MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022234	TGA	2	6	494003	494008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344678
13002	NC_022234	GAC	2	6	494010	494015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344678
13003	NC_022234	CGC	2	6	494054	494059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344678
13004	NC_022234	GGC	2	6	494061	494066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344678
13005	NC_022234	CG	3	6	494151	494156	0 %	0 %	50 %	50 %	538344678
13006	NC_022234	GCG	3	9	494374	494382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344678
13007	NC_022234	GC	3	6	494398	494403	0 %	0 %	50 %	50 %	538344678
13008	NC_022234	GC	3	6	494407	494412	0 %	0 %	50 %	50 %	538344678
13009	NC_022234	CCAGC	2	10	494441	494450	20 %	0 %	20 %	60 %	538344678
13010	NC_022234	CGG	2	6	494510	494515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344678
13011	NC_022234	GCACGC	2	12	494534	494545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344678
13012	NC_022234	GC	3	6	494558	494563	0 %	0 %	50 %	50 %	538344678
13013	NC_022234	GCC	2	6	494592	494597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344678
13014	NC_022234	CGT	2	6	494609	494614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344678
13015	NC_022234	GCG	2	6	494754	494759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_022234	CTC	2	6	494816	494821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13017	NC_022234	CCG	2	6	494851	494856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_022234	TGCGCT	2	12	494902	494913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_022234	GGCC	2	8	494935	494942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_022234	GGCG	2	8	494992	494999	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13021	NC_022234	CGG	2	6	495180	495185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344679
13022	NC_022234	CGA	2	6	495190	495195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344679
13023	NC_022234	GC	3	6	495232	495237	0 %	0 %	50 %	50 %	538344679
13024	NC_022234	CGAT	2	8	495278	495285	25 %	25 %	25 %	25 %	538344679
13025	NC_022234	GGT	2	6	495304	495309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344679
13026	NC_022234	CGA	2	6	495373	495378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344679
13027	NC_022234	CGAT	2	8	495432	495439	25 %	25 %	25 %	25 %	538344679
13028	NC_022234	GCA	2	6	495467	495472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_022234	AGGCCG	2	12	495476	495487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_022234	GCG	2	6	495492	495497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_022234	CGAT	2	8	495514	495521	25 %	25 %	25 %	25 %	538344680
13032	NC_022234	CGA	2	6	495543	495548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344680
13033	NC_022234	CGGG	2	8	495555	495562	0 %	0 %	75 %	25 %	538344680
13034	NC_022234	GGA	2	6	495600	495605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344680
13035	NC_022234	CG	3	6	495653	495658	0 %	0 %	50 %	50 %	538344680
13036	NC_022234	CG	4	8	495768	495775	0 %	0 %	50 %	50 %	538344680
13037	NC_022234	GC	3	6	495805	495810	0 %	0 %	50 %	50 %	538344680
13038	NC_022234	CGG	2	6	495875	495880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344680
13039	NC_022234	CGC	2	6	495918	495923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344680
13040	NC_022234	GGA	2	6	495990	495995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344680
13041	NC_022234	CGG	3	9	496002	496010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344680
13042	NC_022234	GCG	2	6	496043	496048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344680
13043	NC_022234	CTG	2	6	496060	496065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344680
13044	NC_022234	GAG	2	6	496081	496086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344680
13045	NC_022234	GAT	2	6	496113	496118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344680
13046	NC_022234	TGC	3	9	496190	496198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344680
13047	NC_022234	GAC	2	6	496201	496206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344680
13048	NC_022234	GCG	2	6	496217	496222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344680
13049	NC_022234	CTG	2	6	496228	496233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344680
13050	NC_022234	GCC	2	6	496285	496290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344680
13051	NC_022234	CGC	2	6	496313	496318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344680
13052	NC_022234	GTC	2	6	496351	496356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344680
13053	NC_022234	CGG	2	6	496424	496429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344680
13054	NC_022234	GCCA	2	8	496456	496463	25 %	0 %	25 %	50 %	538344680
13055	NC_022234	TGGC	2	8	496467	496474	0 %	25 %	50 %	25 %	538344680
13056	NC_022234	AGA	2	6	496481	496486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344680
13057	NC_022234	GCC	2	6	496490	496495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_022234	GGC	2	6	496524	496529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_022234	CTT	2	6	496562	496567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344681
13060	NC_022234	GCGGG	2	10	496578	496587	0 %	0 %	80 %	20 %	538344681
13061	NC_022234	GC	3	6	496590	496595	0 %	0 %	50 %	50 %	538344681
13062	NC_022234	GCG	2	6	496632	496637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344681
13063	NC_022234	CTT	2	6	496657	496662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344681
13064	NC_022234	CG	3	6	496681	496686	0 %	0 %	50 %	50 %	538344681
13065	NC_022234	GCGCG	2	10	496726	496735	0 %	0 %	60 %	40 %	538344681
13066	NC_022234	TGG	2	6	496771	496776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344681
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13069	NC_022234	GCG	2	6	496806	496811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344681
13070	NC_022234	CG	4	8	496810	496817	0 %	0 %	50 %	50 %	538344681
13071	NC_022234	GCC	2	6	496873	496878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344681
13072	NC_022234	GCC	2	6	496890	496895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344681
13073	NC_022234	GCGCG	2	10	496900	496909	0 %	0 %	60 %	40 %	538344681
13074	NC_022234	CGG	2	6	496978	496983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344681
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13078	NC_022234	GCC	2	6	497057	497062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344681
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13080	NC_022234	GCTGG	2	10	497077	497086	0 %	20 %	60 %	20 %	538344681
13081	NC_022234	GCG	2	6	497109	497114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344681
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13086	NC_022234	GCG	2	6	497340	497345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_022234	CGG	2	6	497351	497356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_022234	GGA	2	6	497360	497365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_022234	GCT	2	6	497375	497380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13091	NC_022234	GCT	2	6	497535	497540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344682
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13093	NC_022234	GCC	2	6	497650	497655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344682
13094	NC_022234	CGCC	2	8	497691	497698	0 %	0 %	25 %	75 %	538344682
13095	NC_022234	GAG	2	6	497730	497735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344682
13096	NC_022234	ACG	2	6	497737	497742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344682
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13098	NC_022234	GGCC	2	8	497806	497813	0 %	0 %	50 %	50 %	538344682
13099	NC_022234	GC	3	6	497867	497872	0 %	0 %	50 %	50 %	538344683
13100	NC_022234	GCAT	2	8	497923	497930	25 %	25 %	25 %	25 %	538344683
13101	NC_022234	GC	3	6	497931	497936	0 %	0 %	50 %	50 %	538344683
13102	NC_022234	TCG	2	6	497953	497958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344683
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13105	NC_022234	CGC	2	6	498018	498023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344683
13106	NC_022234	GC	5	10	498030	498039	0 %	0 %	50 %	50 %	538344683
13107	NC_022234	AGC	2	6	498127	498132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344683
13108	NC_022234	CGG	2	6	498173	498178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_022234	GCC	2	6	498208	498213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_022234	CGG	2	6	498218	498223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_022234	GCCGC	2	10	498268	498277	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13112	NC_022234	TCGA	2	8	498304	498311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13113	NC_022234	TTC	2	6	498388	498393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344684
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13118	NC_022234	TGT	2	6	498590	498595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344684
13119	NC_022234	GC	3	6	498641	498646	0 %	0 %	50 %	50 %	538344684
13120	NC_022234	CGGG	2	8	498671	498678	0 %	0 %	75 %	25 %	538344684
13121	NC_022234	GCCG	2	8	498693	498700	0 %	0 %	50 %	50 %	538344684
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13123	NC_022234	CTG	2	6	498721	498726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344684
13124	NC_022234	TCG	2	6	498736	498741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344684
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13126	NC_022234	CCG	2	6	498779	498784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344684
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13240	NC_022234	CTG	2	6	502370	502375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344687
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13242	NC_022234	CGG	2	6	502436	502441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344687
13243	NC_022234	CCA	2	6	502447	502452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344687
13244	NC_022234	TCT	2	6	502483	502488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344687
13245	NC_022234	GGGCG	2	10	502492	502501	0 %	0 %	80 %	20 %	538344687
13246	NC_022234	CGA	2	6	502549	502554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344687
13247	NC_022234	CGC	2	6	502579	502584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344687
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13253	NC_022234	CGA	2	6	502747	502752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344687
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13306	NC_022234	CGGCC	2	10	504647	504656	0 %	0 %	40 %	60 %	538344688
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13309	NC_022234	CGGCG	2	10	504714	504723	0 %	0 %	60 %	40 %	538344688
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13334	NC_022234	CGG	2	6	505494	505499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344688
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13337	NC_022234	GCG	2	6	505574	505579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344688
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13341	NC_022234	GCT	2	6	505963	505968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344689
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13347	NC_022234	GC	3	6	506104	506109	0 %	0 %	50 %	50 %	538344689
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13350	NC_022234	CGTG	2	8	506281	506288	0 %	25 %	50 %	25 %	538344690
13351	NC_022234	CGA	2	6	506317	506322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344690
13352	NC_022234	TCG	2	6	506340	506345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344690
13353	NC_022234	GTC	2	6	506369	506374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344690
13354	NC_022234	CGCCGG	2	12	506386	506397	0 %	0 %	50 %	50 %	538344690
13355	NC_022234	TGC	2	6	506467	506472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344690
13356	NC_022234	ATG	2	6	506490	506495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344690
13357	NC_022234	GCG	2	6	506503	506508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344690
13358	NC_022234	GCC	2	6	506602	506607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344690
13359	NC_022234	GAC	2	6	506610	506615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344690
13360	NC_022234	CG	3	6	506694	506699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13361	NC_022234	CGC	2	6	506745	506750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13362	NC_022234	TGA	2	6	506788	506793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_022234	CTT	2	6	506816	506821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13364	NC_022234	GA	3	6	506981	506986	50 %	0 %	50 %	0 %	538344691
13365	NC_022234	TTGC	2	8	506988	506995	0 %	50 %	25 %	25 %	538344691
13366	NC_022234	TGA	2	6	507023	507028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344691
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13370	NC_022234	TCG	2	6	507247	507252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344691
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13379	NC_022234	T	6	6	507665	507670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13380	NC_022234	GCA	2	6	507674	507679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13381	NC_022234	CG	3	6	507702	507707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13382	NC_022234	CGC	3	9	507818	507826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344692
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13386	NC_022234	TGC	2	6	507924	507929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344692
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13388	NC_022234	GGA	2	6	507999	508004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344692
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13392	NC_022234	CGG	2	6	508209	508214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344693
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13398	NC_022234	CGATG	2	10	508308	508317	20 %	20 %	40 %	20 %	538344693
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13429	NC_022234	GCC	2	6	509699	509704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13430	NC_022234	GCGG	2	8	509759	509766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13431	NC_022234	CCG	2	6	509789	509794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13432	NC_022234	CATT	2	8	509842	509849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13433	NC_022234	GTGGCG	2	12	509852	509863	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13434	NC_022234	TCG	2	6	509962	509967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13435	NC_022234	ACCC	2	8	509999	510006	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13436	NC_022234	CGGC	2	8	510011	510018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13437	NC_022234	TCT	2	6	510069	510074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344695
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13441	NC_022234	GAT	2	6	510381	510386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13461	NC_022234	GC	3	6	511063	511068	0 %	0 %	50 %	50 %	538344696
13462	NC_022234	CCTT	2	8	511093	511100	0 %	50 %	0 %	50 %	538344696
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13467	NC_022234	ATG	2	6	511255	511260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344696
13468	NC_022234	TGC	2	6	511276	511281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13469	NC_022234	CG	3	6	511327	511332	0 %	0 %	50 %	50 %	538344697
13470	NC_022234	GCCATC	2	12	511479	511490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538344697
13471	NC_022234	TGC	2	6	511525	511530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344697
13472	NC_022234	CG	3	6	511555	511560	0 %	0 %	50 %	50 %	538344697
13473	NC_022234	GACCG	2	10	511658	511667	20 %	0 %	40 %	40 %	538344697
13474	NC_022234	TGC	2	6	511675	511680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344697
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13477	NC_022234	CGC	2	6	511819	511824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13478	NC_022234	CCG	2	6	511875	511880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13479	NC_022234	TGG	3	9	511890	511898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13480	NC_022234	TGCGC	2	10	511911	511920	0 %	20 %	40 %	40 %	538344698
13481	NC_022234	GGC	2	6	511934	511939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344698
13482	NC_022234	CGG	2	6	511959	511964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344698
13483	NC_022234	CGC	2	6	511995	512000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13484	NC_022234	GCT	2	6	512014	512019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13485	NC_022234	CGA	2	6	512056	512061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13486	NC_022234	CGC	2	6	512121	512126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13487	NC_022234	GC	3	6	512130	512135	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13488	NC_022234	CTG	2	6	512137	512142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13489	NC_022234	CAC	2	6	512143	512148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344698
13490	NC_022234	TGCCGA	2	12	512157	512168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13491	NC_022234	GTT	2	6	512173	512178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
13492	NC_022234	ACC	2	6	512186	512191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344698
13493	NC_022234	CCACCG	2	12	512202	512213	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538344698
13494	NC_022234	CCG	2	6	512238	512243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
13495	NC_022234	GC	3	6	512295	512300	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
13496	NC_022234	CCTGCG	2	12	512328	512339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344698
13497	NC_022234	TGG	2	6	512373	512378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
13498	NC_022234	CAG	2	6	512401	512406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344698
13499	NC_022234	CGGT	2	8	512411	512418	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
13500	NC_022234	CCG	2	6	512445	512450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698

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