152	NC_022234	CAG	2	6	964622	964627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345127
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25156	NC_022234	TTC	2	6	964924	964929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345127
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25178	NC_022234	CCG	2	6	966029	966034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25179	NC_022234	CCCGAT	2	12	966078	966089	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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25203	NC_022234	CGG	2	6	967381	967386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25223	NC_022234	GACG	2	8	968313	968320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25224	NC_022234	AGC	2	6	968324	968329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25225	NC_022234	GC	3	6	968328	968333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25226	NC_022234	CAA	2	6	968404	968409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25227	NC_022234	A	10	10	968408	968417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25228	NC_022234	CAGT	2	8	968520	968527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25229	NC_022234	CG	3	6	968545	968550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25230	NC_022234	TGCCC	2	10	968578	968587	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25231	NC_022234	CGG	2	6	968725	968730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25232	NC_022234	GTCA	2	8	968734	968741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25233	NC_022234	GTG	2	6	968784	968789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25234	NC_022234	TTC	2	6	968812	968817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25235	NC_022234	TTG	2	6	968889	968894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345130
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25237	NC_022234	TTGT	2	8	969041	969048	0 %	75 %	25 %	0 %	538345130
25238	NC_022234	AGT	2	6	969082	969087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345130
25239	NC_022234	AGT	2	6	969201	969206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345130
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25241	NC_022234	GTC	2	6	969254	969259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25242	NC_022234	CCA	2	6	969265	969270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25243	NC_022234	GCG	2	6	969271	969276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25244	NC_022234	CCG	2	6	969279	969284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25245	NC_022234	CTC	2	6	969302	969307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25246	NC_022234	GACC	2	8	969354	969361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25247	NC_022234	GTT	2	6	969535	969540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345131
25248	NC_022234	GCC	2	6	969590	969595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345131
25249	NC_022234	CAA	2	6	969607	969612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345131
25250	NC_022234	TGACG	2	10	969649	969658	20 %	20 %	40 %	20 %	538345131
25251	NC_022234	GTC	2	6	969685	969690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345132
25252	NC_022234	CCA	2	6	969705	969710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345132
25253	NC_022234	ATG	2	6	969713	969718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345132
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25256	NC_022234	TGC	2	6	969996	970001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345132
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25259	NC_022234	GGCTCT	2	12	970148	970159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345132
25260	NC_022234	GGC	2	6	970165	970170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345132
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25262	NC_022234	CGA	2	6	970194	970199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345132
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25265	NC_022234	T	7	7	970274	970280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25266	NC_022234	GC	3	6	970314	970319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25267	NC_022234	CG	3	6	970428	970433	0 %	0 %	50 %	50 %	538345133
25268	NC_022234	CCT	2	6	970494	970499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345133
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25272	NC_022234	GCGCG	2	10	970695	970704	0 %	0 %	60 %	40 %	538345133
25273	NC_022234	CGA	2	6	970707	970712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345133
25274	NC_022234	TCG	2	6	970789	970794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345134
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25277	NC_022234	GCG	2	6	970903	970908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345134
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25279	NC_022234	TGC	2	6	971038	971043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345134
25280	NC_022234	GC	3	6	971104	971109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25281	NC_022234	TAG	2	6	971169	971174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25282	NC_022234	GCT	2	6	971218	971223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345135
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25300	NC_022234	GCCG	2	8	972022	972029	0 %	0 %	50 %	50 %	538345135
25301	NC_022234	GCT	2	6	972039	972044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345135
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25309	NC_022234	CGC	2	6	972493	972498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345135
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25311	NC_022234	GCG	2	6	972513	972518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345135
25312	NC_022234	TTCATG	2	12	972539	972550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	538345135
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25314	NC_022234	TGG	2	6	972594	972599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345135
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25316	NC_022234	TGC	2	6	972693	972698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345135
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25320	NC_022234	GAC	2	6	972791	972796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25327	NC_022234	GC	4	8	973118	973125	0 %	0 %	50 %	50 %	538345136
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25342	NC_022234	AG	3	6	974110	974115	50 %	0 %	50 %	0 %	538345138
25343	NC_022234	AGC	2	6	974199	974204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345138
25344	NC_022234	TGC	2	6	974346	974351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345138
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25346	NC_022234	GAC	2	6	974427	974432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25347	NC_022234	GGT	2	6	974505	974510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345139
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25349	NC_022234	CCG	2	6	974647	974652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345139
25350	NC_022234	CAGC	2	8	974727	974734	25 %	0 %	25 %	50 %	538345139
25351	NC_022234	CCG	2	6	974788	974793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345139
25352	NC_022234	CCTGT	2	10	974802	974811	0 %	40 %	20 %	40 %	538345139
25353	NC_022234	GCG	2	6	974819	974824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345139
25354	NC_022234	GC	3	6	974837	974842	0 %	0 %	50 %	50 %	538345139
25355	NC_022234	TCC	2	6	974950	974955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345139
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25357	NC_022234	GCGTC	2	10	975014	975023	0 %	20 %	40 %	40 %	538345139
25358	NC_022234	C	6	6	975061	975066	0 %	0 %	0 %	100 %	538345139
25359	NC_022234	ACC	2	6	975067	975072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345139
25360	NC_022234	TGC	2	6	975076	975081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345139
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25362	NC_022234	GTC	2	6	975096	975101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345139
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25482	NC_022234	TGC	2	6	980085	980090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140
25483	NC_022234	TGGC	2	8	980126	980133	0 %	25 %	50 %	25 %	538345140
25484	NC_022234	GCC	2	6	980146	980151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345140
25485	NC_022234	TGT	2	6	980154	980159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345140
25486	NC_022234	GGTC	2	8	980163	980170	0 %	25 %	50 %	25 %	538345140
25487	NC_022234	CCG	2	6	980229	980234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345140
25488	NC_022234	TTC	2	6	980348	980353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345140
25489	NC_022234	GCTG	2	8	980385	980392	0 %	25 %	50 %	25 %	538345140
25490	NC_022234	CCA	2	6	980421	980426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345140
25491	NC_022234	CG	3	6	980501	980506	0 %	0 %	50 %	50 %	538345140
25492	NC_022234	CATC	2	8	980520	980527	25 %	25 %	0 %	50 %	538345140
25493	NC_022234	TCG	2	6	980546	980551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140
25494	NC_022234	GGTAGC	2	12	980568	980579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538345140
25495	NC_022234	GCT	2	6	980613	980618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140
25496	NC_022234	GTA	2	6	980620	980625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345140
25497	NC_022234	GTT	2	6	980650	980655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345140
25498	NC_022234	GTT	2	6	980671	980676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345140
25499	NC_022234	CAG	2	6	980677	980682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345140
25500	NC_022234	GCT	2	6	980689	980694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140

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