MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022234	GC	3	6	668361	668366	0 %	0 %	50 %	50 %	538344836
17502	NC_022234	GAT	2	6	668371	668376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344836
17503	NC_022234	CGA	2	6	668466	668471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344836
17504	NC_022234	GCT	2	6	668474	668479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344836
17505	NC_022234	CGA	2	6	668502	668507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344836
17506	NC_022234	CCG	2	6	668508	668513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344836
17507	NC_022234	GTC	2	6	668548	668553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344836
17508	NC_022234	CGCGAA	3	18	668578	668595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344836
17509	NC_022234	GGCAC	2	10	668600	668609	20 %	0 %	40 %	40 %	538344836
17510	NC_022234	CGC	2	6	668621	668626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344836
17511	NC_022234	GCAT	2	8	668702	668709	25 %	25 %	25 %	25 %	538344837
17512	NC_022234	GCG	2	6	668718	668723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344837
17513	NC_022234	CGC	2	6	668738	668743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344837
17514	NC_022234	GC	3	6	668760	668765	0 %	0 %	50 %	50 %	538344837
17515	NC_022234	CGG	2	6	668798	668803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344837
17516	NC_022234	GGC	2	6	668925	668930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344837
17517	NC_022234	GCG	2	6	668953	668958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344837
17518	NC_022234	GCT	2	6	669011	669016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344837
17519	NC_022234	CGG	2	6	669046	669051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344837
17520	NC_022234	GTC	3	9	669081	669089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344837
17521	NC_022234	GGCA	2	8	669101	669108	25 %	0 %	50 %	25 %	538344837
17522	NC_022234	GCCG	2	8	669116	669123	0 %	0 %	50 %	50 %	538344837
17523	NC_022234	TGC	2	6	669176	669181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17524	NC_022234	CTG	2	6	669217	669222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17525	NC_022234	TCG	2	6	669230	669235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17526	NC_022234	GCGG	2	8	669276	669283	0 %	0 %	75 %	25 %	538344838
17527	NC_022234	GCG	2	6	669299	669304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344838
17528	NC_022234	GCCG	2	8	669322	669329	0 %	0 %	50 %	50 %	538344838
17529	NC_022234	TGG	2	6	669401	669406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344838
17530	NC_022234	AGC	2	6	669413	669418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17531	NC_022234	GC	3	6	669417	669422	0 %	0 %	50 %	50 %	538344838
17532	NC_022234	CGC	2	6	669456	669461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344838
17533	NC_022234	GCTG	2	8	669485	669492	0 %	25 %	50 %	25 %	538344838
17534	NC_022234	GCT	3	9	669510	669518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17535	NC_022234	CGA	2	6	669519	669524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344838
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17538	NC_022234	G	6	6	669609	669614	0 %	0 %	100 %	0 %	538344838
17539	NC_022234	CGG	2	6	669707	669712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344838
17540	NC_022234	GCG	2	6	669797	669802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344838
17541	NC_022234	TGC	2	6	669833	669838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
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17543	NC_022234	TGC	2	6	670013	670018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17544	NC_022234	TGG	2	6	670036	670041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344838
17545	NC_022234	TCG	2	6	670063	670068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17546	NC_022234	GCT	2	6	670080	670085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
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17549	NC_022234	CG	4	8	670241	670248	0 %	0 %	50 %	50 %	538344838
17550	NC_022234	GCG	2	6	670264	670269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344838
17551	NC_022234	C	6	6	670289	670294	0 %	0 %	0 %	100 %	538344838
17552	NC_022234	ACG	2	6	670295	670300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344838
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17554	NC_022234	ACGGCG	2	12	670334	670345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344838
17555	NC_022234	GC	4	8	670358	670365	0 %	0 %	50 %	50 %	538344838
17556	NC_022234	CGCC	2	8	670383	670390	0 %	0 %	25 %	75 %	538344838
17557	NC_022234	ACG	2	6	670478	670483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344838
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17559	NC_022234	ACG	2	6	670630	670635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344838
17560	NC_022234	CTG	2	6	670780	670785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344838
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17562	NC_022234	CCG	2	6	670795	670800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344838
17563	NC_022234	GGC	2	6	670801	670806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344838
17564	NC_022234	CGC	2	6	670811	670816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344838
17565	NC_022234	CTA	2	6	670818	670823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344838
17566	NC_022234	TGCG	2	8	670864	670871	0 %	25 %	50 %	25 %	538344838
17567	NC_022234	CGG	2	6	670881	670886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344838
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17573	NC_022234	CGA	2	6	671112	671117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344838
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17601	NC_022234	CGGTCA	2	12	672156	672167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344839
17602	NC_022234	CCGATG	2	12	672183	672194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344839
17603	NC_022234	GGC	2	6	672249	672254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344839
17604	NC_022234	CG	3	6	672279	672284	0 %	0 %	50 %	50 %	538344839
17605	NC_022234	CTT	2	6	672316	672321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344839
17606	NC_022234	GGC	2	6	672388	672393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17607	NC_022234	CCG	2	6	672425	672430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344840
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17609	NC_022234	GCG	2	6	672484	672489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344840
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17612	NC_022234	GC	4	8	672572	672579	0 %	0 %	50 %	50 %	538344840
17613	NC_022234	AGC	2	6	672730	672735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344840
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17615	NC_022234	CAG	2	6	672786	672791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344840
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17617	NC_022234	GCG	2	6	672818	672823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344840
17618	NC_022234	GTA	2	6	672852	672857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344840
17619	NC_022234	TCC	2	6	672901	672906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344840
17620	NC_022234	CCA	2	6	672917	672922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344840
17621	NC_022234	TTG	2	6	672946	672951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344840
17622	NC_022234	TGC	2	6	672968	672973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344840
17623	NC_022234	GC	3	6	672985	672990	0 %	0 %	50 %	50 %	538344840
17624	NC_022234	AGC	2	6	672991	672996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344840
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17627	NC_022234	CACGCG	2	12	673074	673085	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344840
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17629	NC_022234	GCC	2	6	673152	673157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344840
17630	NC_022234	GGC	3	9	673181	673189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344840
17631	NC_022234	GCAG	2	8	673205	673212	25 %	0 %	50 %	25 %	538344840
17632	NC_022234	CG	3	6	673213	673218	0 %	0 %	50 %	50 %	538344840
17633	NC_022234	TGCCGG	2	12	673229	673240	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344840
17634	NC_022234	TCA	2	6	673283	673288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344840
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17646	NC_022234	CCAT	2	8	673881	673888	25 %	25 %	0 %	50 %	538344841
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17653	NC_022234	CGT	2	6	674362	674367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344841
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17657	NC_022234	GCC	2	6	674475	674480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344841
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17660	NC_022234	CAC	2	6	674537	674542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344841
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17663	NC_022234	CAG	3	9	674639	674647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344841
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17667	NC_022234	CG	3	6	674803	674808	0 %	0 %	50 %	50 %	538344841
17668	NC_022234	CCT	2	6	674815	674820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344841
17669	NC_022234	GCA	2	6	674905	674910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344841
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17684	NC_022234	GGC	2	6	675494	675499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344841
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17687	NC_022234	CGC	2	6	675632	675637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344841
17688	NC_022234	GCGT	2	8	675656	675663	0 %	25 %	50 %	25 %	538344841
17689	NC_022234	ATG	2	6	675760	675765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17690	NC_022234	CGC	2	6	675786	675791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344842
17691	NC_022234	CGC	2	6	675830	675835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344842
17692	NC_022234	TTG	2	6	675931	675936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344842
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17694	NC_022234	CGC	2	6	676036	676041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344843
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17700	NC_022234	AGT	2	6	676269	676274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344843
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17704	NC_022234	TGCT	2	8	676364	676371	0 %	50 %	25 %	25 %	538344843
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17718	NC_022234	TG	3	6	676761	676766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17719	NC_022234	GCC	3	9	676813	676821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344844
17720	NC_022234	AGGCC	2	10	676833	676842	20 %	0 %	40 %	40 %	538344844
17721	NC_022234	GCA	2	6	676872	676877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344844
17722	NC_022234	CCG	2	6	676907	676912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344844
17723	NC_022234	GAC	2	6	676921	676926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344844
17724	NC_022234	GGCT	2	8	676954	676961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17725	NC_022234	TCGGCC	2	12	677047	677058	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344845
17726	NC_022234	CGC	2	6	677247	677252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344845
17727	NC_022234	AGC	3	9	677302	677310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344845
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17729	NC_022234	GCT	2	6	677327	677332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344845
17730	NC_022234	GCC	2	6	677377	677382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344845
17731	NC_022234	CAC	2	6	677433	677438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344845
17732	NC_022234	ACC	2	6	677446	677451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344845
17733	NC_022234	CTT	2	6	677454	677459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344845
17734	NC_022234	CAT	2	6	677484	677489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344845
17735	NC_022234	GCA	2	6	677495	677500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344845
17736	NC_022234	GGA	2	6	677508	677513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344845
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17738	NC_022234	TTC	2	6	677538	677543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344845
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17859	NC_022234	A	6	6	681985	681990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17860	NC_022234	AGA	2	6	682047	682052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344851
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17862	NC_022234	TGC	2	6	682161	682166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344851
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17885	NC_022234	CGG	2	6	683024	683029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17886	NC_022234	CG	3	6	683085	683090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17887	NC_022234	GGT	2	6	683138	683143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17888	NC_022234	TGC	2	6	683187	683192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17890	NC_022234	CG	3	6	683242	683247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17979	NC_022234	CG	3	6	687018	687023	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
17980	NC_022234	CCA	2	6	687051	687056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344853
17981	NC_022234	CTG	2	6	687058	687063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344853
17982	NC_022234	GC	3	6	687118	687123	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
17983	NC_022234	CTCGGC	2	12	687133	687144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344853
17984	NC_022234	GC	3	6	687143	687148	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
17985	NC_022234	TCG	2	6	687158	687163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344853
17986	NC_022234	CG	3	6	687183	687188	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
17987	NC_022234	GCG	2	6	687215	687220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344853
17988	NC_022234	GGT	2	6	687225	687230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344853
17989	NC_022234	TCA	2	6	687231	687236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344853
17990	NC_022234	GATG	2	8	687249	687256	25 %	25 %	50 %	0 %	538344853
17991	NC_022234	CG	4	8	687280	687287	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
17992	NC_022234	TCA	2	6	687363	687368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344853
17993	NC_022234	GCA	2	6	687420	687425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344853
17994	NC_022234	GC	4	8	687447	687454	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
17995	NC_022234	AGTC	2	8	687509	687516	25 %	25 %	25 %	25 %	538344854
17996	NC_022234	GGC	2	6	687582	687587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344854
17997	NC_022234	GGCG	2	8	687669	687676	0 %	0 %	75 %	25 %	538344854
17998	NC_022234	GC	3	6	687719	687724	0 %	0 %	50 %	50 %	538344854
17999	NC_022234	CCG	2	6	687726	687731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344854
18000	NC_022234	GGC	2	6	687755	687760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344854

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