MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_022234	TCC	2	6	76174	76179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344265
2003	NC_022234	GAT	2	6	76188	76193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344265
2004	NC_022234	CTGT	2	8	76206	76213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2005	NC_022234	GAA	2	6	76247	76252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_022234	CG	4	8	76288	76295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2007	NC_022234	CCA	2	6	76304	76309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_022234	CGC	2	6	76379	76384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344266
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2010	NC_022234	GCTC	2	8	76429	76436	0 %	25 %	25 %	50 %	538344266
2011	NC_022234	CCG	2	6	76456	76461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344266
2012	NC_022234	GCA	2	6	76465	76470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344266
2013	NC_022234	CG	3	6	76481	76486	0 %	0 %	50 %	50 %	538344266
2014	NC_022234	TGGCG	2	10	76517	76526	0 %	20 %	60 %	20 %	538344266
2015	NC_022234	GGC	2	6	76554	76559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344266
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2109	NC_022234	GGA	2	6	80591	80596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_022234	GTCAC	2	10	80618	80627	20 %	20 %	20 %	40 %	538344270
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2126	NC_022234	GCG	2	6	81330	81335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344271
2127	NC_022234	AGC	2	6	81388	81393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344271
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2130	NC_022234	AGA	2	6	81751	81756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344272
2131	NC_022234	TCG	2	6	81757	81762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344272
2132	NC_022234	TGC	2	6	81784	81789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344272
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2135	NC_022234	GCCAC	2	10	81843	81852	20 %	0 %	20 %	60 %	538344272
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2141	NC_022234	AAG	2	6	82020	82025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344272
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2143	NC_022234	GCC	2	6	82270	82275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2151	NC_022234	TCG	3	9	82752	82760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344274
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2169	NC_022234	AG	3	6	83571	83576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2170	NC_022234	CGA	2	6	83593	83598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2171	NC_022234	TGA	2	6	83673	83678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2175	NC_022234	GCTTC	2	10	83839	83848	0 %	40 %	20 %	40 %	538344276
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2194	NC_022234	CAT	2	6	84504	84509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344277
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2200	NC_022234	GAA	2	6	84758	84763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2201	NC_022234	GCTCG	2	10	84809	84818	0 %	20 %	40 %	40 %	538344278
2202	NC_022234	GCTTG	2	10	84909	84918	0 %	40 %	40 %	20 %	538344278
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2209	NC_022234	TGT	2	6	85169	85174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2210	NC_022234	GTG	2	6	85215	85220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2212	NC_022234	AGCC	2	8	85260	85267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2213	NC_022234	GCC	2	6	85275	85280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2214	NC_022234	CTTC	2	8	85309	85316	0 %	50 %	0 %	50 %	538344279
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2221	NC_022234	GC	3	6	85443	85448	0 %	0 %	50 %	50 %	538344279
2222	NC_022234	A	6	6	85466	85471	100 %	0 %	0 %	0 %	538344279
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2226	NC_022234	ATCG	2	8	85577	85584	25 %	25 %	25 %	25 %	538344279
2227	NC_022234	GCA	2	6	85597	85602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344279
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2232	NC_022234	CG	3	6	85718	85723	0 %	0 %	50 %	50 %	538344279
2233	NC_022234	GCCG	2	8	85868	85875	0 %	0 %	50 %	50 %	538344279
2234	NC_022234	GTGC	2	8	85926	85933	0 %	25 %	50 %	25 %	538344279
2235	NC_022234	CAG	2	6	85961	85966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344279
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2237	NC_022234	GA	3	6	85980	85985	50 %	0 %	50 %	0 %	538344279
2238	NC_022234	GCA	2	6	86032	86037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344279
2239	NC_022234	CACCGC	2	12	86063	86074	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538344279
2240	NC_022234	GCC	2	6	86154	86159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344279
2241	NC_022234	GGC	2	6	86161	86166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344279
2242	NC_022234	AAC	2	6	86244	86249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_022234	CTC	2	6	86311	86316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344280
2244	NC_022234	ACATC	2	10	86330	86339	40 %	20 %	0 %	40 %	538344280
2245	NC_022234	CTG	2	6	86353	86358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344280
2246	NC_022234	GTCG	2	8	86386	86393	0 %	25 %	50 %	25 %	538344280
2247	NC_022234	TCGC	2	8	86404	86411	0 %	25 %	25 %	50 %	538344280
2248	NC_022234	GAT	2	6	86508	86513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344280
2249	NC_022234	GGC	2	6	86541	86546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344280
2250	NC_022234	GCAAT	2	10	86564	86573	40 %	20 %	20 %	20 %	538344280
2251	NC_022234	CG	3	6	86576	86581	0 %	0 %	50 %	50 %	538344280
2252	NC_022234	CGGC	2	8	86591	86598	0 %	0 %	50 %	50 %	538344280
2253	NC_022234	CGT	2	6	86607	86612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344280
2254	NC_022234	CAG	2	6	86619	86624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344280
2255	NC_022234	GCG	2	6	86682	86687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344280
2256	NC_022234	GAAC	2	8	86691	86698	50 %	0 %	25 %	25 %	538344280
2257	NC_022234	TGC	2	6	86714	86719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344280
2258	NC_022234	CTT	2	6	86736	86741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344280
2259	NC_022234	ACC	2	6	86747	86752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344280
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2261	NC_022234	TGG	2	6	86825	86830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344280
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2263	NC_022234	GC	3	6	86857	86862	0 %	0 %	50 %	50 %	538344280
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2266	NC_022234	CAGGG	2	10	87004	87013	20 %	0 %	60 %	20 %	538344280
2267	NC_022234	GCA	2	6	87024	87029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344280
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2270	NC_022234	GCG	2	6	87073	87078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344280
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2272	NC_022234	CGC	2	6	87313	87318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2273	NC_022234	CA	3	6	87366	87371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2274	NC_022234	CAGG	2	8	87385	87392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2275	NC_022234	CTG	2	6	87394	87399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2276	NC_022234	CAG	2	6	87516	87521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2277	NC_022234	TGC	2	6	87613	87618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2278	NC_022234	CGA	2	6	87767	87772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2279	NC_022234	CGA	2	6	87794	87799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2280	NC_022234	TCGC	2	8	87821	87828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2281	NC_022234	GTCC	2	8	87879	87886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2282	NC_022234	CAG	2	6	87890	87895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2283	NC_022234	CGG	2	6	87913	87918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2284	NC_022234	CCG	2	6	87952	87957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2285	NC_022234	GGCG	2	8	88009	88016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2286	NC_022234	GAT	2	6	88177	88182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344281
2287	NC_022234	GGC	2	6	88326	88331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2288	NC_022234	GTC	2	6	88399	88404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344282
2289	NC_022234	TCA	2	6	88433	88438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344282
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2291	NC_022234	TC	3	6	88528	88533	0 %	50 %	0 %	50 %	538344282
2292	NC_022234	GCT	2	6	88819	88824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344283
2293	NC_022234	GCG	2	6	88858	88863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344283
2294	NC_022234	TTC	2	6	88904	88909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344283
2295	NC_022234	CG	3	6	88938	88943	0 %	0 %	50 %	50 %	538344283
2296	NC_022234	TCC	2	6	89034	89039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344283
2297	NC_022234	CGG	2	6	89113	89118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344283
2298	NC_022234	AAC	2	6	89271	89276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2299	NC_022234	GATG	2	8	89413	89420	25 %	25 %	50 %	0 %	538344284
2300	NC_022234	CGG	2	6	89533	89538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344284
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2305	NC_022234	GGCC	2	8	89733	89740	0 %	0 %	50 %	50 %	538344284
2306	NC_022234	GCC	2	6	89801	89806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344284
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2318	NC_022234	CCGA	2	8	90353	90360	25 %	0 %	25 %	50 %	538344284
2319	NC_022234	GCG	2	6	90402	90407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344284
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2328	NC_022234	CGA	2	6	91107	91112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344285
2329	NC_022234	GCG	2	6	91121	91126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344285
2330	NC_022234	CTC	2	6	91167	91172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344285
2331	NC_022234	GCG	2	6	91197	91202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344285
2332	NC_022234	CTG	2	6	91204	91209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344285
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2343	NC_022234	CGC	2	6	91620	91625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344286
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2356	NC_022234	G	6	6	92083	92088	0 %	0 %	100 %	0 %	538344286
2357	NC_022234	TGC	2	6	92118	92123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344286
2358	NC_022234	ATC	2	6	92162	92167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344286
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2363	NC_022234	T	6	6	92456	92461	0 %	100 %	0 %	0 %	538344287
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2368	NC_022234	TGCT	2	8	92725	92732	0 %	50 %	25 %	25 %	538344287
2369	NC_022234	CGG	2	6	92761	92766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344287
2370	NC_022234	GGT	2	6	92775	92780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344287
2371	NC_022234	GC	3	6	92834	92839	0 %	0 %	50 %	50 %	538344287
2372	NC_022234	CGCA	2	8	92944	92951	25 %	0 %	25 %	50 %	538344287
2373	NC_022234	TGA	2	6	93017	93022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344287
2374	NC_022234	CG	3	6	93024	93029	0 %	0 %	50 %	50 %	538344287
2375	NC_022234	CGT	2	6	93045	93050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344287
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2379	NC_022234	TCC	2	6	93197	93202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344287
2380	NC_022234	GACC	2	8	93213	93220	25 %	0 %	25 %	50 %	538344287
2381	NC_022234	GAC	2	6	93228	93233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344287
2382	NC_022234	ACC	2	6	93244	93249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344287
2383	NC_022234	GC	3	6	93307	93312	0 %	0 %	50 %	50 %	538344287
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2452	NC_022234	GAG	2	6	96848	96853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2483	NC_022234	C	7	7	98483	98489	0 %	0 %	0 %	100 %	538344292
2484	NC_022234	GGCC	2	8	98516	98523	0 %	0 %	50 %	50 %	538344292
2485	NC_022234	CGG	2	6	98528	98533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344292
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2490	NC_022234	T	6	6	98801	98806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_022234	TGC	2	6	98888	98893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2492	NC_022234	CTGC	2	8	98965	98972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2493	NC_022234	CAC	2	6	99018	99023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344293
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2497	NC_022234	CCGGCG	2	12	99194	99205	0 %	0 %	50 %	50 %	538344293
2498	NC_022234	GC	3	6	99268	99273	0 %	0 %	50 %	50 %	538344293
2499	NC_022234	TC	3	6	99336	99341	0 %	50 %	0 %	50 %	538344293
2500	NC_022234	AGGC	2	8	99368	99375	25 %	0 %	50 %	25 %	538344293

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