MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022234	CCCG	2	8	512593	512600	0 %	0 %	25 %	75 %	538344698
13502	NC_022234	GTA	2	6	512614	512619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344698
13503	NC_022234	TTG	2	6	512627	512632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13504	NC_022234	GTG	2	6	512642	512647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13505	NC_022234	TCGA	2	8	512657	512664	25 %	25 %	25 %	25 %	538344698
13506	NC_022234	TGGT	2	8	512666	512673	0 %	50 %	50 %	0 %	538344698
13507	NC_022234	CGC	2	6	512728	512733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13508	NC_022234	ACCGA	2	10	512762	512771	40 %	0 %	20 %	40 %	538344698
13509	NC_022234	GTG	2	6	512792	512797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13510	NC_022234	GTG	2	6	512858	512863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13511	NC_022234	CGT	2	6	512883	512888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13512	NC_022234	TGG	2	6	512895	512900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13513	NC_022234	TTG	2	6	512996	513001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13514	NC_022234	GTT	2	6	513016	513021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13515	NC_022234	CCG	2	6	513045	513050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13516	NC_022234	CTG	2	6	513055	513060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13517	NC_022234	TGG	2	6	513063	513068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13518	NC_022234	CGC	2	6	513121	513126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13519	NC_022234	CACCG	2	10	513154	513163	20 %	0 %	20 %	60 %	538344698
13520	NC_022234	GTG	2	6	513185	513190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13521	NC_022234	GTG	4	12	513245	513256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13522	NC_022234	CGT	2	6	513276	513281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13523	NC_022234	GTT	2	6	513286	513291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13524	NC_022234	TTG	2	6	513389	513394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13525	NC_022234	GTT	2	6	513409	513414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13526	NC_022234	TGGT	2	8	513452	513459	0 %	50 %	50 %	0 %	538344698
13527	NC_022234	CGC	2	6	513514	513519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13528	NC_022234	CACCG	2	10	513547	513556	20 %	0 %	20 %	60 %	538344698
13529	NC_022234	GTG	2	6	513578	513583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13530	NC_022234	GCC	2	6	513604	513609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13531	NC_022234	CCG	2	6	513633	513638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13532	NC_022234	GTG	2	6	513644	513649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13533	NC_022234	GTT	2	6	513679	513684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13534	NC_022234	TTG	2	6	513782	513787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13535	NC_022234	GTT	2	6	513802	513807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13536	NC_022234	TGT	2	6	513810	513815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13537	NC_022234	GGT	2	6	513823	513828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13538	NC_022234	CTG	2	6	513841	513846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13539	NC_022234	TGG	2	6	513849	513854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13540	NC_022234	GCTG	2	8	513861	513868	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
13541	NC_022234	CGC	2	6	513907	513912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13542	NC_022234	CCCAC	2	10	513938	513947	20 %	0 %	0 %	80 %	538344698
13543	NC_022234	GGT	2	6	513991	513996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13544	NC_022234	GCC	2	6	513997	514002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13545	NC_022234	TCG	2	6	514035	514040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13546	NC_022234	TTG	2	6	514073	514078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13547	NC_022234	GTCC	2	8	514108	514115	0 %	25 %	25 %	50 %	538344698
13548	NC_022234	GTT	2	6	514174	514179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13549	NC_022234	TG	3	6	514214	514219	0 %	50 %	50 %	0 %	538344698
13550	NC_022234	CTG	2	6	514234	514239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13551	NC_022234	TCG	2	6	514242	514247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13552	NC_022234	CGC	2	6	514300	514305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13553	NC_022234	CGT	2	6	514363	514368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13554	NC_022234	GGT	2	6	514384	514389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13555	NC_022234	CCG	2	6	514419	514424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13556	NC_022234	GTC	2	6	514427	514432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13557	NC_022234	GGAGCC	2	12	514435	514446	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344698
13558	NC_022234	TTG	2	6	514568	514573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13559	NC_022234	CTG	2	6	514606	514611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13560	NC_022234	TGG	2	6	514614	514619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13561	NC_022234	GCTG	2	8	514626	514633	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
13562	NC_022234	GTG	2	6	514736	514741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13563	NC_022234	GCC	2	6	514762	514767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13564	NC_022234	CCG	2	6	514791	514796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13565	NC_022234	GTG	2	6	514802	514807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13566	NC_022234	GTT	2	6	514837	514842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13567	NC_022234	GTCC	2	8	514873	514880	0 %	25 %	25 %	50 %	538344698
13568	NC_022234	GTT	2	6	514939	514944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13569	NC_022234	TGG	2	6	514968	514973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13570	NC_022234	TCG	2	6	515010	515015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13571	NC_022234	CTG	2	6	515020	515025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13572	NC_022234	TGG	2	6	515028	515033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13573	NC_022234	CCGG	2	8	515080	515087	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13574	NC_022234	CGC	2	6	515119	515124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13575	NC_022234	GTG	2	6	515150	515155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
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13579	NC_022234	CAATG	2	10	515233	515242	40 %	20 %	20 %	20 %	538344698
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13584	NC_022234	GTCG	2	8	515473	515480	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
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13589	NC_022234	GTC	2	6	515627	515632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13590	NC_022234	CGT	2	6	515655	515660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
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13592	NC_022234	CCG	2	6	515676	515681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13593	NC_022234	GC	3	6	515712	515717	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13594	NC_022234	TGC	2	6	515724	515729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
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13601	NC_022234	GC	3	6	516140	516145	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13602	NC_022234	CCG	2	6	516318	516323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13603	NC_022234	CGTG	2	8	516346	516353	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
13604	NC_022234	CGATGG	2	12	516399	516410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344698
13605	NC_022234	CGGC	2	8	516416	516423	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13606	NC_022234	CGT	2	6	516532	516537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13607	NC_022234	GTC	2	6	516586	516591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13608	NC_022234	TGCC	2	8	516606	516613	0 %	25 %	25 %	50 %	538344698
13609	NC_022234	GCC	2	6	516617	516622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13610	NC_022234	C	6	6	516725	516730	0 %	0 %	0 %	100 %	538344698
13611	NC_022234	GC	3	6	516744	516749	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13612	NC_022234	CGG	2	6	516765	516770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344698
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13615	NC_022234	GTG	2	6	517112	517117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13616	NC_022234	CTG	2	6	517179	517184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13617	NC_022234	GC	3	6	517230	517235	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13618	NC_022234	CGATGG	2	12	517254	517265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344698
13619	NC_022234	GC	3	6	517320	517325	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13620	NC_022234	TGC	2	6	517338	517343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13621	NC_022234	GC	4	8	517342	517349	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13622	NC_022234	CTG	2	6	517371	517376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13623	NC_022234	CGC	2	6	517446	517451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13624	NC_022234	GGT	2	6	517453	517458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13625	NC_022234	GAG	2	6	517505	517510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344698
13626	NC_022234	GCCGT	2	10	517529	517538	0 %	20 %	40 %	40 %	538344698
13627	NC_022234	CGCCTG	2	12	517573	517584	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344698
13628	NC_022234	GCCG	2	8	517612	517619	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13629	NC_022234	GGT	2	6	517666	517671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13630	NC_022234	TGC	2	6	517713	517718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
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13632	NC_022234	GCG	2	6	517890	517895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13633	NC_022234	TTA	2	6	517969	517974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13634	NC_022234	AT	3	6	518014	518019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13635	NC_022234	TTG	2	6	518032	518037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13636	NC_022234	ATT	2	6	518051	518056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13637	NC_022234	GTA	2	6	518112	518117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13640	NC_022234	GCT	2	6	518346	518351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344699
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13649	NC_022234	GCT	2	6	518695	518700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344700
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13651	NC_022234	TGG	2	6	518770	518775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344700
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13656	NC_022234	GAG	2	6	518954	518959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13657	NC_022234	CCGT	2	8	519017	519024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13658	NC_022234	TTC	2	6	519040	519045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13659	NC_022234	AGA	2	6	519232	519237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344701
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13707	NC_022234	GGGC	2	8	521155	521162	0 %	0 %	75 %	25 %	538344701
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13715	NC_022234	GGA	2	6	521529	521534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13716	NC_022234	GAC	2	6	521540	521545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344702
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13718	NC_022234	CAA	2	6	521723	521728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344702
13719	NC_022234	CATC	2	8	521765	521772	25 %	25 %	0 %	50 %	538344702
13720	NC_022234	GGC	2	6	521810	521815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344702
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13722	NC_022234	GCA	2	6	521892	521897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13723	NC_022234	GCA	2	6	521949	521954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13724	NC_022234	GCC	2	6	521969	521974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13725	NC_022234	GCC	2	6	521977	521982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13726	NC_022234	TGCCA	2	10	522007	522016	20 %	20 %	20 %	40 %	538344703
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13728	NC_022234	TCGC	2	8	522098	522105	0 %	25 %	25 %	50 %	538344703
13729	NC_022234	CTG	2	6	522113	522118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344703
13730	NC_022234	GGCG	2	8	522124	522131	0 %	0 %	75 %	25 %	538344703
13731	NC_022234	GCA	2	6	522147	522152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344703
13732	NC_022234	GCA	2	6	522162	522167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344703
13733	NC_022234	GCA	2	6	522202	522207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344703
13734	NC_022234	CGG	2	6	522274	522279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344703
13735	NC_022234	CGG	3	9	522327	522335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344703
13736	NC_022234	TCA	2	6	522339	522344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344703
13737	NC_022234	CGC	2	6	522346	522351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344703
13738	NC_022234	ATG	2	6	522380	522385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344703
13739	NC_022234	CG	3	6	522409	522414	0 %	0 %	50 %	50 %	538344703
13740	NC_022234	ATC	2	6	522419	522424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344703
13741	NC_022234	CAA	2	6	522427	522432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344703
13742	NC_022234	CTG	2	6	522464	522469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344703
13743	NC_022234	TGCC	2	8	522500	522507	0 %	25 %	25 %	50 %	538344703
13744	NC_022234	CCTG	2	8	522514	522521	0 %	25 %	25 %	50 %	538344703
13745	NC_022234	GGCA	2	8	522530	522537	25 %	0 %	50 %	25 %	538344703
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13748	NC_022234	GCG	2	6	522593	522598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344703
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13750	NC_022234	TGG	2	6	522609	522614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344703
13751	NC_022234	GGT	2	6	522619	522624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344703
13752	NC_022234	TCG	2	6	522642	522647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344703
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13760	NC_022234	TCG	2	6	522837	522842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344703
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13762	NC_022234	AGGCC	2	10	522870	522879	20 %	0 %	40 %	40 %	538344703
13763	NC_022234	CG	3	6	522978	522983	0 %	0 %	50 %	50 %	538344703
13764	NC_022234	CAGC	2	8	522985	522992	25 %	0 %	25 %	50 %	538344703
13765	NC_022234	GAG	2	6	523112	523117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344703
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13786	NC_022234	CGG	2	6	523906	523911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344703
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13792	NC_022234	AGCG	2	8	524115	524122	25 %	0 %	50 %	25 %	538344704
13793	NC_022234	CGA	2	6	524215	524220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344704
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13796	NC_022234	CGT	2	6	524283	524288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344704
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13801	NC_022234	GC	3	6	524699	524704	0 %	0 %	50 %	50 %	538344704
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13823	NC_022234	GCA	2	6	525601	525606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344704
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13855	NC_022234	GC	3	6	527013	527018	0 %	0 %	50 %	50 %	538344705
13856	NC_022234	CAG	3	9	527029	527037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344705
13857	NC_022234	CGA	2	6	527067	527072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344705
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13981	NC_022234	TCG	2	6	531739	531744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344711
13982	NC_022234	CG	3	6	531751	531756	0 %	0 %	50 %	50 %	538344711
13983	NC_022234	TCA	2	6	531889	531894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344711
13984	NC_022234	CTT	2	6	531896	531901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344711
13985	NC_022234	CG	3	6	531903	531908	0 %	0 %	50 %	50 %	538344711
13986	NC_022234	GCC	2	6	531911	531916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344711
13987	NC_022234	CGT	2	6	531991	531996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344711
13988	NC_022234	GC	3	6	532062	532067	0 %	0 %	50 %	50 %	538344711
13989	NC_022234	CGG	2	6	532138	532143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344711
13990	NC_022234	GGCGT	2	10	532158	532167	0 %	20 %	60 %	20 %	538344711
13991	NC_022234	CAG	2	6	532203	532208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344711
13992	NC_022234	CCT	2	6	532234	532239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344711
13993	NC_022234	TTC	2	6	532242	532247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344711
13994	NC_022234	CAT	2	6	532256	532261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344711
13995	NC_022234	CAT	2	6	532271	532276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344711
13996	NC_022234	CTG	3	9	532308	532316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344711
13997	NC_022234	TGG	2	6	532336	532341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344711
13998	NC_022234	AGG	2	6	532365	532370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13999	NC_022234	CGA	2	6	532464	532469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344712
14000	NC_022234	CAT	2	6	532506	532511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344712

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