MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022234	GAC	2	6	532533	532538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14002	NC_022234	GAT	2	6	532539	532544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344712
14003	NC_022234	TCG	2	6	532550	532555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14004	NC_022234	CCA	2	6	532571	532576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344712
14005	NC_022234	TGC	2	6	532586	532591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14006	NC_022234	CGG	2	6	532721	532726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344712
14007	NC_022234	GAG	2	6	532735	532740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344712
14008	NC_022234	GGC	2	6	532810	532815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344712
14009	NC_022234	CG	3	6	532836	532841	0 %	0 %	50 %	50 %	538344712
14010	NC_022234	CTG	2	6	532867	532872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14011	NC_022234	GC	3	6	532889	532894	0 %	0 %	50 %	50 %	538344712
14012	NC_022234	CTG	3	9	532927	532935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14013	NC_022234	TGC	2	6	532940	532945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14014	NC_022234	GGA	2	6	532986	532991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344712
14015	NC_022234	GTC	2	6	533004	533009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14016	NC_022234	TCG	2	6	533015	533020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14017	NC_022234	CGGC	2	8	533032	533039	0 %	0 %	50 %	50 %	538344712
14018	NC_022234	GC	3	6	533038	533043	0 %	0 %	50 %	50 %	538344712
14019	NC_022234	CG	4	8	533078	533085	0 %	0 %	50 %	50 %	538344712
14020	NC_022234	GC	3	6	533121	533126	0 %	0 %	50 %	50 %	538344712
14021	NC_022234	CGC	2	6	533157	533162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344712
14022	NC_022234	GCC	2	6	533196	533201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344712
14023	NC_022234	CGC	2	6	533213	533218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_022234	CAC	2	6	533222	533227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_022234	AC	3	6	533241	533246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14026	NC_022234	GCC	2	6	533278	533283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344713
14027	NC_022234	CGG	2	6	533301	533306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344713
14028	NC_022234	CAAGGT	2	12	533334	533345	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538344713
14029	NC_022234	GCG	2	6	533399	533404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344713
14030	NC_022234	GAT	2	6	533433	533438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344713
14031	NC_022234	CAC	2	6	533445	533450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344713
14032	NC_022234	CGG	2	6	533478	533483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344713
14033	NC_022234	GC	3	6	533530	533535	0 %	0 %	50 %	50 %	538344713
14034	NC_022234	TGA	2	6	533555	533560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344713
14035	NC_022234	ACA	2	6	533561	533566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344713
14036	NC_022234	CCA	3	9	533648	533656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344713
14037	NC_022234	CAC	2	6	533661	533666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344713
14038	NC_022234	CG	3	6	533686	533691	0 %	0 %	50 %	50 %	538344713
14039	NC_022234	CGG	2	6	533786	533791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344713
14040	NC_022234	GC	4	8	533840	533847	0 %	0 %	50 %	50 %	538344713
14041	NC_022234	CTT	2	6	533868	533873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344713
14042	NC_022234	GCC	2	6	533881	533886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344713
14043	NC_022234	GGC	2	6	533893	533898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344713
14044	NC_022234	CG	3	6	533904	533909	0 %	0 %	50 %	50 %	538344713
14045	NC_022234	ACT	2	6	533915	533920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344713
14046	NC_022234	CG	3	6	533932	533937	0 %	0 %	50 %	50 %	538344713
14047	NC_022234	TCA	2	6	533939	533944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344713
14048	NC_022234	CGC	2	6	533955	533960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344713
14049	NC_022234	ACG	2	6	533975	533980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344713
14050	NC_022234	CGG	2	6	534002	534007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344713
14051	NC_022234	TGC	2	6	534014	534019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344713
14052	NC_022234	AGA	2	6	534020	534025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344713
14053	NC_022234	AGG	2	6	534035	534040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344713
14054	NC_022234	TAC	2	6	534082	534087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344713
14055	NC_022234	GCA	2	6	534141	534146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344713
14056	NC_022234	CTT	2	6	534156	534161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344713
14057	NC_022234	CGCCAA	2	12	534165	534176	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538344713
14058	NC_022234	CGG	2	6	534247	534252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
14059	NC_022234	CGG	2	6	534257	534262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
14060	NC_022234	CAT	2	6	534272	534277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344714
14061	NC_022234	GC	3	6	534330	534335	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14062	NC_022234	GGCG	2	8	534356	534363	0 %	0 %	75 %	25 %	538344714
14063	NC_022234	GCG	2	6	534370	534375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
14064	NC_022234	AGG	2	6	534457	534462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344714
14065	NC_022234	CG	3	6	534490	534495	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14066	NC_022234	GGC	2	6	534507	534512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
14067	NC_022234	CGA	2	6	534563	534568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344714
14068	NC_022234	GCC	2	6	534573	534578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
14069	NC_022234	TGC	2	6	534613	534618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
14070	NC_022234	AAG	2	6	534627	534632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344714
14071	NC_022234	GCG	2	6	534649	534654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
14072	NC_022234	GGCG	2	8	534737	534744	0 %	0 %	75 %	25 %	538344714
14073	NC_022234	GGCC	2	8	534749	534756	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14074	NC_022234	GC	4	8	534781	534788	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14075	NC_022234	CG	3	6	534913	534918	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14076	NC_022234	CG	3	6	534936	534941	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14077	NC_022234	CG	3	6	534984	534989	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14078	NC_022234	TGC	2	6	535000	535005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
14079	NC_022234	GC	3	6	535015	535020	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14080	NC_022234	CGC	2	6	535027	535032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
14081	NC_022234	GCT	2	6	535034	535039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
14082	NC_022234	CGGC	2	8	535060	535067	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14083	NC_022234	CTG	2	6	535068	535073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
14084	NC_022234	GAA	2	6	535163	535168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344714
14085	NC_022234	GCC	2	6	535212	535217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
14086	NC_022234	CGG	2	6	535277	535282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
14087	NC_022234	GGCC	2	8	535311	535318	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14088	NC_022234	TCGGCC	2	12	535392	535403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344714
14089	NC_022234	GCCG	2	8	535411	535418	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14090	NC_022234	CG	3	6	535423	535428	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14091	NC_022234	CGC	2	6	535465	535470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
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14094	NC_022234	TGC	2	6	535534	535539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
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14099	NC_022234	CG	3	6	535697	535702	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
14100	NC_022234	GGT	2	6	535706	535711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344714
14101	NC_022234	TGCGCG	2	12	535723	535734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344714
14102	NC_022234	CGC	2	6	535760	535765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
14103	NC_022234	GCC	2	6	535800	535805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
14104	NC_022234	GCG	2	6	535830	535835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
14105	NC_022234	TTC	2	6	535900	535905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_022234	TGC	2	6	535935	535940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344715
14107	NC_022234	ACCG	2	8	536002	536009	25 %	0 %	25 %	50 %	538344715
14108	NC_022234	CGC	2	6	536011	536016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
14109	NC_022234	CGG	2	6	536038	536043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
14110	NC_022234	CATT	2	8	536046	536053	25 %	50 %	0 %	25 %	538344715
14111	NC_022234	ACG	2	6	536060	536065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344715
14112	NC_022234	GGC	2	6	536100	536105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
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14115	NC_022234	CGGC	2	8	536273	536280	0 %	0 %	50 %	50 %	538344715
14116	NC_022234	GCC	2	6	536281	536286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
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14118	NC_022234	CGG	2	6	536319	536324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
14119	NC_022234	GC	3	6	536329	536334	0 %	0 %	50 %	50 %	538344715
14120	NC_022234	CGC	2	6	536374	536379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
14121	NC_022234	GTC	2	6	536401	536406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344715
14122	NC_022234	CGT	2	6	536488	536493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344715
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14135	NC_022234	ATGA	2	8	536983	536990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14136	NC_022234	GTC	2	6	537014	537019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14170	NC_022234	CGC	3	9	538950	538958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344718
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14183	NC_022234	TGT	2	6	539487	539492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14224	NC_022234	CG	3	6	540940	540945	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14225	NC_022234	TCG	2	6	541003	541008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
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14229	NC_022234	CGC	2	6	541100	541105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
14230	NC_022234	CAT	2	6	541122	541127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344722
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14232	NC_022234	GC	3	6	541226	541231	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14233	NC_022234	GGT	2	6	541244	541249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344722
14234	NC_022234	CAGC	2	8	541284	541291	25 %	0 %	25 %	50 %	538344722
14235	NC_022234	CGT	2	6	541362	541367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
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14238	NC_022234	ACG	2	6	541489	541494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344722
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14240	NC_022234	CCGTCG	2	12	541561	541572	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344722
14241	NC_022234	CGG	2	6	541592	541597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
14242	NC_022234	GC	3	6	541601	541606	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14243	NC_022234	CG	3	6	541609	541614	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14244	NC_022234	GCTC	2	8	541615	541622	0 %	25 %	25 %	50 %	538344722
14245	NC_022234	TTGA	2	8	541634	541641	25 %	50 %	25 %	0 %	538344722
14246	NC_022234	GCG	2	6	541646	541651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
14247	NC_022234	GGC	2	6	541657	541662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
14248	NC_022234	TCC	2	6	541693	541698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344722
14249	NC_022234	CG	3	6	541707	541712	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14250	NC_022234	GGCC	2	8	541766	541773	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14251	NC_022234	CA	3	6	541850	541855	50 %	0 %	0 %	50 %	538344722
14252	NC_022234	CCG	2	6	541856	541861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
14253	NC_022234	GC	3	6	541874	541879	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14254	NC_022234	CCG	2	6	541912	541917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
14255	NC_022234	GC	3	6	541932	541937	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
14256	NC_022234	GCGCT	2	10	541951	541960	0 %	20 %	40 %	40 %	538344722
14257	NC_022234	CGC	2	6	541999	542004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
14258	NC_022234	CGG	2	6	542022	542027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
14259	NC_022234	GCC	3	9	542053	542061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344723
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14262	NC_022234	CAG	2	6	542241	542246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344723
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14271	NC_022234	TCGA	2	8	542557	542564	25 %	25 %	25 %	25 %	538344723
14272	NC_022234	GAA	2	6	542607	542612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344723
14273	NC_022234	CCG	2	6	542615	542620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344723
14274	NC_022234	CCA	2	6	542621	542626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344723
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14332	NC_022234	CGC	2	6	545316	545321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344726
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14340	NC_022234	CGC	2	6	545575	545580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344726
14341	NC_022234	CGA	2	6	545593	545598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
14342	NC_022234	GATC	2	8	545614	545621	25 %	25 %	25 %	25 %	538344726
14343	NC_022234	GCA	2	6	545641	545646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
14344	NC_022234	GCCA	2	8	545670	545677	25 %	0 %	25 %	50 %	538344726
14345	NC_022234	CG	3	6	545734	545739	0 %	0 %	50 %	50 %	538344726
14346	NC_022234	GAA	2	6	545762	545767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344726
14347	NC_022234	CCA	2	6	545797	545802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344726
14348	NC_022234	ACC	2	6	545820	545825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344726
14349	NC_022234	GCA	3	9	545881	545889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
14350	NC_022234	GCG	2	6	545914	545919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344726
14351	NC_022234	GCT	2	6	545930	545935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344726
14352	NC_022234	CAG	2	6	545945	545950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
14353	NC_022234	TC	3	6	546008	546013	0 %	50 %	0 %	50 %	538344726
14354	NC_022234	AAGA	2	8	546044	546051	75 %	0 %	25 %	0 %	538344726
14355	NC_022234	GAA	2	6	546062	546067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344726
14356	NC_022234	TCGA	2	8	546186	546193	25 %	25 %	25 %	25 %	538344726
14357	NC_022234	CAG	2	6	546203	546208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
14358	NC_022234	CCG	2	6	546229	546234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344726
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14360	NC_022234	GCC	2	6	546284	546289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344726
14361	NC_022234	CCA	3	9	546290	546298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344726
14362	NC_022234	CAG	2	6	546311	546316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
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14367	NC_022234	GC	3	6	546513	546518	0 %	0 %	50 %	50 %	538344726
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14464	NC_022234	CGC	2	6	551254	551259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344730
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14466	NC_022234	CCAC	2	8	551326	551333	25 %	0 %	0 %	75 %	538344730
14467	NC_022234	TCG	2	6	551343	551348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344730
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14480	NC_022234	GAA	2	6	551915	551920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344731
14481	NC_022234	GC	3	6	551956	551961	0 %	0 %	50 %	50 %	538344731
14482	NC_022234	CAG	2	6	552010	552015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344731
14483	NC_022234	CCTGG	2	10	552040	552049	0 %	20 %	40 %	40 %	538344731
14484	NC_022234	AGC	2	6	552107	552112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344731
14485	NC_022234	GC	3	6	552111	552116	0 %	0 %	50 %	50 %	538344731
14486	NC_022234	GCG	2	6	552165	552170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344731
14487	NC_022234	TGC	2	6	552183	552188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344731
14488	NC_022234	AGCCCG	2	12	552206	552217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344731
14489	NC_022234	GCC	2	6	552222	552227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344731
14490	NC_022234	CGG	2	6	552249	552254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344731
14491	NC_022234	ATG	2	6	552320	552325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344731
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14500	NC_022234	TG	3	6	552559	552564	0 %	50 %	50 %	0 %	538344731

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