MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_022234	GCC	2	6	344680	344685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344530
9003	NC_022234	GAT	2	6	344751	344756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344530
9004	NC_022234	CGA	2	6	344802	344807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344530
9005	NC_022234	ATG	2	6	344809	344814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344530
9006	NC_022234	GAT	2	6	344850	344855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344530
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9009	NC_022234	GGA	2	6	345044	345049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344531
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9123	NC_022234	GCC	2	6	349310	349315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9124	NC_022234	GCCG	2	8	349431	349438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_022234	ACCC	2	8	349467	349474	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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9239	NC_022234	TCA	2	6	352819	352824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344542
9240	NC_022234	CG	3	6	352870	352875	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9241	NC_022234	CCG	2	6	353056	353061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344542
9242	NC_022234	AGCGC	2	10	353137	353146	20 %	0 %	40 %	40 %	538344542
9243	NC_022234	CGCTGG	2	12	353193	353204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344542
9244	NC_022234	AGGT	2	8	353208	353215	25 %	25 %	50 %	0 %	538344542
9245	NC_022234	TTC	2	6	353234	353239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344542
9246	NC_022234	ACC	2	6	353328	353333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344542
9247	NC_022234	TGT	2	6	353377	353382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344542
9248	NC_022234	AGC	2	6	353406	353411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9249	NC_022234	TCG	2	6	353457	353462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9250	NC_022234	CAT	2	6	353465	353470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344542
9251	NC_022234	GC	3	6	353490	353495	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9252	NC_022234	TCG	2	6	353565	353570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9253	NC_022234	CG	4	8	353590	353597	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9254	NC_022234	CG	5	10	353612	353621	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9255	NC_022234	GA	3	6	353633	353638	50 %	0 %	50 %	0 %	538344542
9256	NC_022234	CGG	2	6	353654	353659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344542
9257	NC_022234	GC	3	6	353680	353685	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9258	NC_022234	CGA	2	6	353722	353727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9259	NC_022234	GCT	2	6	353731	353736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9260	NC_022234	GC	3	6	353777	353782	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9261	NC_022234	CGC	3	9	353780	353788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344542
9262	NC_022234	GCG	2	6	353797	353802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344542
9263	NC_022234	CCA	2	6	353830	353835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344542
9264	NC_022234	GCA	2	6	353854	353859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9265	NC_022234	GGC	2	6	353896	353901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344542
9266	NC_022234	GCCG	2	8	353942	353949	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9267	NC_022234	CGC	2	6	353957	353962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344542
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9270	NC_022234	GCT	2	6	354028	354033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9271	NC_022234	GCA	2	6	354037	354042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9272	NC_022234	GCT	2	6	354052	354057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9273	NC_022234	GTC	2	6	354059	354064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9274	NC_022234	GCT	2	6	354067	354072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9275	NC_022234	AGC	2	6	354129	354134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
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9277	NC_022234	GCA	2	6	354292	354297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9278	NC_022234	CAG	2	6	354302	354307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9279	NC_022234	CG	3	6	354314	354319	0 %	0 %	50 %	50 %	538344542
9280	NC_022234	CAGCGC	2	12	354332	354343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344542
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9282	NC_022234	CCT	2	6	354370	354375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344542
9283	NC_022234	CGA	2	6	354376	354381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9284	NC_022234	TCG	2	6	354388	354393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9285	NC_022234	TGC	2	6	354489	354494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344542
9286	NC_022234	CGAC	2	8	354532	354539	25 %	0 %	25 %	50 %	538344542
9287	NC_022234	GCG	2	6	354711	354716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344542
9288	NC_022234	GCG	2	6	354720	354725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344542
9289	NC_022234	G	6	6	354725	354730	0 %	0 %	100 %	0 %	538344542
9290	NC_022234	CGGGG	2	10	354731	354740	0 %	0 %	80 %	20 %	538344542
9291	NC_022234	G	9	9	354771	354779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9292	NC_022234	TCAAT	2	10	354786	354795	40 %	40 %	0 %	20 %	538344543
9293	NC_022234	CGC	2	6	354802	354807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9294	NC_022234	CTTC	2	8	354832	354839	0 %	50 %	0 %	50 %	538344543
9295	NC_022234	GGCGAT	2	12	354845	354856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344543
9296	NC_022234	GGT	2	6	354866	354871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344543
9297	NC_022234	CGAT	2	8	354886	354893	25 %	25 %	25 %	25 %	538344543
9298	NC_022234	GCG	2	6	354894	354899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344543
9299	NC_022234	CGC	2	6	354974	354979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9300	NC_022234	GCC	2	6	355002	355007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9301	NC_022234	TCG	2	6	355008	355013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9302	NC_022234	TCG	2	6	355038	355043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9303	NC_022234	CGA	2	6	355054	355059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
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9306	NC_022234	GC	4	8	355081	355088	0 %	0 %	50 %	50 %	538344543
9307	NC_022234	TGG	2	6	355120	355125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344543
9308	NC_022234	GCA	2	6	355159	355164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
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9310	NC_022234	TCC	2	6	355194	355199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344543
9311	NC_022234	GCC	2	6	355203	355208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9312	NC_022234	CTCGGT	2	12	355256	355267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9313	NC_022234	CGC	2	6	355294	355299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9314	NC_022234	TGCG	2	8	355329	355336	0 %	25 %	50 %	25 %	538344543
9315	NC_022234	GCG	2	6	355377	355382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344543
9316	NC_022234	CGC	2	6	355414	355419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9317	NC_022234	GTG	2	6	355428	355433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344543
9318	NC_022234	GAC	2	6	355448	355453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9319	NC_022234	GCG	2	6	355454	355459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344543
9320	NC_022234	GGT	2	6	355471	355476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344543
9321	NC_022234	CCG	2	6	355527	355532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9322	NC_022234	GCA	3	9	355552	355560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9323	NC_022234	ACG	2	6	355608	355613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9324	NC_022234	GCATCC	2	12	355647	355658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538344543
9325	NC_022234	AGC	2	6	355677	355682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9326	NC_022234	CGC	2	6	355697	355702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9327	NC_022234	TCG	2	6	355732	355737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344543
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9329	NC_022234	CAG	2	6	355775	355780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9330	NC_022234	GTT	2	6	355799	355804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344543
9331	NC_022234	CGA	2	6	355849	355854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
9332	NC_022234	CG	3	6	355925	355930	0 %	0 %	50 %	50 %	538344543
9333	NC_022234	GTT	2	6	355958	355963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344543
9334	NC_022234	CCA	2	6	356035	356040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344543
9335	NC_022234	CCG	2	6	356041	356046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9336	NC_022234	ATC	2	6	356121	356126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344543
9337	NC_022234	CGGTGG	2	12	356140	356151	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	538344543
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9339	NC_022234	GCC	2	6	356184	356189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
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9341	NC_022234	GC	3	6	356206	356211	0 %	0 %	50 %	50 %	538344543
9342	NC_022234	TCC	2	6	356229	356234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344543
9343	NC_022234	CGA	2	6	356251	356256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344543
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9345	NC_022234	GAT	2	6	356300	356305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344543
9346	NC_022234	CG	3	6	356317	356322	0 %	0 %	50 %	50 %	538344543
9347	NC_022234	CGC	2	6	356362	356367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344543
9348	NC_022234	GTG	2	6	356434	356439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9349	NC_022234	GC	3	6	356442	356447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9350	NC_022234	CG	3	6	356452	356457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9351	NC_022234	CGA	2	6	356462	356467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9352	NC_022234	CCT	2	6	356560	356565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344544
9353	NC_022234	TCG	2	6	356580	356585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344544
9354	NC_022234	TC	3	6	356599	356604	0 %	50 %	0 %	50 %	538344544
9355	NC_022234	TGG	2	6	356634	356639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344544
9356	NC_022234	GGCC	2	8	356718	356725	0 %	0 %	50 %	50 %	538344545
9357	NC_022234	ACC	2	6	356732	356737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344545
9358	NC_022234	GCCG	2	8	356746	356753	0 %	0 %	50 %	50 %	538344545
9359	NC_022234	CCGA	2	8	356756	356763	25 %	0 %	25 %	50 %	538344545
9360	NC_022234	GCAGCG	2	12	356772	356783	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344545
9361	NC_022234	CGG	2	6	356791	356796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344545
9362	NC_022234	GTC	2	6	356800	356805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344545
9363	NC_022234	TTC	2	6	356863	356868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344545
9364	NC_022234	GTC	2	6	356887	356892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344545
9365	NC_022234	CGA	2	6	356898	356903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344545
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9367	NC_022234	CGC	2	6	356942	356947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344545
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9489	NC_022234	GCT	2	6	360904	360909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344549
9490	NC_022234	CCG	2	6	361021	361026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344549
9491	NC_022234	GCC	2	6	361033	361038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344549
9492	NC_022234	CGC	2	6	361044	361049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344549
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