MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022234	GCG	2	6	631699	631704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344803
16502	NC_022234	GCG	2	6	631725	631730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344803
16503	NC_022234	CAG	2	6	631742	631747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344803
16504	NC_022234	GCA	2	6	631792	631797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344803
16505	NC_022234	GGC	2	6	631798	631803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344803
16506	NC_022234	TCT	2	6	631818	631823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344803
16507	NC_022234	GTC	2	6	631833	631838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344803
16508	NC_022234	CG	3	6	631863	631868	0 %	0 %	50 %	50 %	538344804
16509	NC_022234	ACC	3	9	631925	631933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344804
16510	NC_022234	CGA	2	6	631944	631949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344804
16511	NC_022234	GAT	2	6	631981	631986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344804
16512	NC_022234	GC	3	6	632046	632051	0 %	0 %	50 %	50 %	538344804
16513	NC_022234	CCA	2	6	632064	632069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344804
16514	NC_022234	CAC	2	6	632113	632118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344804
16515	NC_022234	GC	3	6	632119	632124	0 %	0 %	50 %	50 %	538344804
16516	NC_022234	GC	4	8	632141	632148	0 %	0 %	50 %	50 %	538344804
16517	NC_022234	CGTG	2	8	632178	632185	0 %	25 %	50 %	25 %	538344804
16518	NC_022234	GCA	3	9	632244	632252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344804
16519	NC_022234	CG	3	6	632304	632309	0 %	0 %	50 %	50 %	538344804
16520	NC_022234	CGCC	2	8	632318	632325	0 %	0 %	25 %	75 %	538344804
16521	NC_022234	ACG	2	6	632357	632362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344804
16522	NC_022234	ATG	2	6	632420	632425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344804
16523	NC_022234	GGCC	2	8	632454	632461	0 %	0 %	50 %	50 %	538344804
16524	NC_022234	GCAGCG	2	12	632628	632639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344804
16525	NC_022234	GC	3	6	632672	632677	0 %	0 %	50 %	50 %	538344804
16526	NC_022234	CGG	2	6	632712	632717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344804
16527	NC_022234	CAG	2	6	632764	632769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344804
16528	NC_022234	GGC	2	6	632790	632795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344804
16529	NC_022234	CGT	2	6	632823	632828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16530	NC_022234	GTGC	2	8	632858	632865	0 %	25 %	50 %	25 %	538344805
16531	NC_022234	GC	3	6	632911	632916	0 %	0 %	50 %	50 %	538344805
16532	NC_022234	GTG	2	6	633052	633057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344805
16533	NC_022234	CGG	2	6	633108	633113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344805
16534	NC_022234	CCG	2	6	633133	633138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344805
16535	NC_022234	CGT	3	9	633209	633217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344805
16536	NC_022234	GCCGT	2	10	633220	633229	0 %	20 %	40 %	40 %	538344805
16537	NC_022234	GTC	2	6	633237	633242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344805
16538	NC_022234	GCA	2	6	633312	633317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344805
16539	NC_022234	GCG	2	6	633359	633364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344805
16540	NC_022234	GCG	2	6	633383	633388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344805
16541	NC_022234	GC	3	6	633396	633401	0 %	0 %	50 %	50 %	538344805
16542	NC_022234	CAGG	2	8	633432	633439	25 %	0 %	50 %	25 %	538344805
16543	NC_022234	GTT	2	6	633462	633467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344805
16544	NC_022234	CG	5	10	633494	633503	0 %	0 %	50 %	50 %	538344805
16545	NC_022234	CG	3	6	633518	633523	0 %	0 %	50 %	50 %	538344805
16546	NC_022234	GCG	2	6	633539	633544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344805
16547	NC_022234	CGGCG	2	10	633549	633558	0 %	0 %	60 %	40 %	538344805
16548	NC_022234	GGC	2	6	633596	633601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344805
16549	NC_022234	CGA	2	6	633632	633637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344805
16550	NC_022234	GC	3	6	633649	633654	0 %	0 %	50 %	50 %	538344805
16551	NC_022234	GCA	3	9	633725	633733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344805
16552	NC_022234	GC	3	6	633758	633763	0 %	0 %	50 %	50 %	538344805
16553	NC_022234	GCA	2	6	633791	633796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344805
16554	NC_022234	GGT	2	6	633842	633847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344805
16555	NC_022234	TCC	2	6	633897	633902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344806
16556	NC_022234	CTG	2	6	633917	633922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16557	NC_022234	TCG	2	6	633936	633941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16558	NC_022234	CG	3	6	633943	633948	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16559	NC_022234	TGG	2	6	633990	633995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344806
16560	NC_022234	CTT	2	6	634019	634024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344806
16561	NC_022234	AGCGCG	2	12	634026	634037	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344806
16562	NC_022234	GCA	2	6	634048	634053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16563	NC_022234	CGT	2	6	634069	634074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16564	NC_022234	CAG	2	6	634097	634102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16565	NC_022234	GCT	2	6	634127	634132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16566	NC_022234	GC	3	6	634189	634194	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16567	NC_022234	CTT	2	6	634247	634252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344806
16568	NC_022234	GCC	2	6	634307	634312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344806
16569	NC_022234	CGG	2	6	634399	634404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344806
16570	NC_022234	GCC	2	6	634487	634492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344806
16571	NC_022234	CGAT	2	8	634554	634561	25 %	25 %	25 %	25 %	538344806
16572	NC_022234	AGC	2	6	634782	634787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16573	NC_022234	GC	3	6	634796	634801	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16574	NC_022234	CGGC	2	8	634807	634814	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16575	NC_022234	GC	3	6	634818	634823	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16576	NC_022234	GTC	2	6	634955	634960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16577	NC_022234	GCA	2	6	635020	635025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16578	NC_022234	GCG	2	6	635026	635031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344806
16579	NC_022234	GTC	2	6	635043	635048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16580	NC_022234	ACC	2	6	635070	635075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344806
16581	NC_022234	CGAA	2	8	635107	635114	50 %	0 %	25 %	25 %	538344806
16582	NC_022234	CGAG	2	8	635146	635153	25 %	0 %	50 %	25 %	538344806
16583	NC_022234	CGT	2	6	635185	635190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16584	NC_022234	GGT	2	6	635225	635230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344806
16585	NC_022234	CG	3	6	635240	635245	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16586	NC_022234	GCATCG	2	12	635277	635288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16587	NC_022234	CGA	2	6	635293	635298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16588	NC_022234	CAC	2	6	635318	635323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344806
16589	NC_022234	GTT	2	6	635339	635344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344806
16590	NC_022234	CGAC	2	8	635359	635366	25 %	0 %	25 %	50 %	538344806
16591	NC_022234	TGC	2	6	635374	635379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16592	NC_022234	GC	3	6	635434	635439	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16593	NC_022234	CAG	2	6	635444	635449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344806
16594	NC_022234	CG	3	6	635450	635455	0 %	0 %	50 %	50 %	538344806
16595	NC_022234	GGTC	2	8	635468	635475	0 %	25 %	50 %	25 %	538344806
16596	NC_022234	AC	3	6	635549	635554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16597	NC_022234	GCG	2	6	635613	635618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16598	NC_022234	CTT	2	6	635655	635660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344807
16599	NC_022234	GGCC	2	8	635690	635697	0 %	0 %	50 %	50 %	538344807
16600	NC_022234	GA	3	6	635728	635733	50 %	0 %	50 %	0 %	538344807
16601	NC_022234	TGG	2	6	635750	635755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344807
16602	NC_022234	GGT	2	6	635813	635818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344807
16603	NC_022234	GCC	2	6	635819	635824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344807
16604	NC_022234	CTG	2	6	635832	635837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344807
16605	NC_022234	GGA	2	6	635891	635896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344807
16606	NC_022234	GTGGCG	2	12	635913	635924	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	538344807
16607	NC_022234	GAC	2	6	635952	635957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344807
16608	NC_022234	GGGCCC	2	12	635961	635972	0 %	0 %	50 %	50 %	538344807
16609	NC_022234	GCT	2	6	636038	636043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344807
16610	NC_022234	GCC	2	6	636103	636108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344807
16611	NC_022234	GGC	2	6	636143	636148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344807
16612	NC_022234	AGGCG	2	10	636155	636164	20 %	0 %	60 %	20 %	538344807
16613	NC_022234	CGA	2	6	636227	636232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344807
16614	NC_022234	CGC	2	6	636273	636278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344807
16615	NC_022234	CGC	2	6	636301	636306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344807
16616	NC_022234	GCT	2	6	636311	636316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344807
16617	NC_022234	CG	4	8	636338	636345	0 %	0 %	50 %	50 %	538344807
16618	NC_022234	CGG	2	6	636356	636361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344807
16619	NC_022234	CG	4	8	636362	636369	0 %	0 %	50 %	50 %	538344807
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16621	NC_022234	CGAG	2	8	636451	636458	25 %	0 %	50 %	25 %	538344807
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16863	NC_022234	TTGGCG	2	12	644518	644529	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538344808
16864	NC_022234	CG	3	6	644571	644576	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
16865	NC_022234	GCC	2	6	644622	644627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
16866	NC_022234	GTC	2	6	644634	644639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
16867	NC_022234	CGTGGT	2	12	644655	644666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538344808
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16872	NC_022234	CGT	2	6	644862	644867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
16873	NC_022234	CGT	2	6	644879	644884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
16874	NC_022234	CGGG	2	8	644902	644909	0 %	0 %	75 %	25 %	538344808
16875	NC_022234	GTC	2	6	644994	644999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
16876	NC_022234	CTG	2	6	645027	645032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
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16878	NC_022234	CG	4	8	645137	645144	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
16879	NC_022234	GGT	2	6	645207	645212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344808
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16881	NC_022234	CTCGGC	2	12	645276	645287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344808
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16916	NC_022234	GCT	2	6	646293	646298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16918	NC_022234	CGGCC	2	10	646358	646367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16919	NC_022234	CG	3	6	646379	646384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16920	NC_022234	CAA	2	6	646413	646418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16921	NC_022234	GC	3	6	646438	646443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16922	NC_022234	TGCC	2	8	646472	646479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16923	NC_022234	GAA	2	6	646486	646491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16924	NC_022234	GCC	2	6	646498	646503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16925	NC_022234	AGC	2	6	646574	646579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344809
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16973	NC_022234	GC	3	6	648314	648319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16974	NC_022234	CTT	2	6	648363	648368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16975	NC_022234	CA	3	6	648468	648473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16976	NC_022234	CGG	2	6	648474	648479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16977	NC_022234	ATGG	2	8	648509	648516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16978	NC_022234	CGTCG	2	10	648531	648540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16979	NC_022234	CGAC	2	8	648553	648560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16980	NC_022234	GCGAT	2	10	648567	648576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16981	NC_022234	GGC	2	6	648662	648667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
16982	NC_022234	CTG	2	6	648677	648682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16983	NC_022234	CTG	2	6	648707	648712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16984	NC_022234	CTG	2	6	648722	648727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16985	NC_022234	GTG	2	6	648728	648733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344811
16986	NC_022234	TCG	2	6	648735	648740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16987	NC_022234	TGC	2	6	648750	648755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16988	NC_022234	GCT	2	6	648769	648774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16989	NC_022234	CTG	2	6	648779	648784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16990	NC_022234	TGC	2	6	648813	648818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16991	NC_022234	CTGTCG	2	12	648848	648859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16992	NC_022234	GCT	3	9	648871	648879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16993	NC_022234	CAC	2	6	648883	648888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344811
16994	NC_022234	CATCG	2	10	648910	648919	20 %	20 %	20 %	40 %	538344811
16995	NC_022234	CTG	2	6	648932	648937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16996	NC_022234	CAT	2	6	648955	648960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344811
16997	NC_022234	TCG	2	6	648981	648986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
16998	NC_022234	CAA	2	6	648988	648993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344811
16999	NC_022234	GTG	2	6	648995	649000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344811
17000	NC_022234	CGG	2	6	649003	649008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811

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