MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_022234	CGG	2	6	800001	800006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344962
21002	NC_022234	GCT	2	6	800040	800045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344962
21003	NC_022234	GTC	2	6	800047	800052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344962
21004	NC_022234	CG	4	8	800054	800061	0 %	0 %	50 %	50 %	538344962
21005	NC_022234	CCG	2	6	800085	800090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344962
21006	NC_022234	CGC	2	6	800165	800170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344962
21007	NC_022234	AGG	2	6	800234	800239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344962
21008	NC_022234	GCG	2	6	800309	800314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344962
21009	NC_022234	GAT	2	6	800322	800327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344962
21010	NC_022234	CGA	2	6	800367	800372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344962
21011	NC_022234	CCA	2	6	800406	800411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344962
21012	NC_022234	ACCGGC	2	12	800424	800435	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344962
21013	NC_022234	CGG	2	6	800444	800449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344962
21014	NC_022234	GCG	2	6	800452	800457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344962
21015	NC_022234	TGC	2	6	800464	800469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344962
21016	NC_022234	GCG	2	6	800485	800490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21017	NC_022234	GC	3	6	800492	800497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21018	NC_022234	TCGCGG	2	12	800538	800549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344963
21019	NC_022234	GCC	2	6	800600	800605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344963
21020	NC_022234	GCGT	2	8	800610	800617	0 %	25 %	50 %	25 %	538344963
21021	NC_022234	CG	3	6	800619	800624	0 %	0 %	50 %	50 %	538344963
21022	NC_022234	AGGC	2	8	800630	800637	25 %	0 %	50 %	25 %	538344963
21023	NC_022234	CGC	2	6	800671	800676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344963
21024	NC_022234	TGG	2	6	800688	800693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344963
21025	NC_022234	GGCG	2	8	800746	800753	0 %	0 %	75 %	25 %	538344963
21026	NC_022234	TGG	2	6	800757	800762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344963
21027	NC_022234	GCG	2	6	800804	800809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344963
21028	NC_022234	CG	4	8	800808	800815	0 %	0 %	50 %	50 %	538344963
21029	NC_022234	CGG	2	6	800817	800822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344963
21030	NC_022234	CTG	3	9	800954	800962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344963
21031	NC_022234	CTG	2	6	801031	801036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344963
21032	NC_022234	CGG	2	6	801049	801054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344963
21033	NC_022234	GCA	2	6	801092	801097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344963
21034	NC_022234	CCG	2	6	801110	801115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344963
21035	NC_022234	GCT	2	6	801128	801133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344963
21036	NC_022234	CGG	2	6	801137	801142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344963
21037	NC_022234	CAGC	2	8	801240	801247	25 %	0 %	25 %	50 %	538344964
21038	NC_022234	CGC	2	6	801294	801299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344964
21039	NC_022234	CGC	2	6	801368	801373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344964
21040	NC_022234	GCC	2	6	801411	801416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344964
21041	NC_022234	CAG	2	6	801429	801434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344964
21042	NC_022234	CGG	2	6	801443	801448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344964
21043	NC_022234	CAG	2	6	801462	801467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344964
21044	NC_022234	CCG	2	6	801529	801534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344964
21045	NC_022234	CGC	2	6	801540	801545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344964
21046	NC_022234	GCG	2	6	801637	801642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344964
21047	NC_022234	CAG	2	6	801643	801648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344964
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21049	NC_022234	AGCGC	2	10	801686	801695	20 %	0 %	40 %	40 %	538344964
21050	NC_022234	GCG	2	6	801751	801756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344964
21051	NC_022234	CG	3	6	801765	801770	0 %	0 %	50 %	50 %	538344964
21052	NC_022234	GCA	2	6	801788	801793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344964
21053	NC_022234	GCCGAT	2	12	801807	801818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344964
21054	NC_022234	GTG	2	6	801843	801848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344964
21055	NC_022234	GA	3	6	801872	801877	50 %	0 %	50 %	0 %	538344964
21056	NC_022234	CCG	2	6	801902	801907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344964
21057	NC_022234	GGT	2	6	801954	801959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344964
21058	NC_022234	GAA	2	6	801975	801980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344964
21059	NC_022234	CGG	2	6	801986	801991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344964
21060	NC_022234	CAT	2	6	801999	802004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344964
21061	NC_022234	AGA	2	6	802013	802018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344964
21062	NC_022234	CG	3	6	802041	802046	0 %	0 %	50 %	50 %	538344964
21063	NC_022234	CAG	2	6	802071	802076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344964
21064	NC_022234	CAC	3	9	802092	802100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344964
21065	NC_022234	TCA	2	6	802271	802276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344964
21066	NC_022234	GC	3	6	802277	802282	0 %	0 %	50 %	50 %	538344964
21067	NC_022234	CGG	2	6	802283	802288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344964
21068	NC_022234	CGG	2	6	802319	802324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344964
21069	NC_022234	CG	3	6	802327	802332	0 %	0 %	50 %	50 %	538344964
21070	NC_022234	GCCA	2	8	802425	802432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21071	NC_022234	CG	3	6	802444	802449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21072	NC_022234	GGCG	2	8	802450	802457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21073	NC_022234	CGG	2	6	802458	802463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21074	NC_022234	GCG	2	6	802468	802473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21075	NC_022234	GTG	2	6	802560	802565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344965
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21078	NC_022234	CGA	2	6	802651	802656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344965
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21080	NC_022234	CGA	2	6	802681	802686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344965
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21082	NC_022234	TCG	2	6	802719	802724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344965
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21085	NC_022234	GC	3	6	802823	802828	0 %	0 %	50 %	50 %	538344965
21086	NC_022234	GGCC	2	8	802831	802838	0 %	0 %	50 %	50 %	538344965
21087	NC_022234	CAG	2	6	802868	802873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344965
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21089	NC_022234	GCCC	2	8	802966	802973	0 %	0 %	25 %	75 %	538344965
21090	NC_022234	CCGG	2	8	803005	803012	0 %	0 %	50 %	50 %	538344965
21091	NC_022234	GCC	2	6	803013	803018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344965
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21095	NC_022234	GCC	2	6	803330	803335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344965
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21099	NC_022234	GGC	2	6	803443	803448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344965
21100	NC_022234	GTT	2	6	803468	803473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21101	NC_022234	GCG	2	6	803514	803519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344966
21102	NC_022234	CG	3	6	803518	803523	0 %	0 %	50 %	50 %	538344966
21103	NC_022234	GCA	2	6	803547	803552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344966
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21105	NC_022234	GCG	2	6	803573	803578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344966
21106	NC_022234	GCA	2	6	803592	803597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344966
21107	NC_022234	GAA	2	6	803731	803736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344966
21108	NC_022234	CGC	3	9	803793	803801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344966
21109	NC_022234	GCC	2	6	803833	803838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344966
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21116	NC_022234	GCA	2	6	804162	804167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344966
21117	NC_022234	CG	4	8	804178	804185	0 %	0 %	50 %	50 %	538344966
21118	NC_022234	TTG	2	6	804215	804220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344966
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21120	NC_022234	TGG	2	6	804264	804269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344966
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21240	NC_022234	GCCAGA	2	12	809197	809208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344972
21241	NC_022234	TCG	2	6	809209	809214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344972
21242	NC_022234	GCG	2	6	809223	809228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344972
21243	NC_022234	GTC	2	6	809239	809244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344972
21244	NC_022234	GCA	2	6	809256	809261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344972
21245	NC_022234	ACG	2	6	809270	809275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344972
21246	NC_022234	GCT	2	6	809500	809505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344973
21247	NC_022234	ATGGCG	2	12	809573	809584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344973
21248	NC_022234	CCA	2	6	809632	809637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344973
21249	NC_022234	GCC	2	6	809642	809647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344973
21250	NC_022234	CTGC	2	8	809693	809700	0 %	25 %	25 %	50 %	538344973
21251	NC_022234	TGC	2	6	809712	809717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344973
21252	NC_022234	GCA	2	6	809758	809763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344973
21253	NC_022234	GCA	2	6	809779	809784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344973
21254	NC_022234	CCG	2	6	809786	809791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344973
21255	NC_022234	GCG	2	6	809861	809866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21256	NC_022234	TCC	2	6	809893	809898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21257	NC_022234	TGT	2	6	809945	809950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344974
21258	NC_022234	GCT	2	6	809951	809956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21259	NC_022234	GCC	2	6	810009	810014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
21260	NC_022234	CG	4	8	810029	810036	0 %	0 %	50 %	50 %	538344974
21261	NC_022234	CCGC	2	8	810037	810044	0 %	0 %	25 %	75 %	538344974
21262	NC_022234	CTG	2	6	810051	810056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21263	NC_022234	GCG	2	6	810069	810074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344974
21264	NC_022234	TGC	2	6	810103	810108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21265	NC_022234	CG	4	8	810158	810165	0 %	0 %	50 %	50 %	538344974
21266	NC_022234	CGATGA	2	12	810169	810180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538344974
21267	NC_022234	CCG	2	6	810211	810216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
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21269	NC_022234	GCC	3	9	810237	810245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
21270	NC_022234	TCGG	2	8	810252	810259	0 %	25 %	50 %	25 %	538344974
21271	NC_022234	CGC	2	6	810284	810289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
21272	NC_022234	CGC	2	6	810359	810364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
21273	NC_022234	CG	5	10	810403	810412	0 %	0 %	50 %	50 %	538344974
21274	NC_022234	GTC	2	6	810416	810421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21275	NC_022234	GCC	2	6	810423	810428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
21276	NC_022234	GCA	2	6	810430	810435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344974
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21279	NC_022234	GCG	2	6	810486	810491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344974
21280	NC_022234	GCA	3	9	810500	810508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21281	NC_022234	CGC	2	6	810512	810517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
21282	NC_022234	GC	3	6	810516	810521	0 %	0 %	50 %	50 %	538344974
21283	NC_022234	TGGG	2	8	810537	810544	0 %	25 %	75 %	0 %	538344974
21284	NC_022234	CGA	2	6	810554	810559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21285	NC_022234	GAA	2	6	810594	810599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344974
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21287	NC_022234	CAGG	2	8	810656	810663	25 %	0 %	50 %	25 %	538344974
21288	NC_022234	CGG	3	9	810664	810672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344974
21289	NC_022234	CGC	2	6	810674	810679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344974
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21294	NC_022234	CGA	2	6	810976	810981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344974
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21297	NC_022234	TGC	2	6	811048	811053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21298	NC_022234	GCT	2	6	811061	811066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344974
21299	NC_022234	GCT	2	6	811168	811173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344975
21300	NC_022234	GCC	2	6	811175	811180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344975
21301	NC_022234	CTG	3	9	811181	811189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344975
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21304	NC_022234	GCCCG	2	10	811303	811312	0 %	0 %	40 %	60 %	538344975
21305	NC_022234	GCC	2	6	811379	811384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344975
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21310	NC_022234	GCG	2	6	811697	811702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344975
21311	NC_022234	CCG	2	6	811734	811739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344975
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21318	NC_022234	TGC	3	9	812094	812102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344975
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21320	NC_022234	CGT	2	6	812179	812184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344975
21321	NC_022234	CG	3	6	812217	812222	0 %	0 %	50 %	50 %	538344975
21322	NC_022234	CGA	2	6	812248	812253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344975
21323	NC_022234	GTG	2	6	812291	812296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344975
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21332	NC_022234	GGT	2	6	812748	812753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344976
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21335	NC_022234	ATC	2	6	812800	812805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344976
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21339	NC_022234	TCGT	2	8	812929	812936	0 %	50 %	25 %	25 %	538344976
21340	NC_022234	CGA	2	6	812949	812954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344976
21341	NC_022234	GC	3	6	812974	812979	0 %	0 %	50 %	50 %	538344976
21342	NC_022234	CG	3	6	812981	812986	0 %	0 %	50 %	50 %	538344976
21343	NC_022234	TGG	2	6	812987	812992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344976
21344	NC_022234	CAGGC	2	10	813010	813019	20 %	0 %	40 %	40 %	538344976
21345	NC_022234	CTCG	2	8	813039	813046	0 %	25 %	25 %	50 %	538344976
21346	NC_022234	CGACG	2	10	813051	813060	20 %	0 %	40 %	40 %	538344976
21347	NC_022234	CG	3	6	813107	813112	0 %	0 %	50 %	50 %	538344976
21348	NC_022234	GC	4	8	813126	813133	0 %	0 %	50 %	50 %	538344976
21349	NC_022234	CGG	2	6	813198	813203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344976
21350	NC_022234	GGT	2	6	813222	813227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344976
21351	NC_022234	GC	4	8	813246	813253	0 %	0 %	50 %	50 %	538344976
21352	NC_022234	GGC	2	6	813267	813272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344976
21353	NC_022234	GGT	2	6	813273	813278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344976
21354	NC_022234	CGG	2	6	813309	813314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344976
21355	NC_022234	GGT	2	6	813318	813323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344976
21356	NC_022234	CG	3	6	813356	813361	0 %	0 %	50 %	50 %	538344976
21357	NC_022234	TGC	3	9	813425	813433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344976
21358	NC_022234	GGCGAA	2	12	813493	813504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538344976
21359	NC_022234	CGG	2	6	813510	813515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344976
21360	NC_022234	GTC	2	6	813520	813525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344976
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21459	NC_022234	GATC	2	8	816806	816813	25 %	25 %	25 %	25 %	538344977
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21475	NC_022234	TGGG	2	8	817346	817353	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21476	NC_022234	CGG	2	6	817360	817365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21477	NC_022234	CGC	2	6	817382	817387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21478	NC_022234	CGA	2	6	817530	817535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344979
21479	NC_022234	CAC	2	6	817542	817547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344979
21480	NC_022234	CGC	2	6	817552	817557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344979
21481	NC_022234	GCC	3	9	817561	817569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344979
21482	NC_022234	CGC	2	6	817584	817589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344979
21483	NC_022234	GTG	2	6	817600	817605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344979
21484	NC_022234	GC	3	6	817630	817635	0 %	0 %	50 %	50 %	538344979
21485	NC_022234	GCC	2	6	817639	817644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344979
21486	NC_022234	CTG	2	6	817741	817746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344979
21487	NC_022234	GC	3	6	817747	817752	0 %	0 %	50 %	50 %	538344979
21488	NC_022234	GAC	2	6	817774	817779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344979
21489	NC_022234	GAA	2	6	817781	817786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344979
21490	NC_022234	GAA	2	6	817796	817801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21491	NC_022234	GCC	2	6	817892	817897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344980
21492	NC_022234	TCA	2	6	817900	817905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344980
21493	NC_022234	GGCGCG	2	12	817922	817933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344980
21494	NC_022234	GGT	2	6	817991	817996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344980
21495	NC_022234	GCGAC	2	10	818025	818034	20 %	0 %	40 %	40 %	538344980
21496	NC_022234	TGCA	2	8	818124	818131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21497	NC_022234	TC	3	6	818192	818197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21498	NC_022234	GATG	2	8	818236	818243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21499	NC_022234	GCA	2	6	818263	818268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21500	NC_022234	GCA	2	6	818275	818280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344981

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