MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022234	CGT	2	6	649009	649014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17002	NC_022234	ATC	2	6	649022	649027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344811
17003	NC_022234	GGC	2	6	649081	649086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
17004	NC_022234	GC	3	6	649085	649090	0 %	0 %	50 %	50 %	538344811
17005	NC_022234	CGATG	2	10	649099	649108	20 %	20 %	40 %	20 %	538344811
17006	NC_022234	GC	3	6	649141	649146	0 %	0 %	50 %	50 %	538344811
17007	NC_022234	TCC	2	6	649157	649162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344811
17008	NC_022234	GCC	2	6	649179	649184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344811
17009	NC_022234	GATG	2	8	649219	649226	25 %	25 %	50 %	0 %	538344811
17010	NC_022234	GAT	2	6	649312	649317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344811
17011	NC_022234	GCT	2	6	649399	649404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17012	NC_022234	CGGC	2	8	649416	649423	0 %	0 %	50 %	50 %	538344811
17013	NC_022234	TCA	2	6	649428	649433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344811
17014	NC_022234	CG	3	6	649434	649439	0 %	0 %	50 %	50 %	538344811
17015	NC_022234	GCA	2	6	649486	649491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17016	NC_022234	ATC	2	6	649517	649522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344811
17017	NC_022234	GCG	2	6	649589	649594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
17018	NC_022234	TGC	2	6	649596	649601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17019	NC_022234	TGGGCT	2	12	649602	649613	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538344811
17020	NC_022234	GCG	2	6	649627	649632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
17021	NC_022234	GAA	2	6	649636	649641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344811
17022	NC_022234	AGG	2	6	649683	649688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344811
17023	NC_022234	GCCGC	2	10	649712	649721	0 %	0 %	40 %	60 %	538344811
17024	NC_022234	GCG	3	9	649749	649757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
17025	NC_022234	ACG	2	6	649893	649898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17026	NC_022234	GCC	2	6	649955	649960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344811
17027	NC_022234	GCC	2	6	649963	649968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344811
17028	NC_022234	GGT	2	6	650011	650016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344811
17029	NC_022234	GGC	2	6	650032	650037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
17030	NC_022234	AAC	2	6	650054	650059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344811
17031	NC_022234	AGG	2	6	650127	650132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344811
17032	NC_022234	CTG	2	6	650141	650146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17033	NC_022234	CG	3	6	650190	650195	0 %	0 %	50 %	50 %	538344811
17034	NC_022234	TGC	2	6	650223	650228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17035	NC_022234	GCT	2	6	650233	650238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17036	NC_022234	CTG	2	6	650420	650425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17037	NC_022234	CGC	2	6	650454	650459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344811
17038	NC_022234	CTG	3	9	650468	650476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17039	NC_022234	CTCGG	2	10	650525	650534	0 %	20 %	40 %	40 %	538344811
17040	NC_022234	GTG	2	6	650546	650551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344811
17041	NC_022234	CCT	2	6	650559	650564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344811
17042	NC_022234	GCT	2	6	650611	650616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
17043	NC_022234	TGA	2	6	650696	650701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344811
17044	NC_022234	AAG	2	6	650731	650736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_022234	CG	3	6	650771	650776	0 %	0 %	50 %	50 %	538344812
17046	NC_022234	CTC	2	6	650785	650790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344812
17047	NC_022234	GGT	2	6	650811	650816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344812
17048	NC_022234	TGC	2	6	650822	650827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344812
17049	NC_022234	ATC	2	6	650896	650901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344812
17050	NC_022234	GC	3	6	650946	650951	0 %	0 %	50 %	50 %	538344812
17051	NC_022234	TGC	2	6	651061	651066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17052	NC_022234	TCG	2	6	651127	651132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17053	NC_022234	TCG	2	6	651174	651179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17054	NC_022234	CGG	2	6	651190	651195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17055	NC_022234	GGT	2	6	651209	651214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344813
17056	NC_022234	GAC	2	6	651251	651256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17057	NC_022234	TCG	2	6	651316	651321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17058	NC_022234	GCC	2	6	651327	651332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344813
17059	NC_022234	TGC	2	6	651349	651354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17060	NC_022234	CGA	2	6	651413	651418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17061	NC_022234	AGCG	2	8	651438	651445	25 %	0 %	50 %	25 %	538344813
17062	NC_022234	GCCGC	2	10	651470	651479	0 %	0 %	40 %	60 %	538344813
17063	NC_022234	AGA	2	6	651520	651525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344813
17064	NC_022234	TGC	2	6	651640	651645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17065	NC_022234	GCG	2	6	651709	651714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17066	NC_022234	GCG	2	6	651754	651759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17067	NC_022234	CGG	2	6	651797	651802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17068	NC_022234	GGC	2	6	651819	651824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17069	NC_022234	CGG	2	6	651839	651844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17070	NC_022234	ATCGA	2	10	651933	651942	40 %	20 %	20 %	20 %	538344813
17071	NC_022234	CAT	2	6	651980	651985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344813
17072	NC_022234	GGC	2	6	652092	652097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17073	NC_022234	CGC	2	6	652153	652158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344813
17074	NC_022234	CCG	2	6	652174	652179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344813
17075	NC_022234	GC	4	8	652192	652199	0 %	0 %	50 %	50 %	538344813
17076	NC_022234	CTG	2	6	652206	652211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17077	NC_022234	CCA	2	6	652231	652236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344813
17078	NC_022234	TGA	2	6	652270	652275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344813
17079	NC_022234	ACA	2	6	652282	652287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344813
17080	NC_022234	CGGC	2	8	652366	652373	0 %	0 %	50 %	50 %	538344813
17081	NC_022234	CGC	2	6	652390	652395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344813
17082	NC_022234	CGA	2	6	652403	652408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17083	NC_022234	TGA	2	6	652426	652431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344813
17084	NC_022234	TCG	2	6	652444	652449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17085	NC_022234	GTCG	2	8	652469	652476	0 %	25 %	50 %	25 %	538344813
17086	NC_022234	GCC	2	6	652495	652500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344813
17087	NC_022234	TGG	2	6	652522	652527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344813
17088	NC_022234	AGG	2	6	652528	652533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344813
17089	NC_022234	CTG	2	6	652542	652547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17090	NC_022234	GAG	2	6	652566	652571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344813
17091	NC_022234	GCT	2	6	652598	652603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17092	NC_022234	CGG	2	6	652622	652627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344813
17093	NC_022234	GAA	2	6	652646	652651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344813
17094	NC_022234	CTG	2	6	652677	652682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17095	NC_022234	CGC	2	6	652684	652689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344813
17096	NC_022234	TGC	2	6	652696	652701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
17097	NC_022234	CCTTGC	2	12	652726	652737	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538344813
17098	NC_022234	CGA	2	6	652768	652773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17099	NC_022234	CGG	2	6	652783	652788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344814
17100	NC_022234	GGCCG	2	10	652804	652813	0 %	0 %	60 %	40 %	538344814
17101	NC_022234	GCG	2	6	652820	652825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344814
17102	NC_022234	GCG	2	6	652857	652862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344814
17103	NC_022234	G	6	6	652915	652920	0 %	0 %	100 %	0 %	538344814
17104	NC_022234	TGC	2	6	652935	652940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17105	NC_022234	GCG	2	6	652944	652949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344814
17106	NC_022234	TGC	2	6	652953	652958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17107	NC_022234	TGG	2	6	652989	652994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344814
17108	NC_022234	GC	3	6	653187	653192	0 %	0 %	50 %	50 %	538344814
17109	NC_022234	CGG	2	6	653205	653210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344814
17110	NC_022234	TCG	2	6	653213	653218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17111	NC_022234	GGGC	2	8	653235	653242	0 %	0 %	75 %	25 %	538344814
17112	NC_022234	CTG	2	6	653255	653260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17113	NC_022234	GCC	2	6	653276	653281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344814
17114	NC_022234	GC	3	6	653307	653312	0 %	0 %	50 %	50 %	538344814
17115	NC_022234	GCGCA	2	10	653314	653323	20 %	0 %	40 %	40 %	538344814
17116	NC_022234	GAGGTG	2	12	653369	653380	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	538344814
17117	NC_022234	GGGC	2	8	653392	653399	0 %	0 %	75 %	25 %	538344814
17118	NC_022234	GCA	2	6	653449	653454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17119	NC_022234	GC	3	6	653522	653527	0 %	0 %	50 %	50 %	538344814
17120	NC_022234	GCC	2	6	653574	653579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344814
17121	NC_022234	TGC	2	6	653580	653585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17122	NC_022234	AGA	2	6	653619	653624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344814
17123	NC_022234	CCG	2	6	653626	653631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344814
17124	NC_022234	TGCG	2	8	653721	653728	0 %	25 %	50 %	25 %	538344814
17125	NC_022234	TGC	2	6	653751	653756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
17126	NC_022234	GC	3	6	653759	653764	0 %	0 %	50 %	50 %	538344814
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17128	NC_022234	TGC	2	6	653844	653849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
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17131	NC_022234	CGCA	2	8	653963	653970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17132	NC_022234	GCG	2	6	653984	653989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17133	NC_022234	CCG	2	6	654023	654028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17134	NC_022234	ATC	2	6	654054	654059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17140	NC_022234	CG	3	6	654315	654320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17141	NC_022234	AGG	2	6	654333	654338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17149	NC_022234	GCC	2	6	654531	654536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344816
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17350	NC_022234	CA	3	6	661315	661320	50 %	0 %	0 %	50 %	538344824
17351	NC_022234	GCG	2	6	661322	661327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344824
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17357	NC_022234	GTT	2	6	661533	661538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17358	NC_022234	CG	3	6	661563	661568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17359	NC_022234	GCA	2	6	661573	661578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17360	NC_022234	GCA	2	6	661743	661748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17361	NC_022234	GGC	2	6	661800	661805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17362	NC_022234	CATC	2	8	661807	661814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17363	NC_022234	CGGCGT	2	12	661858	661869	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344825
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17433	NC_022234	GGCG	2	8	665258	665265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17434	NC_022234	GCTG	2	8	665311	665318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17435	NC_022234	GCA	2	6	665364	665369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17463	NC_022234	TTC	2	6	666485	666490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17464	NC_022234	CAA	2	6	666607	666612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17465	NC_022234	CGG	2	6	666640	666645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17466	NC_022234	CA	3	6	666682	666687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17467	NC_022234	TCGC	2	8	666688	666695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17468	NC_022234	CGGGG	2	10	666767	666776	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17469	NC_022234	CTG	2	6	666793	666798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17471	NC_022234	GAG	2	6	666853	666858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17472	NC_022234	ATC	2	6	666877	666882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17473	NC_022234	CAG	2	6	666886	666891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17474	NC_022234	CGC	2	6	666956	666961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17475	NC_022234	AC	3	6	666984	666989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17476	NC_022234	CCA	2	6	667001	667006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17477	NC_022234	GGGAC	2	10	667167	667176	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17478	NC_022234	CTG	2	6	667189	667194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17482	NC_022234	CTC	2	6	667447	667452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17483	NC_022234	CTGG	2	8	667473	667480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17484	NC_022234	GCAAG	2	10	667485	667494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17485	NC_022234	GAC	2	6	667495	667500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17486	NC_022234	CGC	2	6	667522	667527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17487	NC_022234	CTT	2	6	667538	667543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17488	NC_022234	CTG	2	6	667551	667556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17489	NC_022234	CGG	2	6	667564	667569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17490	NC_022234	GGC	2	6	667668	667673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17491	NC_022234	TGG	2	6	667711	667716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17492	NC_022234	AGA	2	6	667721	667726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17493	NC_022234	GCCGA	2	10	667788	667797	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17494	NC_022234	TTG	2	6	667883	667888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344835
17495	NC_022234	CAC	2	6	667895	667900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344835
17496	NC_022234	AGC	2	6	667902	667907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344835
17497	NC_022234	CCTTG	2	10	668211	668220	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17498	NC_022234	ATC	2	6	668297	668302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344836
17499	NC_022234	TTC	2	6	668303	668308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344836
17500	NC_022234	CGC	2	6	668346	668351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344836

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